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基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的米象与玉米象的分子鉴定
被引量:
3
1
作者
张蒙
赵艳艳
+1 位作者
鲁玉杰
高晴
《中国粮油学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期174-180,共7页
为建立基于线粒体COI和COⅡ基因序列的米象和玉米象的分子鉴定方法,对采自全国6个地理种群的米象和2个地理种群的玉米象,PCR扩增试虫线粒体COI和COⅡ基因,将获得的基因序列在GenBank中进行BLAST比对,分析基因序列相似性,分别计算基于COI...
为建立基于线粒体COI和COⅡ基因序列的米象和玉米象的分子鉴定方法,对采自全国6个地理种群的米象和2个地理种群的玉米象,PCR扩增试虫线粒体COI和COⅡ基因,将获得的基因序列在GenBank中进行BLAST比对,分析基因序列相似性,分别计算基于COI和COⅡ基因序列的遗传距离,并构建系统发育树。分析结果表明,米象COI基因的种内相似度在98.17%以上,玉米象COI基因的种内相似度100%,米象和玉米象COI基因的种间相似度为85.84%~86.92%;米象COⅡ基因的种内相似度在98.37%以上,玉米象COⅡ基因的种内相似度在97.77%以上,2种象虫COⅡ基因的种间相似度为86.27%~88.31%。米象的种内遗传距离为0.002~0.020(COI)和0.011~0.015(COⅡ),玉米象的种内遗传距离为0.001~0.023(COⅡ)。两种象虫的种间遗传距离为0.145~0.185(COI)和0.128~0.154(COⅡ),基于COI和COⅡ基因的种间遗传距离显著高于种内遗传距离。系统发育树结果显示,在2个基因的系统发育树上,米象和玉米象的基因序列分别位于不同的进化支,同种象虫的基因序列位于相同的进化枝。根据本研究所用的线粒体COI和COⅡ基因序列的差异性可以进行米象和玉米象的分子鉴定。
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关键词
米象
玉米象
COI基因
COⅡ基因
单倍型
分子鉴定
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职称材料
题名
基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的米象与玉米象的分子鉴定
被引量:
3
1
作者
张蒙
赵艳艳
鲁玉杰
高晴
机构
河南工业大学粮油食品学院
出处
《中国粮油学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第10期174-180,共7页
基金
河南省自然科学基金(202300410105)
河南省高等学校重点科研项目(20A210008)
河南工业大学高层次人才科研基金项目(2018BS069)。
文摘
为建立基于线粒体COI和COⅡ基因序列的米象和玉米象的分子鉴定方法,对采自全国6个地理种群的米象和2个地理种群的玉米象,PCR扩增试虫线粒体COI和COⅡ基因,将获得的基因序列在GenBank中进行BLAST比对,分析基因序列相似性,分别计算基于COI和COⅡ基因序列的遗传距离,并构建系统发育树。分析结果表明,米象COI基因的种内相似度在98.17%以上,玉米象COI基因的种内相似度100%,米象和玉米象COI基因的种间相似度为85.84%~86.92%;米象COⅡ基因的种内相似度在98.37%以上,玉米象COⅡ基因的种内相似度在97.77%以上,2种象虫COⅡ基因的种间相似度为86.27%~88.31%。米象的种内遗传距离为0.002~0.020(COI)和0.011~0.015(COⅡ),玉米象的种内遗传距离为0.001~0.023(COⅡ)。两种象虫的种间遗传距离为0.145~0.185(COI)和0.128~0.154(COⅡ),基于COI和COⅡ基因的种间遗传距离显著高于种内遗传距离。系统发育树结果显示,在2个基因的系统发育树上,米象和玉米象的基因序列分别位于不同的进化支,同种象虫的基因序列位于相同的进化枝。根据本研究所用的线粒体COI和COⅡ基因序列的差异性可以进行米象和玉米象的分子鉴定。
关键词
米象
玉米象
COI基因
COⅡ基因
单倍型
分子鉴定
Keywords
s.oryzea
S.zeamais
COI gene
COII gene
haplotype
molecular identification
分类号
S186 [农业科学—农业基础科学]
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作者
出处
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被引量
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1
基于线粒体COⅠ和COⅡ基因的米象与玉米象的分子鉴定
张蒙
赵艳艳
鲁玉杰
高晴
《中国粮油学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
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