改进的SDS-CTAB法提取濒危植物连香树总DNA

对珍稀濒危植物连香树(Cercidiphyllum japonicum)的6种总DNA提取方法进行了对比试验,结果表明改进的SDS-CTAB法更适合于连香树总DNA提取。该方法提取的DNA经紫外消光值检测,其A260/A280为1.8532,优于CTAB法(1.4872)、SDS法(1.3552)、PVP法(1.5079)、尿素法(1.1858)和高盐低pH法(1.4534)。琼脂糖凝胶电泳和PCR扩增结果也得出同样的结论。

SDS-CTAB法提取烟草病圃土壤微生物总DNA

采用SDS-CTAB法提取了烟草病圃土壤中微生物的总DNA,经过纯化后获得的DNA大小约为21 kb,OD260/OD280高于1.70;用细菌和真菌保守序列引物进行PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳能检测到预期大小的扩增条带。

一种快速简便的植物病原真菌基因组DNA提取方法

尿素提取法是最新报道的一种植物拟南芥基因组DNA的提取方法,但是还没有应用于植物病原真菌DNA的提取。本研究采用改进的4种不同的方法(尿素提取法、CTAB提取法、氯化苄提取法以及SDS-CTAB提取法),分别对5种分类地位不同的植物病原真菌(草莓疫霉病菌、西瓜蔓枯病菌、草莓炭疽病菌、西瓜枯萎病菌和水稻纹枯病菌)的基因组DNA进行提取和比较。结果表明,尿素提取法和SDS-CTAB法均能提取到所有5种真菌的基因组DNA,而尿素提取法提取DNA的效率更高、质量更好,操作步骤更为快速简单。

濒危植物岩黄连叶片中基因组DNA的提取及分析

目的获取高质量的岩黄连基因组DNA。方法用改进的SDS-CTAB法从岩黄连叶片中提取基因组DNA,通过琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法、PCR检测其质量,并与传统的CTAB法比较。结果通过改进的SDS-CTAB法提取的DNA优于CTAB法提取的DNA,电泳条带清晰,纯度高,能较好的进行PCR。结论改进的SDS-CTAB法适合岩黄连基因组DNA的提取。

油棕基因组DNA 3种提取方法的比较研究

采用CTAB小样提取法、PVP法和SDS-CTAB改良法,分别从油棕嫩叶和老叶中提取基因组DNA,并通过紫外分光光度计、琼脂糖凝胶电泳和PCR反应进行检测。研究结果表明:用CTAB小样提取法提取的油棕嫩叶总DNA的质量最好,纯度最高;用其他2种方法提取的DNA的质量均较差。

一种提取高质量贝类基因组DNA的简易方法

以企鹅珍珠贝(Pteria penguin)闭壳肌为样品,利用高盐+十二烷基硫酸钠(SDS)除去蛋白和多糖,用低盐+十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)进一步纯化DNA,建立一种贝类基因组DNA简便、安全、经济的提取方法。改进后的SDS-CTAB法提取的DNA纯度较高,无蛋白质和RNA污染;酶切和AFLP实验验证表明,所提取DNA可满足酶切分析和分子标记等实验的要求。

猴头菌DNA提取条件及SRAP-PCR体系的优化

以猴头菌(Hericium erinaceus)菌丝体为试验材料,建立最优的DNA提取条件和SRAP-PCR扩增体系。结果表明:改进的SDS-CTAB法能较好地满足猴头菌属DNA的提取,优化后SRAP-PCR反应体系经过验证,该体系可用于猴头菌的遗传多样性分析和品种鉴定。

刺山柑(Capparis spinosa L.)基因组DNA提取方法的比较

【目的】为获得野生刺山柑DNA提取的最佳方法。【方法】以野生刺山柑叶片为材料,采用CTAB法、SDS-CTAB法、SDS法和尿素法提取了3个不同地方采集的野生刺山柑DNA。【结果】通过A260/A280、琼脂糖电泳法对所提取的DNA质量进行检验,将其纯度、完整性、得率及耗时等方面进行比较。【结论】4种方法提取DNA结果比较显示,CTAB法是野生刺山柑DNA提取的最佳方法。

蒿种子基因组DNA提取方法的比较研究

以籽蒿(Artemisia sphaerocephala Krasch)种子为试验材料,采用SDS法、CTAB法及SDS-CTAB法进行基因组DNA提取。结果表明:SDS-CTAB法适于籽蒿(A.sphaeroce phala)种子基因组DNA提取,SDS法次之,CTAB法不适合。

兰科植物天麻基因组DNA提取方法的比较研究

天麻Gastrodiaelata组织内含有大量的糖类、酚类等次生代谢物质 ,用常规的CTAB(十六烷基溴化铵 )法或SDS(十二烷基硫酸钠 )法难以获得高质量的DNA模板。为获得高质量的DNA ,笔者通过对兰科植物天麻基因组DNA几种提取方法以及天麻不同部位所得的DNA质量进行分析。结果表明 ,SDS -CTAB法是较理想的提取方法 ,能满足普通PCR的需要。天麻不同部位DNA提取的结果表明 。

棉花枯萎菌gDNA不同提纯方法的比较研究

以棉花枯萎菌菌株为试验材料 ,在CTAB法、SDS CTAB法等基础上加以改进 ,对 4种提纯棉花枯萎菌DNA的方法进行了比较研究。结果表明 :SDS CTAB法是适合于棉花枯萎菌DNA提取的方法。该方法提取的DNA纯度高 ,产率高 ,无明显降解现象 ,能很好地被限制性内切酶酶切 ,并用作PCR模板。

苦瓜DNA提取方法的比较

采用CTAB法、SDS法、SDS-CTAB法、试剂盒法4种方法提取苦瓜(Momordica charantia L.)叶片基因组DNA,并使用分光光度法和琼脂糖凝胶电泳检测提取所得DNA的纯度和浓度。结果表明,SDS-CTAB法和试剂盒法提取的基因组DNA纯度高于CTAB法和SDS法,其中SDS-CTAB法提取的DNA浓度和产率高于其他方法。

小麦网腥黑粉菌冬孢子总DNA提取方法比较

目的:研究提取不同时期小麦网腥黑粉菌冬孢子总DNA的最佳方法。方法:应用改良过的四种方法(CTAB法、SDS-CTAB法、SDS法和尿素法)对小麦网腥黑粉菌冬孢子总DNA进行提取。结果:提取当年小麦网腥黑粉菌冬孢子DNA,纯度(OD260/OD280):CTAB法>SDS-CTAB法>SDS法>尿素法=1.876>1.7815>1.7789>1.6095;产率(μg/g):SDS-CTAB法>SDS法>尿素法>CTAB法=796.25>664>306>291.5。提取15年的小麦网腥黑粉菌冬孢子DNA,纯度(OD260/OD280):CTAB法>SDS-CTAB法>SDS法>尿素法=1.91795>1.8876>1.65985>1.55925;产率(μg/g):尿素法>CTAB法>SDS法>SDS-CTAB法=1529.25>799>687.25>372.5。结论:SDS-CTAB法是提取当年小麦网腥黑粉菌冬孢子DNA的最佳方法。CTAB法是提取15年的小麦网腥黑粉菌冬孢子DNA的最佳方法。

微生物发酵床垫料微生物总DNA提取方法的研究

传统的平板分离培养法,不能全面反映垫料微生物的基因信息,所以获得高质量的垫料微生物总DNA对于研究垫料微生物的群落结构就显得尤为重要。本实验设计对比了6种关于养猪发酵床垫料微生物总DNA的提取方法,对6种方法提取的DNA的浓度和纯度进行比较评价,结果表明,试剂盒法中因为没有专门针对本实验垫料的总DNA提取试剂盒,所采用的粪便,土壤以及淤泥总DNA提取试剂盒都没有达到很好的效果;而在化学法当中,单纯的SDS法和CTAB法都不能有效除去腐殖酸和杂蛋白的污染,通过核酸蛋白分析仪测定的A260/A280的比值基本都在1.5以下,说明纯度很低,用16S rDNA通用引物进行PCR扩增也没有得到目的条带。在SDS-CTAB结合法中利用10%的PEG-8000进行沉淀不进行回收纯化所提取的DNA具有完整性好,纯度高的优点,浓度达到200 ng.μL-1以上,通过核酸蛋白分析仪测定的A260/A280的比值达到1.8左右。用16S rDNA通用引物扩增得到比较亮的目的条带,因此SDS-CTAB结合法是一种高效、可靠的垫料微生物总DNA提取方法,有利于进行下游的分子生态学研究。

天麻基因组DNA不同提取方法比较

以天麻块茎为供试材料,采用琼脂糖凝胶电泳检测和紫外分光光度含量测定技术,比较改良CTAB法和SDS-CTAB法提取天麻块茎基因组DNA的效果。结果表明,改良CTAB法提取天麻块茎基因组DNA的产量高于SDS-CTAB法,纯度略次于SDS-CTAB法,二者提取的基因组DNA,DNA结构完整、大片段的DNA分子含量高。该研究为天麻基因组DNA提取方法的选择提供了参考依据,为天麻种质资源的分子遗传研究奠定了一定的科学与技术基础。

大赖草基因组DNA提取方法比较分析

为了研究不同提取方法对大赖草[Leymus racemosus(Lam.)Tzvel]基因组DNA提取质量的影响,以大赖草的嫩叶为材料,采用CTAB法、CTAB改良法、SDS法、SDS-CTAB法4种提取方法提取大赖草叶片基因组DNA,对提取的基因组DNA进行琼脂糖凝胶电泳及紫外分光光度计法检测,获得最佳大赖草DNA提取方法 ,并利用ISSR标记验证其质量。结果表明,改良的CTAB法提取的大赖草基因组DNA纯度较高、完整性较好,ISSR扩增条带清晰,多态性高。最终确定CTAB改良法为最佳提取方法,完全适合于进一步的分子生物学研究。