基于CiteSpace的SCoT分子标记技术研究热点和前沿分析

采用文献计量学可视化分析的方法分析SCoT分子标记技术研究进程与现状,揭示研究热点及演化过程。检索中国知网(CNKI)和Web of Science(WOS)核心合集数据库中2000—2022年相关文献,通过Citespace 6.2.R2软件分析文献作者、机构、关键词、引文情况。结果表明,CNKI检索出297篇文献,WOS检索出319篇文献,SCoT分子标记技术研究发文量呈逐年增加趋势。中文文献大都呈散点状,没有形成复杂的网络合作关系,发文量以广西大学何新华教授居多,其次是陕西理工大学的张羽教授。英文文献发文量以Islamic Azad University的Etminan Alireza教授居多,但没有形成复杂的网络合作关系;而来自四川农业大学的张宇(Zhang Yu)教授与其他团队交流紧密,形成较大的研究团队和合作网络。高频关键词有种质资源、亲缘关系、体系优化、genetic diversity(遗传多样性)、scot(start codon targeted)(靶向起始密码子)、polymorphism(多态性)等,近年频率突现关键词为指纹图谱、猕猴桃、葛根、variability(可变性)、gene flow(基因流)、genotype(基因型)、traits(特性)等。英文分析高被引文章大都为遗传多样性分析文献,引文关键词为callus(愈伤组织)、spectral fingerprinting(光谱指纹)。综上所述,中文和英文文献对SCoT分子标记技术研究的关键词相似,前沿热点稍有不同,作者机构间应继续加强合作,促进同专业的学术交流,共同推动SCoT分子标记技术的应用发展。

SCoT分子标记技术在丝瓜上的应用

【目的】采用SCo T分子标记技术分析丝瓜种质资源的遗传多样性和亲缘关系,为丝瓜种质资源的利用和品种选育提供参考。【方法】采用80条引物和SCo T-PCR对81份丝瓜种质资源进行遗传多样性分析和聚类分析。【结果】在优化的SCo T-PCR反应体系基础上,从80条引物中筛选获得10条多态性丰富、重复性好的引物,每条引物扩增获得10-17条100-2100 bp的条带;10条引物共扩增获得140条带,其中多态性条带124条,多态性比例87.57%。81份丝瓜种质材料的遗传相似系数在0.5900-0.9200,在0.5900处可将所有供试材料划分为两大类,第Ⅰ类包括46份有棱丝瓜材料,第Ⅱ类包括35份普通丝瓜材料,广西和广东的丝瓜种质材料主要聚在第Ⅰ类。在遗传相似系数0.7200和0.7900处,第Ⅰ、Ⅱ大类丝瓜材料均可划分为5个组,每组丝瓜材料主要来自相同地区。【结论】SCo T分子标记可作为ISSR、SRAP等标记的有效补充,为丝瓜种质资源的研究提供简单、可靠的工具。

SCoT分子标记技术在木薯遗传多样性分析中的应用

应用SCo T标记对不同来源的28份木薯种质资源进行遗传多样性和亲缘关系分析。结果表明：从36条引物中筛选出19条重复性好、条带清晰的引物对28份木薯材料进行PCR扩增。共扩增出171条带,其中多态性条带123条,平均每条引物扩增多态性条带6.5条,多态性条带比率为71.9%。经NTSYS-pc2.10e软件计算分析,28份木薯种质间遗传相似系数在0.631-0.930之间。利用UPGMA法进行聚类的结果显示：在系数0.68处,木薯材料分为2大类,品种BRA354单独成为一类;在系数为0.734处,28份木薯种质资源主要聚为5大类,聚类结果与材料来源有一定相关性。SCo T标记能在木薯种质间检测出一定程度的遗传多样性,可为木薯遗传育种提供新的技术支持。

DNA分子标记技术在口腔微生物研究中的应用

传统的微生物培养及鉴定方法,很难全面反映口腔微生物群落的状态及其与宿主之间的关系。近年来,随着分子生物学的发展,某些DNA分子标记技术被广泛应用于口腔微生物领域,为发现新菌种、相关口腔疾病发病机制的探讨及临床病例的快速诊断等方面开辟了新的途径。本文主要对相关DNA分子标记技术的基本原理及在口腔微生物领域的应用现状进行综述,比较各种方法的优势与不足,以期为不同的研究方向提供经验。

DNA分子标记技术及其在羊育种中的应用研究

羊是重要的经济动物,加快羊育种进程、促进羊产业的快速发展对整个畜牧业的发展至关重要。相比传统育种方法,DNA分子标记技术具有标记数量多、多态性高、遗传稳定等优势,其应用范围越来越广泛。文章介绍了DNA分子标记技术的发展情况,并概述其在羊生长性能、产肉性能和繁殖性能等方面选育中的应用,以期为我国羊育种改良研究及DNA分子标记技术在羊育种方面的应用提供一定参考。

基于SCoT分子标记的61份加工型黄瓜种质资源遗传多样性分析及DNA指纹图谱构建

为探明加工型黄瓜种质资源的亲缘关系及遗传多样性,为新品种选育提供理论依据,采用目标起始密码子多态性标记(SCoT)技术,以61份加工型黄瓜种质资源为试验材料,进行遗传多样性分析并构建DNA指纹图谱。结果表明,从100条SCoT引物中筛选出8条扩增条带清晰、多态性高且重复性好的引物;利用筛选出的引物对61份黄瓜种质基因组DNA进行PCR扩增,共扩增出238个位点信息,其中多态性位点227个,平均多态性位点百分比为95.38%;采用NTSYS-pc 2.1软件计算得出供试的61份材料间的遗传相似系数分布在0.588~0.920之间,遗传相似系数最小的材料分别是34号与55号,二者在瓜色、叶片形状及果实形状方面存在较大差异,说明两者亲缘关系最远。基于遗传相似系数对其进行UPGMA聚类分析和树状图绘制,在相似系数0.735处,可将其划分为7个类群,说明61份黄瓜种质材料背景存在差异,但多数地域来源相近、生境相似地区的种质被聚在同一类群。利用2对特异性较大的引物SCoT12和SCoT83构建的DNA指纹图谱可单独鉴别出61份黄瓜种质资源,该图谱可为黄瓜分类与鉴定提供科学依据。

基于SCoT分子标记的48份石斛种质遗传多样性分析

为研究不同品种石斛的遗传多样性和亲缘关系,该研究收集48份不同品种的石斛叶片,提取基因组DNA作为实验材料,利用随机选取的2个DNA样品为模板,从36条引物中筛选出具有扩增条带清晰、重复性好的15条目标起始密码子多态性(start codon targeted polymorphism, SCoT)标记引物,进行所有样品的SCoT-PCR扩增反应和遗传多样性研究。结果显示,挑选得出的15条引物每条引物可检测到12~20个等位位点,共扩增获得224条清晰条带,其中217条为多态性条带,多态性比率达到96.88%。聚类分析结果图中显示,48份供试石斛在遗传相似系数在0.55~0.78,在遗传系数0.659水平上可以将供试石斛分为5个类群。15条SCoT引物对48种石斛材料进行有效区分,并将其分为5个组。48种石斛材料的遗传背景存在显著差异,为石斛资源保护提供理论指导。

分子标记技术在农作物品种鉴定中的应用

分子标记技术在农作物品种鉴定中发挥越来越重要的作用。主要介绍了分子标记技术发展历程,常见的分子标记原理、特点及在农作物品种鉴定中的应用,并对其今后在农作物品种鉴定中的应用进行了展望。

分子标记技术在农作物种子检测中的应用

在对农作物种子进行检测过程中,借助分子标记技术可以促使种子检测工作质量得到提升。介绍了分子标记技术以及分子标记技术的发展历程,梳理了应用成本较高、工作人员存在不规范操作的情况、应用的技术与种子类型不匹配等分子标记技术应用中存在的问题;从种子真实性的检测、种子纯度的检测2个方面,概述了分子标记在农作物种子检测中的具体应用,提出了降低分子标记技术应用成本、充分调查操作环境制定标记方式对照表等促进分子标记技术推广应用的建议。

分子标记技术在旱稻育种中靶向的应用

随着人口的增长和资源的有限性,如何提高旱稻的产量和适应性成为迫切的问题。分子标记技术作为一种高效、准确的遗传分析工具,为旱稻育种带来了新的机遇和挑战。本文旨在探讨分子标记技术在旱稻育种中的靶向应用,重点关注抗病性状、逆境适应性和品质特性的筛选与改良。通过深入研究和应用分子标记技术,有望推动旱稻育种的快速进展,为实现粮食安全和可持续农业发展做出贡献。

新一代分子标记技术──AFLP

ＡＦＬＰ（Ａｍｐｌｉｆｉｅｄｆｒａｇｍｅｎｔｌｅｎｇｔｈｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）是近年来发展起来的最有效的新一代分子标记技术．本文对ＡＦＬＰ的发生发展、基本原理、反应程序，在植物分子生物学研究中的应用以及方法本身的优缺点进行了介绍和评述．

RAPD分子标记技术在茶树亲子鉴定中的应用

为给茶树种质资源的鉴定、品种鉴定、亲子鉴定提供科学方法 ,通过对 3个人工杂交组合的亲本及 F1 代进行 RAPD分析 .结果显示 :双亲的 RAPD谱带能在其 F1 代中表现出来 ,表现率分别为 94.90 % ,97.92 % ,98.64 % ,说明 3个杂交单株是其亲本的真正后代 ,这也表明 RAPD技术在亲子鉴定中具有很强的适用性 .同时从 3个杂交组合的 RAPD分析结果可以看出 ,双亲的 RAPD谱带在 F1 代出现分离现象 。

利用SSR分子标记技术鉴定和分析茄子杂种F_1的纯度

【目的】分析、鉴定茄子杂种F1纯度,为提高茄子杂交育种效率提供参考依据。【方法】在育苗期,采用SSR分子标记技术对栽培茄×栽培茄正、反杂交种和野生茄×栽培茄杂交种进行纯度鉴定及亲缘关系分析。【结果】从124对SSR引物中筛选出15对在亲本间存在差异、扩增稳定、条带清晰的引物;从210株杂种F1单株中共鉴定出208株真杂种,杂种纯度为99.0%,鉴定结果与田间性状调查结果一致;栽培茄×栽培茄正、反交组合的F1与亲本的亲缘关系均较近,遗传关系差别微小;野生茄×栽培茄组合的F1与父本的亲缘关系均较远,且表现出偏母本遗传。【结论】SSR分子标记技术能快速、准确鉴定茄子杂交后代的纯度,可作为分子标记辅助育种手段用于指导选择符合茄子育种目标的优良杂交品种选育。

分子标记技术在小麦遗传育种中的应用现状

小麦庞大的基因组使得分子标记技术在小麦中的应用落后于大麦、玉米、水稻等作物。近年来 ,随着分子标记技术及检测系统的发展和完善 ,分子标记技术在小麦中的应用已有了很大的进展。分子标记技术依靠提供准确、稳定可靠的 DNA水平的遗传标记 ,在小麦遗传育种研究中已用于构建遗传图谱、标定和定位目的基因、鉴定与标记外源染色体片段、鉴定品种真实性和纯度、绘制品种指纹图谱、遗传分析、物种演变。

分子标记技术在入侵生态学研究中的应用

外来入侵物种给农林业生产造成了巨大的经济损失,并威胁生物多样性及人类健康.入侵生态学的研究对于认识外来入侵物种的入侵机制及其可持续控制具有重要意义.分子标记技术为解决入侵生态学研究中的许多基本问题提供了良好的手段.本文综述了该技术在外来入侵物种的鉴定、地理分布、原产地、传播模式、种群遗传变异、杂交及基因渗入等研究中的应用现状,并对其应用前景进行了展望.

分子标记技术在蔬菜作物品种鉴定与纯度检测中的应用

品种鉴定与遗传纯度检测是蔬菜作物种子品质检验极为重要内容。本文综述了以蛋白质、DNA为基础的分子标记,如蛋白质与同工酶、RFLP、RAPD、SSR、ISSR等分析技术应用于蔬菜种子检测的基本原理与进展。利用标记分析技术成功进行F1种子纯度检测的关键是亲本与杂交种间稳定差异位点的获得。已获得的重要园艺性状紧密连锁的遗传标记将有利于F1种子纯度鉴定。由于分子标记客观、稳定、快速、高效,这些技术将在今后种子检测中起到重要作用。

分子标记技术在植物遗传多样性研究中的应用

较系统地叙述了RFLP分析、RAPD分析、ISSR分析、SSR分析、AFLP分析用于植物遗传多样性研究的机理及应用,并对各种分子标记手段的优缺点进行了比较.

SSR分子标记技术在茄子杂交种子纯度鉴定中的应用

利用SSR分子标记技术进行种子纯度鉴定是一种准确快速、简单高效的方法。试验选用100对引物在鄂茄子2号亲本间进行PCR扩增,从中筛选出的3对引物SM17、SM29、SM51在双亲本间能够扩增出差异互补的条带。利用这3对引物对鄂茄子2号杂种一代群体进行纯度鉴定,鉴定结果为97.1%;与同批次种子的田间鉴定结果(96.1%,鉴定地点海南岛)接近,说明应用SSR分子标记技术实施茄子杂种一代种子的纯度鉴定是可行的。

DNA分子标记技术及其在药用植物研究上的应用前景

ＤＮＡ分子标记技术及其在药用植物研究上的应用前景傅荣昭１邵鹏柱２高文远３孙勇如１１．中国科学院遗传研究所，北京１００１０１２．香港中文大学生化系香港·新界·沙田３．中国医学科学院、中国协和医科大学药用植物研究所北京１０００９４ＤＮＡ分子标记（ＤＮＡｍ...