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生理和病理状况对小鼠肝脏SDF2L1基因表达的影响
1
作者
王晓娟
朱斌
常永生
《基础医学与临床》
CSCD
2015年第12期1601-1605,共5页
目的确定小鼠肝脏SDF2L1基因在不同生理和病理条件下的表达情况,并构建SDF2L表达质粒,为进一步研究SDF2L1基因的功能奠定基础。方法 Real-time PCR确定SDF2L1基因在糖尿病条件下(db/db和ob/ob小鼠分别为糖尿病和肥胖模型小鼠)或不同营...
目的确定小鼠肝脏SDF2L1基因在不同生理和病理条件下的表达情况,并构建SDF2L表达质粒,为进一步研究SDF2L1基因的功能奠定基础。方法 Real-time PCR确定SDF2L1基因在糖尿病条件下(db/db和ob/ob小鼠分别为糖尿病和肥胖模型小鼠)或不同营养状态的表达情况;设计并合成SDF2L1基因的PCR引物,以野生型C57BL/6J小鼠肝脏c DNA为模板,扩增SDF2L1编码区,PCR产物测序正确后连接到pc DNA4/myc-His表达载体,鉴定插入片段序列正确后,将构建的质粒转染293A细胞,Western blot检测SDF2L1的表达。结果糖尿病条件下或饥饿状态下小鼠肝脏中SDF2L1基因表达明显下调(P<0.01);纯化质粒的相对分子质量为5.8 kb,酶切鉴定结果符合目的条带(666 bp)大小,插入的寡核苷酸序列与野生型SDF2L1基因序列完全相符,表达的融合蛋白大小为26ku。结论 SDF2L1基因可能参与机体糖脂代谢;成功构建SDF2L表达质粒。
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关键词
质粒
sdf2l1
基因
表达
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职称材料
定量蛋白质组学分析SDF2L1过表达后鼻咽癌细胞中的差异蛋白
2
作者
罗承长
苏琪盛
+2 位作者
黎小红
杨峥
莫武宁
《广西医科大学学报》
CAS
2022年第3期437-442,共6页
目的:分析基质细胞衍生因子2样1(SDF2L1)过表达对人鼻咽癌(NPC)细胞5-8F中蛋白表达谱的影响。方法:提取SDF2L1基因过表达细胞株(5-8Fg)及空载细胞株(5-8F1)的总蛋白,利用非标记定量(LFQ)蛋白组学技术和串联质谱分析技术筛选差异表达蛋白...
目的:分析基质细胞衍生因子2样1(SDF2L1)过表达对人鼻咽癌(NPC)细胞5-8F中蛋白表达谱的影响。方法:提取SDF2L1基因过表达细胞株(5-8Fg)及空载细胞株(5-8F1)的总蛋白,利用非标记定量(LFQ)蛋白组学技术和串联质谱分析技术筛选差异表达蛋白(DEPs),应用R软件对DEPs进行GO和KEGG富集分析,Cytoscape软件筛选关键的DEPs,Oncomine数据库对关键DEPs进行验证,RT-qPCR和western blotting法对筛选出来的关键DEPs进行验证。结果:在5-8Fg细胞中共筛选出730个DEPs,其中296个DEPs上调,434个DEPs下调。富集分析结果显示,DEPs主要定位在核糖体中,参与核糖体合成和内质网蛋白加工等过程,发挥黏附蛋白和催化活性等功能。通过Cytoscape和Oncomine数据库验证出核糖体蛋白L14(RPL14)、RPS15A等9个关键DEPs。SDF2L1过表达后RPL14基因(P<0.05)表达下调。结论:SDF2L1过表达后显著改变了NPC细胞中的蛋白表达特征,RPL14可能是NPC的促癌因子。
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关键词
sdf2l1
鼻咽癌
非标记定量蛋白质组学
生物信息学
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职称材料
题名
生理和病理状况对小鼠肝脏SDF2L1基因表达的影响
1
作者
王晓娟
朱斌
常永生
机构
中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室
首都医科大学附属北京世纪坛医院普通外科北京大学第九临床医学院
出处
《基础医学与临床》
CSCD
2015年第12期1601-1605,共5页
基金
国家自然科学基金(81471049)
文摘
目的确定小鼠肝脏SDF2L1基因在不同生理和病理条件下的表达情况,并构建SDF2L表达质粒,为进一步研究SDF2L1基因的功能奠定基础。方法 Real-time PCR确定SDF2L1基因在糖尿病条件下(db/db和ob/ob小鼠分别为糖尿病和肥胖模型小鼠)或不同营养状态的表达情况;设计并合成SDF2L1基因的PCR引物,以野生型C57BL/6J小鼠肝脏c DNA为模板,扩增SDF2L1编码区,PCR产物测序正确后连接到pc DNA4/myc-His表达载体,鉴定插入片段序列正确后,将构建的质粒转染293A细胞,Western blot检测SDF2L1的表达。结果糖尿病条件下或饥饿状态下小鼠肝脏中SDF2L1基因表达明显下调(P<0.01);纯化质粒的相对分子质量为5.8 kb,酶切鉴定结果符合目的条带(666 bp)大小,插入的寡核苷酸序列与野生型SDF2L1基因序列完全相符,表达的融合蛋白大小为26ku。结论 SDF2L1基因可能参与机体糖脂代谢;成功构建SDF2L表达质粒。
关键词
质粒
sdf2l1
基因
表达
Keywords
plasmid
sdf2l1
gene
expression
分类号
R587.1 [医药卫生—内分泌]
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职称材料
题名
定量蛋白质组学分析SDF2L1过表达后鼻咽癌细胞中的差异蛋白
2
作者
罗承长
苏琪盛
黎小红
杨峥
莫武宁
机构
广西医科大学第一附属医院检验科
出处
《广西医科大学学报》
CAS
2022年第3期437-442,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(No.81460414)
广西自然科学基金资助项目(No.2018GXNSFAA281055)。
文摘
目的:分析基质细胞衍生因子2样1(SDF2L1)过表达对人鼻咽癌(NPC)细胞5-8F中蛋白表达谱的影响。方法:提取SDF2L1基因过表达细胞株(5-8Fg)及空载细胞株(5-8F1)的总蛋白,利用非标记定量(LFQ)蛋白组学技术和串联质谱分析技术筛选差异表达蛋白(DEPs),应用R软件对DEPs进行GO和KEGG富集分析,Cytoscape软件筛选关键的DEPs,Oncomine数据库对关键DEPs进行验证,RT-qPCR和western blotting法对筛选出来的关键DEPs进行验证。结果:在5-8Fg细胞中共筛选出730个DEPs,其中296个DEPs上调,434个DEPs下调。富集分析结果显示,DEPs主要定位在核糖体中,参与核糖体合成和内质网蛋白加工等过程,发挥黏附蛋白和催化活性等功能。通过Cytoscape和Oncomine数据库验证出核糖体蛋白L14(RPL14)、RPS15A等9个关键DEPs。SDF2L1过表达后RPL14基因(P<0.05)表达下调。结论:SDF2L1过表达后显著改变了NPC细胞中的蛋白表达特征,RPL14可能是NPC的促癌因子。
关键词
sdf2l1
鼻咽癌
非标记定量蛋白质组学
生物信息学
Keywords
sdf2l1
nasopharyngeal carcinoma
label-free quantitative proteomics
bioinformatics
分类号
R739.62 [医药卫生—肿瘤]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
生理和病理状况对小鼠肝脏SDF2L1基因表达的影响
王晓娟
朱斌
常永生
《基础医学与临床》
CSCD
2015
0
下载PDF
职称材料
2
定量蛋白质组学分析SDF2L1过表达后鼻咽癌细胞中的差异蛋白
罗承长
苏琪盛
黎小红
杨峥
莫武宁
《广西医科大学学报》
CAS
2022
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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