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基于通用荧光标签的microRNA芯片检测平台
1
作者
李丽诗
沈叶
+2 位作者
吴轶轩
邵杰
李炯
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期307-313,共7页
microRNA(miRNA)是一类生物内源性非编码小RNA分子,在细胞的生长、发育、增殖和细胞凋亡中具有重要的调控作用,并且与癌症的发生息息相关.miRNA表达谱是miRNA研究中的一个关键环节,使用芯片技术分析miRNA表达谱通常要求对miRNA样品进行...
microRNA(miRNA)是一类生物内源性非编码小RNA分子,在细胞的生长、发育、增殖和细胞凋亡中具有重要的调控作用,并且与癌症的发生息息相关.miRNA表达谱是miRNA研究中的一个关键环节,使用芯片技术分析miRNA表达谱通常要求对miRNA样品进行耗时耗力的荧光标记,并且常规的芯片技术难以精确识别高度同源的miRNAs分子.为了解决以上问题,本实验室建立了一个被命名为SHUT(Stacking-hybridized Universal Tag)的新型非标记miRNA芯片分析方法.本文通过分别使用两步杂交法、一步杂交法对SHUT平台的miRNAs特异性检测进行优化.研究结果表明,SHUT平台在48℃下杂交18 h,除了let-7b和P-let-7c,let-7c和P-let-7a分别存在超过32.5%和83.3%的假阳性信号之外,其它交叉杂交信号都低于10%,具有较好的特异性.在该杂交条件下,靶标分子let-7d的最低检测浓度为20 fmol/L,并且在20 fmol/L至200 pmol/L之间具有较好的线性关系.
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关键词
microRNA芯片
shut平台
堆积杂交
特异性
灵敏度
下载PDF
职称材料
采用非标记microRNA芯片筛选早产胎盘差异表达microRNA
2
作者
孙健
魏海霞
+1 位作者
汪云
陈瑛
《中国优生与遗传杂志》
2017年第5期8-10,7,共4页
目的应用非标记microRNA芯片筛选在早产胎盘组织中差异表达的miRNA,并分析其相关的靶基因。方法收集早产儿16例为病例组,同期健康足月产儿18例为对照组,取胎盘组织。通过非标记miRNA芯片技术构建早产胎盘组织miRNA表达谱,采用荧光实时定...
目的应用非标记microRNA芯片筛选在早产胎盘组织中差异表达的miRNA,并分析其相关的靶基因。方法收集早产儿16例为病例组,同期健康足月产儿18例为对照组,取胎盘组织。通过非标记miRNA芯片技术构建早产胎盘组织miRNA表达谱,采用荧光实时定量PCR进行验证,并分析差异表达miRNAs的靶基因。结果 miRNA芯片结果显示44种miRNAs在早产胎盘组织和对照组胎盘组织中差异表达,其中下调表达的11种,上调表达的33种,荧光实时定量PCR验证出miR-493-3p显著下调,mi R-4632-5p显著上调,与芯片结果一致。经软件分析,miRNA靶基因有IL16、SH2D2A、CCNG2、PHB、WNT1、CCDC92、GIT1和ST7L等相关靶基因。结论早产胎盘组织中存在差异表达的miRNAs,提示这些差异表达的miRNAs在早产的发生中有重要的调控作用。
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关键词
早产
微小核糖核酸
芯片
shut平台
原文传递
题名
基于通用荧光标签的microRNA芯片检测平台
1
作者
李丽诗
沈叶
吴轶轩
邵杰
李炯
机构
中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所生物医学部
广西师范大学生命科学学院
公安部第三研究所
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014年第3期307-313,共7页
基金
国家自然科学基金(No.61379025
No.31300301
+3 种基金
No.31300817)
江苏省自然科学基金(No.BK2012193
No.BK2011361)
上海市科学技术委员会(No.12231202900)项目~~
文摘
microRNA(miRNA)是一类生物内源性非编码小RNA分子,在细胞的生长、发育、增殖和细胞凋亡中具有重要的调控作用,并且与癌症的发生息息相关.miRNA表达谱是miRNA研究中的一个关键环节,使用芯片技术分析miRNA表达谱通常要求对miRNA样品进行耗时耗力的荧光标记,并且常规的芯片技术难以精确识别高度同源的miRNAs分子.为了解决以上问题,本实验室建立了一个被命名为SHUT(Stacking-hybridized Universal Tag)的新型非标记miRNA芯片分析方法.本文通过分别使用两步杂交法、一步杂交法对SHUT平台的miRNAs特异性检测进行优化.研究结果表明,SHUT平台在48℃下杂交18 h,除了let-7b和P-let-7c,let-7c和P-let-7a分别存在超过32.5%和83.3%的假阳性信号之外,其它交叉杂交信号都低于10%,具有较好的特异性.在该杂交条件下,靶标分子let-7d的最低检测浓度为20 fmol/L,并且在20 fmol/L至200 pmol/L之间具有较好的线性关系.
关键词
microRNA芯片
shut平台
堆积杂交
特异性
灵敏度
Keywords
microRNA microarray
shut
platform
stacking-hybridization
specificity
sensitivity
分类号
Q5 [生物学—生物化学]
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
采用非标记microRNA芯片筛选早产胎盘差异表达microRNA
2
作者
孙健
魏海霞
汪云
陈瑛
机构
南京医科大学附属苏州医院产科
山东省胜利石油管理局胜东社区锦苑卫生院
南京医科大学附属苏州医院新生儿科
出处
《中国优生与遗传杂志》
2017年第5期8-10,7,共4页
基金
江苏省自然科学基金(BK2012600
BK20131151)
文摘
目的应用非标记microRNA芯片筛选在早产胎盘组织中差异表达的miRNA,并分析其相关的靶基因。方法收集早产儿16例为病例组,同期健康足月产儿18例为对照组,取胎盘组织。通过非标记miRNA芯片技术构建早产胎盘组织miRNA表达谱,采用荧光实时定量PCR进行验证,并分析差异表达miRNAs的靶基因。结果 miRNA芯片结果显示44种miRNAs在早产胎盘组织和对照组胎盘组织中差异表达,其中下调表达的11种,上调表达的33种,荧光实时定量PCR验证出miR-493-3p显著下调,mi R-4632-5p显著上调,与芯片结果一致。经软件分析,miRNA靶基因有IL16、SH2D2A、CCNG2、PHB、WNT1、CCDC92、GIT1和ST7L等相关靶基因。结论早产胎盘组织中存在差异表达的miRNAs,提示这些差异表达的miRNAs在早产的发生中有重要的调控作用。
关键词
早产
微小核糖核酸
芯片
shut平台
Keywords
Preterm birth
MiRNA
Microarray
shut
platform
分类号
R440 [医药卫生—诊断学]
R714.21 [医药卫生—妇产科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于通用荧光标签的microRNA芯片检测平台
李丽诗
沈叶
吴轶轩
邵杰
李炯
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2014
0
下载PDF
职称材料
2
采用非标记microRNA芯片筛选早产胎盘差异表达microRNA
孙健
魏海霞
汪云
陈瑛
《中国优生与遗传杂志》
2017
0
原文传递
已选择
0
条
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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