根瘤菌多样性和系统发育研究的多相分类体系及其进展

近年来对新的根瘤菌资源的不断发掘及现代分子生物学技术的发展和应用使根瘤菌分类研究有了突破性进展。多相分类通过综合获取信息,多种方法相互印证、互为补充,推进了根瘤菌的表型、遗传型和系统发育三方面的发展,从而较全面地反映根瘤菌的生物多样性特征,是根瘤菌多样性研究工作中常常采用的技术手段。文中主要阐述了根瘤菌多相分类体系中的主要方法及现代根瘤菌系统发育地位的研究和进展。

金沙江干热河谷区田菁根瘤菌多样性与系统发育

【目的】揭示金沙江干热河谷区这一特殊地理环境下田菁根瘤菌的多样性和系统发育地位。【方法】采用了数值分类、16S rDNA PCR-RFLP、16S rDNA和GSⅡ序列分析方法。【结果】数值分类结果表明:在93%的水平上,待测菌株分布于6个群,其中4个群分别与R.tropici、R.etli、S.saheli、A.rubi的参比菌株聚在一起,两个群没有参比菌株与之聚群。16S rDNAPCR-RFLP结果与数值分类基本一致,只有两个独立群有所差异。16S rDNA序列分析表明:两独立群中心菌株SCAU176和SCAU144与R.huautlense聚在一起,与该种同源性分别为100%和98.9%。GSⅡ序列分析中SCAU176和SCAU144单独聚在一起,与最近的参比菌株R.tropici的同源性系数在90%以下。【结论】金沙江干热河谷区田菁根瘤菌具有较为丰富的多样性,在系统发育地位上分布于Sinorhizobium、Agrobacterium和Rhizobium三个属。