大肠杆菌SD序列与基因表达水平的关系

依据基因表达水平的理论预测方法从１３７３个大肠杆菌基因中选出了７３个甚高表达基因和１００个甚低表达基因．研究了这两类基因编码区起始密码子ＡＴＧ前－１到－２１位点（包含ＳＤ序列）的碱基构成与基因表达水平的关系．结果表明，ＳＤ序列中的富嘌呤区（约在－７到－１２位点）Ｇ和Ｔ的概率分布曲线中心到ＡＴＧ的距离（记为ＬＨ）与基因表达水平有明显的关系．甚高表达基因ＬＨ约为１０，甚低表达基因的ＬＨ约为８；另外在－１位点处。

大肠杆菌SD序列碱基片段的统计分析

统计了大肠杆菌基因中构成ＳＤ区域的碱基片段，给出了ＳＤ区域中相对使用频率高的和低的２碱基、３碱基、４碱基和６碱基片断．我们发现，构成ＳＤ序列的碱基片段有很强的偏好性；另外我们还研究了这几类碱基片段与基因表达水平的关系，发现碱基片段出现的相对频率有些与基因表达水平成正比，有些与基因表达水平成反比，还有一些与基因表达水平无关。

大肠杆菌与酵母菌基因特定序列信息参量的研究

提出核酸序列的矩阵表示形式,按位点定义了有生物学意义的信息参数M1(l)、M2(l)和M3(l)。着重研究了不同表达水平的大肠杆菌(Escherichiacoli,E.coli)的SD序列(Shine -Dalgarnoregion,SD)以及大肠杆菌(E.coli)和酵母菌(Yeast)基因起始、终止密码子邻近区域核酸序列的碱基关联性与保守性。并求出相应矩阵的本征值 ,给出了信息参量与基因表达水平的关系。发现信息参量体现了原核生物和真核生物翻译起始区域的显著差异 。