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鸟类SLC2A4基因及其编码蛋白GLUT4分子进化分析 被引量:1
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作者 刘刚 李清月 +1 位作者 汪冲 刘晓颖 《生物学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期29-32,共4页
鸟类需要高效的血糖调节机制来维持飞翔时所需要的大量能量,SLC2A4基因及其表达产物GLUT4是细胞吸收葡萄糖的重要转运蛋白,该基因对鸟类飞翔中的能量利用具有重要意义。从GenBank中下载了17种鸟类SLC2A4基因序列进行分析,发现该基因的... 鸟类需要高效的血糖调节机制来维持飞翔时所需要的大量能量,SLC2A4基因及其表达产物GLUT4是细胞吸收葡萄糖的重要转运蛋白,该基因对鸟类飞翔中的能量利用具有重要意义。从GenBank中下载了17种鸟类SLC2A4基因序列进行分析,发现该基因的长度、碱基组成均具有较高的变异性;生物信息学分析显示GLUT4的信号肽剪切位点在氨基酸序列的第11位与57位之间,蛋白质分子具有亲水性,不存在跨膜结构且具有较多的O-糖基化位点;对基因的选择压力分析表明,突胸总目鸟类具有明显的正选择效应,而平胸总目鸟类具有纯化选择作用。采用最大似然法和贝叶斯法进行分析,系统发育分析结果显示系统发育树分为两枝:平胸总目分为第一枝,包括Struthioniformes、Apterygiformes和Tinamiformes 3个目;突胸总目构成第二枝,即Galliformes、Anseriformes、Columbiformes和Passeriformes,结果与形态学分类类似且获得了较高的支持率。研究结果将为鸟类的GLUT4进化研究提供有用的信息。 展开更多
关键词 slc2a4基因 GLUT4 序列特征 进化速率 系统发育
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FTH1、SLC2A4基因多态性与妊娠糖尿病相关性研究 被引量:1
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作者 程琰 刘俊秀 +1 位作者 张庆英 程海东 《中国优生与遗传杂志》 2021年第8期1056-1059,共4页
目的探讨孕妇铁蛋白(FTH1)和溶质转运家族2成员4(SLC2A4)基因单核苷酸多态性(SNP)与妊娠糖尿病(GDM)遗传易感性的关系。方法收集在我院定期产检的GDM组孕妇(206例)和对照组孕妇(197例)的临床资料及实验室指标。应用高通量测序技术检测... 目的探讨孕妇铁蛋白(FTH1)和溶质转运家族2成员4(SLC2A4)基因单核苷酸多态性(SNP)与妊娠糖尿病(GDM)遗传易感性的关系。方法收集在我院定期产检的GDM组孕妇(206例)和对照组孕妇(197例)的临床资料及实验室指标。应用高通量测序技术检测两组孕妇FTH1基因的11个SNP及SLC2A4基因的10个SNP的分布情况。结果GDM组孕妇的孕前BMI,妊娠10~15周时空腹血糖、糖化血红蛋白、铁蛋白、血红蛋白水平均高于正常对照组孕妇(P<0.05)。FTH1基因的11个SNP位点和SLC2A4基因的9个SNP位点,在GDM组与正常对照组间基因型一致均未发现突变位点。SLC2A4基因rs5435位点存在CC、CT、TT三种基因型分布,两组孕妇该位点基因型、等位基因频率的分布,差异无统计学意义(P>0.05)。两组孕妇孕10~15周铁蛋白水平在rs5435位点的各基因型之间差异无统计学意义(P>0.05)。妊娠达24~28周时,TT型孕妇空腹血糖和糖化血红蛋白水平均高于CC型孕妇,差异有统计学意义(P<0.05)。在GDM组中CC型孕妇妊娠10~15周血红蛋白浓度高于CT型孕妇(P<0.05)。结论在本研究人群中未发现FTH1基因多态性与铁蛋白水平、GDM发病的相关性。但rs5435的CC基因型与GDM组孕妇高血红蛋白浓度有关,TT基因型与妊娠24~28周空腹血糖和糖化血红蛋白水平增高有关。 展开更多
关键词 妊娠糖尿病 单核苷酸多态性 铁蛋白基因 溶质转运家族2成员4基因
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利用基因芯片技术解析海地瓜酶解液对糖尿病小鼠糖脂代谢的调控 被引量:4
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作者 董丽莎 李妍妍 +6 位作者 张红燕 崔晨茜 韩姣姣 王朝阳 司开学 周君 苏秀榕 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2018年第9期145-153,共9页
目的:研究海地瓜酶解液对db/db糖尿病小鼠血糖和血脂的调节作用,为进一步开发海地瓜提供理论依据。方法:以db/db糖尿病小鼠为模型,正常进食10周,分别给予海地瓜酶解液,定期测定各组小鼠的尿糖、空腹血糖、糖化血红蛋白、血清胰岛素以及... 目的:研究海地瓜酶解液对db/db糖尿病小鼠血糖和血脂的调节作用,为进一步开发海地瓜提供理论依据。方法:以db/db糖尿病小鼠为模型,正常进食10周,分别给予海地瓜酶解液,定期测定各组小鼠的尿糖、空腹血糖、糖化血红蛋白、血清胰岛素以及血脂水平。利用基因芯片技术,比较不同组别间肾脏基因的表达水平。并通过实时荧光定量聚合酶链式反应技术验证基因表达情况。结果:与模型对照组相比,各给药组均能显著降低糖尿病小鼠的尿糖、空腹血糖、糖化血清蛋白、糖化血红蛋白水平(P<0.05),改善糖耐量水平;显著降低总胆固醇、低密度脂蛋白胆固醇水平(P<0.05),升高高密度脂蛋白胆固醇水平。通过基因芯片技术,获得81个差异基因,其中54个上调基因,27个下调基因。实时荧光定量聚合酶链式反应结果显示,选取的基因均与基因芯片表达水平一致。结论:海地瓜酶解液均可显著改善db/db糖尿病小鼠的糖代谢与脂代谢(P<0.05),它的作用效应可能与slc2A4基因的表达水平有关。 展开更多
关键词 海地瓜酶解液 糖尿病 基因芯片 slc2a4基因
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Residual feed intake phenotype and gender affect the expression of key genes of the lipogenesis pathway in subcutaneous adipose tissue of beef cattle 被引量:2
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作者 Clare McKenna Richard K.Porter +3 位作者 Kate A.Keogh Sinead M.Waters Mark McGee David A.Kenny 《Journal of Animal Science and Biotechnology》 SCIE CAS CSCD 2019年第1期208-217,共10页
Background: Feed accounts for up to 75% of costs in beef production systems,thus any improvement in feed efficiency(FE) will benefit the profitability of this enterprise.Residual feed intake(RFI) is a measure of FE th... Background: Feed accounts for up to 75% of costs in beef production systems,thus any improvement in feed efficiency(FE) will benefit the profitability of this enterprise.Residual feed intake(RFI) is a measure of FE that is independent of level of production.Adipose tissue(AT) is a major endocrine organ and the primary metabolic energy reservoir.It modulates a variety of processes related to FE such as lipid metabolism and glucose homeostasis and thus measures of inter-animal variation in adiposity are frequently included in the calculation of the RFI index.The aim of this study was to determine the effect of phenotypic RFI status and gender on the expression of key candidate genes related to processes involved in energy metabolism within AT.Dry matter intake(DMI) and average daily gain(ADG) were measured over a period of 70 d for 52 purebred Simmental heifers(n = 24) and bulls(n = 28) with an initial BW±SD of 372±39.6 kg and 387±50.6 kg,respectively.Residual feed intake was calculated and animals were ranked within gender by RFI into high(inefficient; n = 9 heifers and n = 8 bulls)and low(efficient; n = 9 heifers and n = 8 bulls) groups.Results: Average daily gain ±SD and daily DMI ±SD for heifers and bul s were 1.2±0.4 kg and 9.1±0.5 kg,and 1.8±0.3 kg and 9.5±1 kg respectively.High RFI heifers and bulls consumed 10% and 15% more(P < 0.05) than their low RFI counterparts,respectively.Heifers had a higher expression of all genes measured than bulls(P < 0.05).A gender × RFI interaction was detected for HMGCS2(P < 0.05) in which high RFI bulls tended to have lower expression of HMGCS2 than low RFI bulls(P < 0.1),whereas high RFI heifers had higher expression than low RFI heifers(P < 0.05) and high RFI bulls(P < 0.05).SLC2 A4 expression was consistently higher in subcutaneous AT of low RFI animals across gender.Conclusion: The findings of this study indicate that low RFI cattle exhibit upregulation of the molecular mechanisms governing glucose metabolism in adipose tissue,in particular,glucose clearance.The decreased expression of SLC2 A4 in the inefficient cattle may result in less efficient glucose metabolism in these animals.We conclude that SLC2 A4 may be a potential biomarker for RFI in cattle. 展开更多
关键词 ADIPOSE CATTLE RFI slc2a4
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基于GEO数据库分析糖尿病心肌病的差异表达基因
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作者 陈嘉敏 李莹 +3 位作者 吴会会 刘鹏 郑燕 苏国海 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第4期545-554,共10页
目的通过对GEO数据库中有关糖尿病心肌病的mRNA芯片进行分析,筛选出导致糖尿病心肌病的关键基因。方法使用GEO数据库的在线分析工具GEO2R对数据集GSE4745和GSE5606进行差异基因分析后,在R中绘制差异表达基因火山图,利用在线韦恩图绘制... 目的通过对GEO数据库中有关糖尿病心肌病的mRNA芯片进行分析,筛选出导致糖尿病心肌病的关键基因。方法使用GEO数据库的在线分析工具GEO2R对数据集GSE4745和GSE5606进行差异基因分析后,在R中绘制差异表达基因火山图,利用在线韦恩图绘制工具分析两个数据集共同表达的差异基因,在R中利用clusterProfile包将差异表达基因进行基因本体和京都基因与基因组百科全书富集分析,GSEA软件进行基因集富集分析,同时使用STRING在线数据库构建差异基因对应蛋白的蛋白互作网络,利用Cytoscape的插件Cytohubba中最大集团中心算法计算出排名前10的基因,在原代大鼠心肌细胞中观察比较筛选出的关键基因在正常组和高糖组的表达情况。结果Pdk4、Ucp3、Hmgcs2、Asl6、Slc2a4与芯片分析结果相符,Pdk4、Ucp3、Hmgcs2在高糖(25 mmol/L)刺激72 h后的心肌细胞中表达增加,Acsl6、Slc2a4在高糖刺激后的心肌细胞中表达下降。结论Pdk4、Ucp3、Hmgcs2、Asl6、Slc2a4可能与糖尿病心肌病的发生发展相关,可能是糖尿病心肌病潜在的生物标志物。 展开更多
关键词 糖尿病心肌病 GEO数据库 基因富集 Acsl6 Pdk4 slc2a4 Hmgcs2 Ucp3
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耳聋易感基因患儿人工耳蜗植入术后听觉言语能力评估 被引量:5
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作者 戴溪 马静 +3 位作者 林垦 高映勤 陈泉东 张铁松 《中国听力语言康复科学杂志》 2017年第1期13-16,共4页
目的探讨不同耳聋易感基因患儿人工耳蜗植入后不同阶段的康复效果和影响因素。方法回顾性分析192例人工耳蜗植入患者的临床资料,将患者分为GJB2基因突变组、SLC26A4基因突变组、线粒体12S rRNA基因突变组、常见耳聋基因检测阴性对照组,... 目的探讨不同耳聋易感基因患儿人工耳蜗植入后不同阶段的康复效果和影响因素。方法回顾性分析192例人工耳蜗植入患者的临床资料,将患者分为GJB2基因突变组、SLC26A4基因突变组、线粒体12S rRNA基因突变组、常见耳聋基因检测阴性对照组,术后随访1年,采用汉语版人工耳蜗植入术后效果评估体系评估患者术后听觉能力、言语能力康复效果并进行分析。结果 MAIS得分,GJB2基因突变组的患儿术后评分优于对照组,其差异有统计学意义(P<0.05),SLC26A4基因突变组随访结果统计学分析显示各项评估结果未显现出明显优势,线粒体12S rRNA基因突变组与对照组差异无统计学意义(P>0.05)。通过CAP分级和SIR分级得分,4组间结果差异无统计学意义(P>0.05)。各组患儿术前听觉言语能力得分与开机后术后3、6、9、12个月的听觉言语得分差异有统计学意义(P<0.05)。结论不同耳聋易感基因的患儿人工耳蜗植入言语康复效果有差异,GJB2基因突变组各项随访结果显示出了较好的长期听觉。 展开更多
关键词 耳聋 人工耳蜗 GJB2基因}SLC26A4基因 线粒体12S RRNA基因
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新疆地区汉族和维吾尔族耳聋基因突变的比较研究 被引量:16
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作者 李琦 方如平 +3 位作者 黄德亮 王国建 刘新 戴朴 《临床耳鼻咽喉头颈外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期11-15,共5页
目的:分析中国新疆地区汉族和维吾尔族耳聋患者的常见耳聋基因突变,为该地区耳聋患者的临床基因诊断提供理论依据。方法:调查对象为新疆地区乌鲁木齐和库尔勒特教学校的125例耳聋患者,其中汉族64例,维吾尔族61例,听力检查全部为重度-极... 目的:分析中国新疆地区汉族和维吾尔族耳聋患者的常见耳聋基因突变,为该地区耳聋患者的临床基因诊断提供理论依据。方法:调查对象为新疆地区乌鲁木齐和库尔勒特教学校的125例耳聋患者,其中汉族64例,维吾尔族61例,听力检查全部为重度-极重度感音神经性聋。所有受检者均采集外周血并提取DNA,进行GJB2全序列、包含SLC26A4IVS7-2A>G、线粒体DNA12SrRNA1494和1555位点的突变分析。结果:新疆地区汉族耳聋患者GJB235delG和SLC26A4IVS7-2的等位基因频率分别为7.4%和10.1%,维吾尔族耳聋人群未发现GJB235delG和SLC26A4IVS7-2突变,两者比较差异有统计学意义。而GJB2235delC、299-300delAT及线粒体DNAA1555G、C1494T维吾尔族和汉族比较差异无统计学意义。结论:新疆地区汉族和维吾尔族GJB235delG和SLC26A4IVS7-2A>G有不同的等位基因频率,新疆地区汉族和维吾尔族常见耳聋基因突变存在异同。 展开更多
关键词 听力损失 基因诊断 线粒体DNAA1555G 线粒体DNAC1494T SLC26A4IVS7-2A〉G GJB2 基因突变
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非综合性耳聋GLB2与SLC26A4双基因突变分析
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作者 马会卿 徐光玲 +2 位作者 薛晓霞 郝秀双 朱俊真 《中国优生与遗传杂志》 2014年第9期44-44,72,共2页
报告1例基因遗传检查为GLB235delc杂合同时伴SLC26A4IVS7-2A>G杂合2168A>G位点杂合突变的耳聋患者。重度耳聋,根据临床和细胞学研究估计该基因型可能不存在多基因的加性效应。
关键词 耳聋 GLB2与SLC26A4 双基因 非综合性
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