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草木樨在汞胁迫下的遗传分化研究(英文)
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作者 郭洪泽 张秋华 +2 位作者 段毅豪 李翠兰 王钰婧 《生态毒理学报》 CAS CSCD 2011年第3期326-330,共5页
以草木樨(Melilotus officinalis)种子为研究对象,将其暴露于0、20、40和60mg·L-1浓度的氯化汞中进行萌发,并对存活的幼苗利用水平淀粉凝胶电泳进行等位酶分析。结果表明,草木樨在Me和Pgi基因座具有多态性,其平均的等位基因数为3.... 以草木樨(Melilotus officinalis)种子为研究对象,将其暴露于0、20、40和60mg·L-1浓度的氯化汞中进行萌发,并对存活的幼苗利用水平淀粉凝胶电泳进行等位酶分析。结果表明,草木樨在Me和Pgi基因座具有多态性,其平均的等位基因数为3.0基因座-1,杂合性为0.332-0.342,草木樨符合种群遗传研究的条件。Roger's遗传距离聚类分析表明草木樨在对照组和汞暴露存活个体组间存在明显的遗传距离分化。草木樨的某些基因型极有可能对汞污染存抗性作用,汞暴露通过定向选择导致遗传分化。研究表明,野化的草木樨是在黄土高原地区进行矿区植物修复的理想潜在物种。 展开更多
关键词 草木樨 氯化汞 水平淀粉凝胶电泳 roger’s遗传距离聚类分析 遗传分化
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3个群体鳙鱼mtDNA D-loop区段的限制性片段长度多态性分析 被引量:19
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作者 单淇 董仕 +1 位作者 吴海防 谷口顺彦 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期174-180,共7页
鳙鱼(Aristichthys nobilis)采自江西瑞昌、湖南长沙的天然群体以及天津宁河的人工繁殖群体共127尾,对其线粒体DNA的D-loop区段进行PCR扩增,使用12种核酸内切限制酶酶切。酶切结果显示,在12种内切酶中,8种有酶切位点,2种个体间有变异,为... 鳙鱼(Aristichthys nobilis)采自江西瑞昌、湖南长沙的天然群体以及天津宁河的人工繁殖群体共127尾,对其线粒体DNA的D-loop区段进行PCR扩增,使用12种核酸内切限制酶酶切。酶切结果显示,在12种内切酶中,8种有酶切位点,2种个体间有变异,为AfaⅠ和HinfⅠ,共得到7种单倍型。依据单倍型频率的组成情况,计算出瑞昌与长沙、宁河群体间的Rogers遗传距离分别为0.728 3和0.500 7,长沙和宁河群体间的Rogers遗传距离为0.813 5。AfaⅠ的酶切类型C和HinfⅠ的酶切类型B组成的单倍型,在长沙群体中占87.5%,而在瑞昌和宁河群体中均为零。由此可以认为鳙鱼瑞昌群体和长沙群体可能是两个隔离的独立群体。 展开更多
关键词 鳙鱼 MTDNA D-LOOP RFLP rogers遗传距 核苷酸多样性 核苷酸歧化距离 遗传多样性
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长江流域3个群体草鱼mtDNAD-loop区段的PCR-RFLP分析 被引量:11
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作者 谭书贞 董仕 +1 位作者 边春媛 谷口顺彦 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期106-112,共7页
对采自长江流域湖北省监利县、江西省九江市以及江苏省扬州市邗江区3个群体的141尾草鱼线粒体 DNA 的 D-loop 区段进行 PCR 扩增,使用12种核酸内切限制酶酶切.结果显示,扩增出的140尾试验鱼的mtDNA D-loop 区段长度约为1.6kbp,监利群体... 对采自长江流域湖北省监利县、江西省九江市以及江苏省扬州市邗江区3个群体的141尾草鱼线粒体 DNA 的 D-loop 区段进行 PCR 扩增,使用12种核酸内切限制酶酶切.结果显示,扩增出的140尾试验鱼的mtDNA D-loop 区段长度约为1.6kbp,监利群体中的1尾约为1.8kbp,个体间存在长度变异现象;6种限制酶具有酶切位点,共检测到两种单倍型,其中监利群体中有长度变异的1尾为一种单倍型,另外140尾为另一种单倍型.依据单倍型频率的组成情况计算出九江和邗江两群体内的单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数均为0,监利群体内的分别为0.0466、0.00180;监利群体与邗江(或九江)群体间的 Rogers 遗传距离为0.0403;x^2检验结果显示3个群体间的遗传差异不显著(P>0.05).这些结果表明草鱼 mtDNA D-loop 区段的遗传多样性很低. 展开更多
关键词 草鱼 MTDNA D—loop PCR—RFLP rogers遗传距 长度变异
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州河鲤、建鲤和框鳞镜鲤的mtDNA D-loop的RFLP分析 被引量:11
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作者 杨正玲 赵世海 +1 位作者 龚疏影 董仕 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2008年第3期40-45,共6页
应用PCR技术扩增了州河鲤、建鲤以及框鳞镜鲤mtDNA的D-loop区段,并用13种限制性内切酶对扩增到的片段进行了分析。结果显示:在3种鱼分别扩增到的约1.6kb的DNA片段上,13种限制性内切酶中有8种(AluⅠ、DraⅠ、EcoRⅠ、HaeⅢ、HapⅡ、Hinf... 应用PCR技术扩增了州河鲤、建鲤以及框鳞镜鲤mtDNA的D-loop区段,并用13种限制性内切酶对扩增到的片段进行了分析。结果显示:在3种鱼分别扩增到的约1.6kb的DNA片段上,13种限制性内切酶中有8种(AluⅠ、DraⅠ、EcoRⅠ、HaeⅢ、HapⅡ、HinfⅠ、TaqⅠ和XspⅠ)有酶切位点,4种(DraⅠ、HaeⅢ、TaqⅠ和XspⅠ)个体间存在变异。不同酶切结果组合后,共得到6种单倍型。州河鲤中以单倍型Ⅲ为主,达91.37%,建鲤以单倍型Ⅵ为主,达81.25%;框鳞镜鲤中单倍型Ⅱ占39.47%,单倍型Ⅲ占47.37%;州河鲤、建鲤以及框鳞镜鲤群体内的单倍型多样性指数(h)和核苷酸多样性指数(π)分别为0.1603、0.3327,0.6287、0.003042,0.004838、0.007163。州河鲤与框鳞镜鲤间的Rogers遗传距最小,为0.4080;州河鲤与建鲤间的为0.8440;框鳞镜鲤与建鲤间的为0.6469。 展开更多
关键词 鲤(Cyprinus carpio) mtDNA D—loop RFLP 核苷酸多样性 rogers遗传距
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4个群体鲢mtDNA D-loop的PCR-RFLP分析 被引量:14
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作者 王淞 曹晓霞 +1 位作者 谷口顺彦 董仕 《淡水渔业》 CSCD 北大核心 2010年第4期3-9,15,共8页
采用PCR技术扩增了湖北监利、江西瑞昌、湖南长沙3个长江野生群体和天津宁河1个人工繁殖群体(已繁殖6代)共158尾鲢(Hypophthalmichthys molitrix)mtDNA D-loop区段,并用14种核酸内切限制酶对扩增片段进行酶切。结果显示:所有试验... 采用PCR技术扩增了湖北监利、江西瑞昌、湖南长沙3个长江野生群体和天津宁河1个人工繁殖群体(已繁殖6代)共158尾鲢(Hypophthalmichthys molitrix)mtDNA D-loop区段,并用14种核酸内切限制酶对扩增片段进行酶切。结果显示:所有试验鱼均扩增出约1.6 kb的DNA片段,10种限制酶有酶切位点,共检测出16种单倍型,以单倍型Ⅰ为主,在各群体中所占比例为57.5%-90.0%。鲢4个群体的单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数为0.1885-0.6526和0.001182-0.007570。瑞昌群体与监利群体的Rogers遗传距最小,为0.1250;监利群体与宁河群体的Rogers遗传距最大,为0.2693。χ^2检验结果显示4个群体间的遗传差异显著(P〈0.01)。在4个群体中,宁河人工繁殖群体的单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数均最高,并且HinfⅠ的C酶切类型为宁河群体所特有,达20.0%。 展开更多
关键词 鲢(Hypophthalmichthys molitrix) mtDNAD-loop PCR-RFLP 遗传多样性 rogers遗传距
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