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半枝莲种素抗结直肠癌作用机制的生物信息学分析与实验验证
1
作者
齐少冲
王紫静
+1 位作者
邓昭敏
杨锦林
《成都医学院学报》
CAS
2024年第2期201-208,共8页
目的 结合生物信息学分析与体内、外实验探索半枝莲种素抗结直肠癌的作用及机制。方法 利用药物与疾病相关公共数据库分别获得半枝莲种素和结直肠癌的相关靶点,对二者交集靶点进行蛋白相互作用分析和功能富集分析以构建“药物-疾病”调...
目的 结合生物信息学分析与体内、外实验探索半枝莲种素抗结直肠癌的作用及机制。方法 利用药物与疾病相关公共数据库分别获得半枝莲种素和结直肠癌的相关靶点,对二者交集靶点进行蛋白相互作用分析和功能富集分析以构建“药物-疾病”调控网络;利用机器学习算法筛选核心基因,并进行分子对接验证;利用人结肠癌细胞系(HCT116)开展细胞实验,验证半枝莲种素体外抗结直肠癌的作用;利用裸鼠皮下瘤模型验证半枝莲种素体内抗结直肠癌作用并探索相关分子机制。结果 共获得246个半枝莲种素药物靶点和3 658个结直肠癌相关靶点,利用50个交集基因构建了蛋白相互作用网络和“药物-疾病”调控网络。通过机器学习算法筛选出5个半枝莲种素抗结直肠癌的核心靶点。分子对接结果显示,所有核心靶点与半枝莲种素间的结合能均低于-5 kcal/mol。细胞实验显示,半枝莲种素处理组HCT116细胞的增殖、迁移及侵袭能力较对照组更弱。动物实验显示,半枝莲种素处理组裸鼠的皮下异种移植瘤生长速度较对照组更慢,且肿瘤组织中MET和磷酸化AKT的表达水平更低(P<0.05)。结论 半枝莲种素可通过下调MET的表达,影响PI3K/AKT通路的磷酸化状态,从而发挥抗结直肠癌作用。
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关键词
结直肠癌
半枝莲种素
生物信息学分析
实验验证
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职称材料
半枝莲种素调控LncRNA HOXA11-AS对肺鳞癌细胞增殖、凋亡及迁移的作用研究
2
作者
武健
宋宜来
刘中国
《中国临床药理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第20期3013-3017,共5页
目的探究半枝莲种素调控肺鳞癌发生和转移的分子机制。方法用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测不同细胞系中目标基因的相对表达水平。动物实验:将动物随机分成2组,半枝莲种素动物组每天灌胃给予50 mg·kg^(-1)半枝莲种素溶液...
目的探究半枝莲种素调控肺鳞癌发生和转移的分子机制。方法用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测不同细胞系中目标基因的相对表达水平。动物实验:将动物随机分成2组,半枝莲种素动物组每天灌胃给予50 mg·kg^(-1)半枝莲种素溶液,模型组每天灌胃给予等体积的0.9%NaCl,测量肿瘤体积。细胞实验:将细胞分为对照组(不做处理)、半枝莲种素组(3.0 g·L^(-1)半枝莲种素)、半枝莲种素+oe-HOXA11-AS组(3.0 g·L^(-1)半枝莲提取物处理并转染HOXA11-AS)、半枝莲种素+oe-HOXA11-AS+XAV939组(3.0 g·L^(-1)半枝莲提取物处理,转染HOXA11-AS并加入10μmol·L^(-1)XAV939)。用5-乙炔基-2’-脱氧尿苷(Edu)和末端转移酶介导的dUTP末端标记法(TUNEL)实验分别检测细胞的增殖率和凋亡率,用Transwell实验检测各组人肺鳞癌细胞NCI-H520的迁移。结果各肺癌细胞系中HOXA11-AS相对表达水平相比正常肺上皮细胞均显著增多(均P<0.05)。35 d时模型组和半枝莲种素动物组肿瘤体积分别为(937.83±67.40)和(512.32±45.61)mm^(3),2组比较,在统计学上差异有统计学意义(P<0.001)。对照组、半枝莲种素组、半枝莲种素+oe-HOXA11-AS组和半枝莲种素+oe-HOXA11-AS+XAV939组细胞迁移数目分别为(127.26±8.92)、(23.76±3.31)、(131.28±9.49)和(27.69±3.57)个,增殖率分别为(56.27±7.49)%、(28.68±4.33)%、(50.12±7.86)%和(13.62±3.54)%,凋亡率分别为(10.86±2.97)%、(43.23±6.78)%、(30.92±4.53)%和(41.77±7.02)%,半枝莲种素组的上述指标与对照组比较,半枝莲种素+oe-HOXA11-AS组的上述指标与半枝莲种素组比较,枝莲种素+oe-HOXA11-AS+XAV939组的上述指标与半枝莲种素+oe-HOXA11-AS组比较,在统计学上差异均有统计学意义(P<0.05,P<0.01,P<0.001)。结论半枝莲种素通过HOXA11-AS抑制Wnt/β-catenin信号通路调控肺鳞癌的发生和转移。
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关键词
半枝莲种素
反义链长非编码核糖核酸同源盒A11
Wnt/β-catenin信号通路
肺鳞癌
转移瘤
原文传递
题名
半枝莲种素抗结直肠癌作用机制的生物信息学分析与实验验证
1
作者
齐少冲
王紫静
邓昭敏
杨锦林
机构
四川大学华西医院消化内科
四川大学华西医院衰老与肿瘤研究实验室
出处
《成都医学院学报》
CAS
2024年第2期201-208,共8页
基金
国家自然科学基金青年项目(No:82103539)
四川省干部保健委员会干部科研保健项目(No:2023104)。
文摘
目的 结合生物信息学分析与体内、外实验探索半枝莲种素抗结直肠癌的作用及机制。方法 利用药物与疾病相关公共数据库分别获得半枝莲种素和结直肠癌的相关靶点,对二者交集靶点进行蛋白相互作用分析和功能富集分析以构建“药物-疾病”调控网络;利用机器学习算法筛选核心基因,并进行分子对接验证;利用人结肠癌细胞系(HCT116)开展细胞实验,验证半枝莲种素体外抗结直肠癌的作用;利用裸鼠皮下瘤模型验证半枝莲种素体内抗结直肠癌作用并探索相关分子机制。结果 共获得246个半枝莲种素药物靶点和3 658个结直肠癌相关靶点,利用50个交集基因构建了蛋白相互作用网络和“药物-疾病”调控网络。通过机器学习算法筛选出5个半枝莲种素抗结直肠癌的核心靶点。分子对接结果显示,所有核心靶点与半枝莲种素间的结合能均低于-5 kcal/mol。细胞实验显示,半枝莲种素处理组HCT116细胞的增殖、迁移及侵袭能力较对照组更弱。动物实验显示,半枝莲种素处理组裸鼠的皮下异种移植瘤生长速度较对照组更慢,且肿瘤组织中MET和磷酸化AKT的表达水平更低(P<0.05)。结论 半枝莲种素可通过下调MET的表达,影响PI3K/AKT通路的磷酸化状态,从而发挥抗结直肠癌作用。
关键词
结直肠癌
半枝莲种素
生物信息学分析
实验验证
Keywords
Colorectal cancer
rivularin
Bioinformatic analysis
Experimental validation
分类号
R574.6 [医药卫生—消化系统]
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职称材料
题名
半枝莲种素调控LncRNA HOXA11-AS对肺鳞癌细胞增殖、凋亡及迁移的作用研究
2
作者
武健
宋宜来
刘中国
机构
山西医科大学第一临床医学院
山西医科大学第一医院药物临床试验机构
出处
《中国临床药理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第20期3013-3017,共5页
文摘
目的探究半枝莲种素调控肺鳞癌发生和转移的分子机制。方法用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测不同细胞系中目标基因的相对表达水平。动物实验:将动物随机分成2组,半枝莲种素动物组每天灌胃给予50 mg·kg^(-1)半枝莲种素溶液,模型组每天灌胃给予等体积的0.9%NaCl,测量肿瘤体积。细胞实验:将细胞分为对照组(不做处理)、半枝莲种素组(3.0 g·L^(-1)半枝莲种素)、半枝莲种素+oe-HOXA11-AS组(3.0 g·L^(-1)半枝莲提取物处理并转染HOXA11-AS)、半枝莲种素+oe-HOXA11-AS+XAV939组(3.0 g·L^(-1)半枝莲提取物处理,转染HOXA11-AS并加入10μmol·L^(-1)XAV939)。用5-乙炔基-2’-脱氧尿苷(Edu)和末端转移酶介导的dUTP末端标记法(TUNEL)实验分别检测细胞的增殖率和凋亡率,用Transwell实验检测各组人肺鳞癌细胞NCI-H520的迁移。结果各肺癌细胞系中HOXA11-AS相对表达水平相比正常肺上皮细胞均显著增多(均P<0.05)。35 d时模型组和半枝莲种素动物组肿瘤体积分别为(937.83±67.40)和(512.32±45.61)mm^(3),2组比较,在统计学上差异有统计学意义(P<0.001)。对照组、半枝莲种素组、半枝莲种素+oe-HOXA11-AS组和半枝莲种素+oe-HOXA11-AS+XAV939组细胞迁移数目分别为(127.26±8.92)、(23.76±3.31)、(131.28±9.49)和(27.69±3.57)个,增殖率分别为(56.27±7.49)%、(28.68±4.33)%、(50.12±7.86)%和(13.62±3.54)%,凋亡率分别为(10.86±2.97)%、(43.23±6.78)%、(30.92±4.53)%和(41.77±7.02)%,半枝莲种素组的上述指标与对照组比较,半枝莲种素+oe-HOXA11-AS组的上述指标与半枝莲种素组比较,枝莲种素+oe-HOXA11-AS+XAV939组的上述指标与半枝莲种素+oe-HOXA11-AS组比较,在统计学上差异均有统计学意义(P<0.05,P<0.01,P<0.001)。结论半枝莲种素通过HOXA11-AS抑制Wnt/β-catenin信号通路调控肺鳞癌的发生和转移。
关键词
半枝莲种素
反义链长非编码核糖核酸同源盒A11
Wnt/β-catenin信号通路
肺鳞癌
转移瘤
Keywords
rivularin
antisense strand length non-coding RNA homobox A11
Wnt/β-catenin signaling pathway
lung squamous cell carcinoma
metastasis
分类号
R28 [医药卫生—中药学]
原文传递
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作者
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半枝莲种素抗结直肠癌作用机制的生物信息学分析与实验验证
齐少冲
王紫静
邓昭敏
杨锦林
《成都医学院学报》
CAS
2024
0
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职称材料
2
半枝莲种素调控LncRNA HOXA11-AS对肺鳞癌细胞增殖、凋亡及迁移的作用研究
武健
宋宜来
刘中国
《中国临床药理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
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