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采用SEREX方法从cDNA表达文库中筛选大肠癌抗原基因
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作者 肖冰 刘宇虎 +2 位作者 何敬东 赖卓胜 张振书 《胃肠病学和肝病学杂志》 CAS 2008年第4期276-278,共3页
目的寻找人源性大肠癌特异性抗原基因。方法采用SMART技术构建人大肠癌组织来源的cDNA噬菌体表达文库,以自体或异体大肠癌患者血清按SEREX方法进行免疫筛选,对平板法扩增获得的阳性克隆片段导入克隆载体PUCm-T后进行测序、鉴定和BLAST... 目的寻找人源性大肠癌特异性抗原基因。方法采用SMART技术构建人大肠癌组织来源的cDNA噬菌体表达文库,以自体或异体大肠癌患者血清按SEREX方法进行免疫筛选,对平板法扩增获得的阳性克隆片段导入克隆载体PUCm-T后进行测序、鉴定和BLAST同源性比较,并根据cDNA序列进行生物信息分析。结果构建了3个大肠癌抗原cDNA噬菌体表达文库,其滴度分别为2.39×10^6pfu/mL、2.07×10^6pfu/mL和1.86×10^6pfu/mL,插入片段长度为0.5-4 kb,平均分别为1.4、1.6和1.3 kb,重组率最高达到97.5%。选择高滴度文库扩增后滴度达到4.1×10^10pfu/mL。SEREX筛选共获得16个阳性克隆,代表12个不同抗原基因,其中10个基因片段为已知抗原基因,如IFITM1、CD24、Survivin、KLK6等,2个为未知EST片段。根据序列分析,筛选出的抗原基因有结构基因、调节基因、代谢相关基因等。结论利用SEREX方法筛选出大肠肿瘤相关抗原基因并获得2个肿瘤抗原候选基因。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 血清学筛选技术 抗原基因 cdna表达文库
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从卵巢癌cDNA表达文库筛选肿瘤抗原基因的研究 被引量:11
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作者 袁明 王颖 +7 位作者 张惠珍 王树军 张笑人 尤强 马安伦 冯荻 周光炎 葛海良 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第2期138-140,共3页
目的利用肿瘤患者自体血清筛选患者肿瘤cDNA表达文库SEREX,寻找肿瘤特异性抗原是肿瘤免疫学研究的新策略,由此方法所获B细胞抗原肽可为进一步寻找T细胞抗原肽,开展肿瘤免疫治疗和诊断提供线索。方法采用SEREX方法,筛选中国人卵巢癌cDNA... 目的利用肿瘤患者自体血清筛选患者肿瘤cDNA表达文库SEREX,寻找肿瘤特异性抗原是肿瘤免疫学研究的新策略,由此方法所获B细胞抗原肽可为进一步寻找T细胞抗原肽,开展肿瘤免疫治疗和诊断提供线索。方法采用SEREX方法,筛选中国人卵巢癌cDNA表达文库。对获得的阳性克隆片段测序鉴定和进行BLAST同源性比较。采用RTPCR,分析正常组织和肿瘤组织及肿瘤细胞株中6个新的EST片段的表达。结果所获基因片段大多数为已知抗原基因20/27。根据其来源又可归类为结构基因、线粒体基因和调控基因。另外,获得6个未知的EST片段。RTPCR的结果表明,4个ESTEST8788、1750、1754和3533片段在肿瘤和正常组织中均有表达,2个EST在正常组织中未见表达,而在肿瘤组织中有表达,可能是与肿瘤相关或特异的EST片段。结论SEREX方法不失为一种有效筛选卵巢癌肿瘤抗原的新方法,所获肿瘤抗原候选基因,可进一步进行结构和功能的研究。 展开更多
关键词 卵巢癌 cdna表达文加 serex筛选 肿瘤抗原 基因表达
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SEREX技术筛选及鉴定食管癌肿瘤抗原 被引量:8
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作者 遇珑 胡海 +3 位作者 冉宇靓 彭良平 李江伟 杨治华 《癌症》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第1期100-105,共6页
背景与目的:正常细胞向癌细胞转化过程中,突变的基因或各种异常表达的蛋白可以成为肿瘤抗原诱导机体的免疫反应,因此肿瘤患者的血清中存在着与肿瘤相关的自身抗体。重组cDNA表达文库血清学分析法(serologicalanalysisofrecombinantcDNAe... 背景与目的:正常细胞向癌细胞转化过程中,突变的基因或各种异常表达的蛋白可以成为肿瘤抗原诱导机体的免疫反应,因此肿瘤患者的血清中存在着与肿瘤相关的自身抗体。重组cDNA表达文库血清学分析法(serologicalanalysisofrecombinantcDNAexpressionlibraries,SEREX)是利用肿瘤患者血清中的自身抗体筛选、鉴定肿瘤抗原的技术。本研究拟采用SEREX的方法寻找食管癌自身抗体的相关肿瘤抗原,鉴定与食管癌发生、发展相关的基因和免疫治疗分子靶点,并为食管癌的诊断提供候选血清标志物。方法:用食管癌组织建立库容量达1.6×106pfu的cDNA表达文库,SEREX筛选获得21个不同cDNA序列的阳性克隆,进一步使用SADA法分析其中4个抗原在10例食管癌及10例正常人血清中的反应。结果:在Homosapiensdesmin(DES)等21个阳性克隆中,4个克隆与已知EST序列明显无同源性,另外17个克隆与已知基因高度同源。RibosomalproteinS4等4个抗原与食管癌患者和正常人血清反应阳性率分别为40%和0%、60%和10%、70%和20%、30%和20%。结论:RibosomalproteinS4等4个抗原普遍参与了食管癌患者的体液免疫反应,与食管癌患者血清的反应阳性率明显高于正常人的血清。本研究发现的21个食管癌抗原可作为食管癌治疗的潜在分子靶点和食管癌诊断新的候选血清学标志物。 展开更多
关键词 食管肿瘤 肿瘤抗原 serex cdna表达文库
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应用SEREX技术筛选与鉴定鼻咽癌相关抗原 被引量:5
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作者 黄绍明 何少健 +4 位作者 莫发荣 梁皓 廖红 谢小薰 罗国容 《广西医科大学学报》 CAS 北大核心 2005年第2期166-169,共4页
目的:应用SEREX技术筛选与鉴定鼻咽癌相关抗原,为鼻咽癌的早期诊断、免疫治疗和预后监测提供候选的生物学指标和理论基础。方法:从鼻咽癌新鲜活检组织中提取mRNA,构建cDNA表达文库。用鼻咽癌患者的血清筛选所构建的cDNA表达文库,获得的... 目的:应用SEREX技术筛选与鉴定鼻咽癌相关抗原,为鼻咽癌的早期诊断、免疫治疗和预后监测提供候选的生物学指标和理论基础。方法:从鼻咽癌新鲜活检组织中提取mRNA,构建cDNA表达文库。用鼻咽癌患者的血清筛选所构建的cDNA表达文库,获得的阳性克隆经扩增后提取噬菌粒DNA进行测序。所得序列与GenBank数据库中已知基因进行同源比较,分析其生物学特性。结果:所构建的cDNA原始文库含1×106个重组体,蓝白斑试验显示重组率为93%。用鼻咽癌血清对表达文库进行筛选,共获得21个阳性克隆,分别代表14个不同的cDNA插入片段。12个插入片段的DNA序列分别与基因库上的基因有不同程度的同源性,其中6个基因与鼻咽癌或其它肿瘤的发生、发展关系密切;另6个基因的生理功能未见文献报道。2个插入片段未发现有同源基因,推测可能为新发现的基因。结论:SEREX技术是目前筛选肿瘤抗原最简便、有效的手段之一。本文研究发现的抗原将为鼻咽癌的研究提供进一步的理论基础。 展开更多
关键词 鼻咽癌 cdna文库 serex 肿瘤抗原
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从大肠癌组织cDNA表达文库筛选肿瘤抗原基因 被引量:6
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作者 何敬东 周高速 +4 位作者 肖冰 李旭 刘宇虎 张振书 南清振 《解放军医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期382-384,共3页
目的利用肿瘤患者血清筛选大肠癌cDNA噬菌体表达文库,寻找肿瘤特异性抗原基因。方法采用SMART技术构建中国人大肠癌cDNA噬菌体表达文库。用SEREX方法筛选中国人大肠癌组织cDNA噬菌体表达文库。对获得的阳性克隆片段进行测序、鉴定和BLAS... 目的利用肿瘤患者血清筛选大肠癌cDNA噬菌体表达文库,寻找肿瘤特异性抗原基因。方法采用SMART技术构建中国人大肠癌cDNA噬菌体表达文库。用SEREX方法筛选中国人大肠癌组织cDNA噬菌体表达文库。对获得的阳性克隆片段进行测序、鉴定和BLAST同源性比较,并对其生物信息进行分析。结果成功地构建了大肠癌cDNA噬菌体表达文库,原始文库含2.39×106个重组子,重组率达到97.5%,文库扩增后滴度达到4.1×1010pfu/ml。插入外源性cDNA片段的大小为0.5~4.0kb。SEREX筛选共获得16个阳性克隆,代表12个不同抗原基因,其中10个基因片段为已知抗原基因,如IFITM1、CD24、Survivin、KLK6等,2个为未知EST片段。根据序列分析,筛选出的抗原基因有结构基因、调节基因、代谢相关基因等。结论利用SEREX方法筛选出大肠肿瘤相关抗原基因并获得2个肿瘤抗原候选基因。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 serex抗原基因 cdna表达文库
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原发型肝癌组织cDNA文库的构建及抗原基因的筛选 被引量:3
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作者 刘辉 潘泽亚 +4 位作者 周伟平 李爱军 傅思源 尹磊 吴孟超 《中国现代医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第6期691-693,698,共4页
目的构建人原发型肝癌组织cDNA文库,以SEREX方法从cDNA文库中筛选肝癌抗原基因。方法采用确诊的原发型肝癌患者新鲜手术切除癌组织构建cDNA文库,测定原始文库滴度,进行蓝白筛选以确定文库的重组率。以肝癌患者的血清,采用血清学方法筛... 目的构建人原发型肝癌组织cDNA文库,以SEREX方法从cDNA文库中筛选肝癌抗原基因。方法采用确诊的原发型肝癌患者新鲜手术切除癌组织构建cDNA文库,测定原始文库滴度,进行蓝白筛选以确定文库的重组率。以肝癌患者的血清,采用血清学方法筛选所构建的cDNA文库,阳性克隆经PCR检测鉴定后进行序列分析。结果成功构建了混合原发型肝癌cDNA文库经测定原始文库滴度为7.42×106pfu/mL,含3.96×106个重组子,重组率为93%,扩增文库滴度为3.92×109pfu/mL,cDNA插入片段大小在0.5~3.0kb之间。文库经3轮血清学筛选共获得31个阳性克隆,分别代表了24个独立的cDNA插入片段(抗原基因)。其中17个与已知基因高度同源,另外7个基因与GenBank中已知基因的部分同源,其中有3个是新基因。利用SMART技术构建了高质量的人原发型肝癌组织cDNA表达文库,有利于以cDNA文库为基础的进一步的实验研究。结论应用SEREX技术初步筛选原发型肝癌组织cDNA文库,共得到17个原发型肝癌相关抗原基因,其中有3个是新基因,可能为原发型肝癌的免疫学研究提供新的研究分子。 展开更多
关键词 原发型肝癌 cdna文库 重组cdna表达文库的血清学分析 抗原基因
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SEREX技术在筛选疾病相关抗原中的应用 被引量:2
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作者 葛昆 钟理 +3 位作者 吴策 祖金池 柳峰松 王海霞(综述) 《免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期479-482,共4页
重组cDNA表达文库血清学分析(SEREX)方法是一种筛选疾病相关抗原的有效分析方法,其筛选鉴定的疾病抗原不仅可对疾病进行早期检测,还能作为免疫治疗的靶标。本综述从肿瘤和其它具有免疫原性的疾病方面介绍了SEREX技术的应用价值,在总结SE... 重组cDNA表达文库血清学分析(SEREX)方法是一种筛选疾病相关抗原的有效分析方法,其筛选鉴定的疾病抗原不仅可对疾病进行早期检测,还能作为免疫治疗的靶标。本综述从肿瘤和其它具有免疫原性的疾病方面介绍了SEREX技术的应用价值,在总结SEREX缺点的基础上提出了SEREX技术的改进方向。 展开更多
关键词 serex技术 cdna噬菌体文库 肿瘤相关抗原 疾病相关抗原
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卵巢癌相关抗原cDNA表达文库的筛选
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作者 阳志军 杨光 +4 位作者 蒋燕明 冉宇靓 杨治华 张玮 李力 《广西医科大学学报》 CAS 北大核心 2008年第5期665-668,共4页
目的:从卵巢癌腹腔积液肿瘤细胞cDNA表达文库中筛选卵巢癌相关抗原。方法:采用SEREX方法从卵巢癌腹腔积液肿瘤细胞构建的cDNA表达文库中筛选阳性克隆。血清学筛选出的阳性克隆与SSH所得的差异表达基因探针进行杂交,最终得到特异性较高... 目的:从卵巢癌腹腔积液肿瘤细胞cDNA表达文库中筛选卵巢癌相关抗原。方法:采用SEREX方法从卵巢癌腹腔积液肿瘤细胞构建的cDNA表达文库中筛选阳性克隆。血清学筛选出的阳性克隆与SSH所得的差异表达基因探针进行杂交,最终得到特异性较高的阳性克隆。对这些克隆进行酶切鉴定、测序分析。结果:经二轮血清学筛选和DotBlot杂交,最终得到55个在血清中有相应IgG和(或)IgM自身抗体的卵巢癌差异表达的候选肿瘤抗原克隆。经核苷酸测序、序列分析和相似性比对,结果表明这55个EST片段代表45个基因,可分为6类:①3个与已知卵巢癌相关基因相似的基因,如BARD1等;②15个与其它肿瘤相关基因相似的基因,如TM4SF1等;③6个在一些特殊组织中表达的基因,如FXR1(fragileX-relatedgene1,脆性X染色体相关基因1)等;④8个与一些特殊功能蛋白基因相似的基因,如TIZ;⑤5个与胚胎来源的基因相似的基因,如PKHD1等;⑥8个在GenBank中无相似序列的新基因,如OV-189等。结论:SEREX方法与SSH方法相结合筛选肿瘤抗原的技术路线是一种行之有效的、能筛选具有较高特异性肿瘤抗原的策略。本研究为进一步研究这些抗原在卵巢癌的发生、发展及诊断方面的应用奠定了基础。 展开更多
关键词 卵巢癌相关抗原 cdna表达文库 serex SSH
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鼻咽癌组织cDNA文库的构建及抗原基因的筛选 被引量:4
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作者 舒峻 李官成 何小鹃 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第1期54-58,共5页
构建人鼻咽癌组织cDNA文库 ,以SEREX方法从cDNA文库中筛选鼻咽癌抗原基因。采用确诊鼻咽癌患者新鲜活检癌组织构建cDNA文库 ,测定原始文库滴度 ,进行蓝白筛选以确定文库的重组率。以建库组织来源患者的自身血清 ,采用“一对一”的血清... 构建人鼻咽癌组织cDNA文库 ,以SEREX方法从cDNA文库中筛选鼻咽癌抗原基因。采用确诊鼻咽癌患者新鲜活检癌组织构建cDNA文库 ,测定原始文库滴度 ,进行蓝白筛选以确定文库的重组率。以建库组织来源患者的自身血清 ,采用“一对一”的血清学方法筛选所构建的cDNA文库 ,阳性克隆经PCR检测鉴定后进行序列分析。经测定原始文库滴度为 7 2 8× 10 6 pfu mL ,含 3 6 4× 10 6 个重组子 ,重组率为 94 % ,扩增文库滴度为 3 8× 10 9pfu mL ,cDNA插入片段大小在 0 5~ 3 0kb之间。文库经三轮血清学筛选共获得 2 3个阳性克隆 ,分别代表了 16个独立的cDNA插入片段 (抗原基因 )。其中 10个与已知基因高度同源 ,另外 6个基因与GenBank中已知基因的部分同源 ,其中有 3个是新基因。利用SMART技术构建了高质量的人鼻咽癌组织cDNA表达文库 ,有利于以cDNA文库为基础的进一步的实验研究。应用SEREX技术初步筛选鼻咽癌组织cDNA文库 ,共得到 16个鼻咽癌相关抗原基因 ,其中有 3个是新基因 ,可能为鼻咽癌的免疫学研究提供新的研究分子。 展开更多
关键词 鼻咽癌 cdna文库 抗原基因 表达文库
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非洲爪蟾肝脏肿瘤cDNA表达文库异种同源抗原的筛选
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作者 万洋 杨寒朔 +1 位作者 邓洪新 姜愚 《华西医学》 CAS 2007年第3期565-566,共2页
目的:通过重组cDNA文库的血清学筛选(SEREX)技术获得来自非洲爪蟾(Xenopus laevis)肝脏肿瘤文库中具有潜在治疗价值的异种同源抗原的cDNA序列。方法:用人肝癌细胞株SMMC-7721免疫家兔后收集的抗血清作为筛选血清,采用SEREX技术筛选Xenop... 目的:通过重组cDNA文库的血清学筛选(SEREX)技术获得来自非洲爪蟾(Xenopus laevis)肝脏肿瘤文库中具有潜在治疗价值的异种同源抗原的cDNA序列。方法:用人肝癌细胞株SMMC-7721免疫家兔后收集的抗血清作为筛选血清,采用SEREX技术筛选Xenopuslaevis肝脏肿瘤cDNA表达文库。结果:通过两轮筛选获得19个阳性克隆,通过DNA序列测定和分子生物学技术确定这19个克隆编码16个蛋白。其中Transgelin 2、RASguanylreleasing protein1和Chromobox protein homolog6可能与肝细胞肝癌有关。结论:用异种免疫血清筛选异种同源肿瘤抗原拓宽了SEREX技术的应用范围,鉴定Transgelin2、RASguanyl releasing protein1和Chromobox protein homolog6可能为异种同源抗原。 展开更多
关键词 serex 异种同源抗原 cdna文库 非洲爪蟾 肝细胞肝癌
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Construction of cDNA Library from NPC Tissue and Screening of Antigenic Genes 被引量:3
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作者 Jun Shu Xiaojuan He Guancheng Li 《Cellular & Molecular Immunology》 SCIE CAS CSCD 2006年第1期53-57,共5页
To construct cDNA library of nasopharyngeal carcinoma (NPC) and obtain the NPC associated or specific antigens from it, we used a powerful new method to identify the antigens eliciting humoral immune response, which... To construct cDNA library of nasopharyngeal carcinoma (NPC) and obtain the NPC associated or specific antigens from it, we used a powerful new method to identify the antigens eliciting humoral immune response, which is SEREX (serological identification of antigen by recombinant cDNA expression library). Autologous serum of NPC patient was used to screen the reactive clones in the human NPC tissue cDNA library consisted of 3.64 × 10^6 recombinants. The 23 exact positive clones were subcloned to monoclonality and the size of cDNA inserts was identified by PCR. Then the nucleotide sequence of cDNA inserts was determined, and the sequence alignments were performed with BLAST software on GenBank database. They represented 16 different antigens. A detailed sequence analysis showed that 10 of 16 genes were high homologous to genes known in GenBank, such as RPL31, SI00 A2, MT2A, etc. However, there were also 6 genes with low homology to genes in GenBank. Furthermore, 3 of 6 genes may be novel genes. The associations of these genes to NPC and the roles that they played in the occurrence and development of NPC should be further revealed. 展开更多
关键词 NPC cdna library serex antigenic gene
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大鼠睾丸异种抗原的血清学筛选 被引量:3
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作者 彭枫 田聆 +6 位作者 邓洪新 李玉 杨寒朔 阚兵 赵霞 廖建 魏于全 《四川大学学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期305-308,共4页
目的 通过重组 c DNA表达文库的血清学分析 (SEREX)技术获得来自大鼠睾丸文库有潜在治疗价值的异种同源抗原的 c DNA序列。方法 将人卵巢癌细胞株免疫兔后收集的抗血清作为筛选血清 ,采用 SEREX技术筛选大鼠睾丸 c DNA文库。结果 通... 目的 通过重组 c DNA表达文库的血清学分析 (SEREX)技术获得来自大鼠睾丸文库有潜在治疗价值的异种同源抗原的 c DNA序列。方法 将人卵巢癌细胞株免疫兔后收集的抗血清作为筛选血清 ,采用 SEREX技术筛选大鼠睾丸 c DNA文库。结果 通过两轮筛选获得 10个阳性克隆。通过生物信息学分析认为这 10个阳性单克隆 c DNA序列编码 7种不同的蛋白 ,其中 OV- 2、OV- 4为肿瘤相关序列 ,OV- 6、OV- 7为编码未知蛋白的序列。结论 用异种免疫血清筛选异种同源肿瘤抗原拓宽了 SEREX技术的应用范围 ,是一种行之有效的方法。 展开更多
关键词 血清学分析 异种同源抗原 cdna文库
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类风湿关节炎滑膜组织cDNA文库的构建及自身抗原的筛选和鉴定 被引量:1
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作者 任蕾 高飞 刘彦虹 《国际免疫学杂志》 CAS 2014年第6期520-525,共6页
目的 通过SEREX(serological analysis of recombinant cDNA expression library)技术对类风湿关节炎滑膜组织cDNA文库进行初步筛选,得到新的类风湿关节炎自身抗原.方法 利用SMART技术构建类风湿关节炎患者滑膜组织cDNA文库,并对该文... 目的 通过SEREX(serological analysis of recombinant cDNA expression library)技术对类风湿关节炎滑膜组织cDNA文库进行初步筛选,得到新的类风湿关节炎自身抗原.方法 利用SMART技术构建类风湿关节炎患者滑膜组织cDNA文库,并对该文库进行SEREX筛选,获得特异性结合阳性克隆,对阳性克隆同源性分析.然后进行酶联免疫吸附实验(ELISA)验证,分析该阳性克隆对于类风湿关节炎诊断临床敏感度和特异度.结果 构建cDNA文库滴度约为6.89×10^6 pfu/mL,筛选文库获得12个阳性克隆,同源性分析3个阳性克隆插入片段为已知蛋白,分别是:Filaggrin、SERPINE2和p68.进行血清学初步验证,抗-Filaggrin和抗-SERPINE2具有高敏感度和低特异度,而抗-p68具有高敏感度和高特异度.结论 抗-Filaggrin、抗-SERPINE2和抗-p68对于类风湿关节炎的诊断具有不同的敏感度和特异度. 展开更多
关键词 类风湿关节炎 滑膜组织 cdna文库 serex技术 自身抗原
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Screening and analysis of hepatocellular carcinomaassociated antigens and their encoding genes
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作者 SHIYongyu WANGHongcheng LIYan 《Chinese Science Bulletin》 SCIE EI CAS 2003年第20期2192-2195,共4页
Identification of hepatocellular carcinoma- associated tumor antigens is necessary and pivotal for specific immunotherapy in hepatocellular carcinoma (HCC) patients. In the present study, HCC cDNAs are constructed int... Identification of hepatocellular carcinoma- associated tumor antigens is necessary and pivotal for specific immunotherapy in hepatocellular carcinoma (HCC) patients. In the present study, HCC cDNAs are constructed into ZAP cDNA expression library and screened by sera of patients with HCC. The positive clones are DNA sequenced and analyzed by bioinformatics. Thirty-one genes of hepatocellular carcinoma-associated tumor antigens are identified, of which 1 is unknown and 30 are known. The proteins encoded by these known genes can be classified into 8 categories: constitutive molecules of hepatocytes, RNA transcription and splicing-associated molecules, protein metabolism-associated molecules, energy synthesis-associated molecules, signal transduction molecules, cell adhesion molecules, immunosuppressive molecules, and proteins with unknown function. Among these genes, CAGE is a cancer-testis (CT) antigen. It is concluded that identification of hepatocellular carcinoma-associated tumor antigens provides potential targets for immunotherapy of HCC patients and facilitates explanation of carcinogenesis of HCC. 展开更多
关键词 肝细胞癌 肿瘤抗原 编码基因 基因表达 免疫疗法
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