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云南蚕区家蚕微孢子虫遗传多样性分析
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作者 张永红 苏振国 +2 位作者 罗家福 李春峰 敖宝林 《生物技术进展》 2024年第4期631-639,共9页
家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)是蚕业生产上一种重要病害——微粒子病的病原体。探讨家蚕微孢子虫种内的遗传多样性,可为云南蚕区家蚕微粒子病的防控提供参考依据。从云南省不同养蚕地区收集了感染微孢子虫的病蚕样品,分离纯化家蚕微... 家蚕微孢子虫(Nosema bombycis)是蚕业生产上一种重要病害——微粒子病的病原体。探讨家蚕微孢子虫种内的遗传多样性,可为云南蚕区家蚕微粒子病的防控提供参考依据。从云南省不同养蚕地区收集了感染微孢子虫的病蚕样品,分离纯化家蚕微孢子虫并提取基因组,克隆SSU rDNA(small subunit ribosomal DNA)和ITS(internal transcribed spacer)序列并进行生物信息学分析。结果发现,云南蚕区Nosema bombycis分离株SSU rDNA序列同源性高达99%以上,遗传距离小于0.006,它们在长度和多个位点存在差异,呈现不同程度的多态性;ITS遗传差异较为显著,序列中存在多碱基的插入或缺失、单碱基的转换和颠换。基于SSU rDNA和rDNA-ITS序列构建系统发生树,结果显示,云南蚕区家蚕微孢子虫分离株系间存在遗传分化,种群间亲缘关系与地理位置无直接联系。研究结果丰富了云南蚕区家蚕微孢子虫的种内遗传多样性。 展开更多
关键词 家蚕微孢子虫 遗传多样性 核糖体小亚基 转录间隔区
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Taxonomy and phylogeny of the section Chaetoceros(Chaetocerotaceae,Bacillariophyta),with description of two new species
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作者 Xudan LU Mengyi ZHAI +1 位作者 Nina LUNDHOLM Yang LI 《Journal of Oceanology and Limnology》 SCIE CAS CSCD 2024年第4期1286-1311,共26页
Chaetoceros Ehrenberg is one of the most diverse genera of planktonic diatoms.The species in section Chaetoceros are characterized by cells and setae having numerous chloroplasts and being widely distributed.However,t... Chaetoceros Ehrenberg is one of the most diverse genera of planktonic diatoms.The species in section Chaetoceros are characterized by cells and setae having numerous chloroplasts and being widely distributed.However,the delimitations of some species are problematic because of limited morphological information in the classical descriptions.Monoclonal strains of the section Chaetoceros were established,morphological features were studied using light and electron microscopy,and the hypervariable D 1-D 3 region of the nuclear ribosomal large subunit gene was sequenced to address phylogenetic relationships.Fifteen species belonging to the section Chaetoceros were recorded,including two new species,C.hainanensis sp.nov.and C.tridiscus sp.nov.Chaetoceros hainanensis was characterized by straight chains,narrowly lanceolate to hexagonal apertures,sibling setae diverging in nearly right angles,stipule-shaped spines on terminal setae and arrowhead-shaped spines on intercalary setae.C.tridiscus had short straight chains,narrowly lanceolate apertures,arrowhead-shaped spines and circular poroids arranged in a grid pattern on terminal and intercalary setae.The phylogenetic analyses revealed six groups formed by 19 species within the section Chaetoceros,which was found to be monophyletic.The subdivision of the section is still not well understood.The morphological characters within each group varied considerably and molecular information on more species are needed to enrich the phylogenetic profiling. 展开更多
关键词 morphology large subunit ribosomal RNA encoding gene(LSU) section Chaetoceros Chaetoceros hainanensis Chaetoceros tridiscus
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Genetic diversity of the S-type small subunit ribosomal RNA gene of Plasmodium knowlesi isolates from Sabah,Malaysian Borneo and Peninsular Malaysia
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作者 Eric Tzyy Jiann Chong Joveen Wan Fen Neoh +3 位作者 Tiek Ying Lau Kek Heng Chua Yvonne Ai-Lian Lim Ping-Chin Lee 《Asian Pacific Journal of Tropical Medicine》 SCIE CAS 2024年第2期84-90,共7页
Objective:To determine the genetic diversity of Plasmodium(P.)knowlesi isolates from Sabah,Malaysian Borneo and Peninsular Malaysia,targeting the S-type SSU rRNA gene and including aspects of natural selection and hap... Objective:To determine the genetic diversity of Plasmodium(P.)knowlesi isolates from Sabah,Malaysian Borneo and Peninsular Malaysia,targeting the S-type SSU rRNA gene and including aspects of natural selection and haplotype.Methods:Thirty-nine blood samples infected with P.knowlesi were collected in Sabah,Malaysian Borneo and Peninsular Malaysia.The S-type SSU rRNA gene was amplified using polymerase chain reaction,cloned into a vector,and sequenced.The natural selection and haplotype of the S-type SSU rRNA gene sequences were determined using DnaSP v6 and illustrated using NETWORK v10.This study's 39 S-type SSU rRNA sequences and eight sequences from the Genbank database were subjected to phylogenetic analysis using MEGA 11.Results:Overall,the phylogenetic analysis showed no evidence of a geographical cluster of P.knowlesi isolates from different areas in Malaysia based on the S-type SSU rRNA gene sequences.The S-type SSU rRNA gene sequences were relatively conserved and with a purifying effect.Haplotype sharing of the S-type SSU rRNA gene was observed between the P.knowlesi isolates in Sabah,Malaysian Borneo,but not between Sabah,Malaysian Borneo and Peninsular Malaysia.Conclusions:This study suggests that the S-type SSU rRNA gene of P.knowlesi isolates in Sabah,Malaysian Borneo,and Peninsular Malaysia has fewer polymorphic sites,representing the conservation of the gene.These features make the S-type SSU rRNA gene suitable for comparative studies,such as determining the evolutionary relationships and common ancestry among P.knowlesi species. 展开更多
关键词 Plasmodium knowlesi S-type small subunit ribosomal RNA Genetic diversity Natural selection HAPLOTYPE
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Molecular mechanisms of diabetic coronary dysfunction due to large conductance Ca2+-activated K+ channel impairment 被引量:22
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作者 WANG Ru-xing SHI Hai-feng +10 位作者 CHAI Qiang WU Ying SUN Wei JI Yuan YAO Yong LI Ku-lin ZHANG Chang-ying ZHENG Jie GUO Su-xia LI Xiao-rong LU Tong 《Chinese Medical Journal》 SCIE CAS CSCD 2012年第14期2548-2555,共8页
Background Diabetes mellitus is associated with coronary dysfunction, contributing to a 2- to 4-fold increase in the risk of coronary heart diseases. The mechanisms by which diabetes induces vasculopathy involve endot... Background Diabetes mellitus is associated with coronary dysfunction, contributing to a 2- to 4-fold increase in the risk of coronary heart diseases. The mechanisms by which diabetes induces vasculopathy involve endothelial-dependent and -independent vascular dysfunction in both type 1 and type 2 diabetes mellitus. The purpose of this study is to determine the role of vascular large conductance Ca2+-activated K+ (BK) channel activities in coronary dysfunction in streptozotocin-induced diabetic rats. Methods Using videomicroscopy, immunoblotting, fluorescent assay and patch clamp techniques, we investigated the coronary BK channel activities and BK channel-mediated coronary vasoreactivity in streptozotocin-induced diabetic rats. Results BK currents (defined as the iberiotoxin-sensitive K+ component) contribute (65+4)% of the total K+currents in freshly isolated coronary smooth muscle cells and 〉50% of the contraction of the inner diameter of coronary arteries from normal rats. However, BK current density is remarkably reduced in coronary smooth muscle cells of streptozotocin-induced diabetic rats, leading to an increase in coronary artery tension. BK channel activity in response to free Ca2+ iS impaired in diabetic rats. Moreover, cytoplasmic application of DHS-1 (a specific BK channel i~ subunit activator) robustly enhanced the open probability of BK channels in coronary smooth muscle cells of normal rats. In diabetic rats, the DHS-1 effect was diminished in the presence of 200 nmol/L Ca2+ and was significantly attenuated in the presence of high free calcium concentration, i.e., 1 μmol/L Ca2+. Immunoblotting experiments confirmed that there was a 2-fold decrease in BK-β1 protein expression in diabetic vessels, without alterinq the BK channel a-subunit expression.Although the cytosolic Ca2+ concentration of coronary arterial smooth muscle cells was increased from (103±23) nmol/L (n=5) of control rats to (193±22) nmol/L (n=6, P 〈0.05) of STZ-induced diabetic rats, reduced BK-β1 expression made these channels less sensitive to intracellular Ca2+, which in turn led to enhanced smooth muscle contraction. Conclusions Our results indicated that BK channels are the key determinant of coronary arterial tone. Impaired BK channel function in diabetes mellitus is associated with down-regulation of BK-β1 expression and reduction of the β1-mediated BK channel activation in diabetic vessels. 展开更多
关键词 large conductance Ca 2+ -activated K+ channel coronary artery smooth muscle cell diabetes mellitus β1-subunit patch clamp
原文传递
杏仁核点燃癫痫大鼠模型中BKCa通道β4亚基动态变化
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作者 李巷 王亚如 +5 位作者 李润琪 何桂英 王成雅 汤博 董子康 杨春水 《神经损伤与功能重建》 2024年第2期69-72,85,共5页
目的:观察杏仁核点燃癫痫大鼠BKCa通道β4亚基动态演变情况。方法:建立杏仁核点燃癫痫大鼠模型,随机分对照组、点燃24 h组、30 d组、60 d组。采用尼氏染色观察各组神经元损伤情况;采用实时定量PCR、蛋白质印迹、免疫组织化学检测发作后2... 目的:观察杏仁核点燃癫痫大鼠BKCa通道β4亚基动态演变情况。方法:建立杏仁核点燃癫痫大鼠模型,随机分对照组、点燃24 h组、30 d组、60 d组。采用尼氏染色观察各组神经元损伤情况;采用实时定量PCR、蛋白质印迹、免疫组织化学检测发作后24 h、30 d、60 d大鼠脑内BKCa通道β4亚基表达的动态改变情况。结果:相比对照组,杏仁核点燃癫痫模型大鼠皮质及海马CA1、CA3区神经元均有明显缺失,且随着点燃时间增加,神经元计数呈下降趋势,各组差异有统计学意义(P<0.05)。点燃后24 h,皮质及海马BKCa通道β4亚基表达下降,且随着点燃时间增加呈下降趋势,差异有统计学意义(P<0.05)。结论:杏仁核点燃可导致脑内神经元持续损伤,同时伴随相应部位BKCa通道β4亚基表达下降,推测β4亚基可能参与了杏仁核点燃癫痫模型发生发展的过程。 展开更多
关键词 杏仁核点燃癫痫 大通道钙激活钾通道 β4亚基
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瓶囊碘泡虫的重描述及其与洪湖碘泡虫分子标记的比较
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作者 张潇艺 丁鹏 +3 位作者 张城豪 孙荣华 杨承忠 柳阳 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期180-190,共11页
为了完善瓶囊碘泡虫的分类学特征及厘清其与洪湖碘泡虫的分类关系,实验采用形态学、组织学和分子生物学方法对瓶囊碘泡虫进行了重描述,并与洪湖碘泡虫的分子标记进行了系统比较。结果显示,瓶囊碘泡虫寄生于异育银鲫的鳃,形成乳白色的圆... 为了完善瓶囊碘泡虫的分类学特征及厘清其与洪湖碘泡虫的分类关系,实验采用形态学、组织学和分子生物学方法对瓶囊碘泡虫进行了重描述,并与洪湖碘泡虫的分子标记进行了系统比较。结果显示,瓶囊碘泡虫寄生于异育银鲫的鳃,形成乳白色的圆形或椭圆形孢囊,直径为1.2~1.4 mm。成熟孢子壳面观呈梨形,前端较尖,后端钝圆,孢子长17.3~19.6μm,孢子宽7.4~9.9μm。两个极囊呈瓶状,大小不等。大极囊长6.4~9.7μm,大极囊宽2.1~3.3μm;小极囊长5.3~8.9μm,小极囊宽2.0~3.3μm。极丝圈数为8~11圈。组织学分析显示,瓶囊碘泡虫寄生于鳃小片间的上皮组织。BLAST分析显示,本研究获得的瓶囊碘泡虫的小亚基核糖体DNA(SSU rDNA)序列与GenBank中瓶囊碘泡虫序列的相似性为99.5%~99.8%(KC425223~KC425225、MH329620、JQ690361、JQ690373、KJ725082、MN227351、DQ339482)。系统发育分析表明,瓶囊碘泡虫与洪湖碘泡虫形成姐妹支。瓶囊碘泡虫与洪湖碘泡虫分子标记序列的比较结果显示,这两种碘泡虫的序列相似性为98.2%~98.8%,遗传距离为0.014~0.018,存在27个碱基差异。SSU rRNA二级结构分析显示,瓶囊碘泡虫和洪湖碘泡虫同一物种不同群体间的二级结构一致,两个物种间的二级结构存在明显差异,表明SSU rRNA二级结构可以作为鉴别瓶囊碘泡虫和洪湖碘泡虫的分子特征。本研究完善了瓶囊碘泡虫在异育银鲫鳃部的详细寄生部位,提出SSU rRNA二级结构可以作为有效鉴别瓶囊碘泡虫和洪湖碘泡虫的分子标记。 展开更多
关键词 粘孢子虫 小亚基核糖体DNA(SSU rDNA) 二级结构 系统发育分析
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玉溪霍尔多巴吉鹅感染贝氏隐孢子虫的分子鉴定
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作者 陈俊蓉 谢昕言 +2 位作者 贺君君 杨建发 王萍 《中国兽医杂志》 CAS 北大核心 2024年第3期54-57,共4页
为了对云南省玉溪市某养殖场的霍尔多巴吉鹅进行隐孢子虫检测,本试验采集疑似感染隐孢子虫的霍尔多巴吉鹅的粪便样品,利用饱和盐水漂浮法进行镜检,并结合分子生物学鉴定方法,提取粪便样品DNA,采用巢氏PCR扩增隐孢子虫核糖体小亚基RNA(SS... 为了对云南省玉溪市某养殖场的霍尔多巴吉鹅进行隐孢子虫检测,本试验采集疑似感染隐孢子虫的霍尔多巴吉鹅的粪便样品,利用饱和盐水漂浮法进行镜检,并结合分子生物学鉴定方法,提取粪便样品DNA,采用巢氏PCR扩增隐孢子虫核糖体小亚基RNA(SSU rRNA)基因,测序后通过NCBI进行Blast在线比对,构建系统发育进化树。结果显示,所采集的鹅粪便样品中,隐孢子虫检出率为20.45%(9/44);隐孢子虫SSU rRNA基因的PCR扩增结果显示,该鹅源隐孢子虫与贝氏隐孢子虫同源性达100%;系统进化分析显示,二者位于同一分支。结果表明,该养殖场的霍尔多巴吉鹅存在贝氏隐孢子虫感染。 展开更多
关键词 核糖体小亚基RNA(SSU rRNA) 贝氏隐孢子虫 霍尔多巴吉鹅 分子鉴定
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吴茱萸碱对宫颈癌小鼠移植瘤的抑制机制
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作者 蔡月红 麦燕 钱沁佳 《西北药学杂志》 CAS 2024年第5期77-82,共6页
目的 探究吴茱萸碱(evodiamine,Evo)对宫颈癌小鼠移植瘤的抑制作用及对哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)/p70核糖体蛋白S6激酶(p70 ribosomal protein S6 kinase, p70S6K)通路的影响。方法 取40只BALB/c裸鼠... 目的 探究吴茱萸碱(evodiamine,Evo)对宫颈癌小鼠移植瘤的抑制作用及对哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)/p70核糖体蛋白S6激酶(p70 ribosomal protein S6 kinase, p70S6K)通路的影响。方法 取40只BALB/c裸鼠,随机选取10只设为健康组,剩余30只裸鼠成功建立宫颈癌移植瘤模型,随机分为荷瘤组、Evo组和Evo联合溶血磷脂酸(lysophosphatidic acid,LPA)组,各10只。Evo联合LPA组裸鼠灌胃Evo(18 mg·kg^(-1)),尾静脉注射LPA(0.8μmol·kg^(-1));Evo组裸鼠灌胃Evo(18 mg·kg^(-1)),尾静脉注射等体积生理盐水;健康组、荷瘤组裸鼠灌胃等体积二甲基亚砜(dimethyl sulfoxide,DMSO),尾静脉注射等体积生理盐水。每日1次,连续30 d。测定肿瘤体积;流式细胞仪检测外周血CD4^(+)、CD8^(+)T淋巴细胞占比;Tunel染色检测移植瘤细胞凋亡率;免疫印记法(Western blotting)检测移植瘤组织mTOR、p-mTOR、p70S6K、p-p70S6K蛋白的表达水平。结果 与荷瘤组比较,Evo组干预后第10、20、30天肿瘤体积均减小,CD4^(+)T淋巴细胞占比、CD4^(+)/CD8^(+)值升高,CD8^(+)T淋巴细胞占比、p-mTOR/mTOR值和p-p70S6K/p70S6K值降低(P<0.05);与Evo组比较,Evo联合LPA组干预后第10、20、30天肿瘤体积均增大,CD4^(+)T淋巴细胞占比、CD4^(+)/CD8^(+)值降低,CD8^(+)T淋巴细胞占比、p-mTOR/mTOR值和p-p70S6K/p70S6K值升高(P<0.05)。结论 Evo可抑制宫颈癌移植瘤生长、促进宫颈癌细胞凋亡、增强机体免疫功能,其作用机制可能与抑制mTOR/p70S6K信号通路有关。 展开更多
关键词 吴茱萸碱 宫颈癌 哺乳动物雷帕霉素靶蛋白 核糖体40S小亚基S6K蛋白激酶 信号通路
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XLαs通过影响线粒体功能调控颅骨发育的研究
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作者 左祎怡 何青 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期587-592,共6页
目的:本研究旨在探究超大型刺激性G蛋白α亚单位(extra-large stimulatory G protein alpha subunit, XLαs)在小鼠颅骨发育和成骨分化中的功能及分子机制。方法:通过构建XLαs第一外显子敲除的小鼠模型,运用阿尔新蓝茜素红染色技术分... 目的:本研究旨在探究超大型刺激性G蛋白α亚单位(extra-large stimulatory G protein alpha subunit, XLαs)在小鼠颅骨发育和成骨分化中的功能及分子机制。方法:通过构建XLαs第一外显子敲除的小鼠模型,运用阿尔新蓝茜素红染色技术分析颅骨表型变化。从小鼠颅骨中分离原代颅骨成骨细胞,进行体外培养并诱导成骨分化,同时通过实时荧光定量聚合酶链反应和RNA测序技术对基因表达及其功能进行分析。结果:实验结果显示,XLαs敲除小鼠颅缝宽度增加(P<0.05),颅骨未矿化区域明显增多(P<0.001),且成骨分化能力受抑制(P<0.01)。RNA测序进一步揭示XLαs缺失影响了线粒体功能。结论:本研究证实了XLαs在调节颅骨发育和成骨分化中的关键作用,特别是通过影响线粒体功能来发挥其调控效应。这一发现为针对GNAS突变导致的颅骨发育异常提供了新的治疗策略,具有潜在的临床应用价值。 展开更多
关键词 超大型刺激性G蛋白α亚单位 颅骨发育 矿化 线粒体
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乙型肝炎病毒大表面蛋白诱导内质网应激调控p27 IRES翻译活性的机制研究
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作者 郭亦笑 邵杰 +2 位作者 尉丁 陈志南 边惠洁 《空军军医大学学报》 CAS 2024年第7期732-739,共8页
目的探讨在乙型肝炎病毒大表面蛋白(LHB)诱导的内质网应激条件下,抑癌基因p275′UTR内部核糖体进入位点(IRES)的活性变化及其调控机制。方法构建双荧光素酶报告质粒,用双荧光素酶报告基因实验检测p275′UTR中IRES的活性;利用qRT-PCR和We... 目的探讨在乙型肝炎病毒大表面蛋白(LHB)诱导的内质网应激条件下,抑癌基因p275′UTR内部核糖体进入位点(IRES)的活性变化及其调控机制。方法构建双荧光素酶报告质粒,用双荧光素酶报告基因实验检测p275′UTR中IRES的活性;利用qRT-PCR和Western blotting检测LHB诱导的未折叠蛋白反应相关分子水平;RNA下拉、质谱技术和RNA免疫沉淀筛选并确认潜在的与p275′UTR结合的相关蛋白;siRNA转染建立PCBP2和ANXA2敲低细胞模型,用双荧光素酶报告基因检测在敲低PCBP2和ANXA2后p27 IRES翻译活性的变化。结果成功构建了检测p27 IRES活性的双荧光素酶报告质粒。LHB可以诱导内质网应激,同时显著提高p27的IRES翻译活性(P<0.01)。LHB过表达激活了PERK通路并提高了eIF2α的磷酸化水平,特异性PERK通路抑制剂GSK2606414使RERK和eIF2α的磷酸化水平降低,从而引起p275′UTR的IRES翻译活性显著降低(P<0.01,P<0.05)。同时,磷酸酶抑制剂Sal003能显著增加eIF2α磷酸化水平,使p27 IRES活性进一步增强(P<0.01,P<0.05)。最后,我们发现PCBP2和ANXA2作为潜在的反式作用因子可增强p27 IRES活性。结论LHB诱导的内质网应激通过eIF2α磷酸化增强p27 IRES翻译活性。反式作用因子PCBP2和ANXA2正向调控其IRES翻译活性。 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒大表面蛋白 p275′UTR 内质网应激 内部核糖体进入位点 反式作用因子
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大跨度双曲面钢网架累积外扩同步顶升施工技术
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作者 张文格 梁生武 +3 位作者 杜海波 贾磊 马水生 龚睿 《铁路技术创新》 2024年第4期159-167,共9页
鄱阳站屋盖钢网架为正放四角锥形式,主体形态两侧平缓,中间微起,形成双向双曲面。针对这种大跨度双曲面焊接球式屋面钢网架在拼装及就位施工中所涉及的问题,如高空焊接拼装难度大、区域交叉施工组织难和安全管理要求高等,通过借鉴网架... 鄱阳站屋盖钢网架为正放四角锥形式,主体形态两侧平缓,中间微起,形成双向双曲面。针对这种大跨度双曲面焊接球式屋面钢网架在拼装及就位施工中所涉及的问题,如高空焊接拼装难度大、区域交叉施工组织难和安全管理要求高等,通过借鉴网架整体同步顶升施工技术,提出了累积外扩整体同步顶升施工方法,由候车厅中间区域向两侧边拼边顶升直至网架全部拼装完成,最后同步整体顶升至预定高度,累计顶升21.59 m。利用该工艺将网架就位,保证施工质量及安全,可为同类型异形曲面钢网架工程施工提供参考。 展开更多
关键词 大跨度双曲钢网架 模拟分析 分单元 累积外扩 同步顶升
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胃癌组织RRBP1、LAMB3的mRNA表达水平及其与患者临床病理特征、预后的关系
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作者 张泽天 杨婕琳 +1 位作者 吴娜 王锐 《广西医学》 CAS 2023年第21期2561-2565,共5页
目的探讨胃癌组织内质网核糖体结合蛋白1(RRBP1)、层粘连蛋白亚基β3(LAMB3)的mRNA表达水平及其与患者临床病理特征、预后的关系。方法收集373例胃癌患者的胃癌组织标本和癌旁组织标本。采用实时荧光定量PCR检测胃癌组织和癌旁组织中RR... 目的探讨胃癌组织内质网核糖体结合蛋白1(RRBP1)、层粘连蛋白亚基β3(LAMB3)的mRNA表达水平及其与患者临床病理特征、预后的关系。方法收集373例胃癌患者的胃癌组织标本和癌旁组织标本。采用实时荧光定量PCR检测胃癌组织和癌旁组织中RRBP1和LAMB3的mRNA表达水平,分析RRBP1和LAMB3的mRNA表达水平与胃癌患者临床病理特征的关系,绘制生存曲线分析胃癌组织中RRBP1和LAMB3的mRNA表达水平与患者预后的关系,采用COX回归模型分析胃癌患者预后的影响因素。结果与癌旁组织相比,胃癌组织中RRBP1和LAMB3的mRNA表达水平升高(P<0.05)。肿瘤直径≥4 cm、分化程度为低或未分化、浸润深度为T_(3)~T_(4)、发生淋巴结转移及远处转移的胃癌患者RRBP1 mRNA表达水平更高(P<0.05);分化程度为低或未分化、浸润深度为T_(3)~T_(4)、发生淋巴结转移及远处转移的胃癌患者LAMB3 mRNA表达水平更高(P<0.05)。RRBP1高表达组和LAMB3高表达组的3年生存率分别低于RRBP1低表达组和LAMB3低表达组(P<0.05)。COX回归分析结果显示,RRBP1 mRNA高表达、LAMB3 mRNA高表达、低或未分化程度、T_(3)~T_(4)浸润深度和发生淋巴结转移均是影响胃癌患者预后的独立危险因素(P<0.05)。结论RRBP1和LAMB3 mRNA在胃癌组织中高表达,且与患者临床病理特征和预后密切相关。 展开更多
关键词 胃癌 内质网核糖体结合蛋白1 层粘连蛋白亚基β3 临床病理特征 预后
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非洲鸵鸟源芽囊原虫基因型鉴定及分析 被引量:1
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作者 陈俊蓉 谢昕言 +6 位作者 徐翠蓉 衡昭君 徐聪 王俊祥 杨建发 贺君君 吴志蕾 《动物医学进展》 北大核心 2023年第12期42-46,共5页
芽囊原虫是一种呈世界性分布的常见机会致病性原虫,为鉴定云南某非洲鸵鸟养殖专业合作社芽囊原虫感染情况及其基因型,对采集的90份鸵鸟粪便样品,通过套式PCR扩增芽囊原虫SSU rRNA基因。结果发现,62份样本为阳性,芽囊原虫感染率为68.89%(... 芽囊原虫是一种呈世界性分布的常见机会致病性原虫,为鉴定云南某非洲鸵鸟养殖专业合作社芽囊原虫感染情况及其基因型,对采集的90份鸵鸟粪便样品,通过套式PCR扩增芽囊原虫SSU rRNA基因。结果发现,62份样本为阳性,芽囊原虫感染率为68.89%(62/90);其中,90日龄感染率最高,为86.36%(19/22),60日龄感染率最低,为6.25%(20/32),但不同日龄鸵鸟芽囊原虫的感染率差异不显著(P>0.05,χ^(2)=6.67,df=3);基于SSU rRNA基因的序列分析,鉴定出ST5、ST7及ST20共3种芽囊原虫亚型,ST5为优势亚型。其中,ST5、ST7属人兽共患亚型。研究结果丰富了云南地区养殖非洲鸵鸟感染芽囊原虫的情况背景及基因分型的数据,为芽囊原虫的防控工作提供了参考。 展开更多
关键词 非洲鸵鸟 芽囊原虫 基因分型 核糖体小亚基
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粗粒化模拟研究核糖体30S小亚基的组装动力学 被引量:1
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作者 刘欣 张志勇 《中国科学技术大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期58-65,67,共9页
核糖体是一种生物大分子复合物,它负责蛋白质的生物合成。在大肠杆菌(E.coli)中,完整的核糖体由30S小亚基和50S大亚基组成。大约半个世纪以来,30S小亚基一直是研究核糖体体外组装的关键模型系统,并提出了其组装图谱。然而,该RNA-蛋白质... 核糖体是一种生物大分子复合物,它负责蛋白质的生物合成。在大肠杆菌(E.coli)中,完整的核糖体由30S小亚基和50S大亚基组成。大约半个世纪以来,30S小亚基一直是研究核糖体体外组装的关键模型系统,并提出了其组装图谱。然而,该RNA-蛋白质复合物动态组装过程中很多的结构细节仍然未知。本文按照30S小亚基组装图谱的顺序进行了一系列粗粒化模拟,以研究其组装过程中的构象动力学。我们发现,裸露的16S rRNA三级结构非常不稳定,即使与早期组装蛋白结合后仍然会出现类似情况。中期组装蛋白可以显著限制16S rRNA的柔性,并使后者接近于天然结构。晚期组装蛋白的最终结合使16S rRNA完全获得其功能运动。特别地,我们发现蛋白S9和S3对30S小亚基的组装可能比其他核糖体蛋白有更重要的贡献。如果已知组装图谱,我们的粗粒化模拟策略可以广泛应用于研究生物大分子复合物的组装动力学。 展开更多
关键词 生物大分子复合物 组装 核糖体 30S亚基 粗粒化模拟 主成分分析
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凡纳滨对虾血蓝蛋白大亚基启动子的克隆及鉴定
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作者 郭丽钒 黄贺楠 +3 位作者 赵琼君 张涵 杨昊 杨培奎 《韩山师范学院学报》 2023年第6期40-48,共9页
为了鉴定凡纳滨对虾血蓝蛋白大亚基基因启动子的核心区域和转录因子,探究该基因的转录调控机制.该研究首先通过PCR扩增凡纳滨对虾血蓝蛋白大亚基基因候选启动序列1969 bp并对其进行测序和生物信息学分析;其次,构建5个不同长度的缺失片... 为了鉴定凡纳滨对虾血蓝蛋白大亚基基因启动子的核心区域和转录因子,探究该基因的转录调控机制.该研究首先通过PCR扩增凡纳滨对虾血蓝蛋白大亚基基因候选启动序列1969 bp并对其进行测序和生物信息学分析;其次,构建5个不同长度的缺失片段双荧光素酶报告载体,转染至293T细胞,利用双荧光素酶报告分析鉴定其核心区域.进一步通过生物信息学预测全长序列的转录起始位点和CpG岛,并对核心启动子区域的转录因子结合位点进行预测.结果表明,扩增得到的凡纳滨对虾蛋白大亚基启动子序列(HLP2)包含启动子元件;利用双荧光素酶报告载体分析发现HLP2的核心启动子区域(+87/+300 bp)位于起始密码子下游的外显子中,生物信息学分析发现该区域包括多种转录因子结合位点.实验结果为进一步探究对虾血蓝蛋白大亚基基因的转录调控机制提供理论依据. 展开更多
关键词 凡纳滨对虾 血蓝蛋白大亚基 启动子 克隆
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巢式PCR法在疟疾检测及虫种鉴别中的应用 被引量:20
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作者 师永霞 黄吉城 +5 位作者 苏锦坤 洪烨 李小波 郑夔 幸芦琴 郭波旋 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期263-266,共4页
根据疟原虫小亚单位核糖体核糖核酸(SSU rRNA)基因序列设计疟原虫通用型和种特异性的引物,对60份血样进行巢式PCR检测及虫种鉴定,并与血样的吉氏染色镜检结果进行比较。巢式PCR检出40份疟原虫阳性血样,其中22份为恶性疟原虫(Plasmodium ... 根据疟原虫小亚单位核糖体核糖核酸(SSU rRNA)基因序列设计疟原虫通用型和种特异性的引物,对60份血样进行巢式PCR检测及虫种鉴定,并与血样的吉氏染色镜检结果进行比较。巢式PCR检出40份疟原虫阳性血样,其中22份为恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)阳性、13份为间日疟原虫(P.vivax)阳性、3份为恶性疟原虫和间日疟原虫混合感染、1份为卵形疟原虫阳性(P.ovale)、1份未能分型。与镜检结果一致的血样为46份,占76.7%(46/60),其中恶性疟原虫阳性18份、间日疟原虫阳性11份和阴性17份。将两种检测结果不一致的血样进行扩增片段序列测定和实时荧光PCR分析,检测结果均与巢式PCR结果一致。卵形疟原虫阳性血样扩增片段的序列分析结果显示,该序列与卵形疟原虫SSU rRNA基因序列(GenBank登录号DQ845247)的对应部分同源性为100%,证实该病例为输入性卵形疟原虫感染病例。 展开更多
关键词 疟疾 巢式PCR 小亚单位核糖体核糖核酸
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28S rDNA PCR-RFLP分析在侧耳属系统发育研究中的应用 被引量:31
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作者 马富英 罗信昌 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2002年第3期201-205,共5页
对侧耳属 18个种 5 2个菌株及 3个其它属的菌株的 2 8SrDNA 5’端进行PCR扩增 ,得到长度约为 1.4 6kb的片段。对该片段分别用 7种限制性内切酶AluⅠ、BamHⅠ、HaeⅢ、HhaⅠ、HinfⅠ、MspⅠ、TaqⅠ酶切 ,结果表明 ,MspⅠ酶切片段多态性最... 对侧耳属 18个种 5 2个菌株及 3个其它属的菌株的 2 8SrDNA 5’端进行PCR扩增 ,得到长度约为 1.4 6kb的片段。对该片段分别用 7种限制性内切酶AluⅠ、BamHⅠ、HaeⅢ、HhaⅠ、HinfⅠ、MspⅠ、TaqⅠ酶切 ,结果表明 ,MspⅠ酶切片段多态性最高 ,AluⅠ对侧耳属无酶切多态性。聚类分析结果表明 ,菌株间的相似系数为 0 .5 6 9~ 1.0 0 0 ,在 92 %相似水平可将侧耳分为 5大类 :Ⅰ .红平菇和桃红侧耳 ;Ⅱ .鲍鱼菇和囊盖侧耳 ;Ⅲ .具核侧耳 ;Ⅳ .金顶侧耳 ;Ⅴ . 展开更多
关键词 28S RDNA PCR-RFLP分析 侧耳属 系统发育 应用 食用菌 大亚基核糖体DNA 聚合酶链式反应 限制性酶切分析
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福建古田红曲生产用红曲霉菌主要种类的鉴别 被引量:10
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作者 李志强 刘颖 +1 位作者 林风 吴丽云 《食品与发酵工业》 CAS CSCD 北大核心 2017年第5期64-69,共6页
以购自中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)的5株红曲霉菌为对照,对福建省微生物研究所红曲霉菌资源库中收藏自福建省古田县的60株红曲霉菌(Monascus sp.)进行分类鉴定研究。首先根据不同菌株在麦芽汁琼脂(Wa)、察氏酵母提取物琼脂(C... 以购自中国工业微生物菌种保藏管理中心(CICC)的5株红曲霉菌为对照,对福建省微生物研究所红曲霉菌资源库中收藏自福建省古田县的60株红曲霉菌(Monascus sp.)进行分类鉴定研究。首先根据不同菌株在麦芽汁琼脂(Wa)、察氏酵母提取物琼脂(CYA)和甘油硝酸盐琼脂(G25N)培养基上的菌落形态特征进行初步分类,进而基于核糖体DNA内转录间隔区(rDNA internal transcribed spacer,rDNA ITS)、核糖体大亚基(28S nuclear ribosomal large subunit rRNA gene,LSU)和核糖体小亚基(18S nuclear ribosomal small subunit r RNA gene,SSU)的基因片段的测序结果,在Gen Bank中通过BLAST进行分子生物学方面的鉴定研究,并用ITS序列构建系统发育树。通过形态特征及3个基因序列的比对,认为所选取的60株古田红曲霉菌分别归属红色红曲霉菌(M.ruber)、丛毛红曲霉菌(M.pilosus)或紫色红曲霉菌(M.purpureus)3个种。 展开更多
关键词 红曲霉菌 ITS LSU SSU 鉴定
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基于核糖体基因分析的中华血吸虫分子种系发生研究 被引量:6
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作者 张广军 邱持平 +3 位作者 邱东川 常正山 秦志辉 夏明仪 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期201-204,共4页
目的 测定中华血吸虫细胞核核糖体基因 r DNA- ITS2和 L SU序列 ,并根据这些序列 ,构建基因树 ,探讨中华血吸虫在裂体属内的系统发生位置。 方法 以 GNT- K法抽提基因组 DNA后 ,用特异引物 ,PCR扩增目的基因。扩增后的 PCR产物经纯... 目的 测定中华血吸虫细胞核核糖体基因 r DNA- ITS2和 L SU序列 ,并根据这些序列 ,构建基因树 ,探讨中华血吸虫在裂体属内的系统发生位置。 方法 以 GNT- K法抽提基因组 DNA后 ,用特异引物 ,PCR扩增目的基因。扩增后的 PCR产物经纯化后克隆于载体质粒 p T- adv中再次扩增后 ,提取并纯化质粒 DNA,并以此作模板 ,使用通用测序引物 M13 (F/ R)于 L icor测序仪上进行测序。检索 Gen Bank,查找曼氏血吸虫相关血吸虫两基因序列 ,将有关血吸虫同一基因排序、比较分析后 ,以毛毕吸虫和杜氏小裂体吸虫作为外群 ,使用 PHYL IP和 MEGA以邻接法和最大简约法绘制系统发生树。 结果 克隆并测定了中华血吸虫的 r DNA - ITS2和 L SU ,毛毕吸虫的r DNA- ITS2序列 ,以及根据这些序列构建系统发生树。 结论 中华血吸虫 ITS2和 L SU基因的系统发生树结果一致 ,均提示中华血吸虫归属于亚洲血吸虫种群 。 展开更多
关键词 中华血吸虫 毛毕吸虫 内部转录间隔子 核糖体大亚基基因 系统发生分析
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基于28S rDNA序列的鞘藻目系统发育研究 被引量:9
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作者 梅洪 刘国祥 胡征宇 《水生生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期492-498,共7页
作者进行了较广泛的样品采集,通过实验分离纯化培养得到多个鞘藻目种类的株系,并采用PCR技术新获得鞘藻目2属8个种类的部分28S rDNA序列,连同GenBank中的另两条序列,分析的物种涵盖了鞘藻目中的每个属。通过比较分析绿藻纲中包括此10条... 作者进行了较广泛的样品采集,通过实验分离纯化培养得到多个鞘藻目种类的株系,并采用PCR技术新获得鞘藻目2属8个种类的部分28S rDNA序列,连同GenBank中的另两条序列,分析的物种涵盖了鞘藻目中的每个属。通过比较分析绿藻纲中包括此10条序列的共36个种类的同一基因序列,并选取Trebouxiophyceae中的椭圆小球藻(Chlorella ellipsoidea)和Fusochloris perforata作外类群,运用多种方法构建分子系统树,包括邻接法(Neighbor-Joining)、最大简约法(Maximum Parsimony)和Bayesian方法。3种方法所得的结果非常相似,在形态上就在整个绿藻中界限分明的鞘藻目从分子水平上再次证明为单系起源的类群;构建的系统发育树还在一定程度上表明毛鞘藻属处于鞘藻目内三个属中较分离的位置,而枝鞘藻属与鞘藻属植物并无明显界限。 展开更多
关键词 鞘藻目 细胞核编码的核糖体大亚基 系统发育 Bayesian方法
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