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大肠杆菌SD序列碱基片段的统计分析 被引量:3
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作者 李宏 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1998年第5期655-659,共5页
统计了大肠杆菌基因中构成SD区域的碱基片段,给出了SD区域中相对使用频率高的和低的2碱基、3碱基、4碱基和6碱基片断.我们发现,构成SD序列的碱基片段有很强的偏好性;另外我们还研究了这几类碱基片段与基因表达水平的关系... 统计了大肠杆菌基因中构成SD区域的碱基片段,给出了SD区域中相对使用频率高的和低的2碱基、3碱基、4碱基和6碱基片断.我们发现,构成SD序列的碱基片段有很强的偏好性;另外我们还研究了这几类碱基片段与基因表达水平的关系,发现碱基片段出现的相对频率有些与基因表达水平成正比,有些与基因表达水平成反比,还有一些与基因表达水平无关。 展开更多
关键词 sd区域 碱基片段 基因表达水平 大肠杆菌
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大肠杆菌终止密码子前后序列碱基的统计分析 被引量:5
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作者 李宏 罗辽复 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1999年第2期179-184,共6页
统计了大肠杆菌985个基因终止密码子前31个碱基和终止密码子后33个碱基在各个位点的碱基概率分布.发现终止密码子前3个碱基和终止密码子后3个碱基的概率分布与其它位点的概率分布有很大的差别.以TAA结尾的基因序列和以T... 统计了大肠杆菌985个基因终止密码子前31个碱基和终止密码子后33个碱基在各个位点的碱基概率分布.发现终止密码子前3个碱基和终止密码子后3个碱基的概率分布与其它位点的概率分布有很大的差别.以TAA结尾的基因序列和以TAG或TGA结尾的基因序列的碱基分布在终止密码子附近也有明显不同.我们又统计了高表达基因和低表达基因终止密码子前后序列的碱基分布,发现在紧邻终止密码子前后3个碱基范围内,某些碱基分布有明显的差别.还发现碱基G和碱基T的3周期分布贯穿整个编码区,碱基A的3周期分布在编码终止区非常明显. 展开更多
关键词 大肠杆菌 终止密码子 碱基 概率分布 统计分析
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