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瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因的克隆及表达特性分析
1
作者
孙博
常玉梅
+1 位作者
张立民
梁利群
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期3950-3954,共5页
以瓦氏雅罗鱼为研究材料,利用团队前期转录组数据对瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因进行克隆。结果表明,SLC26A1基因CDS长度为2562 bp,编码蛋白质长度为854 aa,蛋白理论等电点为8.97,蛋白大小为94.18 kD。预测SLC26A1属于膜蛋白,含有12个跨膜区...
以瓦氏雅罗鱼为研究材料,利用团队前期转录组数据对瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因进行克隆。结果表明,SLC26A1基因CDS长度为2562 bp,编码蛋白质长度为854 aa,蛋白理论等电点为8.97,蛋白大小为94.18 kD。预测SLC26A1属于膜蛋白,含有12个跨膜区。进化树分析结果显示,瓦氏雅罗鱼的SLC26A1与西藏高原鳅、鱇浪白鱼的SLC26A1序列遗传关系较近。qRT-PCR组织特异性表达分析表明,SLC26A1基因在瓦氏雅罗鱼肾和肠中表达量较高,在鳃、头肾、脑、脾脏和肝脏中少量表达;碱胁迫处理后SLC26A1基因的表达上调,表明该基因可能参与碱胁迫反应。研究推测,SLC26A1可能以转运阴离子的方式参与了瓦氏雅罗鱼的耐高碱机制。
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关键词
瓦氏雅罗鱼
slc26a1基因
克隆
表达特性
原文传递
题名
瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因的克隆及表达特性分析
1
作者
孙博
常玉梅
张立民
梁利群
机构
中国水产科学研究院黑龙江水产研究所
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第9期3950-3954,共5页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2016PT05)
国家重点研发计划(2019YFD0900405,2019YFD0900404)
+1 种基金
黑龙江省重大项目(GA18B202)
黑龙江省自然基金重点项目(ZD2018008)共同资助
文摘
以瓦氏雅罗鱼为研究材料,利用团队前期转录组数据对瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因进行克隆。结果表明,SLC26A1基因CDS长度为2562 bp,编码蛋白质长度为854 aa,蛋白理论等电点为8.97,蛋白大小为94.18 kD。预测SLC26A1属于膜蛋白,含有12个跨膜区。进化树分析结果显示,瓦氏雅罗鱼的SLC26A1与西藏高原鳅、鱇浪白鱼的SLC26A1序列遗传关系较近。qRT-PCR组织特异性表达分析表明,SLC26A1基因在瓦氏雅罗鱼肾和肠中表达量较高,在鳃、头肾、脑、脾脏和肝脏中少量表达;碱胁迫处理后SLC26A1基因的表达上调,表明该基因可能参与碱胁迫反应。研究推测,SLC26A1可能以转运阴离子的方式参与了瓦氏雅罗鱼的耐高碱机制。
关键词
瓦氏雅罗鱼
slc26a1基因
克隆
表达特性
Keywords
Leuciscus waleckii
slc
26a
1 gene
Cloning
Expression characteristics
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
瓦氏雅罗鱼SLC26A1基因的克隆及表达特性分析
孙博
常玉梅
张立民
梁利群
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
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已选择
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