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人SLC15A3基因及蛋白质的生物信息学分析
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作者 钟璐璐 周峰 +2 位作者 彭佳欣 谭洋 裴刚 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期233-239,共7页
目的:研究SLC15A3调控和功能的完整机制。方法:通过生物信息学软件对人SLC15A3基因启动子元件和蛋白结构、理化和定位特性及其进化关系进行表征。结果:人SLC15A3基因受多种转录因子(YY1、AP-1、c-Fos、c-Jun、Sp1、NF-κB)调控。SLC15A... 目的:研究SLC15A3调控和功能的完整机制。方法:通过生物信息学软件对人SLC15A3基因启动子元件和蛋白结构、理化和定位特性及其进化关系进行表征。结果:人SLC15A3基因受多种转录因子(YY1、AP-1、c-Fos、c-Jun、Sp1、NF-κB)调控。SLC15A3蛋白是由581个氨基酸残基组成的疏水不稳定蛋白,在哺乳动物中氨基酸序列有高保守性,与CD6、TYROBP、CD5、NOD2等蛋白相互作用。结论:本研究生物信息学分析结果有助于深入研究SLC15A3在炎症反应发生发展中的作用机制。 展开更多
关键词 slc15a3 启动子 蛋白 转录因子结合位点 生物信息学
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SLC15A3基因影响HPV阳性宫颈癌预后和免疫浸润的研究 被引量:3
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作者 黄安妮 梅馨予 +1 位作者 王黎明 汪辉 《现代妇产科进展》 北大核心 2023年第6期414-420,共7页
目的:探索溶质载体家族15成员3(SLC15A3)在HPV阳性宫颈癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系,为HPV阳性宫颈癌的诊治提供新靶标。方法:利用TCGA和GEO数据库、BEST网页和R软件分析SLC15A3在宫颈癌中的表达及其对预后的影响,差异基因和G... 目的:探索溶质载体家族15成员3(SLC15A3)在HPV阳性宫颈癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系,为HPV阳性宫颈癌的诊治提供新靶标。方法:利用TCGA和GEO数据库、BEST网页和R软件分析SLC15A3在宫颈癌中的表达及其对预后的影响,差异基因和GO富集分析研究SLC15A3的生物学功能。利用CIBERSORT、xCell和ESTIMATE免疫算法及Spearman相关性分析方法在TCGA数据库中探究SLC15A3与免疫浸润及免疫相关分子的关系。利用BEST网页获取SLC15A3与免疫治疗的关系。在临床标本中采用免疫组化法验证SLC15A3与CD8及CD68的关系。结果:SLC15A3在HPV阳性宫颈癌中高表达且其高表达有利于预后。SLC15A3高表达显著富集于免疫相关通路,并与各种免疫相关分子呈正相关。SLC15A3在抗PD-1/PD-L1免疫治疗应答者中表达上调且其上调预示着更好的预后,能较好区分免疫治疗应答与非应答者。免疫组化结果验证了SLC15A3与CD8及CD68的正相关关系。结论:HPV阳性宫颈癌患者中,SLC15A3高表达可能通过增加免疫细胞的浸润和调节免疫细胞的募集信号通路,从而改善其生存状况。这为SLC15A3作为HPV阳性宫颈癌治疗和预后评估的生物标志物提供了理论依据。 展开更多
关键词 宫颈癌 HPV slc15a3 免疫浸润 预后
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