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日本血吸虫SCP/TAPS基因家族的生物信息学分析和克隆表达
1
作者
陈静芳
胡旭初
+1 位作者
王乐旬
余新炳
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期804-807,811,共5页
目的以黄蜂Vv Vesv5蛋白为检索源检索日本血吸虫EST数据库,对检索出的序列进行生物信息学分析,并挑选出有代表性的基因进行克隆表达,为日本血吸虫SCP/TAPS家族蛋白的功能研究打下一定的基础。方法利用生物信息学软件对检索出的日本血吸...
目的以黄蜂Vv Vesv5蛋白为检索源检索日本血吸虫EST数据库,对检索出的序列进行生物信息学分析,并挑选出有代表性的基因进行克隆表达,为日本血吸虫SCP/TAPS家族蛋白的功能研究打下一定的基础。方法利用生物信息学软件对检索出的日本血吸虫SCP/TAPS家族蛋白进行生物信息学分析,经PCR确定后,以AAW24579为代表进行进一步的研究,将其命名为SjVAL2。根据SjVAL2的序列设计引物,通过RT-PCR扩增出全长编码区域,克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,在大肠埃希菌中诱导表达并纯化,免疫印迹实验(Western-blotting)鉴定纯化的重组蛋白。结果日本血吸虫SCP/TAPS家族中至少有17个不同的蛋白成员存在,多序列比对分析发现它们初步可以分为3个不同的亚组。以日本血吸虫成虫cDNA为模板RT-PCR扩增出SjVAL2序列,PCR、双酶切及DNA测序均证实pET-28a(+)-SjVAL2重组质粒构建成功。SDS-PAGE结果表明,目的基因在大肠埃希菌中获得高效表达,重组蛋白能识别日本血吸虫感染的小鼠血清,说明其具有免疫反应性。结论日本血吸虫SCP/TAPS家族中至少有17个不同的蛋白成员存在,其中SjVAL2基因可在原核表达系统中高效表达,为进一步研究该家族蛋白的功能打下基础。
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关键词
日本血吸虫
scp/taps基因家族
基因
克隆
原核表达
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职称材料
家族性胆固醇结石患者肝组织HMGCR和SCP_2mRNA的表达
被引量:
4
2
作者
崔云峰
崔乃强
+1 位作者
李东华
张琚
《世界华人消化杂志》
CAS
北大核心
2005年第9期1115-1118,共4页
目的:研究家族遗传性胆囊胆固醇结石患者、非家族遗传性胆囊胆固醇结石患者和非胆固醇结石患者肝组织HMGCoA还原酶(HMGCR)、固醇携带蛋白2(SCP2)基因mRNA的表达情况,进而明确二者在胆石形成中的作用.方法:选取2003-08/2004-08天津市南...
目的:研究家族遗传性胆囊胆固醇结石患者、非家族遗传性胆囊胆固醇结石患者和非胆固醇结石患者肝组织HMGCoA还原酶(HMGCR)、固醇携带蛋白2(SCP2)基因mRNA的表达情况,进而明确二者在胆石形成中的作用.方法:选取2003-08/2004-08天津市南开医院外科住院病例90例,均取得患者及家属知情同意,其中家族遗传性胆囊胆固醇结石患者28例,非家族遗传性胆囊胆固醇结石患者30例,非胆固醇结石患者32例,术中肝活检,行肝组织总RNA提取,逆转录反应合成cDNA,设计引物,进行聚合酶链反应(PCR)扩增HMGCR和SCP2基因的目的片段,检测肝组织mRNA的表达水平的不同.结果:家族遗传性和非家族遗传性胆固醇结石组HMGCR,SCP2mRNA表达水平较非胆固醇结石组升高;其中HMG(:RmRNA表达在家族遗侉}生胆固醇结石组为1.9269±0.2134,非家族遗传性组为1.9791±0.2524,二者均高于非胆固醇结石组0.7730±0.1530,差异有显著性(P<0.05);SCP2mRNA表达在家族遗传性胆固醇结石组为0.8908±0.1649,非家族遗传性组为0.7503±0.1004,二者均高于非胆固醇结石组0.5205±0.1900,差异有显著性(P<0.05);家族遗传性胆固醇结石SCP2mRNA表达水平较非家族遗传性胆固醇结石组升高,差异有显著性(P<0.05),而HMGCRmRNA在家族遗传性和非家族遗传性胆固醇结石组两组间无统计学差别.结论:胆囊胆固醇结石患者肝组织HMGCR,SCP2mRNA表达水平升高是胆囊胆固醇结石形成的重要原因.
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关键词
结石患者
肝组织
聚合酶链反应(pCR)
mRNA表达
家族
遗传性
家族
性
胆囊胆固醇结石形成
scp
2
HMGCoA
基因
MRNA
总RNA提取
逆转录反应
显著性
表达情况
住院病例
医院外科
胆石形成
家属知情
cDNA
设计引物
P2
基因
水平
还原酶
下载PDF
职称材料
家族性胆固醇结石病人SCP_2基因表达的研究
被引量:
3
3
作者
崔云峰
崔乃强
+1 位作者
李东华
张琚
《中华肝胆外科杂志》
CAS
CSCD
2006年第8期541-543,共3页
目的研究具有家族性胆囊胆固醇结石病人、非家族性胆囊胆固醇结石病人和非结石病人肝组织 SCP_2基因的表达情况。方法应用逆转录-聚合酶链反庸(RT-PCR)技术,研究了28例具有家族遗传性胆囊胆固醇结石病人、30例非家族性胆囊胆固醇结石病...
目的研究具有家族性胆囊胆固醇结石病人、非家族性胆囊胆固醇结石病人和非结石病人肝组织 SCP_2基因的表达情况。方法应用逆转录-聚合酶链反庸(RT-PCR)技术,研究了28例具有家族遗传性胆囊胆固醇结石病人、30例非家族性胆囊胆固醇结石病人和32例非胆固醇结石病人肝组织 SCP_2 mRNA 的表达水平;同时应用 Western blotting 法分别检测三组病人肝组织中 SCP_2蛋白含量变化;并采用生化技术行胆汁脂质分析,计算成石指数。结果家族遗传性和非家族遗传性胆固醇结石组 SCP_2 mRNA 表达水平较非胆固醇结石升高,差异有显著性;家族遗传性胆固醇结石SCP_2 mRNA 表达水平较非家族性胆固醇结石升高,差异有显著性:SCP_2蛋白水平的变化与 SCP_2mRNA 变化一致,差异有显著性。结论胆囊胆固醇结石病人肝组织 SCP_2mRNA 表达水平升高,SCP_2基因表达上调可能是胆囊胆固醇结石形成的重要原因;SCP_2基因表达水平上调则可能在遗传中起一定作用。
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关键词
胆结石
scp
2
基因
表达
致石性胆汁
家族
遗传性
原文传递
题名
日本血吸虫SCP/TAPS基因家族的生物信息学分析和克隆表达
1
作者
陈静芳
胡旭初
王乐旬
余新炳
机构
长沙市疾病预防控制中心
中山大学中山医学院病原微生物学教研室
出处
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第9期804-807,811,共5页
文摘
目的以黄蜂Vv Vesv5蛋白为检索源检索日本血吸虫EST数据库,对检索出的序列进行生物信息学分析,并挑选出有代表性的基因进行克隆表达,为日本血吸虫SCP/TAPS家族蛋白的功能研究打下一定的基础。方法利用生物信息学软件对检索出的日本血吸虫SCP/TAPS家族蛋白进行生物信息学分析,经PCR确定后,以AAW24579为代表进行进一步的研究,将其命名为SjVAL2。根据SjVAL2的序列设计引物,通过RT-PCR扩增出全长编码区域,克隆到原核表达载体pET-28a(+)中,在大肠埃希菌中诱导表达并纯化,免疫印迹实验(Western-blotting)鉴定纯化的重组蛋白。结果日本血吸虫SCP/TAPS家族中至少有17个不同的蛋白成员存在,多序列比对分析发现它们初步可以分为3个不同的亚组。以日本血吸虫成虫cDNA为模板RT-PCR扩增出SjVAL2序列,PCR、双酶切及DNA测序均证实pET-28a(+)-SjVAL2重组质粒构建成功。SDS-PAGE结果表明,目的基因在大肠埃希菌中获得高效表达,重组蛋白能识别日本血吸虫感染的小鼠血清,说明其具有免疫反应性。结论日本血吸虫SCP/TAPS家族中至少有17个不同的蛋白成员存在,其中SjVAL2基因可在原核表达系统中高效表达,为进一步研究该家族蛋白的功能打下基础。
关键词
日本血吸虫
scp/taps基因家族
基因
克隆
原核表达
Keywords
Schistosoma japonicum
scp
/taps
gene family
molecular cloning
prokaryotic expression
分类号
R383.2 [医药卫生—医学寄生虫学]
下载PDF
职称材料
题名
家族性胆固醇结石患者肝组织HMGCR和SCP_2mRNA的表达
被引量:
4
2
作者
崔云峰
崔乃强
李东华
张琚
机构
天津市南开医院急腹症研究所
南开大学分子生物学研究所
出处
《世界华人消化杂志》
CAS
北大核心
2005年第9期1115-1118,共4页
基金
天津市卫生局基金资助项目
NO.03KY33~~
文摘
目的:研究家族遗传性胆囊胆固醇结石患者、非家族遗传性胆囊胆固醇结石患者和非胆固醇结石患者肝组织HMGCoA还原酶(HMGCR)、固醇携带蛋白2(SCP2)基因mRNA的表达情况,进而明确二者在胆石形成中的作用.方法:选取2003-08/2004-08天津市南开医院外科住院病例90例,均取得患者及家属知情同意,其中家族遗传性胆囊胆固醇结石患者28例,非家族遗传性胆囊胆固醇结石患者30例,非胆固醇结石患者32例,术中肝活检,行肝组织总RNA提取,逆转录反应合成cDNA,设计引物,进行聚合酶链反应(PCR)扩增HMGCR和SCP2基因的目的片段,检测肝组织mRNA的表达水平的不同.结果:家族遗传性和非家族遗传性胆固醇结石组HMGCR,SCP2mRNA表达水平较非胆固醇结石组升高;其中HMG(:RmRNA表达在家族遗侉}生胆固醇结石组为1.9269±0.2134,非家族遗传性组为1.9791±0.2524,二者均高于非胆固醇结石组0.7730±0.1530,差异有显著性(P<0.05);SCP2mRNA表达在家族遗传性胆固醇结石组为0.8908±0.1649,非家族遗传性组为0.7503±0.1004,二者均高于非胆固醇结石组0.5205±0.1900,差异有显著性(P<0.05);家族遗传性胆固醇结石SCP2mRNA表达水平较非家族遗传性胆固醇结石组升高,差异有显著性(P<0.05),而HMGCRmRNA在家族遗传性和非家族遗传性胆固醇结石组两组间无统计学差别.结论:胆囊胆固醇结石患者肝组织HMGCR,SCP2mRNA表达水平升高是胆囊胆固醇结石形成的重要原因.
关键词
结石患者
肝组织
聚合酶链反应(pCR)
mRNA表达
家族
遗传性
家族
性
胆囊胆固醇结石形成
scp
2
HMGCoA
基因
MRNA
总RNA提取
逆转录反应
显著性
表达情况
住院病例
医院外科
胆石形成
家属知情
cDNA
设计引物
P2
基因
水平
还原酶
Keywords
Hereditary cholesterol gallstone
Liver
HMGcoA reductase
Sterol carrier protein-2
分类号
R575.62 [医药卫生—消化系统]
下载PDF
职称材料
题名
家族性胆固醇结石病人SCP_2基因表达的研究
被引量:
3
3
作者
崔云峰
崔乃强
李东华
张琚
机构
南开医院急腹症研究所
南开大学分子生物学研究所
出处
《中华肝胆外科杂志》
CAS
CSCD
2006年第8期541-543,共3页
基金
天津市卫生局基金资助(基金编号03KY33)
文摘
目的研究具有家族性胆囊胆固醇结石病人、非家族性胆囊胆固醇结石病人和非结石病人肝组织 SCP_2基因的表达情况。方法应用逆转录-聚合酶链反庸(RT-PCR)技术,研究了28例具有家族遗传性胆囊胆固醇结石病人、30例非家族性胆囊胆固醇结石病人和32例非胆固醇结石病人肝组织 SCP_2 mRNA 的表达水平;同时应用 Western blotting 法分别检测三组病人肝组织中 SCP_2蛋白含量变化;并采用生化技术行胆汁脂质分析,计算成石指数。结果家族遗传性和非家族遗传性胆固醇结石组 SCP_2 mRNA 表达水平较非胆固醇结石升高,差异有显著性;家族遗传性胆固醇结石SCP_2 mRNA 表达水平较非家族性胆固醇结石升高,差异有显著性:SCP_2蛋白水平的变化与 SCP_2mRNA 变化一致,差异有显著性。结论胆囊胆固醇结石病人肝组织 SCP_2mRNA 表达水平升高,SCP_2基因表达上调可能是胆囊胆固醇结石形成的重要原因;SCP_2基因表达水平上调则可能在遗传中起一定作用。
关键词
胆结石
scp
2
基因
表达
致石性胆汁
家族
遗传性
Keywords
Cholelithiasis
scp
2
Gene expression
Lithogenic bile
Hereditary
分类号
R657.42 [医药卫生—外科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
日本血吸虫SCP/TAPS基因家族的生物信息学分析和克隆表达
陈静芳
胡旭初
王乐旬
余新炳
《中国人兽共患病学报》
CAS
CSCD
北大核心
2011
0
下载PDF
职称材料
2
家族性胆固醇结石患者肝组织HMGCR和SCP_2mRNA的表达
崔云峰
崔乃强
李东华
张琚
《世界华人消化杂志》
CAS
北大核心
2005
4
下载PDF
职称材料
3
家族性胆固醇结石病人SCP_2基因表达的研究
崔云峰
崔乃强
李东华
张琚
《中华肝胆外科杂志》
CAS
CSCD
2006
3
原文传递
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