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SHMT2通过上调Akt1促进人皮肤黑色素瘤细胞的迁移和侵袭
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作者 夏艳 曹远均 +1 位作者 夏苗 张妮 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第13期2328-2334,共7页
目的:研究丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)通过上调Akt1促进人皮肤黑色素瘤细胞迁移和侵袭的分子机制。方法:通过嘌呤霉素压力筛选获取稳定表达SHMT2蛋白的A-375和WM35细胞系;通过Western Blotting和细胞免疫化学检测SHMT2蛋白在A-375和WM3... 目的:研究丝氨酸羟甲基转移酶2(SHMT2)通过上调Akt1促进人皮肤黑色素瘤细胞迁移和侵袭的分子机制。方法:通过嘌呤霉素压力筛选获取稳定表达SHMT2蛋白的A-375和WM35细胞系;通过Western Blotting和细胞免疫化学检测SHMT2蛋白在A-375和WM35细胞系中的稳定表达;通过细胞划痕、Transwell小室实验检测SHMT2对A-375和WM35细胞体外划痕愈合、迁移和侵袭能力的影响;通过GEPIA在线数据库分析SHMT2与Akt1及上皮-间充质转换(EMT)相关因子Snai1、Snai2、ZEB2和vimentin在人皮肤黑色素瘤中表达的相关性;通过RT-PCR、Western Blotting检测Akt1、p-Akt1、Snai1、Snai2、ZEB2和vimentin在SHMT2稳定表达细胞系中的表达情况。结果:成功构建SHMT2稳定表达的A-375和WM35细胞系;过表达SHMT2可以促进A-375和WM35细胞的体外划痕愈合、迁移和侵袭;GEPIA在线数据库结果显示在人皮肤黑色素瘤中SHMT2表达与Akt1、Snai1、Snai2、ZEB2和vimentin表达呈正相关;过表达SHMT2可以上调Akt1和p-Akt1蛋白在人皮肤黑色素瘤细胞中的表达。结论:SHMT2通过上调Akt1表达促进A-375和WM35细胞的体外迁移和侵袭。 展开更多
关键词 shmt2 AKT1 人皮肤黑色素瘤 迁移 侵袭
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靶向SHMT2上调ESR1表达增强他莫昔芬的抗乳腺癌作用
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作者 王璐伟 秘先霞 +4 位作者 孔浩然 莫菲 王颖洁 胡金霞 秦樾 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第20期3834-3840,共7页
目的:研究乳腺癌组织中SHMT2与ESR1表达的相关性,及靶向SHMT2对他莫昔芬治疗乳腺癌效果的影响。方法:生物信息学方法分析SHMT2在乳腺癌细胞中的表达情况并应用免疫组化进行验证,分析SHMT2与ESR1表达的相关性和临床意义;选择ESR1表达阳... 目的:研究乳腺癌组织中SHMT2与ESR1表达的相关性,及靶向SHMT2对他莫昔芬治疗乳腺癌效果的影响。方法:生物信息学方法分析SHMT2在乳腺癌细胞中的表达情况并应用免疫组化进行验证,分析SHMT2与ESR1表达的相关性和临床意义;选择ESR1表达阳性细胞株MCF-7和T47D为细胞模型,应用RNAi技术敲低SHMT2或小分子化合物SHIN2抑制SHMT2活性后,qRT-PCR和Western blot检测ESR1的表达情况;平板克隆形成实验检测siRNA敲低、应用他莫昔芬处理或者siRNA与他莫昔芬联用对乳腺癌细胞增殖的影响;应用Transwell细胞迁移实验检测SHMT2靶向抑制剂SHIN2、他莫昔芬、SHIN2与他莫昔芬联用对细胞迁移的影响。结果:生物信息学分析发现SHMT2在乳腺癌组织中高表达,且在ER阳性乳腺癌中其表达增高与患者预后不良相关;敲低或抑制SHMT2活性后,ESR1表达上调,使用他莫昔芬时联合应用siRNA或SHIN2对乳腺癌细胞增殖和迁移具有更强的抑制作用。结论:在乳腺癌组织中SHMT2与ESR1的表达负相关,靶向或抑制其活性可使ESR1表达上调,并增强他莫昔芬的抗乳腺癌作用。 展开更多
关键词 乳腺癌 shmt2 ESR1 他莫昔芬 增殖 迁移
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SHMT2通过结合并上调HAX1促进乳腺癌细胞的侵袭和迁移
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作者 陈前智 沈娜 +1 位作者 张宁 陈嫣 《肿瘤防治研究》 CAS 2023年第9期860-865,共6页
目的探讨SHMT2调控乳腺癌细胞侵袭和迁移的分子机制。方法生物信息分析验证SHMT2在乳腺癌组织中的作用,Transwell小室法检测乳腺癌细胞侵袭和迁移能力的变化,免疫共沉淀法、敲低质粒转染、蛋白印迹实验确定蛋白调控关系。结果生物信息... 目的探讨SHMT2调控乳腺癌细胞侵袭和迁移的分子机制。方法生物信息分析验证SHMT2在乳腺癌组织中的作用,Transwell小室法检测乳腺癌细胞侵袭和迁移能力的变化,免疫共沉淀法、敲低质粒转染、蛋白印迹实验确定蛋白调控关系。结果生物信息学分析显示,在浸润性乳腺癌组织中SHMT2表达水平显著高于癌旁正常组织(P<0.001),SHMT2高表达组的5年疾病特异性生存率和总生存率均显著低于SHMT2低表达组(均P<0.001)。Transwell小室法检测发现敲低SHMT2可显著降低MCF7细胞的侵袭(t=5.375,P=0.0058)和迁移能力(t=6.274,P=0.0033)。蛋白印迹实验发现,SHMT2能与HAX1相互结合,而敲低SHMT2可降低HAX1的蛋白水平。Transwell小室实验发现,敲低SHMT2对MCF7细胞迁移能力的抑制作用可被高表达HAX1逆转(t=6.274,P=0.0033;t=8.041,P=0.0013),而SHMT2抑制剂(SHIN1,10 nmol/L)可显著抑制SHMT2高表达对MCF7细胞迁移能力的促进作用(t=10.16,P=0.0005;t=8.741,P=0.0009)。结论SHMT2与乳腺癌不良预后密切相关,是乳腺癌细胞侵袭转移的关键因子,其作用机制可能是SHMT2通过结合并上调HAX1来增加乳腺癌细胞侵袭和迁移能力,SHMT2抑制剂对乳腺癌转移的治疗潜力,为其临床治疗提供了潜在的干预靶点。 展开更多
关键词 乳腺癌 shmt2 shmt2抑制剂 HAX1 侵袭 迁移
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SHMT2结合并上调SQSTM1促进结肠癌细胞增殖 被引量:2
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作者 陈前智 沈娜 李雪芹 《医药导报》 CAS 北大核心 2023年第6期814-818,共5页
目的探索SHMT2调控结肠癌细胞增殖的分子机制。方法通过免疫组化染色及生物信息分析来验证SHMT2在结肠癌组织中的表达和作用,通过细胞克隆形成实验检测SHMT2对结肠癌细胞增殖能力的影响,利用免疫共沉淀法、质粒转染、蛋白印迹实验等验证... 目的探索SHMT2调控结肠癌细胞增殖的分子机制。方法通过免疫组化染色及生物信息分析来验证SHMT2在结肠癌组织中的表达和作用,通过细胞克隆形成实验检测SHMT2对结肠癌细胞增殖能力的影响,利用免疫共沉淀法、质粒转染、蛋白印迹实验等验证SHMT2在结肠癌中的作用机制。结果免疫组化染色揭示SHMT2蛋白在结肠癌肿瘤组织中显著高表达,通过生信分析发现SHMT2 mRNA水平与结肠癌的不良预后相关,在细胞实验中发现SHMT2低表达或者SHMT2抑制剂可显著抑制结肠癌细胞增殖,其作用机制可能是SHMT2通过与SQSTM1结合并上调其蛋白水平来促进结肠癌细胞增殖。结论该研究发现SHMT2-SQSTM1信号轴对结肠癌细胞增殖的关键调控作用,为结肠癌相关分子机制研究提供了新的线索和方向。 展开更多
关键词 结肠癌 丝氨酸羟甲基转移酶2(shmt2) shmt2抑制剂 SQSTM1 增殖
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牡丹SHMT基因的鉴定与生物信息学分析
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作者 周广灿 刘夏婷 +1 位作者 王博 杜晶晶 《菏泽学院学报》 2023年第5期106-114,共9页
丝氨酸羟甲基转移酶(Serine hydroxymethyltransferase,SHMT)是一种磷酸吡哆醛(PLP)依赖酶,SHMT基因在为植物提供一碳单位和抗病虫害等方面发挥着重要作用.研究利用生物信息学方法从牡丹基因组数据库中鉴定得到33条SHMT基因.这些基因所... 丝氨酸羟甲基转移酶(Serine hydroxymethyltransferase,SHMT)是一种磷酸吡哆醛(PLP)依赖酶,SHMT基因在为植物提供一碳单位和抗病虫害等方面发挥着重要作用.研究利用生物信息学方法从牡丹基因组数据库中鉴定得到33条SHMT基因.这些基因所编码的蛋白质含有69~603个不等数量的氨基酸,分子量大小为7.52~66.90 kD,理论等电点处于4.90~10.45之间,近2/3的基因都分布在第4条染色体上.启动子顺式作用原件分析显示,牡丹SHMT启动子中含有大量与植物光反应、应激反应等有关联的顺式作用原件.该研究结果可为牡丹SHMT基因功能的进一步研究奠定基础. 展开更多
关键词 牡丹 shmt基因 鉴定 演化特征
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杨树SHMT基因家族分析及PtrSHMT9突变体创制 被引量:2
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作者 李冰 程玉祥 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2020年第6期906-912,共7页
丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)在植物细胞一碳代谢途径上起着重要作用。我们识别毛果杨PtrSHMT家族有9个基因成员,eFP数据显示7个PtrSHMTs基因在多个组织内有转录表达,其中PtrSHMT9在木质部表达水平最高。进一步定量PCR和Aspwood检测显示,Pt... 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)在植物细胞一碳代谢途径上起着重要作用。我们识别毛果杨PtrSHMT家族有9个基因成员,eFP数据显示7个PtrSHMTs基因在多个组织内有转录表达,其中PtrSHMT9在木质部表达水平最高。进一步定量PCR和Aspwood检测显示,PtrSHMT9表达量在茎木质组织次生壁加厚阶段呈现高水平,这表明它可能参与杨树木材形成。用Cas9/gRNA基因编辑技术,制备PtrSHMT9被编辑产生的突变体,获得4个不同株系ptrshmt9敲除突变体。这些研究结果为深入探究树木SHMT及PtrSHMT9功能,提供了基础信息和遗传材料。 展开更多
关键词 毛果杨 shmt ptrshmt9突变体 Cas9/gRNA
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野生大豆抗胞囊线虫基因SHMT的序列多样性 被引量:1
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作者 袁翠平 赵洪锟 +3 位作者 王玉民 刘晓冬 齐广勋 董英山 《中国油料作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第6期755-760,共6页
大豆丝氨酸羟基转移酶(serine hydroxymethyltransferase)基因(SHMT)是Rhg4位点的抗胞囊线虫基因。本研究根据基因序列设计PCR引物对92份野生大豆进行了扩增,并对扩增产物测序,研究了其遗传多样性及其与大豆对胞囊线虫抗性的关系,旨在... 大豆丝氨酸羟基转移酶(serine hydroxymethyltransferase)基因(SHMT)是Rhg4位点的抗胞囊线虫基因。本研究根据基因序列设计PCR引物对92份野生大豆进行了扩增,并对扩增产物测序,研究了其遗传多样性及其与大豆对胞囊线虫抗性的关系,旨在为野生大豆资源的合理利用提供参考。在供试的92份野生大豆SHMT序列(2 430bp)中,共发现了13个SNP位点(7个转换,6个颠换)和4个Indel(均发生在非编码区),其中11个为简约信息位点;SHMT序列多样性为π=0.000 61和θ=0.001 06;多态性位点形成16个单倍型,其中9个单倍型的分布频率>2%,单倍型多样性为0.855;Tajima’s D、Fu and Li’s D和Z检验发现野生大豆SHMT不存在选择压力;卡方测验表明野生大豆SHMT与大豆对胞囊线虫的抗性没有直接关联;采用UPGMA法构建的SHMT分子进化树表明,供试92份野生大豆被聚类在6个类群,并表现出种质间的遗传关系与其生态区有一定的联系。 展开更多
关键词 野生大豆 大豆胞囊线虫 shmt 序列多样性
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丙酮醛诱导细胞凋亡相关基因SHMT2L的生物信息学分析
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作者 曾军英 刘学伟 +2 位作者 张杰 孙志洪 谭支良 《生命科学研究》 CAS CSCD 2008年第2期131-135,共5页
基因芯片是一种高通量地同时研究多个基因表达的有力工具.在用基因芯片技术检测丙酮醛诱导人牙周膜成纤维细胞凋亡的基因表达研究中,发现一个新基因SHMT2L,其表达为显著下调,并推测该基因与细胞凋亡密切相关.利用生物信息学方法对SHMT2... 基因芯片是一种高通量地同时研究多个基因表达的有力工具.在用基因芯片技术检测丙酮醛诱导人牙周膜成纤维细胞凋亡的基因表达研究中,发现一个新基因SHMT2L,其表达为显著下调,并推测该基因与细胞凋亡密切相关.利用生物信息学方法对SHMT2L基因及其蛋白产物进行各种分析,结果发现SHMT2L基因与线粒体丝氨酸羟甲基转移酶具有较高的相似性.SHMT2L在细胞中低表达与丙酮醛造成DNA损伤所引发的细胞凋亡相关. 展开更多
关键词 丙酮醛 基因芯片 shmt2L 生物信息学
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SHMT1基因启动子的rs638416位点与先天性心脏病的相关性 被引量:2
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作者 姜钰超 匡乐乐 +2 位作者 王红艳 段文元 蔡春泉 《复旦学报(医学版)》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期429-434,共6页
目的 通过研究丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxy methyl transferase,SHMT1)基因启动子区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)来探讨该基因与先天性心脏病 (congenital heart disease,CHD)的相关性。方法 ... 目的 通过研究丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxy methyl transferase,SHMT1)基因启动子区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)来探讨该基因与先天性心脏病 (congenital heart disease,CHD)的相关性。方法 选取来自山东省的201例CHD患儿(病例组)和192例正常儿童(对照组),采用Sanger测序法对rs638416和rs117940726两个位点的基因分型进行病例-对照研究,进一步用双荧光素酶报告基因分析其是否为功能性SNP。结果 两个SNP位点的基因型分布在病例组和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡;单位点分析显示rs638416位点G等位基因在病例组中分布频率显著高于对照组 (P=0.009)。经非条件Logistic回归分析确定,Log-additive模型最适用于分析rs638416,且该模型下统计学差异最显著 (OR=1.49,95%CI:1.11- 2.01,P=0.007 4);双荧光素酶报告基因分析显示带有G等位基因的启动子序列转录效率较带有C等位基因的启动子序列低36% (P=0.013)。结论 rs638416位点能影响SHMT1转录效率,并与心脏发育异常相关,提示rs638416位点G等位基因是山东人群CHD发生的遗传风险因子。 展开更多
关键词 先天性心脏病 shmt1 胸腺嘧啶合成 叶酸
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植物SHMT基因家族研究进展
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作者 倪弦之 柏浩东 +4 位作者 韩进财 罗丁峰 李祖任 胡一鸿 金晨钟 《湖南农业科学》 2021年第1期102-106,共5页
丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞代谢和光呼吸作用的关键酶,对丝氨酸和甘氨酸反应起着催化作用。SHMT基因家族是存在于胞质和线粒体中结构和功能上非常相似的编码SHMT蛋白的一类基因。对SHMT基因在植物体中的分类及表达、SHMT基因... 丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)是植物细胞代谢和光呼吸作用的关键酶,对丝氨酸和甘氨酸反应起着催化作用。SHMT基因家族是存在于胞质和线粒体中结构和功能上非常相似的编码SHMT蛋白的一类基因。对SHMT基因在植物体中的分类及表达、SHMT基因的克隆、SHMT基因逆境表达机理及其在植物保护领域中的应用等研究进展进行了综述,旨在为植物SHMT基因家族的功能及其相关应用研究提供参考。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶(shmt) 基因克隆 逆境表达 植物保护 综述
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SHMTI C1420T polymorphism contributes to the risk of non-Hodgkin lymphoma: evidence from 7309 patients
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《Chinese Journal of Cancer》 SCIE CAS CSCD 2015年第12期573-582,共10页
Background Serine hydroxymethyltransferase 1 (SHMT1) is a key enzyme in the folate metabolic pathway thatplays an important role in biosynthesis by providing one carbon unit. SHMT1 C1420T may lead to the abnormalbio... Background Serine hydroxymethyltransferase 1 (SHMT1) is a key enzyme in the folate metabolic pathway thatplays an important role in biosynthesis by providing one carbon unit. SHMT1 C1420T may lead to the abnormalbiosynthesis involved in DNA synthesis and methylation, and it may eventually increase cancer susceptibility. Manyepidemiologic studies have explored the association between C1420T polymorphism and the risk of non-Hodgkinlymphoma (NHL), but the results have been contradictory.Therefore, we performed this meta-analysis to evaluate therelationship.Methods: The meta-analyses were conducted to evaluate the effect of SHMT1 C1420T polymorphism on NHL risk.Odds ratios (ORs) and 95% confidence intervals (CIs) were calculated to measure the strength of the association.Results: Eight studies encompassing 3232 cases and 4077 controls were included. A statistically significant associationwas found between SHMT1 C1420T polymorphism and NHL risk under the allelic comparison (T vs. C: OR = 1.09,95% Cl 1.01-1.17); a borderline association was found between SHMT1 C1420T polymorphism and NHL risk under thehomozygote model (TT vs. CC: OR = 1.18,95% Cl 1.00-1.39) and the dominant model (CT+TT vs. CC: OR = 1.10,95%Ci 1.00-1.21).Conclusion: SHMT1 C1420T polymorphism may be associated with NHL risk, which needs to be validated in large,prospective studies. 展开更多
关键词 SERINE hydroxymethyltransferase 1 (shmt1) Polymorphism NON-HODGKIN lymphoma META-ANALYSIS
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甲醇利用菌SDM11中glyA基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达 被引量:1
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作者 孔庆胜 张向阳 +2 位作者 韩晓琳 林强 董全林 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第5期141-144,157,共5页
对甲醇降解菌Methylobacterium.sp SDM11中的glyA基因进行克隆及特性研究,以获得更多的丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxymethyltransferase,SHMT)资源。根据GenBank中已报道的Methylobacterium extorquensAM1中的glyA基因序列(登录号:... 对甲醇降解菌Methylobacterium.sp SDM11中的glyA基因进行克隆及特性研究,以获得更多的丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxymethyltransferase,SHMT)资源。根据GenBank中已报道的Methylobacterium extorquensAM1中的glyA基因序列(登录号:L33463)设计引物,以SDM11的基因组DNA为模板,PCR扩增glyA基因。利用pETblue-2载体将该基因在大肠杆菌BL21(DE3)中得到表达。PCR扩增到一个1.40 kb大小的DNA片段,经过blast软件比对分析,发现该片段与已报道的Methylobacterium extorquensAM1的glyA基因的序列相似性为95%,氨基酸序列的相似性为98%。该基因编码468个氨基酸,预测的分子量大小为52.2 kD,等电点为7.02,发现纯化后的目标蛋白具有SHMT酶活性,并初步测定了酶活力。 展开更多
关键词 SDM11 glyA基因 克隆 表达 shmt
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辅酶四氢叶酸的合成及其活力测定 被引量:4
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作者 孙进 吴梧桐 陈志宏 《药物生物技术》 CAS CSCD 2000年第1期38-41,共4页
在利用基因工程菌表达的丝氨酸羟甲基转移酶 (SHMT)酶法制备L 丝氨酸的过程中 ,SHMT需要四氢叶酸作为辅酶。研究了常压氢化法、加压氢化法、硼氢化物还原法及连二亚硫酸钠还原法等制备四氢叶酸 ,并优化了常压氢化法、硼氢化物还原法的... 在利用基因工程菌表达的丝氨酸羟甲基转移酶 (SHMT)酶法制备L 丝氨酸的过程中 ,SHMT需要四氢叶酸作为辅酶。研究了常压氢化法、加压氢化法、硼氢化物还原法及连二亚硫酸钠还原法等制备四氢叶酸 ,并优化了常压氢化法、硼氢化物还原法的工艺条件。常压氢化法的产品已用来代替进口试剂作为酶促反应的辅酶 ,但硼氢化物还原法成本最低 ,且能合成满足酶促反应要求的产物。四氢叶酸在制备过程和使用中 ,均极易氧化破坏 ,因此需提供严格的抗氧化条件。 展开更多
关键词 合成 叶酸 四氢叶酸 辅酶 L-丝氨酸 shmt
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GlyA基因的克隆及检验 被引量:2
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作者 蔡宇 吴梧桐 史燕东 《药物生物技术》 CAS CSCD 1995年第1期1-4,共4页
用PCR法从大肠杆菌中调出长1.9kb的DNA片断,插入质粒pT77,核酸电泳和DNA测序分析结果证明该片段是GlyA目的基因。
关键词 GLYA 丝氨酸羟甲基转移酶 shmt PCR
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利用Design-Expert软件优化丝氨酸羟甲基转移酶产酶培养基 被引量:24
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作者 左爱连 张伟国 《生物技术》 CAS CSCD 2008年第3期45-49,共5页
利用Design Expert软件中水平设计和响应面分析法对产酶基本培养基主要成分进行了优化,经过逐步回归分析建立了丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)活力对培养基主要成分的二次回归模型,其回归方程的决定系数达到了0.9984。得到的最佳培养基主要... 利用Design Expert软件中水平设计和响应面分析法对产酶基本培养基主要成分进行了优化,经过逐步回归分析建立了丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)活力对培养基主要成分的二次回归模型,其回归方程的决定系数达到了0.9984。得到的最佳培养基主要组成为:葡萄糖29.5g/L、硫酸铵18.1g/L、玉米浆3.79g/L。SHMT活力最高达到113.7U/mL,比优化前(77U/mL)提高了47.7%。优化后的酶液经酶促反应50h,能催化产生10g/L的L-丝氨酸,比优化前(6g/L)提高66.7%。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶 培养基优化 响应面法 酶促反应
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苹果实生树阶段转变过程中丝氨酸羟甲基转移酶的变化 被引量:2
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作者 曾广娟 张新忠 李春敏 《江西农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期254-257,311,共5页
用酶联免疫(ELISA)法和免疫组织化学方法(IHC)检测5年生苹果实生树不同节位的丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)的变化。结果表明,此酶只存在苹果实生树营养生长期的叶片中,而在童期的叶片和生殖生长期的叶片中含量极低或检测不到。SHMT在苹果... 用酶联免疫(ELISA)法和免疫组织化学方法(IHC)检测5年生苹果实生树不同节位的丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)的变化。结果表明,此酶只存在苹果实生树营养生长期的叶片中,而在童期的叶片和生殖生长期的叶片中含量极低或检测不到。SHMT在苹果实生树阶段转变过程中存在差异表达。 展开更多
关键词 苹果 阶段转变 丝氨酸羟甲基转移酶 酶联免疫(ELISA) 免疫组织化学(IHC)
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大肠杆菌丝氨酸羟甲基转移酶基因(glyA)的克隆和表达 被引量:1
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作者 沈天翔 那淑敏 +2 位作者 喻国策 谢家仪 贾盘兴 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1997年第6期423-428,共6页
利用插入失活及营养缺陷型互补法将大肠杆菌K12 13kb的glyA基因克隆到质粒pBR329中。将重组质粒酶切,亚克隆,确定2.6kb PstI-EcoRI亚克隆片段带有完整的glyA基因。共获得12株glyA基因重组菌,对重组质粒进行了酶切鉴定。不同重组菌丝氨... 利用插入失活及营养缺陷型互补法将大肠杆菌K12 13kb的glyA基因克隆到质粒pBR329中。将重组质粒酶切,亚克隆,确定2.6kb PstI-EcoRI亚克隆片段带有完整的glyA基因。共获得12株glyA基因重组菌,对重组质粒进行了酶切鉴定。不同重组菌丝氨酸羟甲基转移酶(SHMT)活性及其酶表达量均不相同。受体菌未检测到丝氨酸的产生。重组菌株JM109(pSM13)、K12(pSM13)、K12(pSM14)和K12(pSM15)SHMT酶表达量分别占全菌可溶性蛋白的15.7%、15.4%、11.8%和9.48%。 展开更多
关键词 大肠杆菌 丝氨酸 羟甲基转移酶 glyA基因 克隆
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甘薯、番茄和拟南芥中丝氨酸羟甲基转移酶基因家族功能研究
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作者 赵玉琪 周志林 +3 位作者 唐君 姚改芳 胡康棣 张华 《合肥工业大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2022年第12期1705-1714,共10页
丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxymethyltransferase,SHMT)普遍存在于植物中,在高等植物的一碳代谢和光呼吸过程中起着重要作用,然而该家族在甘薯中的功能尚不清楚。文章通过同源比对获取甘薯、番茄、拟南芥中21个SHMT基因家族的信息... 丝氨酸羟甲基转移酶(serine hydroxymethyltransferase,SHMT)普遍存在于植物中,在高等植物的一碳代谢和光呼吸过程中起着重要作用,然而该家族在甘薯中的功能尚不清楚。文章通过同源比对获取甘薯、番茄、拟南芥中21个SHMT基因家族的信息,通过系统进化树分析,发现21个SHMT蛋白形成4个分支;利用蛋白motif分析、蛋白结构域分析、基因外显子内含子结构分析、蛋白的二级结构和三级结构预测、蛋白质理化性质分析、核定位序列(nuclear localization sequence,NLS)、亚细胞定位分析预测,发现蛋白高级结构和基因结构在同一分支内更为保守,即同源性越高的蛋白,其结构、性质更为接近。通过对番茄中SHMT基因进行表达量分析,发现SHMT基因可能在番茄种子发育、开花、果实成熟方面发挥作用。另外,通过对拟南芥SHMT(AtSHMT)家族在胁迫条件下的表达水平进行分析,推断多个AtSHMT基因对胁迫尤其是盐胁迫、冷胁迫、热胁迫产生应答,表明SHMT基因家族在胁迫应答中起到调控作用。综上,文章将甘薯、番茄、拟南芥中SHMT基因家族的生物信息学分析及基因表达数据进行了挖掘,对深入研究SHMT基因在甘薯、番茄、拟南芥中的作用具有重要意义。 展开更多
关键词 丝氨酸羟甲基转移酶(shmt) 生物信息学分析 甘薯 拟南芥 番茄
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假单胞菌N-13中丝氨酸羟甲基转移酶的酶学性质研究
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作者 张超 栾兴社 +1 位作者 张春明 薛维纳 《氨基酸和生物资源》 CAS 2011年第1期39-42,共4页
从产L-丝氨酸菌株假单胞菌N-13中纯化了丝氨酸羟甲基转移酶,并对其性质进行了研究。结果表明,丝氨酸羟甲基转移酶酶活力在pH=7.0~9.0间稳定,最适宜pH=8.0;酶的最适温度为35℃,在30~40℃水浴30 min酶活力未见明显下降。磷酸吡哆醛的最... 从产L-丝氨酸菌株假单胞菌N-13中纯化了丝氨酸羟甲基转移酶,并对其性质进行了研究。结果表明,丝氨酸羟甲基转移酶酶活力在pH=7.0~9.0间稳定,最适宜pH=8.0;酶的最适温度为35℃,在30~40℃水浴30 min酶活力未见明显下降。磷酸吡哆醛的最适添加浓度为25μmol·L-1。研究了不同金属离子对酶活力的影响,结果表明,Cu2+和Co2+可分别提高酶活力22%和10%;但Mn2+、Mg2+、Zn2+对酶活力有强烈的抑制作用,Ca2+对酶活力没有影响。L-丝氨酸产量与丝氨酸羟甲基转移酶是相互依存的关系,而且在产量越高的菌株中SHMT的活性越高。 展开更多
关键词 假单胞菌 L-丝氨酸 丝氨酸羟甲基转移酶 酶学性质
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重组丝氨酸羟甲基转移酶活性测定及酶促反应条件的优化研究 被引量:6
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作者 陈志宏 吴梧桐 +1 位作者 项冰 高鹏 《药物生物技术》 CAS CSCD 1998年第2期75-79,共5页
本文采用了高效液相色谱法测定重组丝氨酸羟甲基转移酶活力 ,并利用该法将一系列的反应条件 (温度、p H、辅因子浓度等 )加以优化 ,从而确定了该酶促反应的最佳反应条件。在该反应条件下 ,对底物甘氨酸的转化率可达 78%。
关键词 重组 丝氨酸羟甲基 转移酶 活性测定 优化 HPLC
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