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金黄色葡萄球菌噬菌体vB_Sau_P68的基因组分析和裂解酶
被引量:
1
1
作者
于诗筠
吕金晖
+4 位作者
文会淇
张雅倩
喻鑫婷
米志强
黄海龙
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期3107-3119,共13页
【背景】金黄色葡萄球菌是常见的人畜共患条件致病菌,随着多耐药菌株分离率的增长,研发与抗生素作用模式不同的抗菌剂迫在眉睫。【目的】分离高效且特异性强的金黄色葡萄球菌噬菌体,对其进行功能注释,并对其编码的裂解酶进行功能验证。...
【背景】金黄色葡萄球菌是常见的人畜共患条件致病菌,随着多耐药菌株分离率的增长,研发与抗生素作用模式不同的抗菌剂迫在眉睫。【目的】分离高效且特异性强的金黄色葡萄球菌噬菌体,对其进行功能注释,并对其编码的裂解酶进行功能验证。【方法】通过对噬菌体全基因组序列进行分析找到裂解酶基因,利用原核表达系统对其编码的2个裂解酶蛋白进行克隆,用SDS-PAGE与蛋白免疫印迹法(Western blotting)鉴定目的蛋白是否表达,并采用单斑法验证其裂解活性。【结果】本研究的噬菌体为一株新的金黄色葡萄球菌噬菌体,命名为vB_Sau_P68,该基因组全长为139409 bp,GC含量为31.0%,编码220个开放阅读框(open reading frame,ORF),透射电镜观察具有正二十面体头部和收缩性尾部,形态学分类属于肌尾噬菌体。该噬菌体编码2个裂解酶基因,分别具有CHAP催化结构域与SH3_5结合结构域,SDS-PAGE与Western blotting表明Lys161能够表达且有裂解活性,Lys163则无法外源表达。对Lys161序列进行分析,该裂解酶无信号肽,无跨膜区域,以无规则卷曲为主。【结论】本研究对一株新的金黄色葡萄球菌噬菌体编码的2个裂解酶基因进行了克隆表达,结果提示CHAP催化结构域具有裂解活性,而SH3_5结合结构域则不表达。这一结果可为裂解酶的机制探索及应用提供理论基础。
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关键词
全基因组分析
CHAP结构域
SH3_5结构域
蛋白结构
原文传递
题名
金黄色葡萄球菌噬菌体vB_Sau_P68的基因组分析和裂解酶
被引量:
1
1
作者
于诗筠
吕金晖
文会淇
张雅倩
喻鑫婷
米志强
黄海龙
机构
吉林农业大学动物科学技术学院
军事科学院军事医学研究院微生物流行病研究所病原微生物生物安全国家重点实验室
安徽医科大学解放军
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第8期3107-3119,共13页
基金
国家重点研发计划(2018YFC1602500,2017YFF0108605)
国家自然科学基金(31900489,81572045)
吉林省科技厅项目(20190301009NY)。
文摘
【背景】金黄色葡萄球菌是常见的人畜共患条件致病菌,随着多耐药菌株分离率的增长,研发与抗生素作用模式不同的抗菌剂迫在眉睫。【目的】分离高效且特异性强的金黄色葡萄球菌噬菌体,对其进行功能注释,并对其编码的裂解酶进行功能验证。【方法】通过对噬菌体全基因组序列进行分析找到裂解酶基因,利用原核表达系统对其编码的2个裂解酶蛋白进行克隆,用SDS-PAGE与蛋白免疫印迹法(Western blotting)鉴定目的蛋白是否表达,并采用单斑法验证其裂解活性。【结果】本研究的噬菌体为一株新的金黄色葡萄球菌噬菌体,命名为vB_Sau_P68,该基因组全长为139409 bp,GC含量为31.0%,编码220个开放阅读框(open reading frame,ORF),透射电镜观察具有正二十面体头部和收缩性尾部,形态学分类属于肌尾噬菌体。该噬菌体编码2个裂解酶基因,分别具有CHAP催化结构域与SH3_5结合结构域,SDS-PAGE与Western blotting表明Lys161能够表达且有裂解活性,Lys163则无法外源表达。对Lys161序列进行分析,该裂解酶无信号肽,无跨膜区域,以无规则卷曲为主。【结论】本研究对一株新的金黄色葡萄球菌噬菌体编码的2个裂解酶基因进行了克隆表达,结果提示CHAP催化结构域具有裂解活性,而SH3_5结合结构域则不表达。这一结果可为裂解酶的机制探索及应用提供理论基础。
关键词
全基因组分析
CHAP结构域
SH3_5结构域
蛋白结构
Keywords
whole genome analysis
CHAP
domain
sh3_5 domain
protein structure
分类号
S852.611 [农业科学—基础兽医学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
金黄色葡萄球菌噬菌体vB_Sau_P68的基因组分析和裂解酶
于诗筠
吕金晖
文会淇
张雅倩
喻鑫婷
米志强
黄海龙
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
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已选择
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引用分析
参考文献
引证文献
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