SHCBP1表达在肺腺癌预后及免疫细胞浸润中的临床价值

目的探讨纺锤体相关蛋白1(SHCBP1)在肺腺癌(LUAD)组织中的表达、预后及其对免疫细胞浸润的影响。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达综合(GEO)数据库下载LUAD组织的转录、临床及生存信息数据,比较LUAD和正常肺组织SHCBP1表达差异,分析LUAD中SHCBP1表达与临床参数、临床预后的相关性以及独立预后因素,评估SHCBP1高低表达组中免疫细胞浸润情况,预测SHCBP1相关信号通路。结果相比正常肺上皮组织,LUAD组织中的SHCBP1表达升高;SHCBP1表达水平与LUAD患者的年龄、T分期、N分期和临床分期均有关;SHCBP1高表达组的总生存期(OS)、疾病特异性生存期(DSS)、无进展生存期(PFS)预后较差;多因素COX回归分析表明SHCBP1是LUAD患者独立预后因素;基因富集分析(GSEA)结果提示SHCBP1高表达基因富集在有丝分裂姐妹染色单体分离、染色体分离及姐妹染色单体分离等基因集中;CIBERSORT和ssGSEA分析显示:SHCBP1高表达组CD4和CD8T细胞、自然杀伤T细胞、辅助T细胞、记忆B细胞等肿瘤浸润免疫细胞数量增加。结论SHCBP1在LUAD组织中上调,SHCBP1高表达与LUAD不良预后有关,SHCBP1可能成为LUAD的预后生物标志物及免疫治疗生物靶标。

基于生物信息学方法分析SHCBP1基因在肺腺癌中的表达及临床意义

目的:分析SHC的SH2结构域结合蛋白1(SHCBP1)在肺腺癌(LUAD)中的表达及临床意义。方法:应用On⁃comine、TIMER、UALCAN、GEPIA、Kaplan-Meier plotter、STRING数据库探索SHCBP1对LUAD进展及免疫浸润的影响。结果:LUAD组织中SHCBP1 mRNA表达显著高于正常肺组织(P<0.05)。有吸烟史、发生淋巴结转移、临床分期较晚、TP53突变的LUAD患者组织中SHCBP1 mRNA表达明显升高(P<0.05)。GEPIA和Kaplan-Meier plotter数据库进行的生存分析表明SHCBP1 mRNA高表达的LUAD患者总体生存率较低(P<0.05)。SHCBP1 mRNA与LUAD肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞标记物、免疫检查点表达相关。结论:SHCBP1高表达与LUAD患者的不良预后和肿瘤免疫浸润相关。

慢病毒介导SHCBP1低表达对黑色素瘤B16细胞增殖的影响

构建Shcbp1慢病毒干扰载体,探究SHCBP1在黑色素瘤B16细胞中的生物学功能。通过设计靶向干扰小鼠Shcbp1基因的shRNA-1和shRNA-2以及对照序列shRNA-NC,连接至慢病毒骨架载体,利用HEK293T细胞包装慢病毒颗粒,侵染B16细胞,检测干扰效率,并通过CCK-8和流式细胞术检测细胞活力和细胞周期。利用Western Blot检测增殖相关基因的表达。结果显示:敲低Shcbp1显著抑制B16细胞增殖;流式细胞术检测结果发现,敲低Shcbp1将B16细胞阻滞在G1期;ERK1/2的磷酸化水平降低,P21的表达水平升高。结果表明SHCBP1可能通过ERK1/2信号通路抑制P21的转录,加速B16细胞从G1到S期进程。

SHCBP1基因在结肠癌组织中表达及对结肠癌细胞增殖迁移的影响

目的:探讨SHCBP1基因在结肠癌组织中的表达情况及结肠癌进展过程中的作用。方法:荧光定量PCR、免疫组织化学法检测SHCBP1基因在57例临床结肠癌样本的癌及癌旁组织中表达情况、SHCBP1蛋白表达与定位;构建SHCBP1过表达质粒及合成特异性靶向SHCBP1的siRNA、shRNA并转染结肠癌细胞株,Real-timePCR、Western blot检测细胞株SHCBP1 mRNA和蛋白的表达量,CCK8法、克隆形成检测SHCBP1对结肠癌细胞株增殖能力的影响;划痕实验、Transwell实验检测过表达、干扰后SHCBP1对细胞迁移能力的影响。结果:在57对样本中,结肠癌组织中SHCBP1的表达高于癌旁组织(P<0.001);SHCBP1主要表达于结肠癌细胞的胞质中。过表达SHCBP1后可显著促进结肠癌细胞株增殖迁移,干扰SHCBP1可抑制结肠癌细胞株增殖迁移。结论:SHCBP1在结肠癌组织中起到促进细胞增殖迁移的作用,在结肠癌的发生发展起到促进作用。

SHCBP1在肝细胞癌中的表达及其临床意义

目的研究SHCBP1基因在人肝癌组织中的表达情况,探讨SHCBP1基因在肝细胞癌发生发展中的作用。方法采用半定量RT-PCR、荧光定量PCR(时实PCR)、免疫组织化学法等方法检测SHCBP1基因在52例临床肝细胞癌样本的癌及癌旁组织和人正常组织的表达情况,应用统计学方法分析结果。结果①SHCBP1基因mRNA表达水平在人正常组织中表达具有明显差异;在肝细胞癌样本中明显高于癌旁组织(P<0.05);②免疫组化结果检测显示SHCBP1蛋白在癌旁组织组织中低表达或不表达,而在肝细胞癌组织中表达明显增高,且棕色染色区域主要集中在肿瘤细胞边缘细胞膜位置;③Western blot检测结果显示SHCBP1蛋白在肝细胞癌样本中高表达,癌旁组织中不表达或低表达(P<0.05);④临床统计资料分析显示SHCBP1基因的表达情况与肝细胞癌患者的性别、年龄、临床分期无关,而与肿瘤的直径大小、个数、分化程度、脉管浸润紧密相关。结论 SHCBP1基因在肝细胞癌组织中呈高表达,可能通过影响多种癌症信号通路分子促进肝癌的发生发展,同时该基因可能成为肝癌治疗的潜在新靶点。

SHCBP1表达与宫颈癌患者预后相关性的研究

目的探讨SHCBP1在宫颈癌中的表达以及与宫颈癌患者预后的相关性。方法收集61例宫颈癌患者的临床资料和癌及癌旁组织,并进行定期随访。通过定量PCR实验检测宫颈癌与癌旁组织中SHCBP1的mRNA表达量。统计学分析SHCBP1的表达水平与宫颈癌患者临床病理特征、生存期的相关性,并采用Cox回归分析评估SHCBP1表达水平及临床病理特征与宫颈癌患者预后的相关性。结果不同临床分期(Ⅰ~Ⅳ期)的宫颈癌组织中SHCBP1的mRNA表达量均显著高于癌旁组织,并且有淋巴结转移的宫颈癌患者的组织样本中SHCBP1的mRNA表达量显著高于无淋巴结转移的宫颈癌患者。SHCBP1的表达水平与宫颈癌患者的临床分期、淋巴结转移状态以及组织分化程度存在显著的相关性,而与患者年龄、肿瘤大小和组织学类型之间无显著相关性。此外,SHCBP1高表达组的宫颈癌患者的总生存期及无瘤生存期均显著短于SHCBP1低表达组,其中位生存期分别为46个月及40个月。最后,多因素Cox回归分析结果显示临床分期及SHCBP1表达水平是影响宫颈癌患者预后的危险因素,而组织分化程度是其保护因素。结论 SHCBP1的表达在宫颈癌组织中显著上调,且其表达水平与宫颈癌患者生存期呈显著的负相关,提示SHCBP1是一个潜在的宫颈癌预后指标。

SHCBP1:乳腺癌治疗候选靶点和潜在预后标志物

探讨SHCBP1在乳腺癌及其不同亚型中的表达特征和预后价值。利用Oncomine,bc⁃GenExMiner v4.2,Kaplan⁃Meier plotter,GSE41994及STRING数据库分析乳腺癌病人SHCBP1的mRNA表达水平及其与乳腺癌患者生存率的相关性等。结果:(1)乳腺癌组织中SHCBP1的mRNA水平明显高于正常组织样本,但不同分子亚型的乳腺癌患者中SHCBP1的表达水平不同;(2)SHCBP1表达升高可导致Luminal A亚型更短的无转移生存期(Distant metastasis⁃free survival,DMFS)和无病生存期(Disease⁃free survival,DFS);(3)在雌激素受体阳性(ER+)、孕酮受体阳性(PR+)亚型、仅接受辅助化疗、仅接受辅助化疗的ER(+)与接受包括或排除内分泌治疗乳腺癌患者中,SHCBP1表达升高则无复发生存率(Relapse⁃free survival,RFS)显著缩短;(4)SHCBP1和CDC45 mRNA表达水平之间呈正相关,并可能与KIF23等10种蛋白相互作用。结论:SHCBP1是一种很有前景的乳腺癌预后指标和潜在的治疗靶点。

胶质瘤组织中SHCBP1 mRNA表达水平及临床意义

目的探讨SHCBP1在胶质瘤组织中的表达水平及临床价值。方法比较TCGA数据库中胶质瘤及正常组织中SHCBP1mRNA表达水平的差异。K-M曲线分析胶质瘤SHCBP1mRNA高表达及低表达组中位生存时间的差异,Cox回归分析胶质瘤患者预后的危险因素,分析SHCBP1与免疫细胞浸润程度的相关性。胶质瘤细胞株U87根据SHCBP1是否沉默分为阴性对照组、空白组和沉默组,比较3组细胞增殖、侵袭能力的变化。结果与正常组织相比,胶质瘤组织中SHCBPImRNA表达水平升高(P<0.05)。与胶质瘤SHCBP1mRNA低表达组相比,SHCBP1mRNA高表达组中位生存时间缩短(P<0.001)。年龄、WHO分级、IDH状态、1p/19q状态、组织学类型、SHCBP1表达均是影响胶质瘤患者预后的独立危险因素(P<0.05)。胶质瘤中SHCBP1与Th2细胞、巨噬细胞成正相关性(r值分别为0.845、0.414,P<0.001),与pDC细胞成负相关性(r=-0.363,P<0.001)。与空白组和阴性对照组相比,沉默组SHCBP1蛋白和mRNA表达水平降低(P<0.05)。结论SHCBP1在胶质瘤中呈高表达状态,SHCBP1可能在一定程度上参与了胶质瘤的恶性生物学行为。

SHCBP1在非小细胞肺癌发生发展中的作用

目的:探讨纺锤体相关蛋白1(SHCBP1)在非小细胞肺癌(NSCLC)发生发展中的作用。方法:选取2018年1月到2020年3月在赣南医学院第一附属医院治疗的NSCLC患者62例,通过RT-PCR、Werstern blotting和免疫组化法检测SHCBP1基因在NSCLC中的表达并检测其蛋白的表达与定位;利用试剂盒构建SHCBP1质粒并合成出具有特异性的siRNA及shRNA,将之转染至NSCLC细胞株,利用RT-PCR和Western blotting对mRNA及其蛋白表达量进行检测,通过CCK-8实验以及克隆形成检测SHCBP1对NSCLC增殖的影响;利用划痕实验检测过表达及SHCBP1对NSCLC细胞迁移能力的影响。结果:在所检测的样本中,NSCLC组织中SHCBP1的表达相比较非癌组织更高(P<0.01);SHCBP1在NSCLC组织中主要表达于细胞的细胞质中。过表达研究发现SHCBP1能对NSCLC的增殖及迁移起到促进作用,对SHCBP1进行干扰能够抑制增殖和迁移。结论:SHCBP1在NSCLC中能够促进细胞增殖和迁移,对其发生过程有促进作用。

SHC SH2域结合蛋白1对肝细胞癌细胞恶性生物学行为的影响及其作用机制

目的:探究SHC SH2域结合蛋白1(SHCBP1)通过与驱动蛋白家族成员18A(KIF18A)相互作用对肝细胞癌(HCC)细胞增殖、凋亡、侵袭、迁移及干性特征的调控作用。方法:ENCORI数据库分析SHCBP1、KIF18A在HCC组织中的表达以及与HCC患者总体生存率之间的相关性以及SHCBP1与KIF18A表达在HCC组织中的相关性。分析SHCBP1、KIF18A与HCC患者临床病理特征间的关系;STRING数据库预测SHCBP1与KIF18A间潜在的结合关系。体外培养人正常肝细胞系HHL-5、HCC细胞(Huh-7、SNU-449、Hep3B),实时荧光定量PCR(RT-qPCR)、蛋白质印迹法(Western blot)检测SHCBP1、KIF18A表达水平;CCK-8检测细胞活力;TUNEL、划痕和Transwell实验分别评估细胞凋亡、迁移和侵袭;体外成球实验检测细胞成球能力;Western blot分析凋亡、转移相关蛋白及干性标志物表达水平。结果:SHCBP1、KIF18A表达均与HCC患者肿瘤分化程度、脉管侵犯及远处转移之间具有显著相关性(均P<0.05);SHCBP1和KIF18A在HCC组织和细胞中高表达(P<0.05),并与预后不良相关。敲低SHCBP1可抑制细胞增殖、迁移、侵袭和干性并促进细胞凋亡(均P<0.01)。此外,SHCBP1与KIF18A相互作用,KIF18A过表达可逆转SHCBP1干扰对HCC细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭及干性的作用(均P<0.01)。结论:SHCBP1可通过与KIF18A相互作用进而促进HCC细胞恶性生物学行为。

生物信息学和实验验证探究千层纸素A抗宫颈癌的效应及其作用机制

目的探讨千层纸素A抑制宫颈癌的作用及潜在机制。方法在GEO和TCGA数据集中分析SHC SH2结构域结合蛋白1(SHCBP1)在宫颈癌患者与健康人之间的表达的差异;通过MTT实验验证千层纸素A对HeLa细胞的抑制作用。采用Western blotting实验对千层纸素A与SHCBP1之间关系进行研究,运用分子模拟对接评估千层纸素A与SHCBP1蛋白的对接效果;Linkedomics分析宫颈癌患者中SHCBP1的共表达基因;基因本体(GO)和京都基因组百科全书(KEGG)分析相关共表达基因的潜在机制;CIBERSORT法分析SHCBP1与宫颈癌免疫细胞浸润的相关性;TISIDB数据库分析SHCBP1与免疫检查点的关系。结果GEO数据库及TCGA数据库的分析结果得出,SHCBP1在宫颈癌患者中显著高表达;MTT和Westernblotting分析结果显示,千层纸素A在10μmol/L即对He La细胞增殖和SHCBP1的表达具有显著的抑制效果(P<0.05)。分子对接结果显示,千层纸素A与SHCBP1具有较好的结合势能;TISIDB数据库的研究及CIBERSORT法对GEO数据集的分析结果得出,SHCBP1参与了宫颈癌细胞的免疫浸润;SHCBP1及其共表达基因主要富集于炎症相关途径中。结论千层纸素A通过抑制SHCBP1介导的免疫浸润来抑制宫颈癌的生长,这可能在宫颈癌的治疗中有重要意义。