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Trans-cleaving activity of hepatitis delta virus genomic ribozymes
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作者 于乐成 顾长海 +2 位作者 毛青 李奇芬 王宇明 《Journal of Medical Colleges of PLA(China)》 CAS 2000年第4期237-239,共3页
Objective: To study whether 2 hepatitis delta virus genomic ribozymes(g. Rz) have trans-cleaving activity. Methods: g. Rz74 and g. Rz55 were transcribed from their templates which were synthesized and cloned into plas... Objective: To study whether 2 hepatitis delta virus genomic ribozymes(g. Rz) have trans-cleaving activity. Methods: g. Rz74 and g. Rz55 were transcribed from their templates which were synthesized and cloned into plasmid pGEM-4Z; Homologous substrate RNA was transcribed for pRz277B and labelled withα-32 P-UTP. The trans-cleaving activity was studied by mixing the ribozymes and substrate in appropriate who under certain conditions. Results: The trans-cleaved products were generated after mixing the ribozyme with the substrate for 30 min, and accumulated more for 90 min. Conclusion: Both g. Rz74 and g. Rz55 possess trans-cleaving activity. 展开更多
关键词 hepatitis delta virus ribozymeS genome trans-cleavage in VITRO TRANSCRIPTION
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定点切割甲型肝炎病毒RNA片段的Ribozyme的设计和性质的研究 被引量:5
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作者 金哲元 陆长德 +1 位作者 李光地 祁国荣 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1993年第1期1-6,共6页
Ribozyme是一类具有生物催化功能的RNA,它能定点切割RNA靶分子,从而达到有效地阻断基因表达的目的。本文依“锤头结构”原理设计合成了一个38个核苷酸的Ribozyme,能在体外定点切割甲型肝炎病毒的RNA片段(链长为123核苷酸残基,切削点对... Ribozyme是一类具有生物催化功能的RNA,它能定点切割RNA靶分子,从而达到有效地阻断基因表达的目的。本文依“锤头结构”原理设计合成了一个38个核苷酸的Ribozyme,能在体外定点切割甲型肝炎病毒的RNA片段(链长为123核苷酸残基,切削点对应于甲肝病毒RNA的559位)。测定了切割反应与温度、Ribozyme浓度和底物浓度的关系,其Km和kcat分别为0.63μmol/L和0.12min^(-1)。Mg^(2+)或Ca^(2+)均可作为参与该催化反应所必需的金属离子。 展开更多
关键词 ribozyme 甲型肝炎病毒 定点切割
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Anti-viral Activity of Hairpin Ribozyme Directed against HBV Core Region In Vitro
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作者 林菊生 宋宇虎 +6 位作者 孔心娟 谢娜 吴小力 刘南植 王南下 操二虎 金由辛 《Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences)》 SCIE CAS 2001年第3期219-221,共3页
To study the preparation and cleavage of hairpin ribozyme (HpRz) directed against the transcript of HBV core region in vitro, HRz gene designed by computer targeting the transcript of HBV core gene was cloned into the... To study the preparation and cleavage of hairpin ribozyme (HpRz) directed against the transcript of HBV core region in vitro, HRz gene designed by computer targeting the transcript of HBV core gene was cloned into the vector p1.5 between 5′-cis-Rz and 3′-cis-Rz. 32 P-labeled HpRz transcript proved whether the vector fit for the preparation of hairpin ribozyme. 32 P -labeled pKC transcript containing HBV core region as targets-RNA was transcribed by using T 7 RNA polymerase and purified by PAGE. Cold HpRz transcript was incubated with 32 P-labeled target-RNAs under different conditions and radioautographed after denaturing polyacrylamide gel electrophoresis. The results showed that HpRz had the ability of cleavage at 37 ℃ and 12 mmol/L MgCl 2 and the design of ribozyme was correct. It is concluded that HpRz prepared in vitro possesses specific catalytic activity, indicating that it is possible for HpRz to intracellularly inhibit the replication of HBV. It may be developed into a nucleic acid drug in the treatment of hepatitis B in the future. 展开更多
关键词 hairpin ribozyme hepatitis B virus plasmid-independent transcription RNA cleavage
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抗乙型肝炎病毒特异联合型核酶的体外切割作用 被引量:7
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作者 连建奇 周永兴 金由辛 《第四军医大学学报》 1999年第2期97-101,共5页
目的:探讨单一及多位点核酶对乙型肝炎病毒靶RNA的切割作用.方法:利用计算机辅助设计针对乙型肝炎病毒C基因的三个单一核酶及特异联合型核酶,构建三个核酶各自及三个核酶串联的自剪切转录载体(pGEMRz123),观察单一及串联核酶(Rz... 目的:探讨单一及多位点核酶对乙型肝炎病毒靶RNA的切割作用.方法:利用计算机辅助设计针对乙型肝炎病毒C基因的三个单一核酶及特异联合型核酶,构建三个核酶各自及三个核酶串联的自剪切转录载体(pGEMRz123),观察单一及串联核酶(Rz123)对靶RNA的切割作用.结果:构建的串联核酶自剪切转录载体体外转录后,在顺式核酶发生自剪切后可将目的核酶正确地释放出来,计算机设计的单一核酶体外可剪切靶RNA;串联核酶中的单一核酶不仅可单独作用,而且可联合切割,提高了单一核酶的剪切效率.结论:抗乙型肝炎病毒特异联合型核酶体外可联合切割靶RNA. 展开更多
关键词 乙型肝炎病毒 联合核酶 切割 体外 RNA
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不同长度丁型肝炎病毒核酶的体外自剪切活性及其意义 被引量:3
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作者 于乐成 顾长海 +2 位作者 毛青 李奇芬 王宇明 《世界华人消化杂志》 CAS 2000年第1期39-41,共3页
目的分析不同长度丁型肝炎病毒核酶的体外自剪切活性。方法用XbaⅠ,EcoRⅠ或BamHⅠ将含有HDV.Rz序列的pRz277正向质粒(pRz277A)和pRz277反向质粒(pRz277B)线性化,以α-^(32)p-UTP标志和T7噬菌体RNA聚合酶转录出不同长度的基因组核酶(g.... 目的分析不同长度丁型肝炎病毒核酶的体外自剪切活性。方法用XbaⅠ,EcoRⅠ或BamHⅠ将含有HDV.Rz序列的pRz277正向质粒(pRz277A)和pRz277反向质粒(pRz277B)线性化,以α-^(32)p-UTP标志和T7噬菌体RNA聚合酶转录出不同长度的基因组核酶(g.Rz)和抗基因组(即复制中间体)核酶(ag.Rz),在一定条件下进行自剪切反应,然后作聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和放射自显影。结果 g.Rz24/100(自剪切位点5和3端分别含24nt和100nt,下同)、ag.Rz38/119在适当条件下绝大部分发生自剪切。g.Rz24/253和ag.Rz38/239也具有一定自剪切活性,但显著低于前两者,即使温度升至55℃或加入去离子甲酰胺也是如此。结论适宜长度的HDV.Rz在体外具有较高的自剪切活性。这些发现有助于我们下一步研究HDV.Rz的反式剪切作用。 展开更多
关键词 丁型肝炎病毒 病毒核酶 自剪切活性
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反义寡核苷酸体外抗丁型肝炎病毒的初步研究
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作者 邹正升 王升启 +6 位作者 陈菊梅 马立人 施红 韩凤连 程云 雷周云 王玉芝 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1995年第5期326-329,共4页
以质粒(sSVLD3)为模板,通过聚合酶链反应(PCR)扩增得到一条139bp的片段,它含有丁型肝炎病毒(HDV)基因组RNA中核酶(ribozyme)区的cDNA,该核酶具有自身裂解功能,将上述片段插入到pGEM-... 以质粒(sSVLD3)为模板,通过聚合酶链反应(PCR)扩增得到一条139bp的片段,它含有丁型肝炎病毒(HDV)基因组RNA中核酶(ribozyme)区的cDNA,该核酶具有自身裂解功能,将上述片段插入到pGEM-3Z中,经筛选、鉴定,得到一重组质粒(pHDV108),经测序发现有2个碱基变异,以该质粒为模板,通过T7RNA聚合酶,转录出核酶的前体,并观察到其自身裂解产物,自裂率达71%。针对核酶两个重要的单链区,设计并合成二条反义寡核背酸(ASON),当在转录反应中同时加入ASON后,核酶的自裂率下降均较明显,当ASON浓度为16umo1/L时,核酶自裂抑制率均在70%以上。提示,ASON可与核酶两个重要的单链区结合,从而抑制核酶的自裂活性。 展开更多
关键词 反义寡核苷酸 丁型肝炎病毒 丁型肺炎 基因治疗
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利用PCR技术行反义寡核苷酸体外抗丁型肝炎病毒基因组RNA中核酶的研究 被引量:1
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作者 邹正升 陈菊梅 +6 位作者 王升启 马立人 施红 韩凤连 程云 雷周云 王玉芝 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 1996年第1期23-28,共6页
设计一时PCR引物,其中上淤引物的5’端除目的基因外,还加T7RNA聚合酶启动子序列。以质粒(pSVLD3)为模板,通过PCR扩增出带有T7RNA聚合酶启动子序列的139bp的cDNA片段,它含有丁型肝炎病毒(HDV... 设计一时PCR引物,其中上淤引物的5’端除目的基因外,还加T7RNA聚合酶启动子序列。以质粒(pSVLD3)为模板,通过PCR扩增出带有T7RNA聚合酶启动子序列的139bp的cDNA片段,它含有丁型肝炎病毒(HDV)基因组RNA中核酶(Ribozyme)区的cDNA,该核酶具有自身裂解功能。经测序发现该cDNA有2个碱基变异。以此PCR产物为模板,通过T7RNA聚合酶,转录出核酶的前体,并观察到其自身裂解产物,自裂率达71%。针对该核酶唯一的自裂位点及两个重要的单链区,设计并合成3条反义寡核苷酸(ASODN)。当在转录反应中间时加入合成的3条ASODN后,核酶的自裂率均下降较明显,其中,针对核酶自裂位点的ASODN效果更突出,当其浓度为40μmol/L时,核酶自裂率为2%,当浓度为1μmol/L时,核酶的自裂完全消失。结果启示ASODN可与核酶的自裂位点区及两个重要的单链区结合,从而抑制核酶的自裂活性。 展开更多
关键词 丁型肝炎病毒 核酶 反义寡核苷酸 聚合酶链反应
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丁型肝炎病毒基因组RNA中核酶区的cDNA的体外转录
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作者 邹正升 王升启 +5 位作者 施红 韩凤莲 雷周云 陈菊梅 马立人 王玉芝 《中华实验和临床病毒学杂志》 CAS CSCD 1995年第4期307-310,共4页
以质粒pSVLD3为模板,通过聚合酶链反应(PCR)扩增得到1条139bP的cDNA片段,它含有丁型肝炎病毒(HDV)基因组RNA中核酶(Ribozyme)区的cDNA,将此片段克隆到PGEM-32中,经筛选、鉴定,... 以质粒pSVLD3为模板,通过聚合酶链反应(PCR)扩增得到1条139bP的cDNA片段,它含有丁型肝炎病毒(HDV)基因组RNA中核酶(Ribozyme)区的cDNA,将此片段克隆到PGEM-32中,经筛选、鉴定,得到克隆株pHDV108,提取质粒后经双脱氧末端终止法测序,发现有2个碱基变异。以该质粒为模板,通过T7RNA聚合酶转录出HDV基因组RNA中核酶区的前体,并观察到其自身裂解产物,自裂率达71%。 展开更多
关键词 丁型肝炎病毒 RNA CDNA 体外转录 核苷酸序列
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