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环状RNA SAMD8调控miR-223-3p/RHOB表达抑制胰腺导管腺癌进程的分子机制
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作者 郑坚江 郑秉礼 刘跃全 《实用临床医药杂志》 CAS 2024年第5期31-39,共9页
目的探讨环状RNA SAMD8(circ-SAMD8)在胰腺导管腺癌(PDAC)进展中的潜在机制。方法基于Microarray数据(GSE79634)分析PDAC组织中circRNAs的表达谱。通过实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证circ-SAMD8(hsa_circ_0006148)在PDAC组织和... 目的探讨环状RNA SAMD8(circ-SAMD8)在胰腺导管腺癌(PDAC)进展中的潜在机制。方法基于Microarray数据(GSE79634)分析PDAC组织中circRNAs的表达谱。通过实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)验证circ-SAMD8(hsa_circ_0006148)在PDAC组织和细胞(CFPAC-1和PANC-1)中的表达。采用生物信息学分析预测circ-SAMD8的靶微小RNA(miRNA)及其下游mRNA,并采用双荧光素酶报告基因实验进行鉴定。采用MTT法和集落形成法检测PDAC细胞的增殖能力。采用免疫印迹法(Western blot)检测抗凋亡蛋白Bcl-2和促凋亡蛋白Bax的表达水平。采用流式细胞术检测凋亡细胞百分比。结果circ-SAMD8在PDAC组织和细胞中的表达水平低于癌旁组织和正常细胞,差异有统计学意义(P<0.05)。过表达circ-SAMD8能有效促进PDAC细胞凋亡,抑制PDAC细胞增殖。双荧光素酶报告基因实验显示,miR-223-3p是circ-SAMD8的一个潜在相互作用分子,miR-223-3p的下游mRNA靶点是RHOB。miR-223-3p在PDAC组织和细胞中异常过表达,并伴有RHOB低表达。在转染miR-223-3p模拟物或sh-circ-SAMD8的PDAC细胞中,RHOB表达显著降低,增殖能力增强,凋亡率降低。结论circ-SAMD8通过海绵化miR-223-3p,调控下游RHOB的表达,有效抑制PDAC的发生发展。 展开更多
关键词 胰腺导管腺癌 环状RNA samd8 微小RNA-223-3p RHOB基因 靶点 细胞增殖
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SAMD13通过激活ERK1/2对胶质瘤细胞增殖和侵袭的影响
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作者 季明德 廖俊进 +5 位作者 高彩月 倪思琦 高培宇 王迎伟 邱文 赵晨卉 《南京医科大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2024年第12期1649-1656,共8页
目的:检测胶质瘤组织和细胞中无菌α基序结构域蛋白13(sterile alpha motif domain-containing protein 13,SAMD13)的表达情况,并探究SAMD13表达对胶质瘤细胞增殖和侵袭的影响和调控机制。方法:使用GEPIA数据库分析胶质瘤患者癌组织中SA... 目的:检测胶质瘤组织和细胞中无菌α基序结构域蛋白13(sterile alpha motif domain-containing protein 13,SAMD13)的表达情况,并探究SAMD13表达对胶质瘤细胞增殖和侵袭的影响和调控机制。方法:使用GEPIA数据库分析胶质瘤患者癌组织中SAMD13的表达及其与预后的相关性。行RT-PCR和Western blot检测胶质瘤细胞系(U373、U87和U251)中SAMD13的表达情况。构建SAMD13过表达质粒(pIRES2-SAMD13)和SAMD13 shRNA质粒(shSAMD13),转染细胞后行Western blot、CCK-8和Transwell实验,检测过表达和沉默SAMD13基因对于U373细胞增殖和侵袭的影响,同时检查Akt1、ERK1/2和STAT3的表达和磷酸化水平。此外,在转染pIRES2-SAMD13的同时,加入ERK1/2抑制剂(U0126),通过CCK-8和Transwell实验观察其对细胞增殖和侵袭的影响。结果:胶质瘤患者癌组织中SAMD13的表达显著高于癌旁组织,并与患者不良预后密切相关。U373、U87和U251 3种胶质瘤细胞系均表达SAMD13,以U373细胞表达最为显著。在U373细胞中转染pIRES2-SAMD13和shSAMD13,可分别过表达和沉默SAMD13基因,并分别促进和抑制细胞的增殖和侵袭。此外,过表达和沉默SAMD13可分别显著增强和减弱U373细胞中ERK1/2的磷酸化,而对Akt1和STAT3的磷酸化无明显影响。U0126可显著抑制由SAMD13过表达所诱发的U373细胞增殖和侵袭,但对SAMD13的表达无明显影响。结论:胶质瘤组织和细胞中均高表达SAMD13,上调的SAMD13可通过激活ERK1/2促进胶质瘤细胞的增殖和侵袭。 展开更多
关键词 胶质瘤 samd13 ERK1/2 增殖 侵袭
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老年胃癌患者SAMD4A和MDM2的表达及其临床意义
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作者 施雨花 许凤 龚苗 《临床和实验医学杂志》 2024年第10期1025-1029,共5页
目的观察老年胃癌患者癌组织中无菌α-基序结构域含蛋白4A(SAMD4A)和鼠双微体基因2(MDM2)的表达情况,并分析其临床意义。方法前瞻性选取2020年1月至2021年12月入上海市浦东新区公利医院行手术治疗的120例老年胃癌患者作为胃癌组,并选取... 目的观察老年胃癌患者癌组织中无菌α-基序结构域含蛋白4A(SAMD4A)和鼠双微体基因2(MDM2)的表达情况,并分析其临床意义。方法前瞻性选取2020年1月至2021年12月入上海市浦东新区公利医院行手术治疗的120例老年胃癌患者作为胃癌组,并选取同期在同院接受胃镜检查的100例胃部良性病变老年者作为对照组。采用免疫组织化学法检测组织中SAMD4A和MDM2阳性表达,比较两组患者的SAMD4A和MDM2阳性表达;采用单因素和多因素Logistic回归分析SAMD4A和MDM2阳性表达的影响因素;采用受试者操作特征(ROC)曲线评估SAMD4A和MDM2阳性表达对老年胃癌的诊断价值。结果胃癌组患者的SAMD4A和MDM2阳性表达率分别为68.33%、71.67%,均明显高于对照组(9.00%、11.00%),差异均有统计学意义(P<0.05)。不同性别、肿瘤直径、pTNM分期、脉管癌栓与否、不同Lauren分型的老年胃癌患者的SAMD4A和MDM2阳性表达率比较,差异均无统计学意义(P>0.05);淋巴结转移与否、不同组织学分级、浸润深度的老年胃癌患者的SAMD4A和MDM2阳性表达率比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。淋巴结转移、组织学分级、浸润深度是影响胃癌患者SAMD4A和MDM2阳性表达的独立危险因素(P<0.05)。SAMD4A诊断老年胃癌的曲线下面积(AUC)为0.846,敏感度为87.19%,特异度为79.63%;MDM2诊断老年胃癌的AUC为0.842,敏感度为86.93%,特异度为78.49%;SAMD4A和MDM2联合诊断老年胃癌的AUC为0.913,敏感度为91.62%,特异度为83.59%;联合检测的诊断效能明显高于单独检测,差异有统计学意义(P<0.05)。结论在老年胃癌患者中,SAMD4A和MDM2的阳性表达率明显升高,与胃癌临床特征的关系密切,能够反映老年胃癌的病变情况。检测SAMD4A和MDM2的表达情况对诊断老年胃癌有一定的临床价值,且两者联合的检测诊断价值更高。 展开更多
关键词 胃癌 samd4A MDM2 影响因素 诊断价值
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糖肾平对糖尿病肾病KK-Ay小鼠肾脏保护作用及对TGF-β_1/Samd6/BMP7信号通路影响的研究 被引量:10
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作者 吴阿敏 赵宗江 +5 位作者 张新雪 杨美娟 杨冠男 苗永辉 徐昌君 黄雅薇 《世界科学技术-中医药现代化》 2016年第8期1342-1352,共11页
目的:本研究主要探讨糖肾平对糖尿病肾病(DKD)KK-Ay小鼠肾脏保护作用及其对TGF-β_1/Samd6/BMP7信号通路的影响。方法:10只雌性C57BL/6J小鼠作为对照组。雌性10周龄KK-Ay小鼠60只,KK鼠料诱导10周后建立糖尿病肾病动物模型。模型小鼠按... 目的:本研究主要探讨糖肾平对糖尿病肾病(DKD)KK-Ay小鼠肾脏保护作用及其对TGF-β_1/Samd6/BMP7信号通路的影响。方法:10只雌性C57BL/6J小鼠作为对照组。雌性10周龄KK-Ay小鼠60只,KK鼠料诱导10周后建立糖尿病肾病动物模型。模型小鼠按体质量和血糖区组分层随机法分为模型组、厄贝沙坦组与糖肾平小、中、大剂量组。厄贝沙坦组,糖肾平小、中、大剂量组均灌胃给药,正常组、模型组用等体积去离子水灌胃。每4周称体质量和测24 h尿蛋白定量。实验第26周,眼球取血并处死小鼠,称肾脏质量、测血糖,分离血清测BUN、Scr、TG、MDA、NO和SOD;HE染色和Mallory染色观察肾组织病理形态;原位杂交、免疫组化、Western blot检测肾组织TGF-β_1、Samd6、BMP7、α-SMA、E-Cadherin m RNA及蛋白表达。结果:与模型组比较,各治疗组体质量、肾质量/体质量、尿蛋白降低,其中糖肾平中、大剂量组有显著性差异(P<0.01);肾脏病理损害明显减轻,FBG、血清BUN、Scr、TG和MDA含量明显降低(P<0.01),NO、SOD含量明显增加(P<0.01),Samd6、BMP7和E-Cadherin m RNA及蛋白的表达量增加,TGF-β_1和α-SMA m RNA及蛋白的表达量减少,其中糖肾平大剂量组有显著性差异(P<0.01),糖肾平的治疗效果呈剂量依赖关系。结论:糖肾平对DKD KK-Ay小鼠肾脏保护及逆转肾小管上皮细胞转分化的作用,可能与下调氧化应激水平及调节TGF-β_1/Samd6/BMP7信号通路有关,这为DKD"肾痿"学说提供了新的实验依据。 展开更多
关键词 糖尿病肾病 糖肾平 肾痿 KK-AY小鼠 TGF-β1/samd6/BMP7通路 肾小管上皮细胞转分化
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弥漫大B细胞淋巴瘤中SAMD9L的表达及意义 被引量:2
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作者 缪小兵 何松 +3 位作者 陈卓琳 张邢松 徐小红 周颖 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1193-1197,共5页
目的探讨SAMD9L在弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)中的表达及临床意义。方法采用免疫组化EnVision法检测135例DLBCL中SAMD9L的表达,分析SAMD9L表达与DLBCL临床病理特征、治疗反应及总生存期(overall survival,... 目的探讨SAMD9L在弥漫大B细胞淋巴瘤(diffuse large B cell lymphoma,DLBCL)中的表达及临床意义。方法采用免疫组化EnVision法检测135例DLBCL中SAMD9L的表达,分析SAMD9L表达与DLBCL临床病理特征、治疗反应及总生存期(overall survival,OS)之间的相关性。结果SAMD9L表达与患者年龄(P=0.049)、B症状(P=0.003)、国际预后指数(international prognostic index,IPI)评分(P=0.026)相关,其在年龄>60岁、有B症状以及高IPI评分患者中表达较高。但SAMD9L低表达组和高表达组患者在性别、结外累及、Hans分型、Ann Arbor分期、美国东部肿瘤协作组(Eastern Cooperative Oncology Group,ECOG)体能状态(performances status,PS)评分、Ki-67增殖指数、骨髓浸润、乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)水平、白蛋白(albumin,ALB)水平以及治疗反应方面差异无显著性(P均>0.05)。Kaplan-Meier生存曲线分析显示,SAMD9L高表达组较低表达组的OS显著缩短(P<0.001)。单因素和多因素回归分析显示,SAMD9L表达水平是影响OS的相关因素,但非预后的独立影响因素(P=0.710)。结论SAMD9L在患者年龄>60岁、有B症状以及高IPI评分患者中表达较高。SAMD9L高表达组较低表达组的OS显著缩短,SAMD9L表达水平是影响DLBCL患者OS的相关因素,但非预后的独立影响因素。 展开更多
关键词 淋巴瘤 弥漫大B细胞淋巴瘤 samd9L 免疫组织化学
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SAMD9/SAMD9L突变相关疾病5例并文献复习
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作者 王希楠 覃霞 +2 位作者 姚如恩 金燕樑 陈静 《中国小儿血液与肿瘤杂志》 CAS 2022年第4期221-225,共5页
目的总结分析SAMD9/SAMD9L基因突变所致疾病的临床特点和基因结果。方法回顾性分析2017年1月—2019年12月于上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心诊断的5例SAMD9/SAMD9L基因突变相关疾病的患儿临床资料和全外显子组测序结果。结果5... 目的总结分析SAMD9/SAMD9L基因突变所致疾病的临床特点和基因结果。方法回顾性分析2017年1月—2019年12月于上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心诊断的5例SAMD9/SAMD9L基因突变相关疾病的患儿临床资料和全外显子组测序结果。结果5例患儿中男孩3例(2例为同胞兄弟),女孩2例,中位年龄2岁(9个月~9岁)。2例表现为骨髓衰竭,均用环孢素治疗有效,其中1例停药后复发,成功接受异基因造血干细胞移植;1例表现为全身型幼年特发性关节炎合并巨噬细胞活化综合征,免疫抑制治疗有效;2例同胞兄弟表现为神经系统发育落后,其中1例脑垂体拉克氏囊肿。全外显子组测序结果显示2例为SAMD9基因的移码突变,2例为SAMD9L基因的移码突变,1例为SAMD9L基因的错义突变,均为致病突变。4例突变来自父亲或母亲,1例为新发突变。结论SAMD9/SAMD9L基因突变所致疾病可涉及造血、免疫和神经等诸多系统,临床表现可从无明显临床症状到严重综合征。对于SAMD9/SAMD9L基因突变所致的骨髓衰竭性疾病,异基因造血干细胞移植是有效的治疗手段,对于诸如神经系统等其他系统的病变,则以对症支持治疗为主。 展开更多
关键词 samd9 samd9L 骨髓衰竭 幼年特发性关节炎 神经病变
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SAMD9在食管鳞癌中的表达及其意义
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作者 汤善宏 郑琇山 +5 位作者 贺莉 乔丽娟 景丹 倪阵 曾维政 蒋明德 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期411-413,416,共4页
目的研究SAMD9(sterile alpha motif domain-containing 9)在食管癌中表达和临床意义。方法选取72例手术切除食管癌及癌旁组织,采用免疫组织化学染色法检测SAMD9在食管癌及癌旁组织表达差异,并分析其在食管癌组织表达临床意义。另外选取... 目的研究SAMD9(sterile alpha motif domain-containing 9)在食管癌中表达和临床意义。方法选取72例手术切除食管癌及癌旁组织,采用免疫组织化学染色法检测SAMD9在食管癌及癌旁组织表达差异,并分析其在食管癌组织表达临床意义。另外选取3例手术时已发生转移及3例手术时未发现任何转移的食管癌组织,Western blot法检测SAMD9在2组中表达差异。结果 SAMD9在食管癌组织及癌旁食管鳞状上皮细胞中表达无明显差异;SAMD9在食管癌组织中表达水平与患者淋巴管浸润及淋巴结转移密切相关(P<0.05),而与患者性别、年龄、分化及T分期无明显相关性(P>0.05)。Western blot法结果显示SAMD9在转移性食管癌组织中表达水平显著强于非转移性食管癌组织(P<0.01)。结论 SAMD9在食管癌组织中表达水平与转移密切相关。 展开更多
关键词 samd9 食管癌 转移
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SAMD20/21+ATWINC1500的智能容栅位移传感器设计 被引量:1
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作者 于兴晗 《单片机与嵌入式系统应用》 2016年第8期46-49,共4页
介绍了一款使用SAMD20/21+ATWINC1500方案设计并实现的WIFI智能容栅位移传感器,并详细介绍其原理和相关技术。本文设计的传感器可以将测量的位移数据通过WIFI接口上传到Internet,异地终端接收数据并处理,不但可以实现异地测量,而且可以... 介绍了一款使用SAMD20/21+ATWINC1500方案设计并实现的WIFI智能容栅位移传感器,并详细介绍其原理和相关技术。本文设计的传感器可以将测量的位移数据通过WIFI接口上传到Internet,异地终端接收数据并处理,不但可以实现异地测量,而且可以实现多个传感器智能组网、协同处理,扩大了容栅位移传感器的使用范围。 展开更多
关键词 容栅 位移传感器 WIFI samd20/21 ATWINC1500
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胃癌组织SAMD5表达与肿瘤病理特征的相关研究
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作者 沈晓健 朱郁飞 +2 位作者 谢美丽 丁益宏 张薇 《齐齐哈尔医学院学报》 2022年第10期905-908,共4页
目的分析胃癌组织SAMD5表达与肿瘤病理特征的相关性,为胃癌诊断提供新型分子标志物。方法前瞻性选择2019年1月—2020年12月经本院病理确诊胃癌患者共80例为研究对象,其中男50例,女30例,平均(58.6±5.9)岁。采用免疫组化染色法检测... 目的分析胃癌组织SAMD5表达与肿瘤病理特征的相关性,为胃癌诊断提供新型分子标志物。方法前瞻性选择2019年1月—2020年12月经本院病理确诊胃癌患者共80例为研究对象,其中男50例,女30例,平均(58.6±5.9)岁。采用免疫组化染色法检测肿瘤与癌旁正常组织中SAMD5蛋白阳性表达,反转录定量PCR(RT-qPCR)检测SAMD5 mRNA相对表达量。结果肿瘤组织SAMD5蛋白的阳性表达率和SAMD5 mRNA相对表达量明显高于癌旁正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。SAMD5蛋白阳性表达患者的肿瘤最大直径明显大于阴性表达患者,低分化增多,肿瘤浸润深度增加,淋巴结转移增多,TNM分期(Ⅲ-Ⅳ)增多,差异有统计学意义(P<0.05)。结论肿瘤组织SAMD5高表达可能与胃癌的发生和发展密切相关,SAMD5有望成为肿瘤诊断和临床靶向治疗的重要靶点。 展开更多
关键词 胃癌 samd5 病理特征 临床治疗
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牦牛和犏牛睾丸SAMD12基因的克隆测序及其mRNA水平比较 被引量:1
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作者 杨乐 黄林 +2 位作者 金素钰 雷杰雯 郑玉才 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2016年第5期525-530,共6页
SAMD12是新近发现的SAM结构域家族成员.为进一步探究犏牛雄性不育的分子机制,实验从健康成年牦牛(n=10)和雄性不育犏牛(n=7)睾丸组织中提取总RNA,利用常规基因克隆技术,对牦牛SAMD12基因进行克隆测序,并采用实时荧光定量PCR技术,比较牦... SAMD12是新近发现的SAM结构域家族成员.为进一步探究犏牛雄性不育的分子机制,实验从健康成年牦牛(n=10)和雄性不育犏牛(n=7)睾丸组织中提取总RNA,利用常规基因克隆技术,对牦牛SAMD12基因进行克隆测序,并采用实时荧光定量PCR技术,比较牦牛和犏牛睾丸中SAMD12基因mRNA水平.结果本实验克隆获得了牦牛SAMD12基因的3种变异体,分别命名为v715、v779和v852.v715与普通牛5号变异体完全对应;v779含SAM结构域但与普通牛序列存在一些差异,可能是SAMD12基因的新变异体类型;v852无结构域部分可能不表现活性.定量PCR结果显示:SAMD12基因在牦牛和犏牛睾丸中均有表达,但表达量差异不显著,推测其表达水平与犏牛雄性不育无直接关系. 展开更多
关键词 牦牛 犏牛 睾丸 samd12基因 杂交雄性不育
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SAMD9基因突变致MIRAGE综合征2例病例报告及文献复习 被引量:3
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作者 朱琳 陈春 +1 位作者 宗海峰 杨传忠 《临床与病理杂志》 CAS 2021年第11期2741-2746,共6页
MIRAGE综合征是由第7号染色体上的SAMD9基因突变引起一种常染色体显性遗传病,临床症状多变,主要表现为骨髓增生异常、反复感染、生长受限、肾上腺发育不全、生殖器异常和肠病。本文报道2例新生儿MIRAGE综合征患儿,以加强临床医生对本病... MIRAGE综合征是由第7号染色体上的SAMD9基因突变引起一种常染色体显性遗传病,临床症状多变,主要表现为骨髓增生异常、反复感染、生长受限、肾上腺发育不全、生殖器异常和肠病。本文报道2例新生儿MIRAGE综合征患儿,以加强临床医生对本病的认识。 展开更多
关键词 血小板减少症 贫血 samd9基因 MIRAGE综合征
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山羊SAMD12基因分子及表达特征分析
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作者 吕锦诗 李安 +5 位作者 刘珂含 王永 李艳艳 王友利 刘伟 林亚秋 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2023年第2期134-141,共8页
旨在克隆山羊SAMD12基因,明确SAMD12分子特征及表达特征,探究SAMD12基因对山羊肌内脂肪细胞分化的影响.首先通过RT-PCR技术扩增获得山羊SAMD12基因序列,利用生物信息学分析软件及qPCR技术明确山羊SAMD12分子特征及其在山羊组织、肌内脂... 旨在克隆山羊SAMD12基因,明确SAMD12分子特征及表达特征,探究SAMD12基因对山羊肌内脂肪细胞分化的影响.首先通过RT-PCR技术扩增获得山羊SAMD12基因序列,利用生物信息学分析软件及qPCR技术明确山羊SAMD12分子特征及其在山羊组织、肌内脂肪细胞分化过程中的表达模式.结果表明,扩增获得山羊SAMD12基因序列734 bp, CDS区486 bp,编码氨基酸161个.山羊SAMD12特征分析结果显示SAMD12蛋白带正电且属于碱性亲水不稳定蛋白,主要分布于细胞核(52.2%),含有SAM家族所特有的SAM功能结构域.SAMD12蛋白二级结构中大部分氨基酸以α-螺旋、无规卷曲的方式存在.同源性比对结果显示山羊SAMD12与绵羊SAMD12同源性高达90.7%,同源性最低的为马(23.4%).系统进化树结果显示:山羊与绵羊、家牛划分为一支,说明山羊SAMD12与这两种哺乳动物亲缘关系最近.组织表达特征分析显示:SAMD12在山羊多个组织中均有表达,在瘤胃中表达量最高,其次为肾,这两种组织中的表达量都显著高于其他组织(P<0.05).细胞时序表达特征谱分析显示:成脂诱导分化后山羊SAMD12基因整体表达水平呈上升趋势,在诱导分化96 h时表达量达到最高值,显著高于0 h(P<0.05).以上结果提示,SAMD12基因在山羊肌内脂肪细胞成脂过程中可能起重要作用. 展开更多
关键词 山羊 samd12基因 生物学特性 表达特征
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基于生物信息学探讨IFIH1和SAMD9L在胶质母细胞瘤抗肿瘤免疫中的作用 被引量:5
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作者 侯波 孙冬雪 +4 位作者 宋飞龙 张赛 涂悦 王振国 滕川 《临床肿瘤学杂志》 CAS 2021年第5期430-436,共7页
目的通过生物信息学数据库筛选及分析,并结合临床验证,探讨胶质母细胞瘤(GBM)的基因表达变化及其可能的作用机制。方法在GEO数据库检索GBM基因数据集,通过GEO2R在线工具处理,将各数据集的基因进行韦恩图分析,筛选出差异基因(DEGs)。利用... 目的通过生物信息学数据库筛选及分析,并结合临床验证,探讨胶质母细胞瘤(GBM)的基因表达变化及其可能的作用机制。方法在GEO数据库检索GBM基因数据集,通过GEO2R在线工具处理,将各数据集的基因进行韦恩图分析,筛选出差异基因(DEGs)。利用String网站构建DEGs蛋白互作(PPI)网络图,并进行功能富集分析;采用Cytoscape软件MCODE插件识别PPI网络中的关键模块、CytoHubba插件筛选PPI网络中的Hub基因。在GEPIA网站观察Hub基因的表达水平及其对生存率的影响。以2017年6月至2019年12月经手术切除且病理证实的GBM患者40例为研究组,15例正常人为对照组。采用ELISA法检测两组血清干扰素β(IFN-β)、趋化因子C-X-C配体10(CXCL10)、干扰素诱导蛋白44样(IFI44L)和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)含量;采用实时荧光定量PCR测定GBM组织及瘤周正常组织中的基因表达水平,并对其进行相关性分析。结果纳入GSE2223、GSE4290及GSE15824三个数据集,筛选出83个DEGs。共识别出8个Hub基因,其中IFIH1和SAMD9L对患者生存率有潜在影响,且两者呈正相关(r=0.86,P<0.001)。GBM患者血清IFN-β、CXCL10、IFI44L和TNF-α含量均高于对照组(P<0.001)。GBM组织中SAMD9L表达量明显高于瘤周正常组织(6.00±2.98 vs.1.06±0.49,P<0.001),IFIH1表达量亦明显高于瘤周正常组织(4.05±1.90 vs.1.01±0.57,P<0.001),且GBM组织中IFIH1和SAMD9L表达量呈正相关(r=0.663,P<0.001);IFIH1、SAMD9L基因表达与血清IFN-β、CXCL10、IFI44L含量均呈正相关(P均<0.05)。IFIH1、SAMD9L高表达组的中位OS分别为16.5个月、17个月,均低于低表达组(P<0.05)。结论GBM患者IFIH1和SAMD9L基因表达上调且存在相关性,并降低了生存率;两者与机体抗肿瘤免疫系统激活密切相关,可能是免疫治疗GBM的新靶点。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 免疫 IFIH1 samd9L 生物信息学
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鸡SAMD9L基因真核表达载体构建及其对ALV-J病毒复制的影响 被引量:3
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作者 陈世豪 潘诗雨 +1 位作者 赵睿涵 吴挺 《扬州大学学报(农业与生命科学版)》 CAS 北大核心 2021年第6期54-59,共6页
为分析鸡无菌α基序域蛋白9样(SAMD9L)蛋白的生物学特性,构建SAMD9L基因真核表达载体,并探究其对J亚型禽白血病病毒(ALV-J)复制的影响。利用ProtParam、Uniport、TMHMM和String等在线网站分析SAMD9L序列,获得亲疏水性、保守结构域、信... 为分析鸡无菌α基序域蛋白9样(SAMD9L)蛋白的生物学特性,构建SAMD9L基因真核表达载体,并探究其对J亚型禽白血病病毒(ALV-J)复制的影响。利用ProtParam、Uniport、TMHMM和String等在线网站分析SAMD9L序列,获得亲疏水性、保守结构域、信号肽表达及互作蛋白等生物信息。构建携带His标签的SAMD9L重组表达载体并进行测序鉴定。采用qRT-PCR技术检测ALV-J感染对SAMD9L表达水平的影响;采用Western blot技术检测过表达SAMD9L对ALV-J复制的影响。结果表明:鸡SAMD9L无信号肽表达,无跨膜结构域,含有无菌α基序超家族保守结域(55—249位氨基酸),其互作蛋白预测为MX1、DDX60、ISG12-2和IFIT5等天然免疫抗病毒蛋白质。ALV-J感染36 h后显著诱导SAMD9L表达(P<0.001),而过表达SAMD9L则显著抑制ALV-J在DF-1细胞中的复制,推测鸡SAMD9L具有抗ALV-J病毒的能力。该研究成功构建了鸡SAMD9L基因真核表达载体,通过生物信息学分析了蛋白质特性,并初步探究SAMD9L与ALV-J感染之间的关系,为进一步阐明鸡SAMD9L的生物学功能及其抗J亚型禽白血病的分子机制奠定了基础。 展开更多
关键词 samd9L 生物信息学分析 真核表达载体 ALV-J复制
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实时荧光定量PCR检测人脑胶质瘤、髓母细胞瘤中SAMD 14的表达
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作者 龚范勇 葛盈盈 肖绍文 《微创医学》 2017年第2期162-165,186,共5页
目的分析人胶质瘤和髓母细胞瘤中SAMD 14 mRNA的表达情况及其与临床参数间的关系。方法使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测10例正常人脑组织、24例胶质瘤患者和11例髓母细胞瘤患者肿瘤组织中SAMD 14 mRNA的相对表达量,分析其表达与患者... 目的分析人胶质瘤和髓母细胞瘤中SAMD 14 mRNA的表达情况及其与临床参数间的关系。方法使用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测10例正常人脑组织、24例胶质瘤患者和11例髓母细胞瘤患者肿瘤组织中SAMD 14 mRNA的相对表达量,分析其表达与患者临床病理学特征的关系。结果胶质瘤、髓母细胞瘤组织中SAMD 14 mRNA的表达水平低于正常脑组织,胶质瘤中SAMD14 mRNA的表达水平高于髓母细胞瘤组织(P<0.05)。SAMD 14 mRNA相对表达量与性别、年龄、肿瘤直径和KPS评分等因素无关(P>0.05)。结论 SAMD 14 mRNA的低表达可能与胶质瘤和髓母细胞瘤的发生、发展有关。 展开更多
关键词 胶质瘤 髓母细胞瘤 samd 14 荧光定量PCR
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SAMD9基因新发突变引起新生儿MIRAGE综合征1例
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作者 李雅慧 王依闻 谢利娟 《上海交通大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1644-1648,共5页
新生儿,女,胎龄30周时因“羊水少、宫内发育迟缓”剖宫产出生,生后出现严重的呼吸窘迫、严重低血压、电解质糖代谢紊乱,以及伴有皮肤色素沉着等肾上腺皮质功能不全的表现。患儿病情危重,生后5 d因多脏器功能衰竭抢救无效死亡。基因分析... 新生儿,女,胎龄30周时因“羊水少、宫内发育迟缓”剖宫产出生,生后出现严重的呼吸窘迫、严重低血压、电解质糖代谢紊乱,以及伴有皮肤色素沉着等肾上腺皮质功能不全的表现。患儿病情危重,生后5 d因多脏器功能衰竭抢救无效死亡。基因分析显示患儿SAMD9基因有新发杂合变异c.4598G>A (p.Arg1533Gln),结合相关临床症状诊断为MIRAGE综合征(myelodysplasia, infection, restriction of growth, adrenal hypoplasia, genital phenotypes, and enteropathy, MIRAGE syndrome)。MIRAGE综合征可累及多系统,病情危重复杂,早期基因检查识别可指导治疗、改善预后。 展开更多
关键词 MIRAGE综合征 samd9基因 肾上腺皮质功能不全 新生儿
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普罗布考对糖尿病肾病大鼠TGF-β1/Samd6/BMP7信号通路的影响及其意义 被引量:1
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作者 曾嵘 孙玉洁 祝香芝 《东南大学学报(医学版)》 CAS 2019年第3期412-418,共7页
目的:探讨普罗布考对糖尿病肾病(DKD)大鼠转化生长因子-β1/Samd6/骨形成蛋白7(TGF-β1/Samd6/BMP7)信号通路的影响及其意义。方法:选取40只DKD大鼠,随机分为DKD组和普罗布考组各20只,另取健康SD大鼠20只为对照组,DKD组和对照组每日予... 目的:探讨普罗布考对糖尿病肾病(DKD)大鼠转化生长因子-β1/Samd6/骨形成蛋白7(TGF-β1/Samd6/BMP7)信号通路的影响及其意义。方法:选取40只DKD大鼠,随机分为DKD组和普罗布考组各20只,另取健康SD大鼠20只为对照组,DKD组和对照组每日予生理盐水0.2ml·kg^-1灌胃,普罗布考组每日予普罗布考50mg·kg-1灌胃,均连续给药12周。给药前后分别检测空腹血糖(BG)、尿肌酐(Ucr)、内生肌酐清除率(Ccr)、24h尿蛋白(24hUP)以及治疗后肾组织TGF-β1、Samd6、BMP7蛋白和mRNA表达。结果:治疗后,普罗布考组BG、Ucr、Ccr、24hUP以及TGF-β1蛋白和mRNA表达均显著降低(P<0.05),Samd6、BMP7蛋白和mRNA表达显著增高(P<0.05),大鼠肾脏的病理表现介于正常组和DKD组之间。结论:普罗布考可上调Samd6、BMP7蛋白和mRNA表达,下调TGF-β1蛋白和mRNA的表达,通过影响TGF-β1/Samd6/BMP7信号通路的转导而减轻肾间质纤维化,延缓DKD进展。 展开更多
关键词 普罗布考 糖尿病肾病 大鼠 转化生长因子-Β1 samd6 骨形成蛋白7
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肺结核患者血清SAMD9L基因表达水平与病情严重程度及预后的关系 被引量:1
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作者 汪文平 刘雨晴 +1 位作者 甘维利 严晓娟 《传染病信息》 2023年第2期133-136,共4页
目的探究无菌α基序域9样蛋白(sterile alpha motif domain containing 9-like,SAMD9L)基因在肺结核患者血清中的表达水平与患者病情严重程度及预后的关系。方法选取2019年2月20日─2020年6月23日期间我院收治的232例肺结核患者作为研... 目的探究无菌α基序域9样蛋白(sterile alpha motif domain containing 9-like,SAMD9L)基因在肺结核患者血清中的表达水平与患者病情严重程度及预后的关系。方法选取2019年2月20日─2020年6月23日期间我院收治的232例肺结核患者作为研究对象,根据患者病情严重程度分为轻症组(129例)和中重症组(103例),收集并分析2组患者的一般资料。采用实时荧光定量PCR法检测血清中SAMD9L基因表达水平,比较2组间差异。采用ROC曲线分析血清SAMD9L mRNA表达水平对肺结核患者病情严重程度及预后的评估价值。结果中重症组血清SAMD9L mRNA表达水平显著高于轻症组(P<0.05);中重症组预后不良的患者中有吸烟史人数及血清SAMD9L mRNA表达水平显著高于预后良好的患者(P<0.05)。血清SAMD9L mRNA评估肺结核患者病情严重程度的AUC为0.783(95%CI:0.724~0.834),敏感度和特异性度分别为68.93%和77.52%,最优截断值为1.22;血清SAMD9L mRNA评估肺结核患者预后不良的AUC为0.691(95%CI:0.627~0.750),敏感度和特异度分别为64.00%和66.88%,最优截断值为1.25。结论肺结核患者血清SAMD9L mRNA表达水平与病情严重程度及预后密切相关,病情越严重,血清SAMD9L mRNA表达水平越高,可为肺结核的早期诊断提供参考依据。 展开更多
关键词 Ⅰ肺结核 samd9L 病情严重程度 预后 ROC曲线 敏感度 特异度
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基于SAMDE整定PI的中频感应加热温度控制系统 被引量:5
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作者 郝博 罗宏 《自动化与仪表》 2018年第2期20-24,共5页
为了降低工件在热加工过程中出现的不良因素干扰系统稳定运行,而导致控制系统中温度精度有所下降这一影响。该文提出了基于个体适应度参数的自适应差分进化(SAMDE)整定PI算法,设计了基于该算法的中频感应加热智能温度控制系统,运用Matla... 为了降低工件在热加工过程中出现的不良因素干扰系统稳定运行,而导致控制系统中温度精度有所下降这一影响。该文提出了基于个体适应度参数的自适应差分进化(SAMDE)整定PI算法,设计了基于该算法的中频感应加热智能温度控制系统,运用Matlab语言编写控制系统SAMDE整定PI控制算法,并对SAMDE整定PI控制算法与常规PID控制算法的控制效果进行了对比仿真。结果表明,与常规PID控制相比,SAMDE整定PI控制算法表现出具有良好的控制品质特性(自适应性强、鲁棒性高等),它不仅提高了中频感应加热设备温度控制的控制精度,而且还较容易实现对控制系统的温度进行在线参数校正,满足现场设备实时地对温度控制的要求,具有重大的工程实际研究价值。 展开更多
关键词 过盈配合 中频感应加热 个体适应度参数自适应差分进化算法 PI控制
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SAMD9/SAMD9L突变相关疾病3例临床特征分析
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作者 朱柯 孙碧君 +5 位作者 王文婕 周钦华 刘璐瑶 侯佳 王晓川 孙金峤 《罕见病研究》 2024年第4期507-511,共5页
SAMD9和SAMD9L基因突变可分别引起MIRAGE综合征和共济失调-全血细胞减少(ATXPC)综合征。本文报道3例与SAMD9/SAMD9L突变相关的疾病病例,其中包括1例SAMD9基因突变(c.3809T>A,p.F1270Y)和2例SAMD9L基因突变(c.2675T>G,p.M892R;c.10... SAMD9和SAMD9L基因突变可分别引起MIRAGE综合征和共济失调-全血细胞减少(ATXPC)综合征。本文报道3例与SAMD9/SAMD9L突变相关的疾病病例,其中包括1例SAMD9基因突变(c.3809T>A,p.F1270Y)和2例SAMD9L基因突变(c.2675T>G,p.M892R;c.1096T>G,p.F366V和c.4517T>C,p.L1506p),既往均未见报道。所有患儿均表现出反复感染、生长发育迟缓和骨髓增生异常的症状,并在不同程度上累及呼吸、消化、免疫、内分泌、神经、生殖等多系统。治疗方面,2例患儿定期输注免疫球蛋白后感染情况有所好转,1例患儿于1岁5月龄行造血干细胞移植后恢复良好。对于反复感染伴有骨髓增生异常、全血细胞减少、生长发育迟缓的儿童需考虑SAMD9/SAMD9L基因突变的可能,尽快基因检测明确诊断,以期早期发现、早期治疗,改善预后。 展开更多
关键词 samd9基因 samd9L基因 MIRAGE综合征 ATXPC综合征
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