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滇南小耳猪与巴马小型猪SLA-DQA基因多态分析 被引量:15
1
作者 李华 于辉 +4 位作者 蒋岸岸 李学伟 田允波 赵海全 陈云 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期430-435,共6页
对滇南小耳猪和巴马小型猪的SLA-DQA基因的部分内含子1、完整的外显子2和部分内含子2共341bp片段进行了PCR-RFLP酶切分型,结果表明:2品种经EcoRⅠ酶切后BB基因型频率(0.468 8)高于AB型(0.375 0),AA型最低(0.156 3),B为优势基因(0.656 3... 对滇南小耳猪和巴马小型猪的SLA-DQA基因的部分内含子1、完整的外显子2和部分内含子2共341bp片段进行了PCR-RFLP酶切分型,结果表明:2品种经EcoRⅠ酶切后BB基因型频率(0.468 8)高于AB型(0.375 0),AA型最低(0.156 3),B为优势基因(0.656 3),A为劣势基因(0.343 7)。经AluⅠ酶切后,滇南小耳猪MM基因型频率(0.500 0)高于MN型(0.321 4)和NN型(0.178 6);而巴马猪则以MN基因型频率(0.485 3)高于MM型(0.338 2)和NN型(0.176 5);2个品种中M等位基因(0.604 2)频率高于N等位基因(0.395 8)。经分析表明,2猪种在两酶切位点上各分型已达Hardy-Weinberg平衡。巴马小型猪和滇南小耳猪中分别存在9种和7种PCR-RFLP组合基因型,其中BBMN为优势组合基因型,AAMN为劣势组合基因型;AAMM组合基因型在2品种间差异显著(P<0.05)。遗传多态参数分析表明:SLA-DQA基因外显子2的两酶切位点在2猪种间均表现为中度多态,AluⅠ的基因多样性略高于EcoRⅠ,巴马小型猪杂合性略高于滇南小耳猪,2品种间遗传距离为0.000 4。 展开更多
关键词 小型猪 sla-dqa基因 PCR-RFLP 基因多态
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东北民猪SLA-DQA基因的PCR-RFLP多态性分析 被引量:7
2
作者 张冬杰 杨国伟 +2 位作者 汪晓鸿 刘琪 刘娣 《吉林农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期421-424,共4页
采用克隆测序和PCR-RFLP的方法对SLA-DQA基因的整个编码区进行了扫描和多态性分析。结果表明该基因的第2外显子是整个基因的高变区,突变率达到5.6%,其中80%为有效突变,但没有发现新的等位基因;PCR-RFLP结果表明外显子2用限制酶EcoR I酶... 采用克隆测序和PCR-RFLP的方法对SLA-DQA基因的整个编码区进行了扫描和多态性分析。结果表明该基因的第2外显子是整个基因的高变区,突变率达到5.6%,其中80%为有效突变,但没有发现新的等位基因;PCR-RFLP结果表明外显子2用限制酶EcoR I酶切可获得3种基因型:254 bp(AA)、254 bp/88 bp/ 166 bp(AB)、88 bp/166 bp(BB),用限制酶PvuⅡ酶切可获得3种基因型:254 bp(AA)、254 bp/129 bp/125 bp (AB)、129 bp/125 bp(BB),外显子3用限制酶FbaⅠ酶切可获得3种基因型:282 bp(AA)、282 bp/130 bp/152 bp (AB)、130 bp/152 bp(BB),外显子4用限制酶Hin1Ⅰ酶切可获得3种基因型:184 bp(AA)、184 bp/83 bp/101 bp (AB)、83 bp/101 bp(BB);Hardy-Weinberg平衡分析表明民猪在EcoRⅠ位点处于平衡状态(P<0.05),而在PvuⅡ位点处于不平衡状态(P>0.05),FbaⅠ和Hin 1Ⅰ位点处于极不平衡状态(P>0.01)。 展开更多
关键词 民猪 sla-dqa 克隆 PCR-RFLP
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苏太猪SLA-DQA基因多态性及其与生产性能的关联分析 被引量:9
3
作者 吴圣龙 鞠慧萍 +5 位作者 包文斌 李碧春 陈国宏 杨建生 黄雪根 华金弟 《中国畜牧兽医》 CAS 2007年第7期38-40,共3页
本研究采用PCR-RFLP方法对苏太猪SLA-DQA基因多态性进行分析,结果表明,苏太猪SLA-DQA基因开放阅读框第722个碱基存在1个A→G突变,从而导致了氨基酸Gly到Arg的转变,并产生了TaqⅠ酶切位点。当扩增产物被限制性内切酶TaqⅠ消化后,检测到AA... 本研究采用PCR-RFLP方法对苏太猪SLA-DQA基因多态性进行分析,结果表明,苏太猪SLA-DQA基因开放阅读框第722个碱基存在1个A→G突变,从而导致了氨基酸Gly到Arg的转变,并产生了TaqⅠ酶切位点。当扩增产物被限制性内切酶TaqⅠ消化后,检测到AA和AG基因型。分析这2种基因型与苏太猪生产性能间的相关性,结果表明:SLA-DQA基因与生产性能不存在相关性。 展开更多
关键词 sla-dqa基因 生产性能
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SLA-DQA基因在F18大肠杆菌抗性和敏感性断奶仔猪间的差异表达分析 被引量:3
4
作者 訾臣 刘璐 +6 位作者 苏先敏 杜子栋 黄雪根 杨建生 孙寿永 吴圣龙 包文斌 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第4期516-520,共5页
运用荧光定量PCR方法分析SLA-DQA基因在苏太猪F18大肠杆菌病抗性和敏感性资源群体中各个组织的分布和表达水平,以及在抗性组和敏感组中的表达差异,以探讨SLA-DQA基因在断奶仔猪抗大肠杆菌F18菌株感染中发挥的作用。试验结果显示,SLA-DQ... 运用荧光定量PCR方法分析SLA-DQA基因在苏太猪F18大肠杆菌病抗性和敏感性资源群体中各个组织的分布和表达水平,以及在抗性组和敏感组中的表达差异,以探讨SLA-DQA基因在断奶仔猪抗大肠杆菌F18菌株感染中发挥的作用。试验结果显示,SLA-DQA基因在所检测的11个组织中均有表达,并呈现相似的表达规律,在肺、脾和淋巴结中的表达量较高,在空肠、十二指肠和胸腺中也有中度的表达。SLA-DQA基因在抗性组个体各个组织中的表达量普遍高于敏感性个体,而且在肺、脾、淋巴结、空肠和十二指肠5个组织中,SLA-DQA基因在抗性组个体中的表达量显著高于敏感性个体(P<0.05)。由此可见,当断奶仔猪受到大肠杆菌毒素侵扰后,SLA-DQA基因较高的表达量有利于SLA-II类抗原分子的合成,SLA-DQA基因虽然不是针对由大肠杆菌F18菌株造成的断奶仔猪腹泻和水肿病的直接免疫因子,但是在断奶仔猪受大肠杆菌F18菌株病原菌侵袭后引起的一系列生理变化和应答过程中发挥着重要的作用。 展开更多
关键词 F18大肠杆菌 sla-dqa基因 荧光定量PCR
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甘孜藏猪与合作猪SLA-DQA基因的群体遗传研究 被引量:3
5
作者 李华 蒋岸岸 +3 位作者 于辉 吕学斌 李学伟 赵海全 《高技术通讯》 CAS CSCD 北大核心 2006年第12期1294-1299,共6页
对甘孜藏猪和合作猪SLA-DQA基因的第1和第2内含子部分序列以及完整的第2外显子进行了PCR-RFLP分析,结果表明:经EcoRⅠ酶切后,BB基因型频率(0.5537)分别高于AB型(0.3719)和从型(0.0744);B为优势等位基因(0.7397)。经Alu... 对甘孜藏猪和合作猪SLA-DQA基因的第1和第2内含子部分序列以及完整的第2外显子进行了PCR-RFLP分析,结果表明:经EcoRⅠ酶切后,BB基因型频率(0.5537)分别高于AB型(0.3719)和从型(0.0744);B为优势等位基因(0.7397)。经AluⅠ酶切后,MM基因型频率(0.4380)分别高于MN型(0.3637)和NN型(0.1983);M为优势等位基因(0.6198)。2品种中AluⅠ酶切基因型在合作猪中未达到Hardy-Weinberg平衡,且群体间M、N的基因频率和NN基因型频率差异分别达极显著(P〈0.01)和显著水平(P〈0.05)。共鉴别了9种组合基因型,甘孜藏猪和合作猪分别为6和8种组合基因型,BB-MM、BBNN组合基因型频率在两群体间差异显著(P〈0.05)。两酶切位点均表现为中度多态,AluⅠ位点多态信息含量均高于EcoRⅠ位点,合作猪杂合性高于甘孜藏猪,两群体间的遗传距离为0.0389。 展开更多
关键词 藏猪 sla-dqa PCR-RFLP 遗传参数
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合作猪SLA-DQA基因第4外显子多态性分析 被引量:5
6
作者 张国华 马小军 吕伟丽 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期97-101,共5页
合作猪的MHC-DQA基因的适应性变异,其抗原识别区域(即外显子4)通过PCR扩增和随后的单链构象多态性(SSCP)和序列分析,结果显示在439个合作猪个体,SLA-DQA第4外显子检出4个等位基因和6个基因型(AA、BB、DD、AB、AC和AD),其中A等位基因和A... 合作猪的MHC-DQA基因的适应性变异,其抗原识别区域(即外显子4)通过PCR扩增和随后的单链构象多态性(SSCP)和序列分析,结果显示在439个合作猪个体,SLA-DQA第4外显子检出4个等位基因和6个基因型(AA、BB、DD、AB、AC和AD),其中A等位基因和AA基因型的频率最高,为优势基因和优势基因型。对不同型的PCR-SSCP条带测序分析,发现7个突变位点(5 068 bp T→C,5 109 bp和5 149 bp处缺失C,5 131 bp A→G导致丝氨酸变为甘氨酸,5 135 bp C→T,5 234 bp G→A,5 136 bp处插入A)。遗传学分析发现,合作猪多态信息含量(PIC)为0.240 1,属于低度多态,各种基因型的分布不显著。研究结果证实,合作猪SLA—DQA基因第4外显子为低度多态。 展开更多
关键词 合作猪 sla-dqa基因 多态性 遗传特性
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三品种外种猪SLA-DQA基因的PCR-RFLP分析 被引量:5
7
作者 于辉 李建东 +2 位作者 赵海全 左启祯 李华 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2010年第9期14-17,共4页
对杜洛克、长白猪和大白猪的SLA-DQA第1和第2内含子部分序列以及完整的第2外显子进行群体分析,PCR-RFLP分型。结果表明:三品种猪在EcoRⅠ酶切位点上,基因型频率BB(0.5604)高于AB(0.3626)和AA(0.0769),B等位基因频率较高;在AluⅠ酶切位点... 对杜洛克、长白猪和大白猪的SLA-DQA第1和第2内含子部分序列以及完整的第2外显子进行群体分析,PCR-RFLP分型。结果表明:三品种猪在EcoRⅠ酶切位点上,基因型频率BB(0.5604)高于AB(0.3626)和AA(0.0769),B等位基因频率较高;在AluⅠ酶切位点上,基因型频率NN(0.6154)高于MN(0.3407)和MM(0.0440),N等位基因频率较高。三品种猪仅在EcoRⅠ酶切位点上达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),各组合基因型频率差异均不显著(P>0.05)。在2个酶切位点上,杜洛克的杂合度最高为0.4966,依次为大白猪0.2774和长白猪0.1467。 展开更多
关键词 sla-dqa PCR-RFLP 遗传指标
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烟台黑猪SLA-DQA基因编码区多态性及生物信息学分析 被引量:2
8
作者 黄晓宇 袁军虎 +2 位作者 杨巧丽 马艳萍 滚双宝 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第5期86-93,共8页
采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对烟台黑猪SLA-DQA基因多态性进行研究,预测其蛋白质结构并分析其功能特征。结果显示:SLA-DQA基因exon 2、exon 3、exon 4分别检测出4种等位基因,5种基因型、6种等位基因,8种基因型、4种等位基... 采用PCR-SSCP、克隆测序和生物信息学等方法对烟台黑猪SLA-DQA基因多态性进行研究,预测其蛋白质结构并分析其功能特征。结果显示:SLA-DQA基因exon 2、exon 3、exon 4分别检测出4种等位基因,5种基因型、6种等位基因,8种基因型、4种等位基因,7种基因型,包括3种新等位基因。SLA-DQA基因共编码255个氨基酸,编码区共发现32个核苷酸突变和13个氨基酸变异,exon 2多态性最为丰富。蛋白质结构预测结果显示二级结构中无规则卷曲和延伸链比例最高,α螺旋数量多且集中,β折叠最少。功能预测结果显示,SLA-DQA基因蛋白质在能量代谢、结构蛋白和生长因子等方面几率较高。本研究结果可为SLA-DQA基因在猪抗病分子育种中的应用提供理论依据。 展开更多
关键词 烟台黑猪 sla-dqa基因 编码区 多态性 蛋白质结构
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SLA-DQA基因在大约克、苏太和梅山猪断奶仔猪中组织表达差异分析 被引量:1
9
作者 訾臣 吴正常 +6 位作者 刘璐 杜子栋 黄小国 杨建生 朱国强 吴圣龙 包文斌 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第5期832-837,共6页
本研究旨在通过对SLA-DQA基因在苏太猪大肠杆菌F18菌株抗性群体和大约克猪、梅山猪断奶仔猪各组织间的表达规律及其在3个群体间表达差异的分析,探讨SLA-DQA基因与国内外猪品种断奶仔猪不同水平免疫机能和大肠杆菌抗性间的潜在关系。研... 本研究旨在通过对SLA-DQA基因在苏太猪大肠杆菌F18菌株抗性群体和大约克猪、梅山猪断奶仔猪各组织间的表达规律及其在3个群体间表达差异的分析,探讨SLA-DQA基因与国内外猪品种断奶仔猪不同水平免疫机能和大肠杆菌抗性间的潜在关系。研究结果显示,SLA-DQA基因在3个猪群体所检测的11个组织中均表达,并且表达规律基本一致,在肺脏、脾脏、淋巴结等免疫器官中的表达量较高,在胃、十二指肠、空肠等消化道中表达量居中。SLA-DQA基因在苏太猪所有检测组织中的表达量均最高,大约克中次之,梅山猪中表达量最低。尤其在肺脏、淋巴结和胸腺3个组织中,SLA-DQA基因在苏太猪中的表达量均显著高于其在梅山猪中的表达量;在胸腺组织中,SLA-DQA基因在苏太猪中的表达量显著高于大约克猪。研究结果表明,SA-DQA基因在断奶仔猪受大肠杆菌F18菌株病原菌侵袭后引起的一系列生理变化和应答过程中发挥着重要的抗原递呈和激发机体免疫的作用。 展开更多
关键词 sla-dqa基因 免疫应答 F18大肠杆菌
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西藏小型猪SLA-DQA基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析 被引量:5
10
作者 张建明 曹桂荣 +3 位作者 王玉珏 李金泽 岳敏 顾为望 《实验动物与比较医学》 CAS 2008年第2期90-94,共5页
目的分析西藏小型猪SLA-DQA基因第2外显子不同酶切位点的基因型多态性以及等位基因的多态性,检验这些酶切位点上的基因频率是否达到Hardy-Weinberg平衡态。方法采用EcoRⅠ和AluⅠ两种限制性内切酶对西藏小型猪SLA-DQA目的基因的第1和第... 目的分析西藏小型猪SLA-DQA基因第2外显子不同酶切位点的基因型多态性以及等位基因的多态性,检验这些酶切位点上的基因频率是否达到Hardy-Weinberg平衡态。方法采用EcoRⅠ和AluⅠ两种限制性内切酶对西藏小型猪SLA-DQA目的基因的第1和第2内含子部分序列以及完整的外显子2进行PCR-RFLP分析。结果结果表明,经EcoRⅠ酶切后,以纯合子BB基因型居多,BB、AB、AA基因型频率分布为0.4500、0.3167和0.2333,其中B为优势等位基因(0.6083);经AluⅠ酶切后,MN基因型频率(0.5000)分别高于MM型(0.3000)和NN型(0.2000),其中M为优势等位基因(0.5500)。经卡方适合性检验验证,EcoRⅠ酶切位点χ2值未达到显著水平(P>0.05),而AluⅠ酶切位点χ2值则具有显著差异(P<0.05)。综合双酶切结果,共出现7种组合带型,其中BBMM组合带型出现的频率最高(0.3000),暂没有发现AANN以及BBNN两种组合带型。结论西藏小型猪SLA-DQA基因在AluⅠ酶切位点上没有达到Hardy-Weinberg平衡态,在该位点的遗传选择压力较EcoRⅠ位点大。 展开更多
关键词 西藏小型猪 sla-dqa基因 PCR-RFLP 多态性
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合作猪SLA-DQA基因外显子2多态性分析 被引量:2
11
作者 张国华 马小军 吕伟丽 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期91-95,共5页
旨在研究合作猪DQA基因外显子2多态性,确定其等位基因数、核苷酸多态位点、氨基酸多态位点及各个等位基因之间的遗传关系,分析其进化意义。选用PCR-SSCP对439只合作猪SLA-DQA基因外显子2的多态性进行检测;测序群体内因变异而产生的各等... 旨在研究合作猪DQA基因外显子2多态性,确定其等位基因数、核苷酸多态位点、氨基酸多态位点及各个等位基因之间的遗传关系,分析其进化意义。选用PCR-SSCP对439只合作猪SLA-DQA基因外显子2的多态性进行检测;测序群体内因变异而产生的各等位基因序列,并分析序列数据。结果显示,在合作猪SLA-DQA外显子2中发现了7个新等位基因,共18个核苷酸多态位点,10个氨基酸多态位点。合作猪SLA-DQA外显子2具有较丰富的多态性,群体内可能蕴藏着更加丰富的遗传资源;合作猪SLA-DQA外显子2基因最初可能由一个等位基因突变分化成一大类基因;合作猪SLA-DQA外显子2序列与各个猪种的SLA-DQA外显子2序列具有较高的同源性,预示着这些猪种的SLA-DQA外显子2基因最早可能来源于其分歧之前的共同祖先原始序列;新发现的7个SLA-DQA外显子2等位基因,可能由遗传关系较近的两个等位基因突变产生。 展开更多
关键词 合作猪 sla-dqa外显子2 多态性 PCR—SSCP
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西藏小型猪SLA-DQA基因外显子2的PCR-RFLP多态性分析
12
作者 张建明 王玉珏 +2 位作者 李金泽 岳敏 顾为望 《中国比较医学杂志》 CAS 2008年第10期83-83,共1页
目的分析西藏小型猪SLA-DQA基因第2外显子不同酶切位点的基因型多态性以及等位基因的多态性,检验这些酶切位点上的基因频率是否达到Hardy-Weiberg平衡态。方法采用EcoRⅠ和AluⅠ两种限制性内切酶对西藏小型猪SLA-DQA目的基因的第1和第2... 目的分析西藏小型猪SLA-DQA基因第2外显子不同酶切位点的基因型多态性以及等位基因的多态性,检验这些酶切位点上的基因频率是否达到Hardy-Weiberg平衡态。方法采用EcoRⅠ和AluⅠ两种限制性内切酶对西藏小型猪SLA-DQA目的基因的第1和第2内含子部分序列以及完整的外显子2进行PCR-RFLP分析。结果经EcoRⅠ酶切后,以纯合子BB基因型居多,BB、AB、AA基因型频率分布为45.000%、31.667%和23.333%,其中B为优势等位基因(60.833%);经AluⅠ酶切后,MN基因型频率(50.000%)分别高于MM型(30.000%)和NN型(20.000%),其中M为优势等位基因(55.000%)。经卡方适合性检验验证,EcoRⅠ酶切位点χ2值未达到显著水平(P>0.05),而AluⅠ酶切位点χ2值则具有显著差异(P<0.05=。综合双酶切结果,共出现7种组合带型,其中BBMM组合带型出现的频率最高(30.000%),暂没有发现AANN以及BBNN两种组合带型。结论西藏小型猪SLA-DQA基因在AluⅠ酶切位点上没有达到Hardy-Weiberg平衡态,在该位点的遗传选择压力较EcoRⅠ位点大。 展开更多
关键词 西藏小型猪 sla-dqa基因 PCR-RFLP 多态性
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滇南小耳猪与云南野猪SLA-DQA基因的多态性比较 被引量:1
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作者 刘荣辉 卢丽仪 +2 位作者 陶璇 于辉 李华 《实验动物与比较医学》 CAS 2011年第5期360-364,共5页
目的 分析滇南小耳猪与云南野猪(S.s.silvianus) SLA-DQA基因不同酶切位点的基因型多态性以及等位基因的多态性,检验这些酶切位点上的基因频率是否达到Hardy-Weinberg平衡.方法 采用EcoRⅠ和AluⅠ两种限制性内切酶对滇南小耳猪和云南... 目的 分析滇南小耳猪与云南野猪(S.s.silvianus) SLA-DQA基因不同酶切位点的基因型多态性以及等位基因的多态性,检验这些酶切位点上的基因频率是否达到Hardy-Weinberg平衡.方法 采用EcoRⅠ和AluⅠ两种限制性内切酶对滇南小耳猪和云南野猪SLA-DQA第1和第2内含子部分序列以及完整的外显子2进行PCR-RFLP分析.结果 在EcoRⅠ与AluⅠ酶切位点上均得到3种基因型,在这两个酶切位点上版纳系有9种组合基因型,明光系有8种组合基因型,而野猪仅发现4种组合基因型.经x2适合性检验表明:滇南小耳猪SLA-DQA外显子2在EcoRⅠ与Alu Ⅰ酶切位点上均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.05),但明光系和云南野猪在两酶切位点均达到了平衡状态(P>0.05).结论 滇南小耳猪SLA-DQA在EcoRⅠ与AluⅠ酶切位点均表现为中度多态,云南野猪在EcoRⅠ为中度多态,在Alu Ⅰ酶切位点则为低度多态;滇南小耳猪的HardyWeinberg不平衡主要来自版纳系小耳猪. 展开更多
关键词 滇南小耳猪 云南野猪 sla-dqa RFLP 遗传特性
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猪SLA-DQA一个新SNP的发现及其遗传效应的研究 被引量:22
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作者 彭勇波 李奎 +5 位作者 樊斌 余梅 朱猛进 熊统安 彭中镇 刘榜 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第12期2526-2530,共5页
采用PCR-RFLP方法对新发现的一引起氨基酸改变的SNP位点(读码框第722位碱基)进行了检测,初步探讨了DQA基因作为影响经济性状候选基因的可能性。经在6个中国地方猪种及大白猪中PCR-RFLP检测,发现除小梅山和大白猪外,其它几个猪种均存在... 采用PCR-RFLP方法对新发现的一引起氨基酸改变的SNP位点(读码框第722位碱基)进行了检测,初步探讨了DQA基因作为影响经济性状候选基因的可能性。经在6个中国地方猪种及大白猪中PCR-RFLP检测,发现除小梅山和大白猪外,其它几个猪种均存在多态性,同时对6个地方猪种间的基因型频率的差异进行了χ2检验。在通城猪、长白猪、大白猪及其三元杂种猪长大通和达长通猪中检测了该位点的基因型,并运用GLM进行基因型与生长、胴体性状间关联分析,发现该SNP位点与平均背膘厚、6-7肋间背膘厚存在显著相关(P<0.05),与胸腰椎间背膘厚也接近显著性水平(P=0.06),与内脂率、眼肌高、肌肉失水率亦存在显著相关(P<0.05),但未发现与生长性状间的相关。 展开更多
关键词 SLA—DQA 第四外显 SNP PCR—RFLP 关联分析 多态性
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八眉猪SLA-DQA基因外显子2多态性分析 被引量:3
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作者 寸海霞 谢德琼 +4 位作者 王龙 魏涛 张稳 郭鹏辉 刘丽霞 《中兽医学杂志》 2016年第3期10-13,共4页
本研究以八眉猪为研究对象,采用PCR-SSCP和克隆测序的方法研究了SLA-DQA基因外显子2功能区的分子遗传特征。结果显示,八眉猪SLA-DQA基因外显子2共有7种等位基因(A、B、C、D、E、F、G)和7种基因型(分别是AA、AB、AC、AE、AF、BB、DG),其... 本研究以八眉猪为研究对象,采用PCR-SSCP和克隆测序的方法研究了SLA-DQA基因外显子2功能区的分子遗传特征。结果显示,八眉猪SLA-DQA基因外显子2共有7种等位基因(A、B、C、D、E、F、G)和7种基因型(分别是AA、AB、AC、AE、AF、BB、DG),其中A等位基因和AA基因型占优势,DG基因型为劣势基因型。对不同等位基因进行克隆测序,结果共发现15个氨基酸发生了改变,19个抗原结合位点上共有5个氨基酸发生改变。x2检验结果表明,该基因偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.01)。遗传多态性分析结果表明,八眉猪SLA-DQA基因外显子2,属于中度多态(0.25<PIC<0.5)。研究结果表明,八眉猪SLA-DQA基因第2外显子属于多态基因。 展开更多
关键词 八眉猪 sla-dqa 基因PCR-SSCP 多态性
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Cloning and cDNA Sequence Analysis of SLA-DQA Gene from Hainan Wuzhishan Miniature Pig
16
作者 郑心力 王峰 +2 位作者 魏立民 孙瑞萍 张燕 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2009年第1期17-21,共5页
[ Objective] The study aimed to lay a foundation for studying immune recognition mechanism in xenotransplantation. [ Method] SLA- DQA gene of Hainan Wuzhishan miniature pig was cloned by RT-PCR and sequenced. J-Result... [ Objective] The study aimed to lay a foundation for studying immune recognition mechanism in xenotransplantation. [ Method] SLA- DQA gene of Hainan Wuzhishan miniature pig was cloned by RT-PCR and sequenced. J-Result] The SLA-DQA gene sequence of Wuzhishan minia- ture pig contained 768 nucleotides, among which 1 -765 were the complete open reading frame, encoding 255 amino acids. SLA-DQA cDNA se- quence and its deduced amino acid sequence of Wuzhishan miniature pig were most similar to those of the other miniature pigs in China. When compared with corresponding cDNA sequences and the amino acid sequences in other species, the homology with human was obviously higher than that with mouse. [ Conclusion] As the Chinese pig breed suitable for xenotransplantation, Wuzhishan miniature pig has significant importance to ser- ial studies on immunogenetics characteristics. 展开更多
关键词 sla-dqa gene Major histocompatibility complex XENOTRANSPLANTATION Wuzhishan miniature pig
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海南五指山猪SLA-DQA基因cDNA全长的克隆分析 被引量:7
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作者 郑心力 王峰 +2 位作者 魏立民 孙瑞萍 张燕 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2009年第10期4433-4435,4438,共4页
[目的]为猪异种器官移植的免疫识别机理的研究奠定基础。[方法]采用RT-PCR方法扩增五指山猪DQA基因cDNA,然后进行测序和序列分析。[结果]海南五指山猪SLA-DQA基因序列长度为768个核苷酸,其中1~765为完全阅读框编码255个氨基酸残基。五... [目的]为猪异种器官移植的免疫识别机理的研究奠定基础。[方法]采用RT-PCR方法扩增五指山猪DQA基因cDNA,然后进行测序和序列分析。[结果]海南五指山猪SLA-DQA基因序列长度为768个核苷酸,其中1~765为完全阅读框编码255个氨基酸残基。五指山猪SLA-DQA基因cDNA序列及其推导的氨基酸序列与我国小型猪同源性最高,与人相应基因的同源性明显高于与小鼠的同源性。[结论]将五指山猪作为适合于进行异种器官移植的中国猪种,对免疫遗传学特性系列研究具有重要意义。 展开更多
关键词 sla-dqa 主要组织相容性复合体 异种移植 五指山猪
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撒坝猪及长撒二元杂交猪SLA-DQA基因PCR-RFLP多态性分析 被引量:4
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作者 钱锦花 连林生 《猪业科学》 2008年第6期66-68,共3页
根据SLA-DQA基因cDNA序列和已报道的引物序列,在猪中成功扩增了一个731 bp的片段,该片段包括猪SLA-DQA基因的大部分第2外显子、完整第2内含子和少部分第3外显子。采用限制性内切酶EcoRⅠ对撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQA基因的扩增产物进... 根据SLA-DQA基因cDNA序列和已报道的引物序列,在猪中成功扩增了一个731 bp的片段,该片段包括猪SLA-DQA基因的大部分第2外显子、完整第2内含子和少部分第3外显子。采用限制性内切酶EcoRⅠ对撒坝猪和长撒二元杂猪SLA-DQA基因的扩增产物进行多态性分析,结果2个猪种在酶切后出现2个等位基因,3种基因型:654bp/77bp(AA)、731bp(BB)和731bp/654bp/77bp(AB)。分析发现,A等位基因在群体中占优势,经χ2适合性检验,撒坝猪和长撒二元杂交猪SLA-DQA基因在EcoRⅠ酶切位点处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态。 展开更多
关键词 撒坝猪 长撒二元杂交猪 sla-dqa PCR-RFLP
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不同品种猪SLA-DQA、FUT1和MUC4基因遗传变异初析 被引量:5
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作者 李聪聪 刘思雨 +3 位作者 吴姣 牛晖 李梦云 李婉涛 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2020年第2期55-61,共7页
为了解析地方猪种淮南猪抗逆性强的分子机制,试验采用PCR-RFLP方法对4个猪种(淮南猪、杜洛克猪、大白猪和长白猪共计395头)的猪耳组织白细胞抗原(SLA)-DQA基因、α-1岩藻糖转移酶基因1(FUT1基因)和4型黏蛋白(MUC4)基因进行多态性分析。... 为了解析地方猪种淮南猪抗逆性强的分子机制,试验采用PCR-RFLP方法对4个猪种(淮南猪、杜洛克猪、大白猪和长白猪共计395头)的猪耳组织白细胞抗原(SLA)-DQA基因、α-1岩藻糖转移酶基因1(FUT1基因)和4型黏蛋白(MUC4)基因进行多态性分析。结果表明:4个猪种在SLA-DQA基因座位存在多态性,AA型在4个猪种中基因型频率最高,淮南猪为中等多态,其他3个猪种为低度多态,淮南猪与长白猪、大白猪品种间基因型分布差异极显著(P<0.01),淮南猪与杜洛克猪品种间基因型分布差异不显著(P>0.05);FUT1基因座位也存在多态性,GG基因型在4个猪种中基因型频率最高,淮南猪、大白猪和杜洛克猪都是中等多态,长白猪是低度多态,淮南猪与长白猪品种间基因型分布差异极显著(P<0.01),淮南猪与大白猪、杜洛克猪品种间基因型分布差异不显著(P>0.05);MUC4基因座位同样也存在多态性,AA基因型在淮南猪、长白猪和大白猪中基因型频率最高,AG基因型在杜洛克猪中基因型频率最高,淮南猪和杜洛克猪都是中等多态,大白猪是低度多态,淮南猪与长白猪、杜洛克猪品种间基因型分布差异极显著(P<0.01),淮南猪与大白猪品种间基因型分布差异显著(P<0.05)。说明淮南猪在这3个基因上都有着较高的遗传多样性,更适合用于抗病育种研究的实践中。 展开更多
关键词 淮南猪 sla-dqa基因 FUT1基因 MUC4基因 多态性
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Effects of SLA-DQA Gene on Birth Weight and 30-Day-Old Weight in Piglets 被引量:1
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作者 ZHANG Dong-jie 《Animal Husbandry and Feed Science》 CAS 2010年第2期8-9,共2页
The genetic polymorphism of SLA-DQA gene was investigated by PCR-RFLP. The effects of SLA.DQA gene on birth weight and 30-day-old weight were analyzed in 250 individuals of FI hybrid pig ( Heilongjiang wild boar x Be... The genetic polymorphism of SLA-DQA gene was investigated by PCR-RFLP. The effects of SLA.DQA gene on birth weight and 30-day-old weight were analyzed in 250 individuals of FI hybrid pig ( Heilongjiang wild boar x Beijing Black sow). The analysis revealed four poly- morphic loci in the SLA-DQA gene, but only the Pvu II locus in exon 2 of SLA-DQA gene ( BB genotype) greatly increased the 30-day-old weight of piglets. 展开更多
关键词 sla-dqa gene PIG Birth weight 30-day-old weight PCR-RFLP
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