应用SELDI技术与MATLAB软件预测替吉奥联合榄香烯治疗消化道肿瘤敏感性的前瞻性研究

目的:借助蛋白质指纹技术及MATLAB软件探索预测替吉奥联合榄香烯治疗晚期消化道肿瘤耐药的可能性。方法:选择7例术后采用替吉奥联合榄香烯治疗有确切疗效的晚期消化道肿瘤患者,应用CM10弱阳离子芯片结合表面增强飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术于用药前检测患者血清样本的蛋白质谱,动态观察该药应用后2周至半年内的疗效,根据实体瘤近期疗效标准分为用药稳定组(SD)(4例)和无效组(PD)(3例),应用Biomarker Wiz-ard软件得出两组间差异有统计学意义的指纹。用MATLAB软件进行多项式曲线拟合得出每个差异指纹的拟合曲线及曲线方程。结果:稳定组与无效组相比有6个蛋白质峰的差异有统计学意义(均P<0.05),蛋白质质荷比(M/Z)分别为4467、7959、9277、9555、15903、15064,其中,与稳定组相比,无效组上调的峰M/Z为9277、9555,下调的峰M/Z为4467、7959、15903、15064。用MATLAB软件进行多项式曲线拟合得出每个差异指纹的曲线和曲线方程均呈线性函数关系。结论:替吉奥联合榄香烯治疗晚期消化道癌前检测SELDI指纹M/Z为4467、7959、9277、9555、15903、15064的蛋白质组指纹可以预测替吉奥联合榄香烯治疗晚期消化道癌的敏感性。

用SELDI技术指导化疗和吉非替尼序贯治疗非小细胞肺癌的前瞻性研究

目的观察在SELDI技术指导下应用化疗及吉非替尼序贯治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的远期疗效。方法选择化疗失败且经SELDI检测M/Z:8693±50H+的丰度≤15%的NSCLC患者9例,口服吉非替尼250mg,1次/d,每2个月查血清SELDI指纹,以M/Z:8693±50H+的丰度>15%作为开始化疗指标,反之为继续服用吉非替尼的指标,指导药物序贯应用,观察总生存时间和最后疗效。结果所有患者中位随访时间21个月,中位无进展生存期为12个月,中位总生存期为24个月。结论用SELDI技术指导化疗及吉非替尼序贯治疗非小细胞肺癌能使患者生存期得到延长。

SELDI技术对肝硬化相关血浆差异蛋白的鉴定

目的建立基于SELDI-TOF-MS技术的蛋白质分离、纯化、鉴定技术,用于鉴定运用SELDI技术发现的肝硬化相关血浆差异蛋白。方法采用尿素预处理血液样本,结合离子交换层析、SELDI芯片检测及芯片上酶解、质谱鉴定等多种技术手段,对肝硬化相关的差异蛋白质进行了分离、纯化和鉴定。结果选用阳离子交换剂对血浆样品进行分离,并对分离的各组分进行芯片检测,在300 mM NaCl洗脱组分中,含有与目标蛋白荷质比相同、理化性质相同的蛋白质峰,并且该目标蛋白得到富集。采取芯片原位酶解的方法对目标蛋白进行快速酶解和质谱鉴定,鉴定该差异蛋白为人血浆结合珠蛋白。结论这一技术路线可以对前期运用SELDI技术检测到的疾病相关的差异蛋白质峰进行分离、纯化和鉴定,从而开展进一步的机制研究和应用研究。

SELDI技术在评估恶性肿瘤患者焦虑情绪中存在的问题

当前大多肿瘤患者都存在焦虑情绪,采取SELDI技术评估恶性肿瘤患者焦虑情绪的方法较为可靠,避免了量表测量时的主观性,但仍有较多问题制约其发展,包括SELDI技术用于焦虑检测尚处于探索阶段、患者及家属方面问题(患者对焦虑情绪的危害性认识不足、家庭经济负担重)、医疗资源紧张及自身存在问题等。本文将对这些影响因素进行分析,并提出相应措施,旨在更好的缓解癌症患者的焦虑情绪,提高其生存质量。

SELDI技术分析肾母细胞瘤体外和体内分泌蛋白质的表达

目的运用表面增强激光解析电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术分析肾母细胞瘤细胞株G401细胞培养液与正常胚肾细胞株CCC-HKE-1细胞培养液的差异蛋白质，分析G401利用血清中的蛋白质，并比较G401培养液与患儿血清存在的相似蛋白质。方法培养含10％胎牛血清及无血清的G401细胞和含10％胎牛血清的胚肾细胞株CCC-HEK-1细胞，收集以上三种培养液及G401裂解液，收集肾母细胞瘤患儿术前血清。将以上样本应用于WCX2（弱阳离子交换）芯片，用SELDI-TOF-MS技术检测、阅读和分析各组间差异及相似蛋白质。结果G401和CCC-HEK-1培养液间存在显著的蛋白质差异表达；G401分泌的蛋白质质荷比有：3996、4084、4144、4215、4232、5980、6069、6094、6855、8553Da；G401利用血清中的蛋白质质荷比有：3830、3917、4144、4460、4795、4932、5688、5981、6023、6050、6075、6094、6188、6203、6857、7064、7308、7964Da；质荷比为4082、4143Da的蛋白质在肿瘤细胞培养液和患儿血清中都检测到。结论SELDI-TOF-MS技术应用于体外培养的肾母细胞瘤细胞和患儿血清方法简便、敏感性高、重复性好；从而为从蛋白质水平研究肾母细胞瘤的发病机制和治疗靶位的寻找奠定基础。

SELDI蛋白质芯片技术在肿瘤标志物筛选中的研究进展

表面增强激光解析电离光谱技术 (surface enhancedlaserdesorptionionizationspectrometry ,SELDI)是一种新兴的蛋白质芯片技术 ,它可以简便、快速地从各种体液及组织中获得大量蛋白质分子信息 ,可用于临床筛选新的肿瘤标志物、肿瘤的早期检测和风险评估。本文介绍了本技术的基本原理 ,以及在临床检测中的应用 ,并对本技术的发展前景作出预测。

SELDI蛋白指纹技术在肿瘤早期诊断中的应用

血清蛋白组学模式诊断技术是一种新型的蛋白组学平台, 在此平台上通过高维质谱所获得的蛋白指纹图谱可用做疾病的诊断标准.此技术在早期肿瘤的检测中具有巨大应用前景.目前发现通过SELDI蛋白指纹技术所获得的生物标记物,大多数是在特异性肿瘤微环境中所产生的低分子质量蛋白碎片.通过多种肿瘤的检测表明,其敏感性和特异性均优于传统的肿瘤标记物,对某些肿瘤的敏感性已达100%, 特异性也超过95%,因而在肿瘤早期诊断和早期预警中具有重要临床应用价值.

采用SELDI蛋白质芯片技术研究氧化亚铁硫杆菌对磷酸盐缺失的反应(英文)

氧化亚铁硫杆菌(At.f)是能够利用Fe2+和硫化矿来获取能量的一种化能自养菌.这种细菌在金属硫化矿的生物浸出中起着重要的作用.在硫化矿的生物浸出过程中,浸矿细菌通常会遇到多种胁迫条件,如温度的变化、营养成分的缺失和pH值的变化等,这些因素会影响到细菌的活性.因此对在胁迫条件下这类细菌的应急反应生理机制的研究具有重要的意义.SELDI蛋白质芯片技术是近年一种高通量的蛋白质组学研究技术.测定了以Fe2+为能源正常条件培养的At.f和磷酸盐缺失培养At.f的生长情况,绘制了相应的生长曲线;采用NP20蛋白质芯片,对At.f总蛋白的蛋白质芯片上样量进行了优化.在此基础上,采用IMAC-Cu、SAX2、WCX2三种特异性SELDI蛋白质芯片技术,获取了磷酸盐缺失培养At.f与正常条件培养的At.f的比较蛋白质图谱,采用软件对比较蛋白质图谱进行分析,发现了磷酸盐缺失培养At.f的13个明显差异表达的蛋白质分子,为进一步分离鉴定这些差异表达蛋白质奠定了基础.

SELDI蛋白芯片技术在肝癌及相关肝病中的应用

SELDI蛋白芯片技术全称为表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(surface enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS),把层析、质谱等项技术合理应用于蛋白样品的检测,具有高通量、高效率、高灵敏度等特点,可以快速地分析各种生物样品中蛋白质组的组成,在基础医学研究、临床疾病诊断以及药物研发方面显示出广阔的应用前景。本文就其组成、技术原理、特点及其在肝癌和相关肝病中的应用、意义及发展前景作一综述。

SELDI蛋白质芯片技术在肝癌研究中的进展

SELDI蛋白质芯片技术是一种快速、简便易行和高通量的蛋白质组学研究方法,在肝癌研究中具有广阔的应用前景。本文就其技术原理、临床应用作一综述。

SELDI-TOF-MS技术的改善和优化

表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(Surface-enhanced laser desorption/ionization-time of flight,SELDI-TOF-MS)技术是目前蛋白质组学研究较为有效的手段之一,已被广泛的应用于肿瘤、传染性疾病、心血管病和神经系统等疾病的研究.然而SELDI-TOF-MS技术本身存在着一些问题,如分析结果有效性差和实验重复验证率低等,使其不能完全的应用于常规的临床诊断,现有许多研究致力于解决这些问题,如规范化实验室操作、预处理原始标本和数据、提高统计学方法等极大的改善和优化了这项技术.

SELDI蛋白芯片技术及其应用研究进展

近年来出现的SELDI蛋白芯片技术是一种自动快捷 ,灵敏特异 ,高通量的蛋白组学研究方法。在临床诊断、药物研发及食品卫生等方面有良好的应用前景。综述了该技术的原理、分类及应用范围 ,并对其优势。

SELDI-TOF-MS技术在卵巢癌早期诊断中的应用现状

早期诊断卵巢癌是提高患者长期存活率的关键。血清CA125对于I期卵巢癌的阳性预测值较低;新兴的SELDI-TOF-MS技术具有高通量、低丰度、高灵敏性的优点,通过差异蛋白质组学的研究将新的标志物单独、联合或结合血清CA125用于诊断卵巢癌,具有较高的敏感性和特异性,但同时也面临着挑战。就该技术的作用原理和以上诸方面作一综述。

SELDI蛋白质芯片技术在结直肠癌临床诊断中的应用研究

目的:利用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及蛋白质芯片检测结直肠癌病人血清蛋白质指纹图谱,初步探讨其用于结直肠癌诊断的临床价值。方法:利用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术及弱阳离子交换表面CM10蛋白芯片监测70例结直肠癌患者和48例良性病变对照及25例正常对照的血清蛋白质谱。分为训练集(40例患者40例对照)和验证集(30例患者和33例对照),前者用于筛选结直肠癌的差异蛋白标志物并建立人工神经网络(ANN)诊断模型,后者用于诊断效度的盲法验证。结果:结直肠癌患者和对照组血清蛋白指纹图谱共有148个明显表达差异的蛋白峰,筛选质荷比(m/z)为2957、2974、2982、3016、3282、5928、5948、6647、6661的9个蛋白质峰作为标志蛋白(P<0.01)建立人工神经网络诊断模型,利用该模型对结直肠癌进行盲法预测,结果表明该诊断模型检测结直肠癌的灵敏度为94.2%,特异度为91.3%。结论:应用蛋白芯片技术检测到对结直肠癌有鉴别意义的血清蛋白标志物,可能为结直肠癌的早期诊断提供了新的手段。

SELDI蛋白芯片技术在针灸对胃黏膜损伤修复机制中的研究应用

SELDI蛋白芯片技术作为新兴的蛋白组学研究手段，可以为针灸对胃黏膜损伤修复机制的研究提供广阔的应用空间，可能帮助我们找到损伤修复中起作用的蛋白通路分子。

SELDI蛋白质指纹对因基因多态性导致耐药性漂移诊断的前瞻性研究——吉非替尼与含铂方案序贯治疗非小细胞肺癌

背景与目的本研究组前期研究发现借助于SELDI技术可以预测吉非替尼的疗效,而且指出其蛋白质指纹图谱M/Z:8,693±50H+丰度25%,可以作为吉非替尼治疗非小细胞肺癌(non-smallcelllungcancer,NSCLC)患者取、舍的筛选指标,以这个指标为界定,观察含铂方案治疗失败的患者以蛋白质指纹为依据指导化疗与吉非替尼的序贯应用的方法的远期效果。方法选择TP、DP和GP方案化疗失败,且经SELDI检测M/Z(质核比)8,693±50H+的丰度15%的NSCLC患者9例,口服吉非替尼250mg,1次/d,治疗期间每2个月查患者血清SELDI指纹,以M/Z:8,693±50H+的丰度>25%作为再化疗指标,并以M/Z:8,693±50H+丰度15%为继续服用吉非替尼的指标,两者之间根据肿块变化和肿瘤标记物变化决定取舍吉非替尼治疗时间,指导吉非替尼与含铂方案的序贯治疗,观察总生存时间。结果随访至2010年12月,9例患者中位总生存期为27个月(10个月-66个月)。结论 SELDI技术通过指纹的描述,有计划地选择这些抗肿瘤药物治疗NSCLC的取、舍,可提高药物治疗的获益率和获益时间。

蛋白质指纹技术与MATLAB软件联合应用预测替吉奥胶囊治疗消化道癌疗效的前瞻性研究

目的借助蛋白质指纹技术及MATLAB软件探索预测替吉奥胶囊(S-1)治疗消化道癌耐药的可能性。方法选择6例曾手术并接受S-1治疗并有可观察疗效的晚期消化道癌患者,应用CM10弱阳离子芯片结合表面增强飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术于化疗前检测患者血清样本的蛋白质谱,动态观察该方案化疗后2周～3个月,根据实体瘤近期疗效标准分为用药稳定组(SD)3例和无效组(PD)3例,应用Biomarker Wizard软件得出两组间指纹比较差异有统计学意义。用MATLAB软件进行多项式曲线拟合得出每个差异指纹的拟合曲线及曲线方程。结果术后稳定组与无效组相比有3个蛋白质峰有显著差异性,M/Z(质荷比)分别为7900、8860、9175,其中与有效组相比,无效组上调的峰M/Z为8860、9175,下调的峰M/Z为7900。用MATLAB软件进行多项式曲线拟合得出每个差异指纹的曲线且曲线方程均呈线性的函数关系。结论 MATLAB软件根据实测值获得的曲线方程及曲线呈有意义的线性函数关系,因此借助于蛋白质指纹技术预测S-1治疗消化道癌的耐药是可行的,以此为平台扩大病例数进一步验证即可获得能应用于临床的预测指标。

蛋白质芯片技术在视网膜母细胞瘤患者早期诊断中的运用(英文)

目的:探讨用表面增强基质辅助激光解析离子化-飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)筛选视网膜母细胞瘤(retinoblatoma,Rb)血清标志蛋白,为Rb筛查、早期诊断及鉴别诊断寻找新的方法。方法:采用IMAC30和CM10两种蛋白芯片对18例Rb患者和17名年龄匹配的正常小儿血清进行了蛋白质谱检测。统计分析采用Ciphergenproteinchip3.0.2软件,两组间蛋白峰强度的比较采用t检验,率的比较采用Fisher精确概率法。结果:IMAC30蛋白芯片结果显示:与正常幼儿相比,视网膜母细胞瘤患者血清中有26个差异表达的蛋白峰,其中高表达有21个,质/荷比(m/z)分别为:7746,7014,117133049,7084,7299,5888,2544,12575,5489,9658,95759929,10161,8955,1886,10617,6209,2411,7374和6614低表达有5个,分别为:8382,7923,7972,8590和66576,统计学检验P<0.01。其中以m/z7014峰进行两组统计学分析时,敏感性和特异性分别为94.4%和82.4%。与正常小儿相比,经CM10蛋白芯片分析显示:视网膜母细胞瘤患者血清中有4个差异表达的蛋白峰,其中高表达有个,质/荷比(m/z)分别为5888,6097和7798;低表达蛋白峰为m/z8590。统计学检验P<0.01。当选择m/z779峰进行统计学分析时,敏感性和特异性分别是83.3%和70.6%。结论:视网膜母细胞瘤患者血清中存在较多标志蛋白SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术有望成为Rb筛查、早期诊断及鉴别诊断的新的有效工具。