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基于机器学习Rosetta的全人源化Spastin重组抗体的设计和验证
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作者 马澳 孟智超 谭明会 《暨南大学学报(自然科学与医学版)》 CAS 北大核心 2024年第3期306-314,共9页
目的:基于机器学习软件Rosetta实现人源化Spastin重组抗体的设计、体外制备及验证。方法:使用Rosetta设计出针对人Spastin蛋白抗原表位的全人源化抗体,获得其抗体Fab段轻链及重链可变区的氨基酸序列,优化密码子后转化为核苷酸序列得到... 目的:基于机器学习软件Rosetta实现人源化Spastin重组抗体的设计、体外制备及验证。方法:使用Rosetta设计出针对人Spastin蛋白抗原表位的全人源化抗体,获得其抗体Fab段轻链及重链可变区的氨基酸序列,优化密码子后转化为核苷酸序列得到轻、重链的全长cDNA;随后将全人源化抗Spastin的轻、重链序列分别构建于重组表达载体;在293FT真核表达体系中表达并纯化该抗体;使用Western blot方法鉴定该抗体识别人Spastin重组蛋白信号的能力;通过Rosetta建模模拟抗体与抗原的结合及构象。结果:成功构建了全人源化Spastin重组抗体;该Spastin重组抗体能够在真核系统成功表达;构建的重组抗体轻、重链能够形成完整抗体,且能够特异性识别出人Spastin蛋白信号。结论:借助Rosetta软件成功设计了一种能够特异识别Spastin的重组全人源化抗体。 展开更多
关键词 rosetta 全人源化抗体 抗体设计 SPASTIN 人工智能 机器学习
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基于模糊工具箱和ROSETTA的粗糙集数据挖掘 被引量:11
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作者 徐袭 刘玉波 范学鑫 《微计算机信息》 北大核心 2007年第18期174-175,178,共3页
针对大量连续属性值的数据挖掘,提出了一种基于模糊工具箱和ROSETTA软件的粗糙集数据挖掘方法.在粗糙集理论的基础上,应用模糊工具箱中的模糊聚类方法离散分类连续属性值,并将其转化为粗糙集易于处理的知识表格.应用粗糙集数据挖掘软件R... 针对大量连续属性值的数据挖掘,提出了一种基于模糊工具箱和ROSETTA软件的粗糙集数据挖掘方法.在粗糙集理论的基础上,应用模糊工具箱中的模糊聚类方法离散分类连续属性值,并将其转化为粗糙集易于处理的知识表格.应用粗糙集数据挖掘软件ROSETTA对这些知识表格进行知识约简处理.通过约简知识属性和属性值,得到连续属性值的核心知识规则,并以实测数据为例,说明了该方法的实现过程和有效性. 展开更多
关键词 模糊工具箱 rosetta 粗糙集 数据挖掘
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粗集理论和Rosetta系统在教学质量评价中的应用 被引量:1
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作者 吴立春 《电脑开发与应用》 2014年第8期41-43,共3页
基于粗集理论,利用Rosetta系统对高校教学质量评价信息系统进行离散化和属性约简,得到了评价指标体系中的核心指标和决策规则。利用这些规则,测得被评估教师的实际教学水平,客观评价教师的教学质量,为教师教学质量评价提供一种新的分析... 基于粗集理论,利用Rosetta系统对高校教学质量评价信息系统进行离散化和属性约简,得到了评价指标体系中的核心指标和决策规则。利用这些规则,测得被评估教师的实际教学水平,客观评价教师的教学质量,为教师教学质量评价提供一种新的分析方法。 展开更多
关键词 粗集 信息表 rosetta系统 教学评价
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一种利用噬菌体裂解大肠杆菌Rosetta菌株菌体的方法
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作者 雷琎 孙宇杰 +2 位作者 于达 李胜菊 林连兵 《江苏农业科学》 北大核心 2015年第9期61-63,共3页
Escherichia coli Rosetta菌株是基因克隆表达的重要宿主菌,为了探索裂解E.coli Rosetta菌体的新方法,从污水中分离到1株能裂解E.coli Rosetta菌株的噬菌体,命名为ETP-1,并研究其生物学特性和裂解效率。结果表明,EPT-1在双层平板上形成... Escherichia coli Rosetta菌株是基因克隆表达的重要宿主菌,为了探索裂解E.coli Rosetta菌体的新方法,从污水中分离到1株能裂解E.coli Rosetta菌株的噬菌体,命名为ETP-1,并研究其生物学特性和裂解效率。结果表明,EPT-1在双层平板上形成直径为1~3 mm的噬菌斑;噬菌斑透明,周围有晕环;该噬菌体的潜伏期为20min,裂解期为70 min,在55℃以上以及p H值大于11时,噬菌体失去活性。在6 h内,噬菌体可裂解73%的E.coli Rosetta菌体,ETP-1裂解其宿主细胞为E.coli Rosetta菌株菌体的破碎提供了新的方法。 展开更多
关键词 细胞破碎方法 E.COLI rosetta 噬菌体 裂解效率
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基于Rosetta软件和Vague集的战术机动事件检测方法 被引量:1
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作者 韩云飞 杨露菁 孙仲尧 《指挥控制与仿真》 2017年第6期99-103,共5页
事件检测是态势觉察的重要内容,是对当前战场态势变化的感知,是态势估计的基础,能否正确检测出当前战场所发生的有意义的行为,直接影响到了态势估计的结果。提出一种基于Rosetta软件和Vague集的战术机动事件检测方法,将目标历史数据离散... 事件检测是态势觉察的重要内容,是对当前战场态势变化的感知,是态势估计的基础,能否正确检测出当前战场所发生的有意义的行为,直接影响到了态势估计的结果。提出一种基于Rosetta软件和Vague集的战术机动事件检测方法,将目标历史数据离散化,建立事件决策表;利用Rosetta软件中的遗传算法约简方法对事件决策表进行约简,得到简约决策表;将实时检测到的目标状态变化离散化,根据简约决策表建立Vague集;计算事件的相似度,根据评价体系,判断发生何种事件。仿真结果表明,这种事件检测方法,较大地提高了检测的正确率。 展开更多
关键词 态势觉察 事件检测 rosetta VAGUE集
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Test of the Rosetta Pedotransfer Function for Saturated Hydraulic Conductivity 被引量:2
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作者 Carlos Alvarez-Acosta Robert J. Lascano Leo Stroosnijder 《Open Journal of Soil Science》 2012年第3期203-212,共10页
Simulation models are tools that can be used to explore, for example, effects of cultural practices on soil erosion and irrigation on crop yield. However, often these models require many soil related input data of whi... Simulation models are tools that can be used to explore, for example, effects of cultural practices on soil erosion and irrigation on crop yield. However, often these models require many soil related input data of which the saturated hydraulic conductivity (Ks) is one of the most important ones. These data are usually not available and experimental determination is both expensive and time consuming. Therefore, pedotransfer functions are often used, which make use of simple and often readily available soil information to calculate required input values for models, such as soil hydraulic values. Our objective was to test the Rosetta pedotransfer function to calculate Ks. Research was conducted in a 64-ha field near Lamesa, Texas, USA. Field measurements of soil texture and bulk density, and laboratory measurements of soil water retention at field capacity (–33 kPa) and permanent wilting point (–1500 kPa), were taken to implement Rosetta. Calculated values of Ks were then compared to measured Ks on undisturbed soil samples. Results showed that Rosetta could be used to obtain values of Ks for a field with different textures. The Root Mean Square Difference (RMSD) of Ks at 0.15 m soil depth was 7.81 × 10–7 m·s–1. Further, for a given soil texture the variability, from 2.30 × 10–7 to 2.66 × 10–6 m·s-1, of measured Ks was larger than the corresponding RMSD. We conclude that Rosetta is a tool that can be used to calculate Ks in the absence of measured values, for this particular soil. Level H5 of Rosetta yielded the best results when using the measured input data and thus calculated values of Ks can be used as input in simulation models. 展开更多
关键词 rosetta Saturated HYDRAULIC CONDUCTIVITY KS Pedotransfer FUNCTION
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Assessment the Physico-Chemical Characteristics of Water and Sediment in Rosetta Branch, Egypt 被引量:1
7
作者 Yasser Ahmed El-Amier Mahmoud Abd El-Kawy Zahran Sadam Hameed Al-Mamory 《Journal of Water Resource and Protection》 2015年第13期1075-1086,共12页
Water quality of Rosetta Branch may be changed by several factors in the last decades as a result of anthropogenic activities. So, it’s important to study the physicochemical characteristics of both water and sedimen... Water quality of Rosetta Branch may be changed by several factors in the last decades as a result of anthropogenic activities. So, it’s important to study the physicochemical characteristics of both water and sediment in the Rosetta Branch. Two identified sources are the main origin of most pollutants in this branch, namely: El-Rahawy drain and industrial activities in Kafr El-Zayat city. From the data of water quality index (WQI) based on six important parameters (pH, T °C, DO, BOD, COD and TP), it indicates that site 2 (from Kom Hamada to Edfina) is more polluted than the other two sites (from El-Qanater El-Khairia to Kom Hamada and from Edfina to Rosetta). The concentrations of heavy metals increase in sites that are more affected by drainage water from different drains. Great efforts are needed and wastewater must be treated before draining it into the River Nile water. 展开更多
关键词 rosetta Branch PHYSICOCHEMICAL Characteristics POLLUTION WQI
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Pfu DNA聚合酶在大肠杆菌Rosetta(DE3)中的表达及快速纯化
8
作者 何华华 胡晓韵 +1 位作者 王婷 喻婵 《湖北大学学报(自然科学版)》 CAS 2019年第3期223-227,共5页
来源于Pyrococcus furiosus COM1菌的Pfu DNA聚合酶具有保真性高、延伸速度快、热稳定性强等特点,能够提高PCR反应过程中的扩增效率,减少错误碱基掺入率.以大肠杆菌Rosetta(DE3)为重组细胞,利用一种快速表达纯化方法,让Pfu DNA聚合酶的... 来源于Pyrococcus furiosus COM1菌的Pfu DNA聚合酶具有保真性高、延伸速度快、热稳定性强等特点,能够提高PCR反应过程中的扩增效率,减少错误碱基掺入率.以大肠杆菌Rosetta(DE3)为重组细胞,利用一种快速表达纯化方法,让Pfu DNA聚合酶的表达纯化过程变得更加简便,并维持其高活性.结果表明,Pfu DNA聚合酶在大肠杆菌Rosetta(DE3)中能够进行大量表达,同时60℃高温水浴能有效去除杂蛋白,简化纯化步骤及提高Pfu DNA聚合酶纯度.经过一系列纯化步骤处理后,Pfu DNA聚合酶仍然能够保持较好的酶活,且在100μL PCR反应体系中,加入4μL的1 mg/mL Pfu DNA聚合酶液效果最佳. 展开更多
关键词 PFU DNA聚合酶 rosetta(DE3) 亲和层析 PCR检测
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Simulating the Effect of Improving Water Quality at the El-Rahawy and the Tala Drains in the Rosetta Branch Water Quality
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作者 Mohamed K. Mostafa 《Journal of Water Resource and Protection》 2015年第16期1271-1279,共9页
The El-Rahawy and the Tala drains are the major sources of pollution along the Rosetta branch. The El-Rahawy drain receives primary treated wastewater from the Abu-Rawash Wastewater Treatment Plant (WWTP), while the T... The El-Rahawy and the Tala drains are the major sources of pollution along the Rosetta branch. The El-Rahawy drain receives primary treated wastewater from the Abu-Rawash Wastewater Treatment Plant (WWTP), while the Tala drain receives discharge from dairy industry and agricultural drainage, as well as domestic wastewater. This research involved attempting to study the effect of improving water quality on the El-Rahawy and the Tala drains in the Rosetta branch water quality. Water quality at the El-Rahawy drain is expected to improve after discharging water from the Al-Buhairi Water Canal to the El-Rahawy drain and improving effluent water quality at the Abu-Rawash WWTP. Water quality at the Tala drain is expected to improve after constructing a new WWTP and improving effluent water quality at the dairy industry. The river pollutant (RP) modeling enabled studying the effect of improving water quality at the drains on the Rosetta branch water quality. The RP modeling showed that applying the proposed solutions would significantly improve water quality at the Rosetta branch. 展开更多
关键词 El-Rahawy DRAIN Tala DRAIN Aluminum Chloride Carbon Dioxide RP Modeling rosetta Branch
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Improve Water Quality at the El-Rahawy Drain and the Rosetta Branch, Egypt
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作者 Mohamed K. Mostafa Maha M. Elshafei Robert W. Peters 《Journal of Environmental Protection》 2015年第10期1139-1148,共10页
The El-Rahawy drain, is the major source of pollution along the Rosetta branch, receives primary treated wastewater from the Abu-Rawash Wastewater Treatment Plant (WWTP). The main purpose of this research was to manag... The El-Rahawy drain, is the major source of pollution along the Rosetta branch, receives primary treated wastewater from the Abu-Rawash Wastewater Treatment Plant (WWTP). The main purpose of this research was to manage water quality at the Rosetta branch by improving effluent water quality at the Abu-Rawash WWTP. This research involved attempting to determine the optimal dose of aluminum chloride (AlCl3) to reach an acceptable treatment at the Abu-Rawash WWTP. A dose of 2.0 mg of AlCl3 for each liter of wastewater was selected. Another approach involves discharging flow from Al-Buhairi Water Canal to the El-Rahawy drain in order to increase the dissolved oxygen (DO) concentration and reduce pollutant concentrations at the El-Rahawy drain. Applying these approaches will significantly improve water quality at the El-Rahawy drain. The river pollutant (RP) modeling was also used to study the effect of improving water quality at the El-Rahawy drain on the Rosetta branch water quality. The RP modeling showed that applying the proposed solutions will significantly improve water quality at the Rosetta branch. 展开更多
关键词 Water Quality Modeling Aluminum CHLORIDE Carbon Dioxide El-Rahawy DRAIN rosetta Branch EGYPT
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Impact of Improving Water Quality at the Tala Drain on the Rosetta Branch Water Quality
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作者 Mohamed K. Mostafa 《Journal of Environmental Protection》 2015年第10期1149-1157,共9页
The Tala drain is the second major source of pollution along the Rosetta branch. The Tala drain receives discharge from dairy industry and agricultural drainage, as well as untreated domestic wastewater. This research... The Tala drain is the second major source of pollution along the Rosetta branch. The Tala drain receives discharge from dairy industry and agricultural drainage, as well as untreated domestic wastewater. This research involved attempting to improve water quality at the Rosetta branch by improving water quality at the Tala drain. Water quality at the Tala drain will be improved through improving effluent water quality from the dairy industry using aluminum chloride (AlCl3) as a coagulant, with injections of carbon dioxide (CO2), and constructing a new WWTP. Results indicated that the optimum aluminum chloride dosage was 225 mg/L at a pH value of 6.15. The estimated treatment cost of 1.0 m3 of dairy wastewater is $0.0425 per day. The river pollutant (RP) modeling was also used to study the effect of improving water quality at the Tala drain in the Rosetta branch water quality. The RP modeling showed that applying the proposed solutions will significantly improve water quality at the Tala drain and at the Rosetta branch. 展开更多
关键词 ALUMINUM CHLORIDE Carbon Dioxide RP Modeling Tala DRAIN rosetta Branch
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A Comprehensive Assessment of Water Quality at the Rosetta Branch of the Nile River, Egypt
12
作者 Mohamed Mostafa Robert W. Peters 《Journal of Civil Engineering and Architecture》 2016年第5期513-529,共17页
The aim of the present study is to assess the water quality along the Rosetta branch of the Nile River, Egypt. The study area extends from upstream of the EI-Rahawy drain to the end of the branch. The correlation matr... The aim of the present study is to assess the water quality along the Rosetta branch of the Nile River, Egypt. The study area extends from upstream of the EI-Rahawy drain to the end of the branch. The correlation matrix was performed to help identify the nature of correlations between the different parameters. The WQI (water quality index) was calculated seasonally at different points along the Rosetta branch to provide a simple indicator of water quality at these points. The results of WQI calculations showed that the fecal coliform is the main cause of poor water quality along the Rosetta branch. A statistical analysis was also performed using a two-way ANOVA (analysis of variance) to identify the significant sources of water pollution and to determine the impact of the parameters on a mass loading. A significant difference was observed between the impacts of the pollution sources on the water quality. Also, a significant difference was observed between the impacts of each parameter in the mass loading. The results showed that the E1-Rahawy, Tala and Sabal drains are the major sources for water quality degradation along the Rosetta branch and that the effect of the EI-Tahrir and the Zawyet El-Baher drains on the water quality is not significant. 展开更多
关键词 Physicochemical analysis analysis of variance water quality index correlation matrix rosetta branch Egypt.
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供应链管理与Rosetta Net标准
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作者 羽装 《电子与封装》 2002年第6期49-51,共3页
1供应链管理 当今全球已步人经济一体化和因特网新经济时代,市场的变化正在不断加快,需求的不确定性正在不断加大,势必要求信息交换快捷与准确,产品上市快速与及时.原来传统的企业管理模式--"纵向一体化"管理已不适应新时代... 1供应链管理 当今全球已步人经济一体化和因特网新经济时代,市场的变化正在不断加快,需求的不确定性正在不断加大,势必要求信息交换快捷与准确,产品上市快速与及时.原来传统的企业管理模式--"纵向一体化"管理已不适应新时代的要求. 展开更多
关键词 供应链管理 PIP WIP 物资管理 标准格式 rosetta Net 台积电 ASE 晶圆制造 英特尔 半导体制造业
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三种PTFs方法获取的侵蚀黑土水分特征曲线的比较
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作者 高晓飞 魏欣 高燕 《节水灌溉》 北大核心 2024年第11期97-102,共6页
采用3种土壤转换方程(PTFs)获取不同侵蚀程度黑土的土壤水分特征曲线(SWCC),并与实测数据进行了比较,以选择适合黑土SWCC间接获取的PTFs方法。以4种不同侵蚀程度的黑土为供试土壤,采用常用的PTFs计算机模型:Rosetta3、CalcPTF和以最大... 采用3种土壤转换方程(PTFs)获取不同侵蚀程度黑土的土壤水分特征曲线(SWCC),并与实测数据进行了比较,以选择适合黑土SWCC间接获取的PTFs方法。以4种不同侵蚀程度的黑土为供试土壤,采用常用的PTFs计算机模型:Rosetta3、CalcPTF和以最大吸湿量为残余含水量(θ_(r))发展的PTFs方法(编号:PTFs3),进行了SWCC的van Genuchten (VG)模型参数的预报。Rosetta3模型的输入参数包括土壤机械组成、土壤密度、33 kPa压力下的土壤含水率(θ_(33 kPa))和1 500 kPa压力下土壤含水量(θ_(1 500 kPa));CalcPTF模型的输入参数包括土壤机械组成、土壤密度和有机碳含量;PTFs3的输入参数包括饱和含水量(θ_(0))、最大吸湿量(θ_(97%RH))、θ_(33 kPa)和θ_(1 500 kPa)。将上述3种方法获取的参数带入VG模型,得出供试土壤在不同水吸力下的土壤含水量,并与实测结果进行对比。结果显示,使用3种PTFs模型输出参数的VG模型预报值与实测值都有极显著的相关性,总体计算结果与实测结果也比较接近。PTFs3预报值与实测值的差值在±0.05 cm^(3)/cm^(3)内;CalcPTF-Var模型差值在-0.08~0.05 cm^(3)/cm^(3)之间;而Rosetta3模型的差值在-0.10~0.06 cm^(3)/cm^(3)之间。在土壤含水率压力小于33 kPa情况下时,SWCC差值相对较大。Rosetta3和PTFs3因为有θ_(33 kPa)和θ_(1 500 kPa)两点的水分进行校正,精确性比较可控,效果优于CalcPTF-Var。预报值与实测值差异的百分比也说明了这一点。具体到每个供试土壤样本,3种PTFs对剧烈侵蚀的黑土预报偏差百分比都较大,但PTFs3表现较优于其他两种模型。CalcPTF-Var在微度侵蚀样本S1的模拟上也出现了相对较大的偏差。综上,PTFs3模型是一种比较适合预报黑土SWCC的VG模型参数的PTFs方法。Rosetta3模型误差主要来源于较严重的低估了≤1 kPa SWCC的土壤含水量,而高估了6~33 kPa的土壤含水量。仅输入土壤理化性质的CalcPTF-Var模型需注意在部分黑土样本上的较大偏差。 展开更多
关键词 土壤转换方程 黑土 侵蚀程度 土壤水分特征曲线 VG模型 最大吸湿量 rosetta3 CalcPTF
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“Rosetta stone”的启示
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作者 章育才 《山东外语教学》 1980年第1期70-,共1页
笔者译《国际晶体生长协会第五次大会程序记录》,内有大会主席劳迪斯的序言(Proceeding of the Fifth International Conference on Crystal Growth,Preface,by Co-chairman Laudise),序言中有这样一句话:
关键词 rosetta 晶体生长 chairman BONDING 科技英语翻译 三十一岁 日本文部省 旁搜 十年 有法
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2024年诺贝尔化学奖:计算蛋白质设计与蛋白质结构预测的新时代
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作者 郭福虎 《西北师范大学学报(自然科学版)》 CAS 2024年第6期119-121,I0004,共4页
2024年诺贝尔化学奖授予了三位科学家:David Baker,Demis Hassabis和John Jumper,表彰他们在计算蛋白质设计和蛋白质结构预测方面的开创性工作.这一成就不仅突破了人类对蛋白质这一生命基本分子的理解,还在生物技术、药物开发、材料科... 2024年诺贝尔化学奖授予了三位科学家:David Baker,Demis Hassabis和John Jumper,表彰他们在计算蛋白质设计和蛋白质结构预测方面的开创性工作.这一成就不仅突破了人类对蛋白质这一生命基本分子的理解,还在生物技术、药物开发、材料科学等领域引发了革命性变革. 展开更多
关键词 诺贝尔化学奖 计算蛋白质设计 蛋白质结构预测 rosetta软件 AlphaFold技术
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改善稀有密码子和氨基酸残基限制提高重组人ADAM15去整合素结构域蛋白表达水平 被引量:14
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作者 吴静 雷楗勇 +2 位作者 张莲芬 花慧 金坚 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1067-1074,共8页
【目的】为提高重组人ADAM(A Disintegrin And Metalloproteinase)15去整合素结构域蛋白(rhADAM15)的表达水平。【方法】在详尽分析rhADAM15的cDNA和GST(谷胱甘肽-S-转移酶)-ADAM15结构的基础上,选择表达宿主菌并对表达质粒进行改造。... 【目的】为提高重组人ADAM(A Disintegrin And Metalloproteinase)15去整合素结构域蛋白(rhADAM15)的表达水平。【方法】在详尽分析rhADAM15的cDNA和GST(谷胱甘肽-S-转移酶)-ADAM15结构的基础上,选择表达宿主菌并对表达质粒进行改造。【结果】(1)选择能为大肠杆菌稀有密码子提供额外tRNA的Escherichia coli.Rosetta(DE3)作为宿主菌,将质粒pGEX-ADAM15转化于其中在最佳诱导表达条件下获得298mg/L融合蛋白GST-ADAM15;(2)采用PCR体外定点突变技术将目标蛋白编码区稀有密码子GGA(Gly425)替换为GGC,使融合蛋白表达水平提高9.4%;(3)通过消除凝血酶识别序列附近的Pro-Glu-Phe残基,提高凝血酶酶切效率,使rhADAM15产量提高了35.7%;(4)在GGA替换为GGC基础上切除"Pro-Glu-Phe"残基,使rhADAM15产量提高到68mg/L,比分别切除"Pro-Glu-Phe"残基、GGA替换为GGC和野生型提高了19.2%、51.1%和61.9%。【结论】这一结果表明,在充分认识目标蛋白特性的基础上定向选择表达宿主并改造表达质粒能实现外源蛋白高水平表达。 展开更多
关键词 ADAM15去整合素结构域 大肠杆菌rosetta(DE3) 稀有密码子 PCR定点突变 抑制血管生成
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基于粗集理论的中医喘证临床医案关联规则分析 被引量:4
18
作者 阎红灿 李丽红 +3 位作者 马会霞 李洁 包巨太 刘保相 《辽宁中医杂志》 CAS 2012年第7期1218-1220,共3页
中医临床经验和医案的丰富和庞杂,迫切需要高效的医案分析方法进行辅助学习,通过现代数据处理技术对中医用药经验进行量化研究,为中医走向现代化探索一条有效的研究途径。ROSETTA系统是目前最完整灵活、先进的粗糙集软件系统,基于分类规... 中医临床经验和医案的丰富和庞杂,迫切需要高效的医案分析方法进行辅助学习,通过现代数据处理技术对中医用药经验进行量化研究,为中医走向现代化探索一条有效的研究途径。ROSETTA系统是目前最完整灵活、先进的粗糙集软件系统,基于分类规则,为医学临床诊断提供了科学的数据挖掘和分析方法。该文以中医喘证临床医案为例,详细论述了应用该系统处理症状信息和挖掘用药配伍规律的全过程,为中医临床经验的传承和学习提供了新的研究思路。 展开更多
关键词 粗集理论 临床医案 关联规则 rosetta系统
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一种基于片段组装的蛋白质构象空间优化算法 被引量:3
19
作者 郝小虎 张贵军 +2 位作者 周晓根 程正华 张启鹏 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2015年第3期237-240,共4页
针对蛋白质构象空间优化问题,提出一种基于片段组装的构象空间优化算法。算法利用基于Rosetta粗粒度的知识能量模型有效地提高了收敛速度;同时,借助片段组装技术可以有效弥补因能量函数不精确而导致的预测精度不足的缺陷;此外,差分进化... 针对蛋白质构象空间优化问题,提出一种基于片段组装的构象空间优化算法。算法利用基于Rosetta粗粒度的知识能量模型有效地提高了收敛速度;同时,借助片段组装技术可以有效弥补因能量函数不精确而导致的预测精度不足的缺陷;此外,差分进化算法的引入使得算法具有较好的全局搜索能力。5种测试蛋白的实验结果表明,所提算法具有较好的搜索性能和预测精度。 展开更多
关键词 蛋白质结构预测 片段组装 差分进化算法 rosetta粗粒度能量模型
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鸡骨钙素蛋白的原核表达及其生物学活性 被引量:2
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作者 江莎 张建鹏 +2 位作者 姚大伟 马晓平 侯加法 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期60-66,共7页
为获得具有生物活性的骨钙素蛋白,以鸡颅骨提取的总RNA为模板,RT-PCR法克隆鸡骨钙素成熟肽DNA,连接至原核表达载体pET-32a(+),构建表达质粒pET-32a(+)-rchOC。质粒转化Rosetta-gami(DE3)pLyS宿主菌,IPTG诱导表达含His标签的重组蛋白His-... 为获得具有生物活性的骨钙素蛋白,以鸡颅骨提取的总RNA为模板,RT-PCR法克隆鸡骨钙素成熟肽DNA,连接至原核表达载体pET-32a(+),构建表达质粒pET-32a(+)-rchOC。质粒转化Rosetta-gami(DE3)pLyS宿主菌,IPTG诱导表达含His标签的重组蛋白His-rchOC。肠激酶酶切去除融合蛋白中的His标签后获得重组骨钙素蛋白(rchOC)。通过与羟基磷灰石结合试验、MTT及PNPP法分析该蛋白生物学活性。结果显示:重组骨钙素蛋白能与羟基磷灰石结合,抑制成骨细胞中碱性磷酸酶的表达,但不影响成骨细胞的增殖。结论:经原核表达系统已成功获得鸡重组骨钙素蛋白,且该蛋白具有生物活性。 展开更多
关键词 骨钙素 pET-32a(+) rosetta—gami(DE3)pLyS 蛋白表达 羟基磷灰石 成骨细胞
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