钙结合蛋白S100A11促进结直肠癌进展的作用及其机制研究

目的:探讨钙结合蛋白S100A11调控结直肠癌(colorectal cancer,CRC)进展的作用及其机制。方法:利用GEPIA、UALCAN和HPA等数据库分析S100A11在CRC中的表达情况及其与CRC临床分期和预后的关系,并利用CRC细胞系/永生化肠上皮细胞进行验证,利用RNA干扰实验进一步分析S100A11对CRC细胞迁移及CRC生物学通路的影响。结果:数据库分析结果显示,与正常结直肠组织相比,S100A11在CRC组织中表达显著升高,并且S100A11与CRC的晚期分期及不良预后密切相关。RT-qPCR和Western blot结果也显示,S100A11在CRC细胞中表达升高。敲低S100A11能够有效抑制SW480细胞的迁移和上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)过程。沉默CRC细胞中S100A11的表达后,利用转录组测序和生信分析,共筛选出149个差异表达基因,这些差异表达基因的功能网络富集结果主要涉及到炎症性肠病、黏着斑和PI3K-Akt信号通路等。结论:本研究发现高表达的S100A11是CRC转移的重要因素,并初步揭示S100A11调控CRC细胞的关键信号通路,为深入探讨S100A11调控CRC进展的分子机制提供了实验依据。

苏博美利奴羊S100A11基因序列分析及表达研究

为了探讨S100A11基因在苏博美利奴羊中不同类型细度的细毛羊中的表达模式,试验以苏博美利奴羊为研究对象,克隆了钙囊素S100A11基因,采用生物信息学方法进行遗传进化分析,对S100A11蛋白的理化性质进行分析,并对其二级蛋白结构进行预测,且通过RT-PCR相对定量方法检测S100A11基因在不同绵羊个体中的表达规律。结果表明：绵羊S100A11基因的CDS全长序列为866bp,编码了105个氨基酸,与绵羊、山羊、牛、猪、鼠、兔、鸡、狗和斑马鱼的CDS同源性分别为96%、96%、96%、87%、24%、44%、70%、70%、60%;分别在1bp、220~336bp、415~864bp有3个开放式阅读框（ORF）;S100A11基因全长为4798bp。S100A11蛋白含有1个信号肽、19个磷酸化位点;同时S100A11基因在超细型细毛羊皮肤组织表达量极显著高于细型细毛羊的表达量（P〈0.01）,差异倍数为2.048。

皮肤鳞状细胞癌进展的差异蛋白筛选及鉴定

目的探讨皮肤鳞状细胞癌(CSCC)进展的生物学标志物。方法在GEO数据库中筛选CSCC、日光性角化(AK)和正常皮肤组织的基因表达谱芯片数据集,通过GEO2R在线数据库筛选在正常组织、AK和CSCC3组间存在显著表达差异的基因。纳入2022年6月—12月本院皮肤科65例CSCC患者(CSCC组)、40例AK患者(AK组)和30例正常对照者(对照组)作为研究对象,组织和血清中目的蛋白的表达水平采用免疫组化法和ELISA法检测。血清中目的蛋白表达水平在鉴别AK和CSCC的临床效能采用受试者操作特征曲线(ROC)分析。结果GEO2R在线数据库筛选出5个共同差异表达基因TMSΒ10、PDZD2、ENO1、RRBP1和S100A11。ENO1和S100A11蛋白表达水平在对照组、AK组和CSCC组3组间两两相比差异有统计学意义(P<0.05)。CSCC患者血清中ENO1和S100A11蛋白表达水平与肿瘤细胞分化程度和浸润深度显著相关(P<0.05)。ROC曲线后显示,ENO1和S100A11蛋白表达水平在鉴别AK和CSCC的AUC分别为0.964和0.953,其中ENO1的截断值为35.12 ng/ml,诊断敏感度和特异度分别为95.13%和92.45%,其中S100A11的截断值为23.68 ng/ml,诊断敏感度和特异度分别为94.67%和93.21%。免疫组化结果显示,ENO1在癌组织高度表达18例,中度表达12例,癌旁组织中均无阳性表达;S100A11在癌组织高度表达30例,癌旁组织中均无阳性表达。与癌旁组织相比,CSCC癌组织中ENO1和S100A11阳性表达率显著升高(P<0.05)。结论ENO1和S100A11可能是促进CSCC进展的生物学标志物。