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题名日照海蝉DNA条形码及其分子系统进化分析
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作者
刘丰铭
李金泽
梁启冰
蔺胜娟
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机构
山东省日照第一中学
山东省日照青岛路中学
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出处
《安徽农业科学》
CAS
2016年第3期133-135,共3页
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文摘
[目的]研究COI基因区段作为DNA条形码在识别日照海蝉地理群体的可行性和有效性。[方法]以日照海蝉为研究对象,用引物LCO1490和HCO2198扩增线粒体COI基因片段序列,产物双向测序,用Clustal W进行DNA序列比对,用MEGA 6.0软件采用邻接法(Neighbor-Joing,NJ)和最大简约法(maximum parsimony,MP)构建分子系统发育树。[结果]获得大小为658 bp的COI基因,A、T、C、G的平均含量分别为30.24%、36.63%、16.41%、16.72%,其中A+T平均含量(66.87%)明显高于G+C平均含量(33.13%),NJ和MP系统发育树均表明日照海蝉属于蝉蟹总科(Hippoidea)眉足蟹科(Blepharipoda),与形态学的分属结果一致。[结论]采用COI基因序列作为DNA条形码进行海蝉分类鉴定具有一定的可行性。
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关键词
日照海蝉
DNA条形码
COI基因
系统进化
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Keywords
rizhao haichan
DNA barcoding
CO1 gene
Phylogeny
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分类号
S188
[农业科学—农业基础科学]
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