关于SEN病毒(SENV)

2000年意大利学者Primi等从1名感染HIV的毒瘾者血清中分离到一株单链DNA病毒,以该病人的姓名第一个字母命名为SEN病毒(SENV)。该病毒有8个成员,分别命名为SENV-A～H。 SENV属于TTV相关病毒的超级家族(superfamily of TTV-related viruses),是小的、很可能是无包膜的单链环状DNA病毒。对8株SENV、6株TTV原型株、7株TTV变异株(SANBAN、TUSO1、

上海市非甲～非戊型肝炎患者及献血者中SENV感染的分子特征

目的探讨上海市非甲～非戊型肝炎患者和健康献血者中SEN病毒的感染情况及其分子特征。方法收集非甲～非戊型肝炎患者和健康献血者的血液样本,分离血清,采用巢式聚合酶链反应方法对收集的血清样本进行SENVDNA检测,并对部分PCR产物进行测序鉴定。结果非甲～非戊型肝炎患者中SENVDNA阳性率为53.3%(16/30),无偿献血者中SENV感染率为10%(3/30)。其中,无偿献血者3例阳性样本中,2例为SENVH亚型,1例为SENVD亚型。16例阳性非甲～非戊型肝炎患者标本中,8例为SENVH亚型,6例为SENVD亚型,2例为D亚型和H亚型混合感染。结论上海非甲～非戊型肝炎患者及献血者中SENV主要为D或H亚型,输血传播非SENV唯一传播形式。

不同肝炎患者及献血人员中SENV-D感染流行病学调查

目的:了解SEN病毒D亚型在我国不同肝炎患者和献血人员中的感染情况。方法:采用巢式聚合酶链反应对收集的健康献血者和各型肝炎患者(包括甲肝、乙肝、丙肝和非甲非戊型肝炎患者)进行SENV-D亚型DNA检测。结果:无偿献血者中SENV-D感染率为25.9%,急性甲肝患者中的感染率为14.5%,慢性乙肝患者中的感染率为46%,丙肝患者中的感染率为65%,在非甲-非戊型肝炎患者中的感染率为51.2%。结论:SENV可能与HCV和HBV具有一样的传播方式,但并不是肝病发生的原因。

SEN virus does not affect treatment response in hepatitis C virus coinfected patients but SEN virus response depends on SEN virus DNA concentration

AIM: To clarify the effect of SEN virus (SENV) infection on a combination therapy including interferon alfa (IFN-α) or pegylated-IFN with ribavirin in patients with chronic hepatitis and the effect of a combination therapy on SENV.METHODS: SENV DNA was determined by polymerase chain reaction in serum samples from 95 patients with chronic hepatitis C. Quantitative analysis was done for SENV H DNA.RESULTS: Twenty-one (22%) of 95 patients were positive for SENV DNA. There was no difference in clinical and biochemical parameters between patients with HCV infection alone and coinfected patients. The sustained response rate for HCV clearance after combination therapy did not differ between patients with SENV (52%) and without SENV(50%, n.s.). SENV DNA was undetectable in 76% of the initially SENV positive patients at the end of follow-up. SENV H response to combination therapy was significantly correlated with SENV DNA level (P=-0.05).CONCLUSION: SENV infection had no influence on the HCV sustained response rate to the combination therapy.Response rate of SENV to the combination therapy depends on SENV DNA level.

Mutations around interferon sensitivity-determining region:A pilot resistance report of hepatitis C virus 1b in a Hong Kong population

AIM: To explore mutations around the interferon sensitivity-determining region (ISDR) which are associated with the resistance of hepatitis C virus 1b (HCV-1b) to interferon-α treatment. METHODS: Thirty-seven HCV-1b samples were ob- tained from Hong Kong patients who had completed the combined interferon-α/ribavirin treatment for more than one year with available response data. Nineteen of them were sustained virological responders, while 18 were non-responders. The amino acid sequences of the extended ISDR (eISDR) covering 64 amino acids upstream and 67 amino acids downstream from the previously reported ISDR were analyzed. RESULTS: One amino acid variation (I2268V, P = 0.023) was significantly correlated with treatment outcomein this pilot study with a limited number of patients, while two amino acid variations (R2260H, P = 0.05 and S2278T, P = 0.05) were weakly associated with treatment outcome. The extent of amino acid variations within the ISDR or eISDR was not correlated with treatment outcome as previously reported. CONCLUSION: Three amino acid mutations near but outside of ISDR may associate with interferon treatment resistance of HCV-1b patients in Hong Kong.

Prevalence and clinical significance of SEN virus infection in patients with non A-E hepatitis and volunteer blood donors in Shanghai

AIM:To explore the prevalence of SEN virus (SENV) in patients with non A-E hepatitis and volunteer blood donors in Shanghai. METHODS: According to the published gene sequences, primers from the conserved region were designed. Then, the prevalence of SEN virus in 30 samples from healthy voluntary blood donors and 30 samples from patients with non A-E hepatitis were detected by nested-PCR of SENV-D/H. Some PCR products were cloned and sequenced. RESULTS: The specificity of genotype-specific PCR was confirmed by sequencing, the SENV DNA was detected in 53.3% of the patients with non A-E hepatitis and 10% of the blood donors. The prevalence of SENV-D/H viremia was significantly higher in patients with non A-E hepatitis than in blood donors (P = 0.0002). SENV-H subtype and SENV-D subtype were found in 2 and 1 samples, respectively from blood donors. SENV-H subtype, SENV D subtype, mixed SENV-D and SENV-H subtype were found in 8, 6 and 2 samples, respectively, from patients with non A-E hepatitis. CONCLUSION: The gene type of SENV in patients with non A-E hepatitis and blood donors in shanghai is D or H subtype, and transfusion is not the only transmitting form of SENV.

SEN病毒中国株流行病学研究及克隆和序列分析

为了解SEN病毒中国株的流行病学及基因序列 ,采集肝炎患者 (甲～戊型 )、非甲～非戊型肝炎患者、ALT升高的婴幼儿、尿毒症患者、静脉毒瘾者和健康体检人群的血清标本 ,用巢式PCR检测SEN病毒 ,结果他们的检出率依次为 13 3%、2 0 5 %、4 8%、5 8%、5 7%和 0。PCR获得了两种不同长度阳性片段。选取 5份阳性PCR产物进行纯化、连接及转化 ,获取重组克隆 ,命名为 pGCEM -SENVL(1、2、3)、pGEM -SENVS(1、2 ) ,进行DNA序列分析。结果与SEN病毒 (AX0 2 5 6 6 7)序列同源性分别为 87 7%、76 1%、88 2 %、72 7%和 78 8%。首次发现我国存在SEN病毒散发感染 ,并存在不同于SEN病毒 (AX0 2 5 6 6 7)的中国变异株 。

同时检测SEN病毒D和H聚合酶链反应法的建立

目的 建立同时检测SEN病毒D和H(SENV -D和H)巢式聚合酶链反应法 (nPCR)。方法 第一轮PCR外引物为SENV -D和H开放读码框架 (ORF) 1区的共同序列 ,第二轮PCR内引物分别为SENV -D和HORF1区型特异性引物。应用双脱氧链末端终止法对SENV -D和H的PCR产物进行克隆测序。结果 应用同时检测SENV -D和H的nPCR法最终检出SENV -D和H的血清稀释度为 10 3。序列分析表明 ,用本法检出的SENV -D(DTd株 )和SENV-H(DTh株 )与GenBank收录的SENV -D和H株核苷酸序列同源性均为 92 %。检测 173例慢性乙型肝炎 (轻、中度 )患者 ,SENV -D和H的总感染率为 5 8 4%。结论 本法可用于SENV

武汉地区SEN病毒感染的血清流行病学调查

目的 研究武汉地区SEN病毒 (SENV)感染状况。方法 采用套式聚合酶链反应 (n PCR)对 191例、6种不同人群血清中SENV DNA进行D亚型和H亚型分析。结果 SENV的感染率为 14 7% ,6种人群中SENV感染率的高低依次为血浆置换患者 (36 7% )、静脉吸毒者 (33 3% )、慢性乙型肝炎患者 (11 1% )、非甲～非戊型肝炎患者 (9 4 % )、重症肝炎患者 (8 3% )、正常人群 (5 6 % )。结论 输血和静脉吸毒是SENV感染的重要途径 。

SEN病毒部分基因系统进化分析

目的:通过序列比对分析SEN病毒(SENV)不同开放阅读框(ORF)基因系统进化情况。方法:用聚合酶链反应(PCR)方法扩增武汉地区SENVORF1和ORF2基因,结合GenBank中SEN病毒基因信息对该基因进行序列测定、并采用clutal软件系统进行分析。结果:武汉SEN病毒株与北京株同源性较高,与日本株有一定的差异,和TT病毒有较大差异。结论:SENV可能不是TTV亲缘关系较远的变异株,而是一群不完全相同成员组成的病毒种。

SEN病毒D亚型中国分离株基因克隆及序列分析

According to the published nucleotide sequence of SEN virus genome,specific primers were designed and synthesizedFrom the serum of a Chinese patient with non-A-E hepatitis,two long fragments(totally 3175bp) spanning the complete coding region of SENV-D variant gene were amplified by semi-nested PCRThe amplified fragments were cloned and sequencedThe nucleotide sequence homology of this Chinese strain with SENV-D(AX025730),SENV-D(AB059352) and TTV(AB028668) were 90%,88% and 91% respectivelyThe protein encoded by ORF1 has two putative conserved sequence motifs relating to the replication of the virus and,besides,a conserved ATP/GTP-binding motif and several highly conserved protein kinase phosphorylation

斑点杂交法检测SEN病毒感染

目的 :探讨斑点杂交法检测SEN病毒 (SENV)感染的应用价值 .方法 :应用地高辛标记、制备SENV部分基因探针并用斑点杂交技术检测SENVDNA ,与聚合酶链反应 (PCR)检测结果相比较 .结果 :在 191份血清中 ,采用斑点杂交法检出 6份阳性 ,检出率为 3.1% .PCR方法检测出 11份阳性 ,阳性率 5 .8% .结论 :制备的地高辛探针具有SENV特异性 ,以地高辛标记的SENV探针可用于检测SENV感染 .

中山地区不同类型肝炎患者SEN病毒的感染状况

目的了解中山地区不同类型的病毒性肝炎患者SEN病毒的感染情况。方法设计合成SEN病毒D型和H型的型特异性引物,对乙肝病毒携带者73例、慢性乙肝124例、重症乙型肝炎58例、乙肝肝硬化63例、非甲-戊型肝炎患者57例和对照组健康体检者60人的血清进行套式PCR扩增。结果通过基因克隆和测序证实了基因扩增产物的特异性。非甲-戊型肝炎SEN病毒阳性率(66.67%)明显高于健康献血者(26.67%)(P<0.01)。慢性乙型肝炎患者(52.42%)、重症乙型肝炎患者(53.97%)、乙肝肝硬化患者(56.90%)和非甲-戊型肝炎患者(66.67%)SEN病毒阳性率之间无明显差异(P>0.05),但均显著高于乙肝病毒携带者(27.39%)和健康献血者(P<0.01)。乙肝病毒携带者SEN病毒阳性率与健康献血者之间无明显差异(P>0.05)。结论SEN病毒感染与非甲-戊型肝炎发病有一定的关系。SEN病毒感染可能与乙肝病毒感染的活动和加重有一定的关系。

山东地区不同人群中SEN病毒感染状况

目的 了解山东地区不同人群中SEN病毒 (SENV)感染的状况与其致病性。方法应用逆转录 聚合酶链反应法 (RT PCR)检测了 2 5 4份不同人群和肝病患者血清中SENVDNA ,并对 17例不明原因ALT增高 ,单独SENVDNA阳性的非甲 戊型肝炎患者行肝活检。结果SEN VDNA总阳性检出率为 2 0 .9%( 5 3 / 2 5 4) ,其中非甲 戊型肝炎血清检出率最高为 5 9.6%( 2 8/ 47) ,明显高于健康献血员 3 .2 %( 1/ 3 1)、非肝病患者 5 .5 %( 3 / 5 5 )、输血后丙型肝炎 42 .9%( 12 / 2 8)、血液透析患者 15 .8%( 2 / 13 )和慢性乙肝患者检出率 8.8%( 7/ 80 ) ,SENV在各种人群中存在着显著性差异 (P <0 .0 1)。SENV感染其主要病理学改变为汇管区炎症 ,淋巴细胞集聚 ,碎小坏死 ,小叶内病变较轻 ,呈散在和点状坏死 ,而桥样坏死 ,脂肪性变较少。结论 本研究表明山东地区不同人群及肝病患者中存在着较高SENV感染率 ;SENV感染可能具有嗜肝性 ;而且可能与肝功损害有关 ,是引起非甲 戊型肝炎重要病原 ,输血后丙肝和有血液透析史患者SENV感染率较高 。

广州市生育期妇女乙型肝炎病毒和SEN病毒感染状况调查

目的了解广州市生育期妇女乙型肝炎病毒和SEN病毒感染状况。方法对2006年在广州市某三甲医院妇产科就诊的年龄介于18～47岁的3208名生育期妇女的血清标本用酶联免疫法检测乙肝两对半,并随机抽取其中200份标本用聚合酶链反应法检测SEN病毒D和H亚型。结果HBsAg阳性率为14.3%(459/3208),其中HBsAg、HBeAg、抗-HBc三项阳性占3.2%(103/3208),HBsAg、抗-HBe、抗-HBc三项阳性占8.4%(269/3208),未检出SENV-D和H。结论广州市生育期妇女乙肝病毒携带率高,必须强化乙肝疫苗预防接种,确保新生儿及时、全程接种乙肝疫苗,杜绝乙肝病毒经血传播。SEN病毒感染状况有待进一步研究。

献血者中SEN病毒部分基因的克隆和序列分析

目的 了解我国献血者中是否存在SEN病毒 (SENV)感染 ,并分析SENV国内分离株的部分基因序列。方法 根据SENVORF1区保守序列设计引物 ,采用套式PCR方法 ,从献血者血浆标本中分离SENV基因片段 ,对分离的DNA片段进行基因重组和核苷酸序列分析。结果 从 32 9名献血者中分离出 6株SENV基因片段 ,其核苷酸推导氨基酸序列与SENVA～H基因型序列比较 ,同源性在 5 2 %～ 10 0 % ;系统进化树分析发现 ,分离的 6株SENV属SENV H基因型。结论 国内献血者中存在SENV H基因型感染 ,输血可能成为传播SENV途径之一。

江西省献血员中SEN病毒感染现状的研究

目的了解江西省各地区献血员中SEN病毒(SENV)感染现状。方法采用套式PCR技术对江西省379例献血员血浆标本进行SENV-DNA检测。结果379例献血员中有75例SENV-DNA阳性,占19.79%。其中,上饶最高,占36.54%(19/52),其次是抚州28.52%(12/42),吉安、九江均为18.52%(10/54),南昌18.19%(8/44),宜春13.75%(11/80),赣州为最低9.43%(5/33)。结论江西省各地区献血员中存在SENV感染。

重型肝炎患者血浆置换过程中SEN病毒感染初探

目的:了解血浆置换过程中SEN病毒(SENV)感染情况及对重型肝炎患者肝脏病变的影响。方法:采用套式聚合酶链反应(nPCR)检测慢性重型乙型肝炎患者血浆置换前后血清中SENV DNA并对检测结果和临床资料进行统计学分析。结果:30例慢性重型乙型肝炎患者血浆置换前后SENV检出率分别为10％(3/30)和36.7％(11/30),两组比较差异有显著性意义。30例SENV阳性和阴性患者之间,各项肝功能指标比较,差异均无显著性意义。结论:SENV可通过血浆置换方式传播,但混合SENV感染不影响慢性重型肝炎患者肝脏病变。

山东地区SEN病毒感染的流行病学调查

目的了解山东地区不同人群中SEN病毒(SENV)感染的状况与其致病性。方法应用逆转录聚合酶链反应法(RT-PCR)检测了2545份不同人群和肝病患者血清中SENVDNA,并对17例不明原因ALT增高,单独SENVDNA阳性的非甲—非戊型肝炎患者行肝活检。结果SENVDNA总阳性检出率为20.87%(53/254),其中非甲—非戊型肝炎血清检出率最高为59.57%(28/47),明显高于健康献血员3.23%(1/31)、非肝病患者5.45%(3/55)、输血后丙型肝炎42.86%(12/48)、血液透析患者15.38%(2/13)和慢性乙肝患者8.75%(7/80),SENV在各种人群中存在着显著性差异(P<0.01)。SENV感染其主要病理学改变为汇管区炎症,淋巴细胞集聚,碎小坏死,小叶内病变较轻,呈散在和点状坏死,而桥样坏死,脂肪性变较少。结论山东地区不同人群及肝病患者中存在着较高SENV感染率;SENV感染可能具有嗜肝性;而且可能与肝功损害有关,是引起非甲—非戊型肝炎重要病原,输血后丙肝和有血液透析史患者SENV感染率较高,提示对献血员还应严格筛选。