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应用^(15)N-~1H残留偶极偶合验证刪除肝癌2(DLC2-SAM)不育-α-基序域的螺旋间的取向(英文)
1
作者
李洪艳
时港洪
+1 位作者
冯景梁
孙红哲
《波谱学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期584-596,共13页
刪除肝癌2(DLC2),一种经常发现在原发性肝癌过低表达的肿瘤抑制基因,编码一种含有不育-α-基序多域蛋白质(DLC2-SAM).以前SAM域蛋白(DLC2-SAM)核磁共振结构显示此蛋白是由独特的四螺旋束组成,与其它已知SAM域结构截然不同.在该研究中,...
刪除肝癌2(DLC2),一种经常发现在原发性肝癌过低表达的肿瘤抑制基因,编码一种含有不育-α-基序多域蛋白质(DLC2-SAM).以前SAM域蛋白(DLC2-SAM)核磁共振结构显示此蛋白是由独特的四螺旋束组成,与其它已知SAM域结构截然不同.在该研究中,作者运用了15N-1H残留偶极偶合(RDC)作为附加约束连同NOE和TA-LOS数据进一步优化了DLC2-SAM的结构.由此所得的结构与没有15N-1H残留偶极偶合约束比较显示改善了结构的质量并且有较低的Q值.螺旋的取向,尤其是螺旋4,被残留偶极偶合数据所验证.RDC-优化的人类DLC2-SAM的结构与小鼠的DLC2-SAM很相像.DLC家庭独特的SAM域结构表明该域可能还具有没被发现的新功能.
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关键词
核磁共振(NMR)
DLC2
残留偶极偶合
sam域
结构优化
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职称材料
PRKDC SAMHD1 miR-515-3p在进展期胃癌中的表达及与病理特征相关性研究
被引量:
2
2
作者
肖聃
闻朋浩
张振
《实用医技杂志》
2022年第3期249-253,共5页
目的研究PRKDC、SAMHD1、miR-515-3p在进展期胃癌中的表达及与病理特征相关性。方法选取2020年1月至2021年1月于我院确诊的132例进展期胃癌患者,采用免疫组织化学测定癌组织、癌旁组织PRKDC及SAMHD1阳性率,采用实时荧光定量聚合酶链反应...
目的研究PRKDC、SAMHD1、miR-515-3p在进展期胃癌中的表达及与病理特征相关性。方法选取2020年1月至2021年1月于我院确诊的132例进展期胃癌患者,采用免疫组织化学测定癌组织、癌旁组织PRKDC及SAMHD1阳性率,采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)法测定癌组织、癌旁组织miR-515-3p表达量。分析三者与进展期胃癌患者病理特征、预后的关系及对疾病的预测价值。结果癌组织PRKDC、SAMHD1阳性率、miR-515-3p表达量高于癌旁组织(P<0.05)。PRKDC、SAMHD1、miR-515-3p与患者肿瘤直径无关,差异无统计学意义(P>0.05);与TNM分期、分化程度、浸润深度、有无淋巴结转移、有无神经脉管侵犯相关(P<0.05)。与PRKDC、SAMHD1、miR-515-3p单项相比,三项联合对进展期胃癌的预测价值较高(P<0.05)。结论PRKDC、SAMHD1、miR-515-3p在进展期胃癌表达升高,且与患者多种病理特征有关,可用于疾病预测。
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关键词
胃肿瘤
含
sam域
和HD
域
蛋白1
病理学
PRKDC
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职称材料
SAMHD1抑制肺腺癌细胞中PD-L1表达的研究
被引量:
1
3
作者
李杨仪
龚龑
谢丛华
《国际肿瘤学杂志》
CAS
2022年第11期658-664,共7页
目的探讨在肺腺癌中含SAM域和HD域蛋白1(SAMHD1)与程序性死亡配体-1(PD-L1)表达的相关性。方法通过在线数据库GEPIA和Kaplan-Meier Plotter分析SAMHD1在肺腺癌中的表达及对预后的影响。通过实时荧光定量PCR(qPCR)和蛋白质印迹法检测SAM...
目的探讨在肺腺癌中含SAM域和HD域蛋白1(SAMHD1)与程序性死亡配体-1(PD-L1)表达的相关性。方法通过在线数据库GEPIA和Kaplan-Meier Plotter分析SAMHD1在肺腺癌中的表达及对预后的影响。通过实时荧光定量PCR(qPCR)和蛋白质印迹法检测SAMHD1在多个肺腺癌细胞株中的表达。利用小干扰RNA转染及慢病毒感染技术分别对H1975、H1299及LLC细胞进行SAMHD1基因沉默,通过qPCR、蛋白质印迹法检测对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组肺腺癌细胞中PD-L1 mRNA及蛋白表达水平,用流式细胞术检测细胞膜PD-L1的表达水平。构建小鼠肺腺癌移植瘤模型,用免疫组织化学法检测对照组和shSAMHD1组移植瘤组织中PD-L1的表达。用CCK-8检测对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组肺腺癌细胞增殖活力。结果GEPIA数据库结果表明,SAMHD1 mRNA在肺腺癌中的表达较肺正常组织低(4.81±0.90 vs.5.99±0.76,t=20.67,P<0.001)。SAMHD1高表达患者中位总生存期明显长于低表达患者(109.0个月vs.87.7个月,χ^(2)=26.83,P=0.002)。A549、PC9、H1299和H1975细胞中SAMHD1 mRNA相对表达量分别为1.00±0.02、0.75±0.05、3.49±0.19和7.25±0.38(F=589.00,P<0.001),蛋白相对表达量分别为1.00±0.06、0.34±0.07、1.67±0.22和2.11±0.63(F=15.79,P=0.001)。H1975细胞中,对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组的PD-L1 mRNA相对表达水平分别为1.00±0.00、1.54±0.26、2.89±0.13(F=102.30,P<0.001),蛋白相对表达水平分别为1.00±0.01、1.50±0.10和1.52±0.33(F=6.65,P=0.030);H1299细胞中,3组的PD-L1 mRNA相对表达水平分别为1.00±0.08、1.63±0.03和2.14±0.03(F=368.80,P<0.001),蛋白相对表达水平分别为1.00±0.07、1.88±0.35和2.05±0.38(F=10.66,P=0.011),siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组PD-L1表达水平均高于对照组(均P<0.05)。流式细胞术结果表明,H1975细胞中,对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组膜PD-L1荧光强度分别为246.83±27.59、325.60±8.00和308.93±7.60(F=17.56,P=0.003);H1299细胞中,3组的荧光强度分别为959.00±6.25、1084.33±7.64和1085.33±21.22(F=86.74,P<0.001),siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组荧光强度均高于对照组(均P<0.05)。在小鼠移植瘤模型中,shSAMHD1组PD-L1的H-SCORE评分高于对照组(7.99±1.10 vs.4.49±0.43,t=5.13,P=0.007)。H1975细胞中,对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组72 h细胞增殖活力分别为0.50±0.02、0.75±0.05和0.73±0.06(F=25.01,P=0.001);H1299细胞中,3组72 h细胞增殖活力分别为0.80±0.01、1.00±0.04和0.93±0.07(F=13.90,P=0.006),siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组细胞增殖活力均高于对照组(均P<0.05)。结论在肺腺癌中,沉默SAMHD1可以提高PD-L1的表达。
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关键词
肺腺癌
B7-H1抗原
含
sam域
和HD
域
蛋白1
原文传递
题名
应用^(15)N-~1H残留偶极偶合验证刪除肝癌2(DLC2-SAM)不育-α-基序域的螺旋间的取向(英文)
1
作者
李洪艳
时港洪
冯景梁
孙红哲
机构
香港大学化学系
出处
《波谱学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期584-596,共13页
基金
Research Grants Council of Hong Kong,Croucher Foundation and the University of Hong Kong development fund(UDF)
文摘
刪除肝癌2(DLC2),一种经常发现在原发性肝癌过低表达的肿瘤抑制基因,编码一种含有不育-α-基序多域蛋白质(DLC2-SAM).以前SAM域蛋白(DLC2-SAM)核磁共振结构显示此蛋白是由独特的四螺旋束组成,与其它已知SAM域结构截然不同.在该研究中,作者运用了15N-1H残留偶极偶合(RDC)作为附加约束连同NOE和TA-LOS数据进一步优化了DLC2-SAM的结构.由此所得的结构与没有15N-1H残留偶极偶合约束比较显示改善了结构的质量并且有较低的Q值.螺旋的取向,尤其是螺旋4,被残留偶极偶合数据所验证.RDC-优化的人类DLC2-SAM的结构与小鼠的DLC2-SAM很相像.DLC家庭独特的SAM域结构表明该域可能还具有没被发现的新功能.
关键词
核磁共振(NMR)
DLC2
残留偶极偶合
sam域
结构优化
Keywords
NMR spectroscopy
DLC2
residual dipolar coupling
sam
domain
structure refinement
分类号
O482.53 [理学—固体物理]
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职称材料
题名
PRKDC SAMHD1 miR-515-3p在进展期胃癌中的表达及与病理特征相关性研究
被引量:
2
2
作者
肖聃
闻朋浩
张振
机构
河南省南阳市南石医院肿瘤内科
河南省南阳市第一人民医院肿瘤内科
出处
《实用医技杂志》
2022年第3期249-253,共5页
文摘
目的研究PRKDC、SAMHD1、miR-515-3p在进展期胃癌中的表达及与病理特征相关性。方法选取2020年1月至2021年1月于我院确诊的132例进展期胃癌患者,采用免疫组织化学测定癌组织、癌旁组织PRKDC及SAMHD1阳性率,采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)法测定癌组织、癌旁组织miR-515-3p表达量。分析三者与进展期胃癌患者病理特征、预后的关系及对疾病的预测价值。结果癌组织PRKDC、SAMHD1阳性率、miR-515-3p表达量高于癌旁组织(P<0.05)。PRKDC、SAMHD1、miR-515-3p与患者肿瘤直径无关,差异无统计学意义(P>0.05);与TNM分期、分化程度、浸润深度、有无淋巴结转移、有无神经脉管侵犯相关(P<0.05)。与PRKDC、SAMHD1、miR-515-3p单项相比,三项联合对进展期胃癌的预测价值较高(P<0.05)。结论PRKDC、SAMHD1、miR-515-3p在进展期胃癌表达升高,且与患者多种病理特征有关,可用于疾病预测。
关键词
胃肿瘤
含
sam域
和HD
域
蛋白1
病理学
PRKDC
Keywords
Stomach neoplasms
sam
domain and HD domain-containing protein 1
Pathology
PRKOC
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
SAMHD1抑制肺腺癌细胞中PD-L1表达的研究
被引量:
1
3
作者
李杨仪
龚龑
谢丛华
机构
武汉大学中南医院肿瘤放化疗科
武汉大学中南医院生物样本库
出处
《国际肿瘤学杂志》
CAS
2022年第11期658-664,共7页
基金
国家自然科学基金(81972852)
文摘
目的探讨在肺腺癌中含SAM域和HD域蛋白1(SAMHD1)与程序性死亡配体-1(PD-L1)表达的相关性。方法通过在线数据库GEPIA和Kaplan-Meier Plotter分析SAMHD1在肺腺癌中的表达及对预后的影响。通过实时荧光定量PCR(qPCR)和蛋白质印迹法检测SAMHD1在多个肺腺癌细胞株中的表达。利用小干扰RNA转染及慢病毒感染技术分别对H1975、H1299及LLC细胞进行SAMHD1基因沉默,通过qPCR、蛋白质印迹法检测对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组肺腺癌细胞中PD-L1 mRNA及蛋白表达水平,用流式细胞术检测细胞膜PD-L1的表达水平。构建小鼠肺腺癌移植瘤模型,用免疫组织化学法检测对照组和shSAMHD1组移植瘤组织中PD-L1的表达。用CCK-8检测对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组肺腺癌细胞增殖活力。结果GEPIA数据库结果表明,SAMHD1 mRNA在肺腺癌中的表达较肺正常组织低(4.81±0.90 vs.5.99±0.76,t=20.67,P<0.001)。SAMHD1高表达患者中位总生存期明显长于低表达患者(109.0个月vs.87.7个月,χ^(2)=26.83,P=0.002)。A549、PC9、H1299和H1975细胞中SAMHD1 mRNA相对表达量分别为1.00±0.02、0.75±0.05、3.49±0.19和7.25±0.38(F=589.00,P<0.001),蛋白相对表达量分别为1.00±0.06、0.34±0.07、1.67±0.22和2.11±0.63(F=15.79,P=0.001)。H1975细胞中,对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组的PD-L1 mRNA相对表达水平分别为1.00±0.00、1.54±0.26、2.89±0.13(F=102.30,P<0.001),蛋白相对表达水平分别为1.00±0.01、1.50±0.10和1.52±0.33(F=6.65,P=0.030);H1299细胞中,3组的PD-L1 mRNA相对表达水平分别为1.00±0.08、1.63±0.03和2.14±0.03(F=368.80,P<0.001),蛋白相对表达水平分别为1.00±0.07、1.88±0.35和2.05±0.38(F=10.66,P=0.011),siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组PD-L1表达水平均高于对照组(均P<0.05)。流式细胞术结果表明,H1975细胞中,对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组膜PD-L1荧光强度分别为246.83±27.59、325.60±8.00和308.93±7.60(F=17.56,P=0.003);H1299细胞中,3组的荧光强度分别为959.00±6.25、1084.33±7.64和1085.33±21.22(F=86.74,P<0.001),siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组荧光强度均高于对照组(均P<0.05)。在小鼠移植瘤模型中,shSAMHD1组PD-L1的H-SCORE评分高于对照组(7.99±1.10 vs.4.49±0.43,t=5.13,P=0.007)。H1975细胞中,对照组、siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组72 h细胞增殖活力分别为0.50±0.02、0.75±0.05和0.73±0.06(F=25.01,P=0.001);H1299细胞中,3组72 h细胞增殖活力分别为0.80±0.01、1.00±0.04和0.93±0.07(F=13.90,P=0.006),siSAMHD1-1组和siSAMHD1-2组细胞增殖活力均高于对照组(均P<0.05)。结论在肺腺癌中,沉默SAMHD1可以提高PD-L1的表达。
关键词
肺腺癌
B7-H1抗原
含
sam域
和HD
域
蛋白1
Keywords
Adenocarcinoma of lung
B7-H1 antigen
sam
and HD domain-containing protein 1
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用^(15)N-~1H残留偶极偶合验证刪除肝癌2(DLC2-SAM)不育-α-基序域的螺旋间的取向(英文)
李洪艳
时港洪
冯景梁
孙红哲
《波谱学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
下载PDF
职称材料
2
PRKDC SAMHD1 miR-515-3p在进展期胃癌中的表达及与病理特征相关性研究
肖聃
闻朋浩
张振
《实用医技杂志》
2022
2
下载PDF
职称材料
3
SAMHD1抑制肺腺癌细胞中PD-L1表达的研究
李杨仪
龚龑
谢丛华
《国际肿瘤学杂志》
CAS
2022
1
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