野猪和17个家猪群体SLA-DRB基因外显子2的多态性分析

采用PCR-RFLP方法对野猪和国内外17个家猪品种SLA-DRB基因第2外显子的多态性进行分析,进一步分析SLA-DRB基因与疾病抗性的关系。结果表明:经限制性内切酶RsaⅠ酶切后,共检测到4个等位基因和10种基因型。在野猪中仅存在BB基因型和B等位基因,而在家猪群体中出现了野猪群体中所没有的9种基因型和3个等位基因。五指山猪、临高猪、荣昌猪和藏猪的多态性较为丰富,且具有全部4个等位基因。A等位基因在大多数家猪群体中为优势等位基因,B等位基因在梅山猪、五指山猪、藏猪、荣昌猪中为优势等位基因;BB基因型仅在五指山猪、临高猪、藏猪、荣昌猪和太湖猪群体中分布,地方猪品种中梅山猪BB基因型和B等位基因的频率最高。野猪及17个家猪群体间SLA-DRB基因第2外显子遗传多态性可能是由生态环境差异及自然和人工选择所致,这些遗传差异性可能与抗病力有关。

藏猪SLA-DRB基因第2外显子PCR-RFLP多态性分析

采用限制性内切酶RsaⅠ对藏猪SLA-DRB基因外显子2进行多态性分析。结果表明:藏猪SLA-DRB基因外显子2在RsaⅠ-RFLP位点上存在7种基因型,以杂合子BC型居多,基因型频率为0.4419,为优势基因型。χ2适合性检验结果表明,藏猪SLA-DRB基因外显子2的RsaⅠ酶切位点的χ2值为10.14,高于显著水平(P<0.05),说明藏猪SLA-DRB基因在RsaⅠ酶切位点上没有达到Hardy-Weinberg平衡状态。

阿坝藏猪蒲江种群SLA-DRB基因片段SNP检测及其与生长发育性状关联分析

猪Sus scrofa domesticus的白细胞抗原复合体(SLA)基因的单核苷酸多态性(SNP)与猪生长发育等性状有关。为了开发藏猪品系选育的遗传标记,本文测定了阿坝藏猪蒲江种群89头个体的SLA-DRB基因部分序列,共鉴定出14个SNP位点。根据位点间的连锁强度分为3个组合(组合1:g. 11470、g. 11945、g. 11997、g. 11387、g. 11369与g. 11829;组合2:g. 11532与g. 11838;组合3:g. 11911与g. 11708)和4个独立多态位点(g. 11468、g. 11440、g. 11478和g. 11944)。将基因型与体质量、体长等14项生长发育性状进行关联性分析,结果表明,组合3的基因型与体高、体长、胸围等11项体尺指标间的相关性均显著(FDR <0. 05),基因型为TT/CG的个体较小,表明SLA-DRB基因可用于藏猪小型化选育的遗传标记。管围和12项管围率(除体质量以外)与SLA-DRB基因多态性的相关性最高,受组合1、组合2和位点g. 11468、g. 11478基因型的极显著影响(FDR <0. 001),其中,基因型为组合1=GGGAAC/GGGAAC、组合2=GT/GT、位点g. 11468=C/C和g. 11478=C/C的个体拥有更大的管围和管围率。管骨骨髓是SLA基因发挥免疫功能的主要场所之一。本研究为基于管围的猪种筛选提供了理论依据和可用的SNP位点,也为藏猪抗病遗传筛选提供了基础数据和参考资料。

杜滇猪和杜藏猪SLA-DQB、SLA-DRB基因第二外显子杂交优势分析

本实验旨在研究杂交后代杜滇猪、杜藏猪SLA-DQB、SLA-DRB基因第二外显子多态性问题,并与双亲(杜洛克猪、迪庆藏猪、滇南小耳猪)进行比较,分析其杂交优势。采用PCR-RFLP方法对杜滇猪、杜藏猪SLA-DQB、SLA-DRB基因第二外显子进行研究。结果表明:杜藏猪和杜滇猪SLA-DQB基因第二外显子经Hae III酶切,分别表现出4个和3个SNP位点、3个等位基因、5种基因型;杜滇猪和杜藏猪出现双亲都没有的AC基因型,迪庆藏猪拥有EE基因型而杜藏猪没有;杜滇猪SLA-DQB基因第二外显子杂合度和多态信息含量均高于双亲,表现出良好的杂交优势。杜藏猪和杜滇猪SLA-DRB基因第二外显子经过Rsa I酶切,分别表现出4个和3个SNP位点、4个和3个等位基因、8种和5种基因型;杜藏猪出现了双亲都没有的AC、BD基因型,杜滇猪出现双亲都没有的BD、DD基因型。杜藏猪、杜滇猪SLA-DRB基因第二外显子杂合度和多态信息含量均高于双亲,表现出良好的杂交优势。

猪SLA-DRB1基因外显子3单核苷酸多态性及其与PRRSV易感性的关联

SLA-DRB1是影响猪体免疫反应、疾病感染和疫苗应答的重要因子。本研究对猪SLA-DRB1基因外显子3序列进行扩增和测序,筛选多态性位点,分析其与PRRSV(猪繁殖与呼吸综合征病毒)易感性的相关性。测序发现SLA-DRB1基因外显子3存在4个单碱基突变(g.17G/A、g.95C/T、g.137G/C和g.232G/C)。针对g.232G/C建立PCR-RFLP方法,检测6个猪种群共227个样本,发现在大白姜曲海杂交猪、姜曲海猪、长白猪、定远猪和杜洛克猪中有GG(0.43,0.80,0.59,0.54,0.83)和GC(0.57,0.20,0.41,0.46,0.17)2种基因型,其他群体均为GG型。不同基因型猪肺泡巨噬细胞中PRRSV拷贝数在接毒后6、12、18、24、36 h差异均不显著(P>0.05),不同基因型猪血液中病毒载量在接毒后4、7、11、14、21、28、35、42 d差异均不显著(P>0.05),不同基因型对猪体质量和日增质量的影响不显著(P>0.05)。提示SLA-DRB1的g.232G/C突变与PRRSV抗性无显著关联。