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Rev蛋白:抗HIV-1感染的新靶点
1
作者
曹原
刘新泳
《生命的化学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第4期294-297,共4页
病毒颗粒蛋白表达调节因子(regulatorofvirionproteinexpression,Rev)是HIV-1转录过程中不可缺少的调控蛋白。Rev与病毒mRNA的Rev应答元件(revresponseelement,RRE)相互作用,加速mRNA向核外转运。Rev缺乏或者不能进入细胞核,未剪接和部...
病毒颗粒蛋白表达调节因子(regulatorofvirionproteinexpression,Rev)是HIV-1转录过程中不可缺少的调控蛋白。Rev与病毒mRNA的Rev应答元件(revresponseelement,RRE)相互作用,加速mRNA向核外转运。Rev缺乏或者不能进入细胞核,未剪接和部分剪接的mRNA将在核内完全降解,导致HIV-1的复制被阻断。Rev在HIV-1复制周期中起着重要的反式调节作用,是寻找新作用机制和不易产生耐药性的抗艾滋病药物的新靶点。该文介绍Rev介导的核质转运过程和Rev蛋白的相关抑制剂。
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关键词
人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)
病毒颗粒蛋白表达调节因子(
rev
)
rev应答元件
(RRE)
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职称材料
粗糙集算法在预测RNA保守功能二级结构中的应用
2
作者
付昊月
张祥德
薛定宇
《东北大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1389-1392,共4页
提出了一种预测RNA保守功能二级结构的粗糙集算法.使用粗糙集工具Rosetta软件,在保守结构预测过程的数据挖掘模块中,应用经过整理和离散化的RNA备择碱基对数据生成规则确定出将要出现在同源RNA序列的保守二级结构中的碱基对.将此算法应...
提出了一种预测RNA保守功能二级结构的粗糙集算法.使用粗糙集工具Rosetta软件,在保守结构预测过程的数据挖掘模块中,应用经过整理和离散化的RNA备择碱基对数据生成规则确定出将要出现在同源RNA序列的保守二级结构中的碱基对.将此算法应用在对爱滋病病原体HIV病毒RNA中REV应答元件单元的保守二级结构预测的结果表明,与传统的非数据挖掘算法相比,使用了这种机器学习算法的粗糙集预测方法,使得保守功能结构与野生型结构更加相似,重要的功能结构分支更加清晰明确.
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关键词
RNA二级结构
粗糙集
rev应答元件
保守结构预测
HIV
ROSETTA
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职称材料
HIV-1载体中存在着提高转录和翻译基因的元件
3
作者
孙凤强
方彧聃
+3 位作者
王娟
张帆
马海燕
张敬之
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2010年第5期377-381,共5页
目的研究HIV-1载体中的一些元件如Rev和Tat蛋白对其骨架的转录及外源基因表达水平的影响。方法将HIV-1表达GFP载体(FUGW)单独或分别与Rev蛋白表达质粒(pLP2)、Tat蛋白表达质粒(pcDNA3.1-Tat),及表达Rev和Tat蛋白的质粒(△8.9...
目的研究HIV-1载体中的一些元件如Rev和Tat蛋白对其骨架的转录及外源基因表达水平的影响。方法将HIV-1表达GFP载体(FUGW)单独或分别与Rev蛋白表达质粒(pLP2)、Tat蛋白表达质粒(pcDNA3.1-Tat),及表达Rev和Tat蛋白的质粒(△8.9)等摩尔共转染人293T细胞后,经实时定量RT-PCR、FACS、荧光显微镜镜检等方法检测,比较其表达量。结果Rev与RRE结合后,载体骨架及外源基因的转录是单独转染FUGW时的3倍,Tat与TAR结合后,则提高其骨架及外源基因的转录近4倍,而Rev和Tat蛋白的协同作用,其转录本则可提高至6倍。FACS和荧光显微镜镜检也显示GFP蛋白表达量明显提高。F-TPO载体(HIV-1载体乳腺特异表达促血小板生成素)与△8.9在小鼠乳腺上皮细胞HC-11共转染和表达,则TPO蛋白的表达量接近pcDNA3.1-TPO载体的8倍。结论HIV-1载体中存在着提高转录和翻译基因的元件,可提高其骨架的转录和外源基因的表达,且该现象并不依赖于细胞类型和外源基因的种类。
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关键词
HIV-1载体
rev
蛋白
TAT蛋白
rev应答元件
转录启动反应因子
原文传递
题名
Rev蛋白:抗HIV-1感染的新靶点
1
作者
曹原
刘新泳
机构
山东大学药学院药物化学研究所
出处
《生命的化学》
CAS
CSCD
北大核心
2006年第4期294-297,共4页
基金
国家自然基金项目(No.30371686)
国际合作重点项目(No.2003DF000033)
+1 种基金
山东省自然基金(No.Y2003C11)
山东省1020工程计划项目(卫2004-15)。
文摘
病毒颗粒蛋白表达调节因子(regulatorofvirionproteinexpression,Rev)是HIV-1转录过程中不可缺少的调控蛋白。Rev与病毒mRNA的Rev应答元件(revresponseelement,RRE)相互作用,加速mRNA向核外转运。Rev缺乏或者不能进入细胞核,未剪接和部分剪接的mRNA将在核内完全降解,导致HIV-1的复制被阻断。Rev在HIV-1复制周期中起着重要的反式调节作用,是寻找新作用机制和不易产生耐药性的抗艾滋病药物的新靶点。该文介绍Rev介导的核质转运过程和Rev蛋白的相关抑制剂。
关键词
人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)
病毒颗粒蛋白表达调节因子(
rev
)
rev应答元件
(RRE)
分类号
R91 [医药卫生—药学]
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职称材料
题名
粗糙集算法在预测RNA保守功能二级结构中的应用
2
作者
付昊月
张祥德
薛定宇
机构
东北大学信息科学与工程学院
东北大学理学院
出处
《东北大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008年第10期1389-1392,共4页
基金
辽宁省科学技术基金资助项目(002010)
文摘
提出了一种预测RNA保守功能二级结构的粗糙集算法.使用粗糙集工具Rosetta软件,在保守结构预测过程的数据挖掘模块中,应用经过整理和离散化的RNA备择碱基对数据生成规则确定出将要出现在同源RNA序列的保守二级结构中的碱基对.将此算法应用在对爱滋病病原体HIV病毒RNA中REV应答元件单元的保守二级结构预测的结果表明,与传统的非数据挖掘算法相比,使用了这种机器学习算法的粗糙集预测方法,使得保守功能结构与野生型结构更加相似,重要的功能结构分支更加清晰明确.
关键词
RNA二级结构
粗糙集
rev应答元件
保守结构预测
HIV
ROSETTA
Keywords
RNA secondary structure
rough set
RRE (
rev
-responsive element)
conserved structure prediction
HIV
Rosetta
分类号
TP391 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
HIV-1载体中存在着提高转录和翻译基因的元件
3
作者
孙凤强
方彧聃
王娟
张帆
马海燕
张敬之
机构
上海交通大学医学遗传研究所
出处
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2010年第5期377-381,共5页
基金
国家高技术研究发展计划(863计划)(No.2007AA021206),国家自然科学基金(No.30870943),上海市自然科学基金(No.08ZRl412100)
文摘
目的研究HIV-1载体中的一些元件如Rev和Tat蛋白对其骨架的转录及外源基因表达水平的影响。方法将HIV-1表达GFP载体(FUGW)单独或分别与Rev蛋白表达质粒(pLP2)、Tat蛋白表达质粒(pcDNA3.1-Tat),及表达Rev和Tat蛋白的质粒(△8.9)等摩尔共转染人293T细胞后,经实时定量RT-PCR、FACS、荧光显微镜镜检等方法检测,比较其表达量。结果Rev与RRE结合后,载体骨架及外源基因的转录是单独转染FUGW时的3倍,Tat与TAR结合后,则提高其骨架及外源基因的转录近4倍,而Rev和Tat蛋白的协同作用,其转录本则可提高至6倍。FACS和荧光显微镜镜检也显示GFP蛋白表达量明显提高。F-TPO载体(HIV-1载体乳腺特异表达促血小板生成素)与△8.9在小鼠乳腺上皮细胞HC-11共转染和表达,则TPO蛋白的表达量接近pcDNA3.1-TPO载体的8倍。结论HIV-1载体中存在着提高转录和翻译基因的元件,可提高其骨架的转录和外源基因的表达,且该现象并不依赖于细胞类型和外源基因的种类。
关键词
HIV-1载体
rev
蛋白
TAT蛋白
rev应答元件
转录启动反应因子
Keywords
HIV-1 vector
rev
Tat
rev
-response element
transactivation response element
分类号
Q752 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
Rev蛋白:抗HIV-1感染的新靶点
曹原
刘新泳
《生命的化学》
CAS
CSCD
北大核心
2006
0
下载PDF
职称材料
2
粗糙集算法在预测RNA保守功能二级结构中的应用
付昊月
张祥德
薛定宇
《东北大学学报(自然科学版)》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2008
0
下载PDF
职称材料
3
HIV-1载体中存在着提高转录和翻译基因的元件
孙凤强
方彧聃
王娟
张帆
马海燕
张敬之
《医学分子生物学杂志》
CAS
CSCD
2010
0
原文传递
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