结核分枝杆菌Rv0175基因编码蛋白的生物信息学分析

目的获取结核分枝杆菌Rv0175基因信息,运用多种生物信息学分析软件预测其编码的Mce相关膜蛋白结构和功能。方法从NCBI网站上获得结核分枝杆菌Rv0175基因及编码的Mce相关膜蛋白的基本信息,利用Expasy网站Proparam、ProScale和STRING等在线分析工具对Mce相关膜蛋白的生物信息学进行预测及分析。结果Rv0175基因全长为642 bp,有6个开放阅读框架,编码Mce相关膜蛋白:氨基酸总数为213,分子式为C949H1545N285O320S9,等电点4.86,为稳定、疏水蛋白,有30个磷酸化位点,无保守域;二级结构中α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规则卷曲所占比例分别为48.36%、11.74%、4.23%和35.68%;可能含有的B细胞抗原表位(>0.85)5个,T细胞抗原表位(≥15)6个;含有8个CTL细胞抗原决定簇(≥21),无Th细胞抗原决定簇。结论预测分析Mce相关膜蛋白有多个可能的B细胞和T细胞抗原表位,可作为结核治疗的有效靶点。