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硒代磷酸合成酶2在皮肤黑素瘤中的表达及临床意义
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作者 王旭东 徐建洪 +4 位作者 李志勇 王珺 黄伟 王岭芝 李承新 《空军军医大学学报》 CAS 2023年第7期669-674,680,共7页
目的 利用生物信息学方法探讨硒代磷酸合成酶2(SEPHS2)在皮肤恶性黑素瘤(CMM)中的表达及临床意义。方法 下载TCGA和GTEx数据库中CMM和正常皮肤相关mRNA微阵列表达谱,比较CMM和正常皮肤的SEPHS2基因表达差异;下载GEO数据集GSE3189数据,比... 目的 利用生物信息学方法探讨硒代磷酸合成酶2(SEPHS2)在皮肤恶性黑素瘤(CMM)中的表达及临床意义。方法 下载TCGA和GTEx数据库中CMM和正常皮肤相关mRNA微阵列表达谱,比较CMM和正常皮肤的SEPHS2基因表达差异;下载GEO数据集GSE3189数据,比较SEPHS2在CMM和痣细胞之间的表达差异。同时利用HPA数据库信息分析其在CMM和正常皮肤黑素细胞中蛋白质水平的表达。利用K-M图,比较不同SEPHS2表达组CMM患者的生存差异,并利用Cox回归计算HR值;利用受试者工作特征曲线评价SEPHS2在CMM中的诊断效能。利用XENA.UCSC数据库分析CMM中SEPHS2基因甲基化情况,K-M图评价SEPHS2不同甲基化水平对预后的影响。利用GSVA包分析SEPHS2表达与CMM组织中免疫浸润相关免疫细胞的相关性。采用STRING数据库分析SEPHS2相关蛋白质-蛋白质相互作用网络信息,并利用GO、KEGG数据库和GSEA软件探讨SEPHS2在CMM中的功能及信号通路。结果 SEPHS2在CMM中的表达水平显著高于正常皮肤组织和痣细胞组织(P<0.001)。在CMM患者中,SEPHS2高表达组较低表达组总体生存率更低,显示SEPHS2具有良好的预后价值,并且SEPHS2对CMM具有良好的诊断价值(AUC=0.895,95%CI:0.876~0.913)。与SEPHS2基因高甲基化组相比,低甲基化组与CMM的不良预后相关,具有统计学意义(P=0.013)。在CMM中,SEPHS2表达与树突状细胞、自然杀伤细胞、T细胞、B细胞和细胞毒性细胞浸润呈负相关,与辅助性T细胞等免疫细胞浸润正相关,均具有统计学意义(P<0.05)。蛋白质-蛋白质相互作用分析显示SEPHS2与SEPSECS、SCLY、TXNRD1、TXNRD2和SELK等分子相互作用。GO、KEGG和GSEA通路富集分析显示SEPHS2及其相关基因参与了表皮形成、体液免疫、中性粒细胞活化与免疫应答、角蛋白丝及桥粒构成、IL-2、IL-2家族、IL-4-2、IL-10、IL-12-2和IL-12-STAT4、IL-17、IL-18、IL-27、B细胞受体、T细胞受体、PD-1及CTLA-4等多条免疫相关信号通路,并呈负相关。结论 SEPHS2在CMM组织中高表达,是CMM潜在的诊断和预后的标志物;SEPHS2不仅参与了硒蛋白的合成,而且还影响了肿瘤的免疫调节过程,可能成为CMM治疗靶点之一。 展开更多
关键词 皮肤黑素瘤 sephs2 生物信息学
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Kinetically controlled, high-yield, direct synthesis of [Au_(25)(SePh)_(18)]^-TOA^+
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作者 SONG YongBo CAO TianTian +3 位作者 DENG HuiJuan ZHU XiuYi LI Peng ZHU ManZhou 《Science China Chemistry》 SCIE EI CAS 2014年第9期1218-1224,共7页
In this article, we present a facile, direct, synthetic approach of preparing monodisperse [Au2s(SePh)ls]- nanoclusters in high yield. In this synthetic approach, two-phase Brust-Schiffrin method is used. Both PhSeH... In this article, we present a facile, direct, synthetic approach of preparing monodisperse [Au2s(SePh)ls]- nanoclusters in high yield. In this synthetic approach, two-phase Brust-Schiffrin method is used. Both PhSeH and NaBH4 should be added drop-wise to the solution of Au (III) at the same time. The formula and molecular purity of [Au25(SePh)ls] TOA+ clusters are characterized by MALDI-TOF mass spectrometry, NMR and TGA analysis. Furthermore, some critical parameters to obtain pure [Au25(SePh)18]-TOA+ are identified, including the NaBH4-to-Au ratio, the selenolate-to-Au ratio and the temperature. The facile, direct, high yield synthetic method can be widely applied in the theoretical research of Au clusters protected by selenol. 展开更多
关键词 selenophenol Au cluster Au2s(SePh)18 kinetically controlled atomic precision
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