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春兰CgSEP3基因的克隆和表达分析
被引量:
8
1
作者
贾春蕾
向林
+3 位作者
秦德辉
李小白
吴超
孙崇波
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期1305-1310,共6页
该研究采用RT PCR和RACE技术从春兰(Cymbidium goeringii)中分离到1个SEPALLATA3(SEP3)基因.序列分析表明,该基因含有1个732 bp的开放阅读框(ORF),共编码243个氨基酸.系统进化树分析显示,该基因是MADS-box基因家族AP1/AGL9组SEP...
该研究采用RT PCR和RACE技术从春兰(Cymbidium goeringii)中分离到1个SEPALLATA3(SEP3)基因.序列分析表明,该基因含有1个732 bp的开放阅读框(ORF),共编码243个氨基酸.系统进化树分析显示,该基因是MADS-box基因家族AP1/AGL9组SEP的同源基因,其编码蛋白与其它植物SEP3类蛋白具有较高的一致性,命名为CgSEP3(登录号为KF924272).实时荧光定量分析表明,CgSEP3在春兰花器官中均有表达,其中在唇瓣、侧瓣和萼片中的表达量较高,在子房和蕊柱中的表达量较低;而且CgSEP3在花发育各个时期都有表达,在1~2 cm的花芽中表达量最高,在盛开的花中的表达量最低.研究认为,CgSEP3基因可能在春兰花瓣和萼片的形成过程中具有重要作用.
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关键词
春兰
sep3基因
实时荧光定量表达
花发育
下载PDF
职称材料
铁皮石斛SEP3基因的生物信息学分析及敲除载体的构建
被引量:
1
2
作者
黄鑫
师凯辉
+9 位作者
胡凇
田英男
冯垒
韩欣妤
孙博
王义琴
王冬梅
何玲
朱永平
和凤美
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2021年第4期555-559,共5页
SEP3(SEPALLATA 3)基因是MADS-box家族中的一员,在花器官的形成和发育过程中具有重要作用。为了解SEP3基因在铁皮石斛(Dendrobiumofficinale)中的成花转变机理,从铁皮石斛转录组序列中获得一个SEP3基因序列,并命名为DoSEP3。预测其编码...
SEP3(SEPALLATA 3)基因是MADS-box家族中的一员,在花器官的形成和发育过程中具有重要作用。为了解SEP3基因在铁皮石斛(Dendrobiumofficinale)中的成花转变机理,从铁皮石斛转录组序列中获得一个SEP3基因序列,并命名为DoSEP3。预测其编码区长度为354bp,预测编码117个氨基酸。DoSEP3蛋白相对分子质量13457.87 Da。其不稳定系数为60.53,亲水性的平均值为–0.121,是不稳定的亲水性蛋白,主要在内质网和细胞核中起作用。二级结构主要以α-螺旋为蛋白质最大量的结构元件,跨膜区分析推测Do SEP3蛋白质具有一个跨膜区。进一步的氨基酸比对显示,铁皮石斛Do SEP3蛋白与金钗石斛SEP3蛋白亲缘关系最近,可能具有类似的功能。基于生物信息学分析,利用CRISPR/cas9技术构建铁皮石斛基因敲除载体,并使用农杆菌介导法进行遗传转化,且已获得阳性原球茎,可为后续的SEP3基因表达研究奠定基础。
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关键词
铁皮石斛
sep3基因
生物信息学分析
载体构建
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职称材料
毛白杨PtSEP3-1基因启动子的克隆分析及其表达载体构建
被引量:
10
3
作者
王静澄
李昊
+4 位作者
崔东清
刘军梅
叶梅霞
张志毅
安新民
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期239-244,共6页
SEP(SEPALLATA)类基因属于花器官发育ABCDE模型中的E类基因,拟南芥中的研究表明该类基因可能具有控制花器官形态发育以及激活其它类型基因的功能,是一类花发育过程中的关键基因。因此,研究杨树SEP类基因启动子表达特性对于杨树的开花调...
SEP(SEPALLATA)类基因属于花器官发育ABCDE模型中的E类基因,拟南芥中的研究表明该类基因可能具有控制花器官形态发育以及激活其它类型基因的功能,是一类花发育过程中的关键基因。因此,研究杨树SEP类基因启动子表达特性对于杨树的开花调控研究具有重要意义。本文根据毛白杨SEP3基因和毛果杨基因组序列设计引物,通过PCR获得了PtSEP3-1基因上游2000bp的序列。序列分析结果表明该序列具有启动子的基本元件TATA-box和CAAT-box,还包含大量光响应元件ACE、Box I和Box4等,此外还有脱落酸响应元件ABRE,赤霉素响应元件GARE-motif以及胁迫响应元件HSE、TC-richrepeats等。进一步构建了一个以PtSEP3-1启动子驱动GUS基因的植物表达载体pPtSEP3-1protest,为该启动子的功能鉴定奠定了基础。
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关键词
毛白杨
sep3基因
启动子
表达载体
下载PDF
职称材料
题名
春兰CgSEP3基因的克隆和表达分析
被引量:
8
1
作者
贾春蕾
向林
秦德辉
李小白
吴超
孙崇波
机构
金华职业技术学院
浙江省农业科学院园艺所
出处
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第7期1305-1310,共6页
基金
国家青年自然科学基金(31300583)
浙江省花卉新品种选育重大科技专项(2012C12909-10)
林业公益性行业科研专项(201304117)
文摘
该研究采用RT PCR和RACE技术从春兰(Cymbidium goeringii)中分离到1个SEPALLATA3(SEP3)基因.序列分析表明,该基因含有1个732 bp的开放阅读框(ORF),共编码243个氨基酸.系统进化树分析显示,该基因是MADS-box基因家族AP1/AGL9组SEP的同源基因,其编码蛋白与其它植物SEP3类蛋白具有较高的一致性,命名为CgSEP3(登录号为KF924272).实时荧光定量分析表明,CgSEP3在春兰花器官中均有表达,其中在唇瓣、侧瓣和萼片中的表达量较高,在子房和蕊柱中的表达量较低;而且CgSEP3在花发育各个时期都有表达,在1~2 cm的花芽中表达量最高,在盛开的花中的表达量最低.研究认为,CgSEP3基因可能在春兰花瓣和萼片的形成过程中具有重要作用.
关键词
春兰
sep3基因
实时荧光定量表达
花发育
Keywords
Cymbidium goeringii
sep
3
gene
real-time quantitative PCR
foral development
分类号
Q785 [生物学—分子生物学]
Q789 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
铁皮石斛SEP3基因的生物信息学分析及敲除载体的构建
被引量:
1
2
作者
黄鑫
师凯辉
胡凇
田英男
冯垒
韩欣妤
孙博
王义琴
王冬梅
何玲
朱永平
和凤美
机构
云南农业大学园林园艺学院
出处
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2021年第4期555-559,共5页
基金
国家自然科学基金项目(31760591)资助。
文摘
SEP3(SEPALLATA 3)基因是MADS-box家族中的一员,在花器官的形成和发育过程中具有重要作用。为了解SEP3基因在铁皮石斛(Dendrobiumofficinale)中的成花转变机理,从铁皮石斛转录组序列中获得一个SEP3基因序列,并命名为DoSEP3。预测其编码区长度为354bp,预测编码117个氨基酸。DoSEP3蛋白相对分子质量13457.87 Da。其不稳定系数为60.53,亲水性的平均值为–0.121,是不稳定的亲水性蛋白,主要在内质网和细胞核中起作用。二级结构主要以α-螺旋为蛋白质最大量的结构元件,跨膜区分析推测Do SEP3蛋白质具有一个跨膜区。进一步的氨基酸比对显示,铁皮石斛Do SEP3蛋白与金钗石斛SEP3蛋白亲缘关系最近,可能具有类似的功能。基于生物信息学分析,利用CRISPR/cas9技术构建铁皮石斛基因敲除载体,并使用农杆菌介导法进行遗传转化,且已获得阳性原球茎,可为后续的SEP3基因表达研究奠定基础。
关键词
铁皮石斛
sep3基因
生物信息学分析
载体构建
Keywords
Dendrobium officinale
sep
3
bioinformatics analysis
vector construction
分类号
S682.31 [农业科学—观赏园艺]
Q811.4 [生物学—生物工程]
下载PDF
职称材料
题名
毛白杨PtSEP3-1基因启动子的克隆分析及其表达载体构建
被引量:
10
3
作者
王静澄
李昊
崔东清
刘军梅
叶梅霞
张志毅
安新民
机构
北京林业大学林木育种国家工程实验室
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第2期239-244,共6页
基金
国家自然科学基金项目(30571511)
国家"863"项目(2009AA10Z107)
+2 种基金
教育部重点项目(108017)
国家林业局项目(2006-4-72
LY-09-02)共同资助
文摘
SEP(SEPALLATA)类基因属于花器官发育ABCDE模型中的E类基因,拟南芥中的研究表明该类基因可能具有控制花器官形态发育以及激活其它类型基因的功能,是一类花发育过程中的关键基因。因此,研究杨树SEP类基因启动子表达特性对于杨树的开花调控研究具有重要意义。本文根据毛白杨SEP3基因和毛果杨基因组序列设计引物,通过PCR获得了PtSEP3-1基因上游2000bp的序列。序列分析结果表明该序列具有启动子的基本元件TATA-box和CAAT-box,还包含大量光响应元件ACE、Box I和Box4等,此外还有脱落酸响应元件ABRE,赤霉素响应元件GARE-motif以及胁迫响应元件HSE、TC-richrepeats等。进一步构建了一个以PtSEP3-1启动子驱动GUS基因的植物表达载体pPtSEP3-1protest,为该启动子的功能鉴定奠定了基础。
关键词
毛白杨
sep3基因
启动子
表达载体
Keywords
Populus tomentosa,
sep
3
gene, Promoter, Expression vector
分类号
S792.117 [农业科学—林木遗传育种]
Q943.2 [生物学—植物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
春兰CgSEP3基因的克隆和表达分析
贾春蕾
向林
秦德辉
李小白
吴超
孙崇波
《西北植物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
8
下载PDF
职称材料
2
铁皮石斛SEP3基因的生物信息学分析及敲除载体的构建
黄鑫
师凯辉
胡凇
田英男
冯垒
韩欣妤
孙博
王义琴
王冬梅
何玲
朱永平
和凤美
《安徽农业大学学报》
CAS
CSCD
2021
1
下载PDF
职称材料
3
毛白杨PtSEP3-1基因启动子的克隆分析及其表达载体构建
王静澄
李昊
崔东清
刘军梅
叶梅霞
张志毅
安新民
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
10
下载PDF
职称材料
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