基于生物信息学分析SLC19A3基因在乳腺癌中的表达意义及蟾毒灵的干预研究

目的分析可溶性载体SLC19A3基因在乳腺癌中的表达及临床意义,并探讨蟾毒灵(Bufalin)对乳腺癌细胞中SLC19A3基因的干预作用。方法检索Oncomine和GEO数据库中从建库至今有关乳腺癌和Bufalin干预乳腺癌的数据集,对所获取的数据资料进行数据挖掘,分析SLC19A3基因在乳腺癌组织和正常乳腺组织中的表达情况,及其与预后的关系。同时分析Bufalin对乳腺癌细胞中SLC19A3基因表达水平的影响,并结合文献资料综合分析。结果对Oncomine数据库中共收集的9项关于乳腺癌和乳腺正常组织SLC19A3基因有差异表达的研究数据集进行分析,发现乳腺癌组织中SLC19A3基因的表达明显高于乳腺正常组织,差异有统计学意义(P<0.05)。通过生存分析发现低表达SLC19A3基因的乳腺癌患者无病生存期明显短于高表达者,高表达患者的预后更好(P<0.05)。通过挖掘GEO数据库中的数据集GSE85871发现Bufalin能够上调乳腺癌细胞SLC19A3基因的表达(P<0.01)。结论 SLC19A3基因在乳腺癌组织中呈现低表达,并与乳腺癌患者的预后相关,该基因可能是Bufalin干预乳腺癌细胞的一个新靶点。

生物素-硫铵素反应性基底节病一家系SLC19A3基因的两个新变异

目的分析1例表现为全面发育落后患儿的遗传学病因。方法对患儿进行临床和实验室检査,应用二代目标区域捕获测序技术对患儿进行神经系统疾病相关基因的检测,对可疑变异位点进行保守性及致病性预测,并进行患儿及其父母的Sanger测序验证。结果患儿临床表现为发育迟缓,独坐不稳,不能区分生熟人。基因检测示患儿SLC19A3基因存在c.448G>A和c.169OT,二者均为未见报道的变异,两个变异位置编码的氨基酸为蛋白的保守位点,生物学软件预测具有致病性。结论SLC19A3基因的c.448OA和c.169C>T复合杂合变异丰富了SLC19A3基因的变异数据库,该基因复合杂合变异引起生物素-硫铵素反应性基底节病,可能导致患儿发病。

婴儿早期发病的生物素-硫胺素反应性基底节病一例并文献复习

生物素-硫胺素反应性基底节病(biotin-thiamine responsive basal ganglia disease,BTBGD)也称硫胺素代谢功能障碍综合征2型(thiamine metabolism dysfunction syndrome 2,THMD2),是一种罕见的常染色体隐性遗传的神经代谢障碍性疾病,位于染色体2q36.3上的SLC19A3基因是其致病基因[1]。

阵发性哭闹伴运动倒退2月余

患儿,男,4.5月龄发病,表现为易激惹、运动倒退、角弓反张样姿势。头颅MRI示双侧豆状核、丘脑、中脑、小脑半球对称性异常信号。基因检测发现患儿SLC19A3基因存在复合杂合突变:c.950G>A(p.G317E)和c.962C>T(p.A321V),前者遗传自父亲,后者遗传自母亲。生物信息学分析提示两者均为有害突变。予生物素、硫胺素和"鸡尾酒疗法"治疗后病情好转,1月后头颅MRI示病变显著改善。该患儿最终确诊为生物素-硫胺素反应性基底节病(BTBGD)。BTBGD是一种可治性的常染色体隐性遗传性疾病,早期应用硫胺素、生物素治疗可获得满意的疗效。

生物素-硫胺素反应性基底节病研究进展

生物素-硫胺素反应性基底节病(biotin-thiamine-responsive basal ganglia disease,BTRBGD)是由于编码人类硫胺素转运蛋白2的SLC19A3基因突变造成的先天性维生素B1(硫胺素)代谢障碍性疾病。自1998年首次报道,病例主要为沙特人,其他种族也有个案报告,尚没有中国人发病的报告。临床以儿童期起病的亚急性或急性脑病为特征,影像学表现对称性的尾状核及壳核病变。早期予生物素和/或硫胺素治疗有效。BTRBGD作为一种可治疗的代谢性疾病,在当前的诊断不足。医生发现在儿童期急性或亚急性起病的不明原因脑病伴有双侧尾状核及壳核病变应该考虑该病,在基因诊断之前的病程早期就应该给予生物素及硫胺素治疗。

生物素-硫胺素反应性基底节病1例

生物素-硫胺素反应性基底节病是一种罕见的、可治疗的常染色体隐性神经代谢性疾病,由编码硫胺素跨质膜转运蛋白的SLC19A3基因突变引起。文中报道1例以癫痫为首发症状,伴有运动功能减退、眼外肌麻痹及迟发性肌张力障碍为主要表现的29岁男性患者,头部影像学特征为双侧尾状核、豆状核对称性异常信号,基因检测确诊为生物素-硫胺素反应性基底节病,经予生物素+硫胺素治疗后症状缓解、病灶消退。