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六钼酸盐有机胺杂化衍生物与SARS-CoV 3CL^pro相互作用的分子动力学模拟 被引量:4
1
作者 邵琛 王建萍 +3 位作者 杨国春 苏忠民 胡冬华 孙家锺 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2008年第1期165-169,共5页
采用分子动力学模拟方法,在分子水平上探讨六钼酸盐有机杂化衍生物潜在的抗SARS病毒活性.3CLpro主蛋白酶是冠状病毒复制和转录过程中起关键作用的功能蛋白,因此采用SARS-CoV 3CLpro作为靶标进行抗SARS病毒的药物设计.使用InsightⅡ软件... 采用分子动力学模拟方法,在分子水平上探讨六钼酸盐有机杂化衍生物潜在的抗SARS病毒活性.3CLpro主蛋白酶是冠状病毒复制和转录过程中起关键作用的功能蛋白,因此采用SARS-CoV 3CLpro作为靶标进行抗SARS病毒的药物设计.使用InsightⅡ软件包中的Biopolymer,Discover 3,Profile-3D和Affinity等模块,研究POMs/3CLpro相互作用的结合位点和作用性质.研究其能量变化规律,探讨了多酸化合物对SARS病毒可能的抑制机理.研究结果表明,POMs与3CLpro在酶的催化活性位点处有较强的结合力.形成的复合物主要以静电相互作用相结合,氢键相互作用对复合物的相对稳定性有一定影响.对于POMs/3CLpro复合物,有机胺基团取代的POMs所带负电荷比未取代体系的高,比3CLpro的结合能更高,这与POMs的相关量子化学计算结果吻合. 展开更多
关键词 sars 3CL^pro 多金属氧酸盐 分子动力学 对接
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Synthesis and Biological Evaluation of Quinolinone Compounds as SARS CoV 3CL^pro Inhibitors
2
作者 Yu Guo Ning Zhang +4 位作者 Jian Wang Bo Sun Wei Liu Honggang Zhou Cheng Yang 《Chinese Journal of Chemistry》 SCIE CAS CSCD 2013年第9期1199-1206,共8页
SARS CoV 3CL^pro is known to be a promising target for development of therapeutic agents against the severe acute respiratory syndrome (SARS). A quinolinone compound 1 was selected via virtual screening, and it was ... SARS CoV 3CL^pro is known to be a promising target for development of therapeutic agents against the severe acute respiratory syndrome (SARS). A quinolinone compound 1 was selected via virtual screening, and it was syn- thetized and tested for enzymatic inhibition in vitro. Compound 1 showed potent inhibitory activity (ICs0= 0.44 μmol/L) toward SARS CoV 3CL^pro. Further work on a series of quinolinone derivatives resulted in the discovery of the most potent compound 23, inhibiting SARS CoV 3CL^pro with an IC50 of 36.86 μmol/L. The structure-activity relationships were also discussed. 展开更多
关键词 sars sars cov 3CL^pro INHIBITORS QUINOLINONE
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SARS冠状病毒非结构蛋白质NSP3突变体构建及其对类泛素分子DUB活性 被引量:1
3
作者 杨星星 邢雅玲 +1 位作者 陈晓娟 陈忠斌 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1061-1069,共9页
SARS冠状病毒(SARS-CoV)非结构蛋白NSP3编码的木瓜蛋白酶样蛋白酶(PLpro)对泛素样分子(Ubl)具有去泛素化酶(DUB)活性,但目前有关NSP3 DUB活性研究的报道甚少.本研究构建包含Nsp3基因N末端不同结构域的突变体,并检测NSP3及其一系列突变... SARS冠状病毒(SARS-CoV)非结构蛋白NSP3编码的木瓜蛋白酶样蛋白酶(PLpro)对泛素样分子(Ubl)具有去泛素化酶(DUB)活性,但目前有关NSP3 DUB活性研究的报道甚少.本研究构建包含Nsp3基因N末端不同结构域的突变体,并检测NSP3及其一系列突变体对类泛素分子ISG15和SUMO所修饰蛋白质分子的作用特性.实验结果表明,NSP3及其突变体NSP3AD,NSP3AE,NSP3AF具有一定的去ISG15活性,而其突变体NSP3AC则没有去ISG15(DeISGylation)活性.研究结果提示,SARS NSP3具有一定的体内去ISG15活性,并且这种活性主要依赖于Nsp3基因编码的PLpro.但SARS NSP3及其突变体NSP3AC,NSP3AD,NSP3AE和NSP3AF并不具有去SUMO(DeSUMOylation)活性.SARS冠状病毒NSP3对类泛素样分子作用特性的研究为后续NSP3的生物学特性及其对干扰素通路的调控研究奠定了基础. 展开更多
关键词 sars冠状病毒 非结构蛋白质3(NSP3) 去泛素化酶(DUB) 干扰素刺激基因15 (ISGl5) SUMO
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SARS冠状病毒蛋白酶3CL^(pro) N-finger多肽是酶活性所必需(英文) 被引量:1
4
作者 张笋华 姬明放 邵晓霞 《细胞生物学杂志》 CSCD 2005年第6期657-661,共5页
构建了 SARS冠状病毒主要蛋白酶3CLpro 及其缺失N 端七肽即N-finger的突变体3CLpro(?1–7)融合表达质粒,并于大肠杆菌表达系统中表达。得到的融合蛋白经肠激酶酶切,亲和层析,最终得到纯化的3CLpro及其突变体 3CLpro(?1–7)。酶活性实验... 构建了 SARS冠状病毒主要蛋白酶3CLpro 及其缺失N 端七肽即N-finger的突变体3CLpro(?1–7)融合表达质粒,并于大肠杆菌表达系统中表达。得到的融合蛋白经肠激酶酶切,亲和层析,最终得到纯化的3CLpro及其突变体 3CLpro(?1–7)。酶活性实验显示,去除 N-finger多肽的突变体3CLpro(?1–7)丧失了3CLpro所具有的对含有其自动水解位点的荧光底物的水解活性,表明处于非酶活性中心的N-finger 多肽是酶活性所必需的。利用固相合成法,进一步合成了N-finger七肽。酶抑制实验表明N-finger七肽表现了对3CLpro 部分竞争抑制活性。 展开更多
关键词 sars冠状病毒 3CL^pro蛋白酶 N—finger多肽
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冠状病毒主要蛋白酶M^(pro)(3CL^(pro))的结构——设计抗SARS药物的基础
5
作者 刘飞 《基础医学与临床》 CSCD 北大核心 2003年第3期257-258,共2页
关键词 冠状病毒 蛋白酶M^pro(3CL^pro) 结构 sars药物 设计
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SARS冠状病毒基础研究进展 被引量:2
6
作者 李怡棠 程桂芳 《生理科学进展》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期35-37,共3页
SARS(severeacuterespiratorysyndrome ,严重急性呼吸综合症 )是严重危害人类健康的传染病 ,现已发现其病原体为正链RNA冠状病毒 (coronavirus ,CoV) ,SARSCoV为一类新型的冠状病毒 ,至今没有有效对抗其感染的药物。本文从SARSCoV的功... SARS(severeacuterespiratorysyndrome ,严重急性呼吸综合症 )是严重危害人类健康的传染病 ,现已发现其病原体为正链RNA冠状病毒 (coronavirus ,CoV) ,SARSCoV为一类新型的冠状病毒 ,至今没有有效对抗其感染的药物。本文从SARSCoV的功能受体、蛋白酶、疫苗和RNA干扰技术在SARSCoV研究中的应用等方面综述了其基础研究进展 。 展开更多
关键词 sars cov ACE2 3-C样蛋白 S蛋白 N蛋白
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SARS冠状病毒基因组复制酶起始结合位点的预测
7
作者 曾雅梅 陆文蔚 肖明 《上海师范大学学报(自然科学版)》 2005年第2期66-71,共6页
严重急性呼吸综合征(Severe Acute Respiratory Syndrome,SARS)传染性强,死亡率高, 给全世界约30个国家造成了巨大损失.其病原体为SARS冠状病毒(Severe acute Respiratory Syndrome Associated Coronavirus,SARS—CoV),是冠状病毒(Coron... 严重急性呼吸综合征(Severe Acute Respiratory Syndrome,SARS)传染性强,死亡率高, 给全世界约30个国家造成了巨大损失.其病原体为SARS冠状病毒(Severe acute Respiratory Syndrome Associated Coronavirus,SARS—CoV),是冠状病毒(Coronavirus)的新变异种.作者以“最大信息量”理论和方法为基础,使用结合位点搜寻软件等生物信息学方法,对冠状病毒基因组的3’非翻译区(Untranslated Regions,UTRs)进行分析,预测出了2株SARS—CoV(来自北京的SARSBJ01和浙江的SARSZJ01)以及其他38株冠状病毒株的复制酶起始结合位点(Rep- licase initial binding sites,RIBS).在该预测结果中,不难发现,这些RIBS的序列与前人的研究成果有很大的相似之处,与公认的冠状病毒的顺式作用元件极为相似的基序也存在其中,而且其预测的二级结构与鼠肝炎病毒MHV基因组的某些蛋白结合位点类似.因此,预测的RIBS 在病毒的复制中可能起重要作用. 展开更多
关键词 sars冠状病毒 3′非翻译区 信息量 起始结合位点
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“3步揉搓法”在新冠隔离病区医护人员脱摘防护用品过程中的效果评价
8
作者 胡正翠 李奕 +2 位作者 张伟 薛倩 陈怡 《中国感染控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期707-711,共5页
目的 探讨“3步揉搓法”在新冠隔离病区医护人员脱摘防护用品过程中的效果。方法 选取2022年4—6月参加上海市某三级甲等医院隔离病房支援的临床一线医护人员35人,在脱摘防护用品前,每名医护人员分别进行“3步揉搓法”、“6步揉搓法”... 目的 探讨“3步揉搓法”在新冠隔离病区医护人员脱摘防护用品过程中的效果。方法 选取2022年4—6月参加上海市某三级甲等医院隔离病房支援的临床一线医护人员35人,在脱摘防护用品前,每名医护人员分别进行“3步揉搓法”、“6步揉搓法”两种卫生手消毒法各1次,比较两种方法卫生手消毒前后最外层手套正面、背面、指缝3处标本新型冠状病毒核酸检测结果。结果 两种卫生手消毒法消毒前后的最外层手套表面新型冠状病毒核酸检测结果比较,差异有统计学意义(均P<0.05)。“6步揉搓法”卫生手消毒后最外层手套表面新型冠状病毒核酸检测阳性率为4.76%(5/105),“3步揉搓法”卫生手消毒后最外层手套表面新型冠状病毒核酸检测阳性率为5.71%(6/105),两组比较差异无统计学意义(P>0.05)。使用“3步揉搓法”时的手卫生规范率(91.43%)高于使用“6步揉搓法”时的手卫生规范率(77.14%),差异有统计学意义(P=0.02)。结论 “3步揉搓法”与“6步揉搓法”在新冠隔离病区医护人员脱摘防护用品过程中的消毒效果一致,但实施“3步揉搓法”时医护人员手卫生操作规范率高,因此,“3步揉搓法”有助于保障医护人员的职业安全,在临床工作中易于推广和接受。 展开更多
关键词 手卫生 卫生手消毒法 3步揉搓法 6步揉搓法 新型冠状病毒核酸检测 规范率
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大蓟内生真菌Coniothyrium sp. DJ-1抗SARS-CoV-2 M^(pro)活性的化学成分研究 被引量:1
9
作者 曾洁醇 杨润 +3 位作者 黄金 李艳平 高路 汪伟光 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期3071-3079,共9页
目的研究大蓟Cirsium japonicum内生真菌Coniothyriumsp.DJ-1中抑制新型冠状病毒主蛋白酶(severea cute respiratory syndrome coronavirus 2 main protease,SARS-CoV-2 M^(pro))活性的化学成分。方法运用新型冠状病毒M^(pro)/3CLpro抑... 目的研究大蓟Cirsium japonicum内生真菌Coniothyriumsp.DJ-1中抑制新型冠状病毒主蛋白酶(severea cute respiratory syndrome coronavirus 2 main protease,SARS-CoV-2 M^(pro))活性的化学成分。方法运用新型冠状病毒M^(pro)/3CLpro抑制剂筛选模型从30株菌株中筛选具有抑制活性的菌株和化学成分。采用正相硅胶、反相RP-18柱色谱和HPLC等技术对抑制率高的菌株的次生代谢产物进行分离纯化,通过NMR、质谱等谱学技术解析化合物结构,利用荧光共振能量转移法测定化合物对SARS-CoV-2 M^(pro)的抑制活性。结果在30株菌株中发现抑制活性良好的菌株Coniothyrium sp.DJ-1,并从该菌的大米发酵提取物中分离到17个化合物,分别鉴定为德加隆内酯(1)、5’-表细链格孢烯(2)、细链格孢烯(3)、4’-表细链格孢烯(4)、3-表-二氢细链格孢烯A(5)、瓶霉酚(6)、1-脱氧红藻内酯(7)、6-羟基-8-甲氧基-3a-甲基-3a,9b-二氢-3H-呋喃并[3,2-c]异色烯-2,5-二酮(8)、黄色篮状菌酮(9)、链格孢毒素II(10)、二氢链格孢苝醇(11)、2-(2’-羟基丙基)-5-甲基-7-羟基色酮(12)、7-羟基-2-羟甲基-5-甲基-4H-色烯-4-酮(13)、三环链格孢霉烯6b(14)、三环链格孢霉烯D(15)、苯乙醇(16)和对羟基苯甲醛(17)。化合物5、9、11对SARS-CoV-2 M^(pro)的半数抑制浓度(median inhibition concentration,IC50)分别为42.77、25.85和24.26μmol/L。结论化合物1~15和17均为首次从Coniothyriumsp.属中分离得到,化合物5、9、11对SARS-CoV-2 M^(pro)有较好的抑制作用。通过筛选活性菌株的策略,快速从真菌天然产物中挖掘抗新冠病毒活性的化合物,为抗新冠病毒药物的研发提供了参考。 展开更多
关键词 大蓟 盾壳霉属 内生真菌 次生代谢产物 抗病毒活性 新型冠状病毒主蛋白酶 3-表-二氢细链格孢烯A 黄色篮状菌酮 二氢链格孢苝醇
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严重急性呼吸综合征冠状病毒2膜蛋白对宿主细胞pre-mRNA 3'UTR加工的影响 被引量:1
10
作者 欧阳歆 曾先燕 +7 位作者 谷斌 娄哲琦 黄进 谭正宗 于倩 车雨 钱昱舟 朱勇 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2022年第10期1866-1873,共8页
目的研究严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)膜蛋白对宿主细胞mRNA前体(pre-mRNA)3’非翻译区(UTR)加工的影响。方法本研究以人肺上皮细胞系A549为模型,利用瞬时转染在细胞内过表达SARS-CoV-2膜蛋白;利用RNA-Seq测序技术及生物信... 目的研究严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)膜蛋白对宿主细胞mRNA前体(pre-mRNA)3’非翻译区(UTR)加工的影响。方法本研究以人肺上皮细胞系A549为模型,利用瞬时转染在细胞内过表达SARS-CoV-2膜蛋白;利用RNA-Seq测序技术及生物信息学分析方法,系统性描绘宿主细胞选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation,APA)事件;Metascape数据库对发生显著APA变化的基因进行功能富集分析;RT-qPCR验证靶基因3’UTR长度变化;蛋白质免疫印迹(Western blot)检测目的蛋白表达水平。结果SARS-CoV-2膜蛋白外源表达后宿主细胞内共813个基因发生显著APA变化。GO和KEGG分析显示,差异APA基因广泛参与有丝分裂细胞周期、调节细胞应激等生物过程,涉及病毒感染和蛋白质加工等。从中进一步筛选出AKT1基因,在IGV软件中显示3’UTR延长;RT-qPCR验证AKT1基因的3’UTR长度变化趋势;Western blot结果显示AKT1蛋白磷酸化水平增加。结论SARS-CoV-2膜蛋白潜在影响宿主pre-mRNA的3’UTR加工,其中参与多种病毒性生物过程的AKT1基因3’UTR延长,且其编码的蛋白质功能在细胞内被激活。 展开更多
关键词 严重急性呼吸综合征冠状病毒2膜蛋白 选择性多聚腺苷酸化 PRE-MRNA 3’非翻译区
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基于生物信息学方法的SARS-CoV-2和MERS-CoV差异表达基因分析 被引量:1
11
作者 贾钧儒 屈畅 +1 位作者 付静璇 安海龙 《军事医学》 CAS 北大核心 2020年第10期746-754,共9页
目的旨在筛选严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染人体后的关键基因,探究其发病机制,为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的诊疗提供理论依据。方法对SARS-CoV-2和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)感染人体后的基因表达进行差异分析... 目的旨在筛选严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染人体后的关键基因,探究其发病机制,为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的诊疗提供理论依据。方法对SARS-CoV-2和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)感染人体后的基因表达进行差异分析,通过京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析差异基因或蛋白的功能注释和信号通路。在Cytoscape中构建SARS-CoV-2差异基因的蛋白相互作用网络,通过权重值(weight)比较选取前30作为关键基因。结果发现肿瘤坏死因子(TNF)信号通路在MERS-CoV感染的多个时间点及SARS-CoV-2中均有显著富集,并发现TNF信号通路的相关基因肿瘤坏死因子α诱导蛋白3(TNFAIP3)在差异基因中连接性较强。结论对MERS-CoV和SARS-CoV-2差异基因表达进行分析,找出SARSCoV-2的关键基因TNFAIP3,推测通过调节其表达水平从而抑制炎症反应,为缓解或治疗COVID-19提供新的思路。 展开更多
关键词 表达差异分析 严重急性呼吸综合征冠状病毒2 中东呼吸综合征冠状病毒 肿瘤坏死因子信号通路 肿瘤坏死因子α诱导蛋白3
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动物生物安全三级实验室应急管理经验交流 被引量:3
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作者 林凯丽 刘梅轩 +3 位作者 麻昊然 潘思丹 乔红伟 高虹 《中国比较医学杂志》 CAS 北大核心 2020年第9期76-79,共4页
ABSL-3实验室是国家应对新发再发传染病的生物安全体系基础支撑平台,是研究新型冠状病毒生物学特性、预防和治疗手段的重要硬件基础。新型冠状病毒的应急工作中,在人类对病毒有限认知的前提下,系统、规范化的生物安全管理措施是生物安... ABSL-3实验室是国家应对新发再发传染病的生物安全体系基础支撑平台,是研究新型冠状病毒生物学特性、预防和治疗手段的重要硬件基础。新型冠状病毒的应急工作中,在人类对病毒有限认知的前提下,系统、规范化的生物安全管理措施是生物安全三级实验室高效、有序运行的重要保障,是规避和降低实验室意外事故发生的关键要素。本文就动物生物安全三级实验室内紧急开展新型冠状病毒动物实验活动的生物安全管理展开讨论,旨在为相关实验室的应急管理工作提供思路。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 动物生物安全三级实验室 应急管理
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动物生物安全三级实验室内新型冠状病毒实验活动的防护措施探讨 被引量:2
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作者 冯小丽 李明华 +4 位作者 韩建保 瞿望 都洪弟 邓忠华 郑永唐 《赣南医学院学报》 2021年第9期909-914,共6页
新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是导致新型冠状病毒肺炎发生的病原体,SARS-CoV-2已被国家卫生健康委员会列为第二类病原微生物,涉及SARS-CoV-2的病毒分离培养、动物感染等实验活动都要求在生物安全三级(BSL-3/ABSL-3)实验室内进行。本文结合... 新型冠状病毒(SARS-CoV-2)是导致新型冠状病毒肺炎发生的病原体,SARS-CoV-2已被国家卫生健康委员会列为第二类病原微生物,涉及SARS-CoV-2的病毒分离培养、动物感染等实验活动都要求在生物安全三级(BSL-3/ABSL-3)实验室内进行。本文结合笔者在BSL-3/ABSL-3实验室的实践经验,探讨如何做好新型冠状病毒实验活动期间实验室的生物安全防护措施,保障实验人员及周围环境安全。 展开更多
关键词 生物安全三级实验室 sars-cov-2 生物安全防护
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新型冠状病毒猕猴感染实验生物安全管理
14
作者 孟轲音 万忠海 +5 位作者 李吉平 卜昭阳 缪发明 姚腾 高玉伟 刘军 《生物技术通讯》 CAS 2020年第3期375-378,共4页
目前,全球爆发新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染人类事件,疫苗研制、防治药物筛选及感染机制研究迫在眉睫,而相关研究又离不开实验动物。本文以在动物生物安全三级实验室(animal bio-safety level 3 laboratory,ABSL-3)开展的SARS-CoV-2感... 目前,全球爆发新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染人类事件,疫苗研制、防治药物筛选及感染机制研究迫在眉睫,而相关研究又离不开实验动物。本文以在动物生物安全三级实验室(animal bio-safety level 3 laboratory,ABSL-3)开展的SARS-CoV-2感染猕猴实验为例,结合工作实际,对生物安全管理工作中几个重要环节进行探讨,为正在或即将开展此项工作的同仁们提供参考。 展开更多
关键词 sars-cov-2 猕猴实验 动物生物安全三级实验室 生物安全管理
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呋喃-2-羧酸(5-氯吡啶-3-基)酯类衍生物的设计、合成及3CL^(pro)蛋白酶抑制活性研究
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作者 李慧丽 姜飞 +2 位作者 李珏 江渝斌 沈祥春 《中国药物化学杂志》 CAS 2023年第8期570-580,共11页
目的 设计合成一系列呋喃-2-羧酸(5-氯吡啶-3-基)酯类新型冠状病毒3CL蛋白酶(SARS-CoV-2 3CL^(pro))抑制剂,并进行体外抗病毒活性以及细胞安全性评价。方法 以苯并[b]噻吩-2-羧酸(5-氯吡啶-3-基)酯(6)为先导化合物,对其苯并噻吩环进行... 目的 设计合成一系列呋喃-2-羧酸(5-氯吡啶-3-基)酯类新型冠状病毒3CL蛋白酶(SARS-CoV-2 3CL^(pro))抑制剂,并进行体外抗病毒活性以及细胞安全性评价。方法 以苯并[b]噻吩-2-羧酸(5-氯吡啶-3-基)酯(6)为先导化合物,对其苯并噻吩环进行结构改造。以苯并呋喃-2-甲酸或呋喃-2-甲酸衍生物与5-氯吡啶-3-醇为起始原料,经亲核取代、水解、缩合等反应合成15个目标化合物。采用FRET方法评估目标化合物对SARS-CoV-2 3CL^(pro)的抑制活性,采用MTT法初步评价目标化合物对人宫颈癌细胞(HeLa)以及人脐静脉内皮细胞(HUVEC)的安全性。结果 合成了15个新型SARS-CoV-2 3CL^(pro)抑制剂,其结构均经~1H-NMR、^(13)C-NMR和HR-ESI-MS确证;其中,化合物9、11~13、19和20具有良好的3CL^(pro)蛋白酶抑制活性,除化合物15和16对HUVEC细胞显示出一定的细胞毒性,其他化合物对正常细胞均具有较好的安全性。结论 化合物9和20具有显著的抑制SARS-CoV-2 3CL^(pro)活性作用,其IC_(50)值分别为14.85 nmol·L^(-1)和23.24 nmol·L^(-1),优于奈玛特韦(IC_(50)=49.44 nmol·L^(-1)),且具有较好的细胞安全性,值得进一步深入研究。 展开更多
关键词 呋喃-2-羧酸(5-氯吡啶-3-基)酯类衍生物 新型冠状病毒3CL蛋白酶抑制剂 合成
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基于网络药理学的小柴胡汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)发热的可行性探讨 被引量:42
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作者 杨璐 崔换天 +2 位作者 刘相国 温伟波 王洪武 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第7期1761-1775,共15页
目的通过网络药理学和分子对接的方法,初步探讨小柴胡汤在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)治疗中缓解发热及抗病毒的可能作用机制。方法运用网络药理学方法分析小柴胡汤治疗发热的潜在靶点及通路;从TCMSP、Pharm Mapper数据库收集小柴胡汤... 目的通过网络药理学和分子对接的方法,初步探讨小柴胡汤在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)治疗中缓解发热及抗病毒的可能作用机制。方法运用网络药理学方法分析小柴胡汤治疗发热的潜在靶点及通路;从TCMSP、Pharm Mapper数据库收集小柴胡汤的成分和作用靶点;OMIM和Genecards数据库收集发热相关靶点;String数据库构建蛋白相互作用网络,分析核心靶点;DAVID数据库和KOBAS3.0进行基于基因本体论(GO)的功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)的通路富集分析;Cytoscape3.2.7构建成分-靶点-通路网络图。运用分子对接技术筛选与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)以及SARS-CoV-2感染靶细胞关键受体血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)结合力较强的活性成分,预测可能的结合位点。结果网络药理学分析表明,小柴胡汤共筛选出165种活性成分,预测到靶点168个,筛选出发热相关靶点7 006个,取交集得到小柴胡汤与发热相关的靶点141个。GO富集到基因功能292个,KEGG富集到基因通路30条。分子对接结果表明,小柴胡汤的主要活性成分与SARS-CoV-2和ACE2均有较强的结合能力,其中β-谷甾醇、豆甾醇和3′-羟基-4′-O-甲基葡萄糖苷为结合最强的3个有效成分。结论网络药理学方法初步探讨了小柴胡汤缓解COVID-19发热的作用机制,β-谷甾醇、豆甾醇和3′-羟基-4′-O-甲基葡萄糖苷可能为小柴胡汤中主要发挥抑制SARS-CoV-2的成分,为进一步的研究提供了方向。 展开更多
关键词 小柴胡汤 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 发热 网络药理学 分子对接 Β-谷甾醇 豆甾醇 3′-羟基-4′-O-甲基葡萄糖苷
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参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)合并冠心病的网络药理分子机制探析 被引量:16
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作者 韩利文 张友刚 +4 位作者 李昊楠 汪海洋 李晓彬 王晓静 姚庆强 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期2334-2344,共11页
目的利用网络药理学方法解析参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)合并冠心病的分子网络作用途径。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)和中医百科全书平台(ETCM)收集参麦注射液中红参、麦冬的化学成分;通过SwissTargetPredict... 目的利用网络药理学方法解析参麦注射液治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)合并冠心病的分子网络作用途径。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)和中医百科全书平台(ETCM)收集参麦注射液中红参、麦冬的化学成分;通过SwissTargetPrediction数据库预测化合物的作用靶点;通过NCBI数据库和GeneCards数据库筛选COVID-19及合并症冠心病的靶点;通过DAVID数据库分别进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;运用Cytoscape 3.7.1软件构建化合物-靶点-通路网络。利用Glide软件对参麦注射液成分与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶(Mpro)的分子对接。结果参麦注射液中麦冬皂苷D′、麦冬皂苷D、人参皂苷Rg2、麦冬甲基黄烷酮A、麦冬苷元-3-O-新橙皮糖苷、人参皂苷Rb2、人参皂苷R0、Ophiopogon A、三七皂苷Rd、麦冬二氢高异黄酮E、人参皂苷Re在分析中显示了较高的度值,且与SARSCoV-23CL水解酶结合力较强,可能是参麦注射液发挥治疗COVID-19合并冠心病的主要药效成分,共涉及到IL6、GAPDH、ALB、TNF、MAPK1、MAPK3、TP53、EGFR、CASP3、CXCL8等77个靶点,以及低氧诱导因子-1信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、鞘脂信号通路、Toll样受体信号通路、神经营养素信号通路、血管内皮生长因子信号通路、细胞凋亡、Ras信号通路、PI3K-Akt信号通路、泌乳素信号通路等124条信号通路。结论参麦注射液可能通过抑制细胞因子风暴、维持心脏功能稳态、调节免疫、抗病毒等方面实现对COVID-19与冠心病的同时干预,呈现出了相互影响、复杂关联的网络调控机制。 展开更多
关键词 参麦注射液 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 冠心病 网络药理学 分子对接 麦冬皂苷D′ 麦冬皂苷D 人参皂苷RG2 麦冬甲基黄烷酮A 麦冬苷元-3-O-新橙皮糖苷 人参皂苷Rb2 人参皂苷R0 ophiopogon A 三七皂苷Rd 麦冬二氢高异黄酮E 人参皂苷RE
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藿朴夏苓汤治疗早期新型冠状病毒肺炎(COVID-19)湿邪郁肺证物质基础及功效的网络分析 被引量:8
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作者 范梦月 刘静 孙蓉 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2020年第9期2297-2306,共10页
目的筛选藿朴夏苓汤治疗早期新型冠状病毒肺炎(COVID-19)湿邪郁肺证的物质基础,预测其作用机制。方法查阅文献及临床报道分析藿朴夏苓汤与早期COVID-19湿邪郁肺证的方证关系。运用TCMSP数据库筛选藿朴夏苓汤中潜在活性成分,将活性成分... 目的筛选藿朴夏苓汤治疗早期新型冠状病毒肺炎(COVID-19)湿邪郁肺证的物质基础,预测其作用机制。方法查阅文献及临床报道分析藿朴夏苓汤与早期COVID-19湿邪郁肺证的方证关系。运用TCMSP数据库筛选藿朴夏苓汤中潜在活性成分,将活性成分与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶、血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)进行分子对接,根据结合能筛选与两者均有较好结合作用的核心成分。借助Cytoscape软件构建关键成分靶点蛋白互作网络,筛选出核心靶点;通过STRING数据库进行核心靶点的GO分析,Cytoscape软件Clue GO插件进行Pathway、KEGG富集分析。结果方证关系分析藿朴夏苓汤用于治疗早期COVID-19湿邪郁肺证,筛选出藿朴夏苓汤中潜在作用成分12个,核心靶点67个。其中通草中的通脱木皂苷元Ⅰ,茯苓、猪苓中的过氧麦角甾醇,半夏中的黄芩苷与SARS-CoV-23CL水解酶、ACE2均具有较好的结合活性。GO、Pathway、KEGG富集分析结果显示藿朴夏苓汤中12个潜在作用成分参与调节刺激反应、信号转导、细胞死亡等生物过程以及白介素信号通路、癌症EGFR信号通路、酪氨酸激酶信号转导途径、编程性细胞死亡途径、MAPK信号通路等。结论藿朴夏苓汤以化湿解毒、宣肺透邪治疗早期COVID-19湿邪郁肺证患者,菲酮、黄芩苷、酸枣仁皂苷、啤酒甾醇、常春藤皂苷元、过氧麦角甾醇、柠檬二烯醇、麦角甾-7,22-二烯-3-酮、通脱木皂苷元Ⅰ、泽泻醇B-23-醋酸酯、泽泻醇B、新橙皮苷可能为其主要的物质基础,通过阻断SARS-CoV-2病毒蛋白合成,阻止病毒进入宿主细胞,通过调控白介素信号通路、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、T细胞受体信号通路、C型凝集素受体信号通路,抑制相关炎症因子的表达发挥作用。 展开更多
关键词 藿朴夏苓汤 新型冠状病毒 新型冠状病毒肺炎 分子对接 网络药理学 物质基础 血管紧张素转化酶Ⅱ 菲酮 黄芩苷 酸枣仁皂苷 啤酒甾醇 常春藤皂苷元 过氧麦角甾醇 柠檬二烯醇 麦角甾-7 22-二烯-3-酮 通脱木皂苷元I 泽泻醇B-23-醋酸酯 泽泻醇B 新橙皮苷
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复方季铵盐消毒液对生物安全三级实验室新型冠状病毒消毒效果研究 被引量:1
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作者 李玉薇 但德苗 +3 位作者 刘小可 杜洪桥 卢佳 李新国 《中国消毒学杂志》 CAS 2023年第6期401-403,406,共4页
目的 探讨在生物安全三级实验室(P3实验室)内以复方季铵盐消毒液(MCP)取代次氯酸钠作为新型冠状病毒(SARS-CoV-2)主要消毒剂的可行性。方法 配制体积百分浓度为2%、5%和100%的MCP以及含有效氯250、500或1 000 mg/L的次氯酸钠消毒液,采... 目的 探讨在生物安全三级实验室(P3实验室)内以复方季铵盐消毒液(MCP)取代次氯酸钠作为新型冠状病毒(SARS-CoV-2)主要消毒剂的可行性。方法 配制体积百分浓度为2%、5%和100%的MCP以及含有效氯250、500或1 000 mg/L的次氯酸钠消毒液,采用凝胶过滤悬液定量消毒试验方法,在消毒剂与病毒液以体积比为1:2、1:1、2:1、5:1混合条件下分别作用1 min,测定MCP和次氯酸钠对SARS-CoV-2的灭活效果。结果 不同浓度和不同配比条件下的2种消毒液对悬液内的SARS-CoV-2灭活对数值均> 4.0。该MCP消毒液保存90 d,对新型冠状病毒的消毒效果无明显降低。结论 MCP消毒液和次氯酸钠消毒液对新型冠状病毒消毒效果良好,可用MCP替代次氯酸钠消毒液作为P3实验室有效消毒剂。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 次氯酸钠 Micro-Chem Plus 生物安全三级实验室
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《黄帝内经》三年化疫与2019冠状病毒病的理论探析 被引量:16
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作者 吕英 宫凤英 李爱武 《中华中医药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期1104-1106,共3页
文章从三年化疫理论探讨中医药防治2019冠状病毒病(COVID-19)辨治思路和方法。笔者通过分析2013年至2019年间临床中火热毒证病机演变过程及病机特性,结合COVID-19临床特点,论述COVID-19病机、治则及相应方药,为中医深入认识及治疗COVID... 文章从三年化疫理论探讨中医药防治2019冠状病毒病(COVID-19)辨治思路和方法。笔者通过分析2013年至2019年间临床中火热毒证病机演变过程及病机特性,结合COVID-19临床特点,论述COVID-19病机、治则及相应方药,为中医深入认识及治疗COVID-19提供新的思路和方法。 展开更多
关键词 2019冠状病毒病(covID-19) 严重急性呼吸综合征冠状病毒2(sars-cov-2) 三年化疫 中医药防治 黄帝内经 瘟疫 五运六气
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