期刊文献+
共找到188篇文章
< 1 2 10 >
每页显示 20 50 100
Phylogeny of Ptychostomum (Bryaceae,Musci) inferred from sequences of nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacer (ITS) and chloroplast rps4 被引量:2
1
作者 Chen-Ying WANG Jian-Cheng ZHAO 《Journal of Systematics and Evolution》 SCIE CSCD 北大核心 2009年第4期311-320,共10页
The phylogeny of Ptychostomum was first spacer (ITS) region of the nuclear ribosomal (nr) DNA DNA rps4 sequences. Maximum parsimony, maximum undertaken based on analysis of the internal transcribed and by combinin... The phylogeny of Ptychostomum was first spacer (ITS) region of the nuclear ribosomal (nr) DNA DNA rps4 sequences. Maximum parsimony, maximum undertaken based on analysis of the internal transcribed and by combining data from nrDNA ITS and chloroplast likelihood, and Bayesian analyses all support the conclusion that the reinstated genus Ptychostomum is not monophyletic. Ptychostomum funkii (Schwagr.) J. R. Spence (≡ Bryum funkii Schwaigr.) is placed within a clade containing the type species of Bryum, B. argenteum Hedw. The remaining members of Ptychostomum investigated in the present study constitute another well-supported clade. The results are congruent with previous molecular analyses. On the basis of phylogenetic evidence, we agree with transferring B. amblyodon Mull. Hal. (≡ B. inclinatum (Brid.) Turton≡ Bryum archangelicum Bruch & Schimp.), Bryum lonchocaulon Mull. Hal., Bryum pallescens Schleich. ex Schwaigr., and Bryum pallens Sw. to Ptychostomum. 展开更多
关键词 Bryum molecular phylogeny nuclear ribosomal dna internal transcribed spacer sequences Ptychostomum rps4 sequences.
下载PDF
Application of the first internal transcribed spacer(ITS-1)of ribosomal DNA as a molecular marker to population analysis in farrer's scallop Chlamys farreri 被引量:1
2
作者 YU Ziniu WEI Xiaohua +1 位作者 KONG Xiaoyu YU Shanshan 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2007年第1期93-100,共8页
Sequence variation of the first internal transcribed spacer of ribosomal DNA ( ITS - 1 ) was examined and its application to the study of genetic variation was explored in four populations of farter' s scallop Chla... Sequence variation of the first internal transcribed spacer of ribosomal DNA ( ITS - 1 ) was examined and its application to the study of genetic variation was explored in four populations of farter' s scallop Chlamys farreri. ITS - 1 fragments, with a length of about 300 bp,of 78 individuals collected from Dalian, Qingdao, Yantai in China and Korea respectively were amplified via PCR, cloned and sequenced. Intra-genomic variation was examined by sequencing several clones of single individuals. Alignment and polymorphism analysis detected 44 haplotypes and 50 polymorphic sites which consist of 30 substitutions and 20 indels, indicating a high level of polymorphisms. Sequence analysis also showed a very low level of intra-individual variation. All these features validated the feasibility of application of ITS - 1 fragment to population analysis. Polymorphism analysis showed that the Korea sample has the richest genetic variation, followed by Yantai and Qingdao samples. AMOVA (analysis of molecular variance) showed that the majority (96.26%) of genetic variation was distributed within populations and 3.74% resulted from among populations, but with P 〈 0.05 ( = 0.042), indicating that the populations in this study have significant divergence. This output was basically concordant with the result arising from RAPD data and different from that from mitochondrial 16S rDNA sequence data. Discussion on this inconsistency was made accordingly. 展开更多
关键词 Chlamys farreri farrer' s scallop internal transcribed spacer ITS - 1 dna sequence genetic variation
下载PDF
Characterization of Fusarium Oxysporum Isolates Obtained from Wax Gourd and Chieh-qua in China by Pathogenicity, RAMs and Sequence Analysis of the rDNA Internal Transcribed Spacers (ITS1 and ITS2) 被引量:2
3
作者 D.S. Xie  X.M. He  Q.W. Peng 《分子植物育种》 CAS CSCD 2007年第2期271-272,共2页
Wax gourd (Benincasa hispida Thumb. Cogn) is called white gourd, winter melon, Chinese preserving melon, Chinese squash, and don kwa. It has been cultivated in China for over 2 300 years. It probably
关键词 镰刀霉 病原 序列分析 白葫芦
下载PDF
DNA Barcoding of <i>Ricinus communis</i>from Different Geographical Origin by Using Chloroplast <i>matK</i>and Internal Transcribed Spacers
4
作者 Mohamed Enan Mohammad Al-Deeb +1 位作者 Nael Fawzy Khaled Amiri 《American Journal of Plant Sciences》 2012年第9期1304-1310,共7页
Ricinus communis have attracted considerable attention because of its specific industrial and pharmacological activities. DNA barcodes can be used as reliable tools to facilitate the identification of medicinal plants... Ricinus communis have attracted considerable attention because of its specific industrial and pharmacological activities. DNA barcodes can be used as reliable tools to facilitate the identification of medicinal plants for the safe use, quality control and forensic investigation. In this study, the differential identification of eight accessions of R. com-munis was investigated through DNA sequence analysis of two candidate DNA barcodes. The nucleotide sequence of internal transcribed spacers (ITS2) and chloroplast maturase gene (matK) have been determined to construct the phylogenetic tree. The phylogenetic relationships of accessions based on the nrITS2 region and partial matK region showed that all accessions in this study were related to three geographical origins. Based on sequence align-ment and phylogenetic analyses we concluded that the ITS2 sequences can distinguish R. communis accessions from different geographical distributions. 展开更多
关键词 dna BARCODING internal transcribed spacer Maturase K RICINUS communis
下载PDF
基于SCAR标记和DNA条形码技术的苍术基原鉴别研究
5
作者 陈研 冯露露 +1 位作者 黄荣 齐伟辰 《世界科学技术-中医药现代化》 CSCD 北大核心 2024年第2期490-501,共12页
目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR... 目的开发出能同时鉴别北苍术和关苍术的分子标记方法,并探究不同种质资源苍术的遗传进化关系。方法对不同地区北苍术Atractylodes chinensis(Bunge)Koidz及关苍术A.japonica Koidz.ex Kitam基因组DNA的差异片段进行测序,结合SRAP、ISSR、DAMD分子标记方法,优化PCR反应体系,筛选并转换成特异性标记,同时,采用条形码方法分析种间序列差异。结果通过SRAP、ISSR、DAMD三种分子标记方法的PCR扩增,共筛选出198对能稳定扩增且重现性好的引物,转换出7对能稳定、快速鉴别北苍术和关苍术的SCAR引物。条形码方法检测出北苍术ITS2序列长度为454 bp,关苍术ITS2序列长度为453 bp,与其他苍术属植物之间遗传距离较远。NJ树结果显示,北苍术、关苍术及其他苍术属植物均各自聚为一支,表现出良好的单系性。依据ITS2二级结构,4种苍术属植物在螺旋区的茎环数目、大小、位置均有明显差异,可以直观地进行区分。结论所开发的特异性SCAR标记为苍术属植物优良品种的筛选提供了新方法,DNA条形码能稳定、准确鉴别北苍术。 展开更多
关键词 北苍术 关苍术 internal transcribed spacer 2(ITS2) Sequence-related amplified polymorphism(SRAP) Inter-simple sequence repeat(ISSR) Direct amplification of minisatellite region dna(DAMD) Sequence characterized amplified regions(SCAR)
下载PDF
中华按蚊和嗜人按蚊rDNA内转录间隔2区序列差异 被引量:29
6
作者 马雅军 瞿逢伊 +1 位作者 徐建农 郑哲民 《第二军医大学学报》 CAS CSCD 北大核心 1998年第3期234-236,共3页
目的:比较中华按蚊和嗜人按蚊核糖体DNA(rDNA)内转录间隔2区(ITS2)序列差异。方法:通过对PCR扩增的rDNAITS2片段进行克隆测序,每种蚊测定3个克隆片段序列,比较其差异。结果:中华按蚊和嗜人按蚊的rD... 目的:比较中华按蚊和嗜人按蚊核糖体DNA(rDNA)内转录间隔2区(ITS2)序列差异。方法:通过对PCR扩增的rDNAITS2片段进行克隆测序,每种蚊测定3个克隆片段序列,比较其差异。结果:中华按蚊和嗜人按蚊的rDNAITS2序列长度分别为468和452bp,GC含量分别为44.87%和49.12%,两者序列差异为28.8%。 展开更多
关键词 中华按蚊 嗜人按蚊 dna 核糖体 ITS2
下载PDF
微小按蚊rDNA内转录间隔2区序列差异 被引量:11
7
作者 王学忠 Harold Townson +1 位作者 王丕玉 李菊升 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2001年第1期24-27,共4页
目的 :比较不同地株微小按蚊核糖体DNA(rDNA)内转录间隔 2区 (ITS2 )序列差异。方法 :通过对PCR扩增rDNAITS2片段测序 ,比较其不同地株差异。结果 :对 6株微小按蚊测序比较 ,存在有微小按蚊A和C型。结论 :rDNAITS2序列差异可用于建立A。
关键词 微波按蚊 dna 核糖体 2内转录间隔区
下载PDF
rDNA-ITS2应用于赤眼蜂分子鉴定的研究 被引量:13
8
作者 李正西 沈佐锐 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第5期80-84,共5页
本研究通过对拟澳洲赤眼蜂 Trichogramma confusum、甘蓝夜蛾赤眼蜂 T. brassicae、广赤眼蜂 T.evanescens、食胚赤眼蜂 T. embryophagum,及松毛虫赤眼蜂 T. dendrolimi的 6个地理种群的 r DNA- ITS2进行克隆测序 ,又运用软件 DNAStar的... 本研究通过对拟澳洲赤眼蜂 Trichogramma confusum、甘蓝夜蛾赤眼蜂 T. brassicae、广赤眼蜂 T.evanescens、食胚赤眼蜂 T. embryophagum,及松毛虫赤眼蜂 T. dendrolimi的 6个地理种群的 r DNA- ITS2进行克隆测序 ,又运用软件 DNAStar的 Meg Align程序对不同赤眼蜂属间、赤眼蜂属种间、同种不同地理种群之间以及同一赤眼蜂个体不同拷贝之间的 ITS2序列的遗传分歧及相似性进行了分析。结果表明 :赤眼蜂属与外群 ITS2序列的遗传相似性很低、赤眼蜂属内不同种之间 ITS2序列保守性适中、种内或不同地理种群之间以及同一个体不同 ITS2拷贝间非常保守。说明 展开更多
关键词 Rdna-ITS2 应用 赤眼蜂 分子鉴定 天敌昆虫
下载PDF
应用rDNA ITS2区段基因序列分析对浙江省传疟媒介的鉴定 被引量:7
9
作者 姚立农 夏生荣 +8 位作者 阮卫 夏弟明 徐惠庆 王祖主 莫根强 杨道余 陆锦明 余可根 陈华良 《中国病原生物学杂志》 CSCD 2006年第3期217-218,228,共3页
目的对浙江省传疟媒介种类进行鉴定,以指导疟疾防治工作。方法针对媒介按蚊核糖体核酸内转录间隔2(rDNAITS2)区段基因特征,应用PCR基因鉴别技术,对浙江省现场捕捉的按蚊与嗜人按蚊、八代按蚊、中华按蚊、雷氏按蚊实验室标本进行基因鉴... 目的对浙江省传疟媒介种类进行鉴定,以指导疟疾防治工作。方法针对媒介按蚊核糖体核酸内转录间隔2(rDNAITS2)区段基因特征,应用PCR基因鉴别技术,对浙江省现场捕捉的按蚊与嗜人按蚊、八代按蚊、中华按蚊、雷氏按蚊实验室标本进行基因鉴别和比较。结果浙江省现场捕捉的按蚊DNA样本的PCR扩增产物均为250bp,与实验室中华按蚊标本一致。结论中华按蚊目前仍是浙江省的主要传疟媒介,现场调查未发现嗜人按蚊。 展开更多
关键词 中华按蚊 嗜人按蚊 核糖体核酸内转录间隔2(ITS2) 聚合酶链反应
下载PDF
血卵涡鞭虫核糖体18SrDNA和ITS1-5.8SrDNA-ITS2序列测定与系统发育分析 被引量:3
10
作者 施慧 谢建军 +1 位作者 王庚申 许文军 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第3期560-565,共6页
血卵涡鞭虫是一类寄生性的原生动物,是近年来引起三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)、“牛奶病”及锯缘青蟹(Scylla serrata)“黄水病”的一种主要病原,该虫对宿主感染时间长,流行范围广、发病率、死亡率较高,危害严重,给... 血卵涡鞭虫是一类寄生性的原生动物,是近年来引起三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)、“牛奶病”及锯缘青蟹(Scylla serrata)“黄水病”的一种主要病原,该虫对宿主感染时间长,流行范围广、发病率、死亡率较高,危害严重,给梭子蟹和青蟹的养殖业造成了巨大的经济损失。 展开更多
关键词 血卵涡鞭虫 18S Rdna基因 弼基因 系统发育分析
下载PDF
贵州2种地方鲫鱼群体rDNA ITS-1序列分析 被引量:2
11
作者 郭健康 安苗 +1 位作者 周其椿 曹恒源 《贵州农业科学》 CAS 2015年第11期28-31,共4页
为探讨贵州省草海鲫鱼和普安鲫鱼群体的遗传变异和系统进化,对其rDNA ITS-1序列进行PCR扩增、测序分析。结果表明:24尾草海鲫ITS-1序列长度具有明显的多态性,分为296-297bp、300-301bp和337-339bp 3种类型;共发现1个多态位点、3个碱基... 为探讨贵州省草海鲫鱼和普安鲫鱼群体的遗传变异和系统进化,对其rDNA ITS-1序列进行PCR扩增、测序分析。结果表明:24尾草海鲫ITS-1序列长度具有明显的多态性,分为296-297bp、300-301bp和337-339bp 3种类型;共发现1个多态位点、3个碱基插入和1个碱基缺失,其GC含量(70.8%)明显高于AT含量(29.2%)。14尾普安鲫ITS-1序列长度仅有1种为337-339bp,共检测到18个多态位点,存在1个碱基缺失和1个碱基插入,其GC含量为71.2%,远远高于AT含量(28.8%)。所有序列共产生11种单倍型,单倍型的平均遗传距离(P)以及平均核苷酸差异系数(K)草海鲫低于普安鲫;Tajima’s D和Fu and Li’s D中性检验表明,草海鲫未经历种群扩张,而普安鲫可能经历种群扩张。普安鲫遗传多样性较草海鲫丰富。 展开更多
关键词 鲫鱼 第一内转录间隔区 遗传多样性 普安 草海
下载PDF
按蚊rDNA ITS2区段基因序列检测 被引量:3
12
作者 姚立农 夏生荣 +8 位作者 阮卫 夏弟明 徐惠庆 王祖主 莫根强 杨道余 陆锦明 余可根 陈华良 《浙江预防医学》 2007年第1期1-2,共2页
目的鉴定浙江传疟媒介种类,为制定浙江省疟疾防治策略提供依据。方法利用媒介按蚊核糖体核酸内转录间隔2(rDNA ITS2)区段基因特征,应用PCR基因鉴别技术,对浙江省现场捕捉的按蚊与嗜人按蚊、八代按蚊、中华按蚊、雷氏按蚊实验室标本进行... 目的鉴定浙江传疟媒介种类,为制定浙江省疟疾防治策略提供依据。方法利用媒介按蚊核糖体核酸内转录间隔2(rDNA ITS2)区段基因特征,应用PCR基因鉴别技术,对浙江省现场捕捉的按蚊与嗜人按蚊、八代按蚊、中华按蚊、雷氏按蚊实验室标本进行基因鉴别和比较。结果浙江省现场捕捉的按蚊DNA样本的PCR扩增产物均为250bp,与实验室中华按蚊标本一致。结论浙江省的传疟媒介是中华按蚊,现场调查未发现嗜人按蚊。 展开更多
关键词 中华按蚊 嗜人按蚊 核糖体核酸内转录间隔2 聚合酶链反应
下载PDF
长爪沙鼠源肺孢子虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2序列测定及分析 被引量:1
13
作者 李自慧 冯宪敏 +3 位作者 卢思奇 张帆 王凤云 黄松 《首都医科大学学报》 CAS 2006年第1期135-136,共2页
关键词 长爪沙鼠 肺孢子虫 5.8S核糖体RNA基因(5.8S rdna) 内转录间隔区(ITS)
下载PDF
新疆6种蚊虫的rDNA-ITS2区序列分析 被引量:5
14
作者 马雅军 瞿逢伊 柴君杰 《地方病通报》 2001年第2期66-70,共5页
测定并分析了新疆 4种伊蚊和 2种按蚊的 rDNA—ITS2区序列,新疆伊蚊、刺扰伊蚊ITS2区长度分别为 231bp~256 bp、250bp或 253bp,其克隆间、种内序列差异分别为 0.3%~4.3%、0.8%~1... 测定并分析了新疆 4种伊蚊和 2种按蚊的 rDNA—ITS2区序列,新疆伊蚊、刺扰伊蚊ITS2区长度分别为 231bp~256 bp、250bp或 253bp,其克隆间、种内序列差异分别为 0.3%~4.3%、0.8%~1.4%;里梅伊蚊与长刀伊蚊的长度为330 bp、251 bp,种内序列无差异;4种伊蚊种间序列差异明显大于种内差异水平,为12.3%~33.5%;赫坎按蚊和米赛按蚊的 ITS2区序列长度分别为 463bp、311bp,种内个体间无差异,而种间的差异为 30.8%.结果显示 rDNA-ITS2区序列差异,为形态上易混淆蚊种提供了有意义的分子鉴别特征。 展开更多
关键词 核糖体dna 2内转录间隔区 伊蚊属 按蚊属 新疆
下载PDF
眼蚤属(Ophthalmopsylla)两蚤种的rDNA ITS2序列研究 被引量:1
15
作者 王赟 漆一鸣 《贵阳医学院学报》 CAS 2011年第2期151-153,157,共4页
目的:研究伏河眼蚤异常亚种Ophthalmopsylla volgensis extrema(Ioffet Scalon,1953)和长突眼蚤Oph-thalmopsylla kiritschenkoi(Wagner,1930)rDNA ITS2序列,为蚤类分子系统发育的研究提供基础资料。方法:PCR扩增两蚤种rDNA ITS2片段并... 目的:研究伏河眼蚤异常亚种Ophthalmopsylla volgensis extrema(Ioffet Scalon,1953)和长突眼蚤Oph-thalmopsylla kiritschenkoi(Wagner,1930)rDNA ITS2序列,为蚤类分子系统发育的研究提供基础资料。方法:PCR扩增两蚤种rDNA ITS2片段并测序,比较两者差异。结果:伏河眼蚤异常亚种rDNA ITS2序列长372 bp,长突眼蚤长380 bp;两蚤种间共有30处碱基不同,包括16处缺失/插入、4处转换、10处颠换,种内无差异。结论:rDNA ITS2序列可用作两蚤种鉴别的分子标记。 展开更多
关键词 序列分析 第二内转录间隔区(ITS2)
下载PDF
长爪沙鼠和新西兰白兔源肺孢子虫ITS1-5.8S rDNA-ITS2序列的测定与分析
16
作者 李自慧 卢思奇 +3 位作者 冯宪敏 张帆 王凤云 黄松 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第10期975-977,共3页
目的测定长爪沙鼠及新西兰白兔源肺孢子虫的ITS1-5.8S rDNA-ITS2序列,并与大鼠源肺孢子虫的相应序列进行比较分析。方法用地塞米松免疫抑制法诱导长爪沙鼠和新西兰白兔感染肺孢子虫;制作肺印片进行瑞-姬氏复合染色,通过镜检初步了解感... 目的测定长爪沙鼠及新西兰白兔源肺孢子虫的ITS1-5.8S rDNA-ITS2序列,并与大鼠源肺孢子虫的相应序列进行比较分析。方法用地塞米松免疫抑制法诱导长爪沙鼠和新西兰白兔感染肺孢子虫;制作肺印片进行瑞-姬氏复合染色,通过镜检初步了解感染情况;提取肺孢子虫总DNA,设计合成引物进行PCR扩增;纯化扩增产物后克隆测序;与登录Gen-Bank的大鼠源肺孢子虫相关序列进行比较分析。结果长爪沙鼠源肺孢子虫的ITS1、5.8S rDNA和ITS2基因序列长分别为158、157和172bp,新西兰白兔源肺孢子虫的相应序列分别为129、158和178bp。结论本实验测得的长爪沙鼠及新西兰白兔源肺孢子虫的ITS1-5.8S rDNA-ITS2序列以往未曾报道,此结果为肺孢子虫的遗传学研究提供了新的资料。 展开更多
关键词 肺孢子虫 内转录间隔区(ITS) 5.8S核糖体RNA基因(5.8S rdna)
下载PDF
基于DNA条形码(ITS2)的中药材防风与其混伪品的鉴定 被引量:4
17
作者 林好 钱洁颖 +3 位作者 李斯璐 欧辉鸿 夏海珊 刘镛 《中国当代医药》 2016年第15期4-7,共4页
目的通过ITS2序列分析,对防风及其易混伪品进行鉴定,确保用药安全。方法从Gen Bank数据库下载中药材防风与其混伪品的DNA条形码ITS2序列,利用MEGA 6.06软件进行比对分析,计算GC含量及变异位点、种内、种间遗传距离,并构建NJ系统发育树,... 目的通过ITS2序列分析,对防风及其易混伪品进行鉴定,确保用药安全。方法从Gen Bank数据库下载中药材防风与其混伪品的DNA条形码ITS2序列,利用MEGA 6.06软件进行比对分析,计算GC含量及变异位点、种内、种间遗传距离,并构建NJ系统发育树,应用ITS2数据库网站预测其ITS2二级结构。结果序列分析与遗传距离结果显示,防风与其混伪品存在明显差异,基于ITS2序列的NJ树及其ITS2二级结构均可以将防风与其混伪品进行区分。结论 ITS2能够准确鉴定防风及其易混伪品,可用于中药材的快速鉴别。 展开更多
关键词 防风 dna条形码 混伪品 ITS2 分子鉴定
下载PDF
不对称荧光PCR扩增白念珠菌ITS-2基因单链DNA实验 被引量:1
18
作者 王敬华 虞培娟 +4 位作者 葛平 徐蓉 陈蓉 刘学杰 王华梁 《检验医学》 CAS 2017年第3期210-213,共4页
目的比较在限制性引物不同稀释比例条件下,不对称荧光聚合酶链反应(PCR)扩增白念珠菌5.8S rDNA与28S rDNA间内转录间区2(ITS-2)基因的单链DNA(ssDNA)的实际效果,探讨其体系优化方法。方法以常规PCR为对照,将20μmol/L的正向引物(P1)按... 目的比较在限制性引物不同稀释比例条件下,不对称荧光聚合酶链反应(PCR)扩增白念珠菌5.8S rDNA与28S rDNA间内转录间区2(ITS-2)基因的单链DNA(ssDNA)的实际效果,探讨其体系优化方法。方法以常规PCR为对照,将20μmol/L的正向引物(P1)按照一定比例预稀释后,分别与20μmol/L的荧光标记反向引物(P2')组成含不同P1水平的引物对,采用不对称荧光PCR扩增真菌ITS-2,并对PCR产物进行电泳和测序分析,比较各实验组扩增ssDNA的效果。结果不对称荧光PCR成功扩增出白念珠菌ITS-2基因的ssDNA,随着限制性引物水平的降低,ITS-2基因的双链DNA(dsDNA)条带逐渐变淡,而ssDNA条带逐渐变亮;在限制性引物稀释比例达到1∶90~1∶100时,ds DNA条带已经模糊不清,而ssDNA条带则达到最亮。提示在此扩增体系条件下,ssDNA拷贝数最多,为不对称荧光PCR扩增白念珠菌ITS-2基因ssDNA的最佳扩增条件。PCR产物测序也表明,dsDNA上方的条带为ITS-2基因的ssDNA。结论通过优化限制性引物水平,不对称荧光PCR可以高效地扩增白念珠菌ITS-2基因的ssDNA。 展开更多
关键词 不对称荧光聚合酶链反应 白念珠菌 ITS-2基因 单链dna
下载PDF
Complete nuclear ribosomal DNA sequence amplification and molecular analyses of Bangia (Bangiales, Rhodophyta) from China 被引量:2
19
作者 徐佳杰 姜波 +4 位作者 柴三明 何渊 朱建一 沈宗根 沈颂东 《Chinese Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2016年第5期1044-1053,共10页
Filamentous Bangia,which are distributed extensively throughout the world,have simple and similar morphological characteristics.Scientists can classify these organisms using molecular markers in combination with morph... Filamentous Bangia,which are distributed extensively throughout the world,have simple and similar morphological characteristics.Scientists can classify these organisms using molecular markers in combination with morphology.We successfully sequenced the complete nuclear ribosomal DNA.approximately 13 kb in length,from a marine Bangia population.We further analyzed the small subunit ribosomal DNA gene(nrSSU) and the internal transcribed spacer(ITS) sequence regions along with nine other marine,and two freshwater Bangia samples from China.Pairwise distances of the nrSSU and 5.8S ribosomal DNA gene sequences show the marine samples grouping together with low divergences(0-0.003;0-0.006,respectively) from each other,but high divergences(0.123-0.126;0.198,respectively) from freshwater samples.An exception is the marine sample collected from Weihai,which shows high divergence from both other marine samples(0.063-0.065;0.129,respectively) and the freshwater samples(0.097;0.120,respectively).A maximum likelihood phylogenetic tree based on a combined SSU-ITS dataset with maximum likelihood method shows the samples divided into three clades,with the two marine sample clades containing Bangia spp.from North America,Europe,Asia,and Australia;and one freshwater clade,containing Bangia atropurpurea from North America and China. 展开更多
关键词 BANGIA molecular analysis small subunit ribosomal dna gene(nrSSU) internal transcribed spacer(ITS) ribosomal dna
下载PDF
ITS2序列作为青风藤DNA条形码的研究
20
作者 周池 饶力群 杨华 《湖南农业科学》 2016年第5期1-4,共4页
采用DNA试剂盒法提取采自不同地区的青风藤及其类似植物的基因组DNA,设计通用ITS2引物进行PCR扩增和测序,运用生物信息学软件对序列进行分析,从而对青风藤及其类似植物进行分子鉴定。结果表明:产地为陕西、贵州、湖北的青风藤样品序列... 采用DNA试剂盒法提取采自不同地区的青风藤及其类似植物的基因组DNA,设计通用ITS2引物进行PCR扩增和测序,运用生物信息学软件对序列进行分析,从而对青风藤及其类似植物进行分子鉴定。结果表明:产地为陕西、贵州、湖北的青风藤样品序列长度分别为380~437、429~436、434~438 bp,GC含量在54.2%~55.7%,平均GC含量约为55%。青风藤及其类似植物的ITS2序列存在较大差异,且平均K2P遗传距离明显大于青风藤的种内平均K2P遗传距离。这说明内转录间隔区2(ITS2)作为DNA条形码可准确地鉴别青风藤与其他类似植物,为中药材的鉴别提供了新途径。 展开更多
关键词 青风藤 内转录间隔区2(ITS2) dna条形码 中药材 鉴别
下载PDF
上一页 1 2 10 下一页 到第
使用帮助 返回顶部