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赤水乌骨鸡SLCO1B3基因SNPs鉴定及与蛋品质的关联性分析
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作者 叶涛 李辉 +3 位作者 罗韦 肖涛 余欢 陈友波 《畜牧与兽医》 CAS 北大核心 2023年第2期25-31,共7页
为了探究赤水乌骨鸡SLCO1B3基因外显子上的遗传变异位点对蛋壳颜色、蛋品质指标的影响,对300只赤水乌骨鸡SLCO1B3基因的功能突变位点EAV-HP进行基因分型,筛选出109只绿壳纯合基因型(SL/SL)的母鸡。通过直接测序方法鉴定纯合子基因型(SL/... 为了探究赤水乌骨鸡SLCO1B3基因外显子上的遗传变异位点对蛋壳颜色、蛋品质指标的影响,对300只赤水乌骨鸡SLCO1B3基因的功能突变位点EAV-HP进行基因分型,筛选出109只绿壳纯合基因型(SL/SL)的母鸡。通过直接测序方法鉴定纯合子基因型(SL/SL)个体的SLCO1B3基因外显子上存在的SNPs,并构建这些SNPs的双倍型,再与蛋品质指标进行相关性分析。结果表明:在赤水乌骨鸡SLCO1B3基因外显子上共检测到3个SNPs,第5外显子上的g.65235858G>A位点为非同义突变,突变后mRNA二级结构发生改变;关联性分析表明,赤水乌骨鸡SLCO1B3基因的这3个SNPs构建的双倍型对蛋壳颜色ΔL*值、蛋壳颜色Δb*值、蛋形指数有显著影响(P<0.05)。结果表明,SLCO1B3基因的遗传变异与蛋壳颜色、蛋形指数存在显著相关。 展开更多
关键词 赤水乌骨鸡 slco1b3 SNPS
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Influence of organic anion transporting potypeptide(SLCO1B1 and SLCO1B3)genetic polymorphisms on mycophenolic acid in Chinese kidney transplantation patients
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作者 武多娇 《外科研究与新技术》 2011年第4期282-282,共1页
Objective To analyze the relationship between genetic polymorphisms of organic anion transporting polypeptide ( SLCO1B1 and SLCO1B3) and mycophenolic acid ( MPA) pharmacokinetics in Chinese kidney transplant recipient... Objective To analyze the relationship between genetic polymorphisms of organic anion transporting polypeptide ( SLCO1B1 and SLCO1B3) and mycophenolic acid ( MPA) pharmacokinetics in Chinese kidney transplant recipients. Methods Gene mutations ( SLCO1B3 T334G,SLCO1B1 A338G) were detected in 68 recipi- 展开更多
关键词 ACID Influence of organic anion transporting potypeptide SLCO1B1 and slco1b3)genetic polymorphisms on mycophenolic acid in Chinese kidney transplantation patients
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5个绿壳蛋鸡群体中EAV-HP在SLCO1B3基因5′-非编码区插入整合频率和类型的研究 被引量:9
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作者 王晨 张丹萍 +6 位作者 张浩 俄广鑫 沙日耐 曾盛诚 张海燕 潘建飞 韩建林 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2014年第10期183-188,共6页
本试验旨在测定和比较5个绿壳蛋鸡群体中EAV-HP在溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员1B3(solute carrier organic anion transporter family member 1B3,SLCO1B3)基因的5′-非编码区插入整合的频率和类型。所选5个绿壳蛋鸡群体包括3... 本试验旨在测定和比较5个绿壳蛋鸡群体中EAV-HP在溶质载体有机阴离子转运蛋白家族成员1B3(solute carrier organic anion transporter family member 1B3,SLCO1B3)基因的5′-非编码区插入整合的频率和类型。所选5个绿壳蛋鸡群体包括3个北京地区的商业群体(北京-LK、北京-LF和北京-YM)、贵州长顺绿壳蛋鸡群体和四川省地方品种旧院黑鸡;采用双重PCR对EAV-HP的插入整合进行检测,并利用DNA测序的方法判断EAV-HP的主要突变位点。结果表明,5个绿壳蛋鸡群体均拥有一定数量的EAV-HP插入整合的个体,表现为杂合(LC/N)和纯合(LC/LC)基因型,均可产绿壳蛋,其中旧院黑鸡的绿壳蛋频率最低,仅为28.90%,其次是北京-LF群体,为46.94%,其他3个群体的绿壳蛋频率为83.33%~84.62%;经卡方检验,北京-LF和旧院黑鸡群体符合Hardy-Weinberg平衡(P〉0.05),而其他3个群体则极显著偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P〈0.01)。DNA测序结果显示这5个绿壳蛋鸡群体中EAV-HP插入整合的序列与之前报道的东乡绿壳蛋鸡的KC632577.1完全一致。地方品种旧院黑鸡的绿壳蛋频率较低,建议利用双重PCR检测的分子标记辅助选择方法加以提高。 展开更多
关键词 绿壳蛋 EAV-HP插入 slco1b3基因
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一例Rotor综合征SLCO1B1和SLCO1B3基因突变分析 被引量:2
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作者 张志华 郑必霞 +2 位作者 李玫 金玉 林谦 《肝脏》 2016年第7期542-544,605,共4页
目的初步探讨1例Rotor综合征患者的临床特点和SLCO1B1和SLCO1B3基因突变情况,从分子遗传学角度分析该疾病的发生机制。方法收集患者临床资料,从外周血白细胞提取基因组DNA,采用二代测序进行四千种已知单基因遗传性疾病筛查,用Sanger测... 目的初步探讨1例Rotor综合征患者的临床特点和SLCO1B1和SLCO1B3基因突变情况,从分子遗传学角度分析该疾病的发生机制。方法收集患者临床资料,从外周血白细胞提取基因组DNA,采用二代测序进行四千种已知单基因遗传性疾病筛查,用Sanger测序法分析验证二代测序发现的突变位点。结果患儿主要临床表现为反复皮肤及巩膜黄染,实验室检查示高胆红素血症,直接、间接胆红素双向增高。高通量测序发现患儿携带SLCO1B1基因c.1738 C>T纯合突变和SLCO1B3基因c.360_481 del纯合突变。c.1738 C>T突变为无义突变,已有文献报道,推测导致蛋白的第580位氨基酸密码子由精氨酸变为终止密码子。c.360_481 del突变为移码突变,蛋白编码区的第360至481位碱基缺失。该变异未见文献报道,也未见SNP数据库收录。此变异使蛋白缺失40个氨基酸的同时还造成开放阅读框移码,可能造成蛋白功能丧失。结论 SLCO1B1和SLCO1B3基因突变导致的有机阴离子转运多肽OATP1B1和OATP1B3功能缺陷是该Rotor综合征患者临床表现的分子遗传基础。 展开更多
关键词 ROTOR综合征 SLCO1B1基因 slco1b3基因
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胃癌患者SLCO1B3基因多态性与多西紫杉醇诱导中性粒细胞减少相关性研究 被引量:1
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作者 吴萍 邹素兰 倪雪峰 《临床合理用药杂志》 2017年第26期5-7,共3页
目的研究胃癌患者SLCO1B3基因多态性与多西他赛化疗引起的骨髓抑制的相关性。方法共纳入61例接受多西他赛化疗的胃癌患者,采用飞行时间质谱法检测SLCO1B3基因多态性,研究不同SLCO1B3基因分型与骨髓抑制风险发生的相关性。结果 SLCO1B3 A... 目的研究胃癌患者SLCO1B3基因多态性与多西他赛化疗引起的骨髓抑制的相关性。方法共纳入61例接受多西他赛化疗的胃癌患者,采用飞行时间质谱法检测SLCO1B3基因多态性,研究不同SLCO1B3基因分型与骨髓抑制风险发生的相关性。结果 SLCO1B3 AA型42例(68.9%),AG型16例(26.2%),GG型有3例(4.9%)。Logistic回归分析发现,不同SLCO1B3基因型与骨髓抑制发生风险之间无统计学差异[共显性遗传模型:杂合子(AG)vs.野生型(AA),优势比(OR)=0.341,95%置信区间(95%CI):0.101-1.156;纯合子(GG)vs.(AA),OR=0.375,95%CI:0.031-4.465;显性遗传模型:(AG+GG)vs.AA,OR=0.346,95%CI=0.110-1.087;隐性遗传模型:GG vs.(AG+AA),OR=0.500,95%CI=0.043-5.823]。进一步对患者各临床特征与骨髓抑制发生风险之间进行统计学分析,结果发现二者之间也不存在相关性。结论 SLCO1B3基因多态性不能作为预测本组人群多西他赛化疗相关骨髓抑制的基因预测指标。 展开更多
关键词 胃癌 slco1b3基因 多态性 化疗
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The influence of genetic polymorphisms in drug metabolism enzymes and transporters on the pharmacokinetics of different fluvastatin formulations 被引量:1
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作者 Qian Xiang Weidang Wu +10 位作者 Nan Zhao Chuan Li Junyu Xu Lingyue Ma Xiaodan Zhang Qiufen Xie Zhuo Zhang Jiancheng Wang Weiren Xu Xia Zhao Yimin Cui 《Asian Journal of Pharmaceutical Sciences》 SCIE CAS 2020年第2期264-272,共9页
The purpose of the present study was to investigate the impact of genetic polymorphism on fluvastatin pharmacokinetics.In addition,we compared the fluvastatin pharmacokinetics differences between extended-release(ER)8... The purpose of the present study was to investigate the impact of genetic polymorphism on fluvastatin pharmacokinetics.In addition,we compared the fluvastatin pharmacokinetics differences between extended-release(ER)80 mg tablet and immediate-release(IR)40 mg capsule in terms of drug metabolism enzyme and transporter genetic polymorphisms.In this open-label,randomized,two-period,two-treatment,crossover study(n=24),effects of ABCG2,SLCO1B1,ABCB1,CYP2C9 and CYP3A5 polymorphisms on the pharmacokinetics of fluvastatin were analyzed.The administration dosage for IR 40 mg and ER 80 mg were twice and once daily,respectively,for total 7 d.Blood samples for pharmacokinetic evaluation were taken on the 1st and 7th d.The lower exposure following ER was observed.For ER tablets,SLCO1B1 T521C genotype correlated with AUC 0-24 of repeat doses(P=0.010).SLCO1B1 T521C genotype had no statistically significant effect on AUC 0-24 of IR capsule of fluvastatin after single or repeated doses.In vitro study demonstrated that when the concentration of fluvastatin was low(<1μmol/l),the uptake of fluvastatin in the HEK293-OATP1B1 with SLCO1B1521TT(K m=0.18μmol/l)was faster than that with SLCO1B1521CC(K m=0.49μmol/l),On the other hand,when concentration reached to higher level(>1μmol/l),transport velocity of fluvastatin by HEK293-OATP1B1 with SLCO1B1521TT(K m=11.4μmol/l)and with SLCO1B1521TCC(K m=15.1μmol/l)tend to be the same.It suggests that the increased effect of SLCO1B1 T521C genotype on ER formulation of fluvastatin was mainly caused by lower blood concentrations.We recommend that formulation should be incorporated into future pharmacogenomics studies. 展开更多
关键词 genetic polymorphisms SLCO1B1 FLUVASTATIN Immediate-release EXTENDED-RELEASE
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儿童Rotor综合征临床特点及SLCO1B1和SLCO1B3基因突变分析 被引量:1
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作者 叶家卫 谭丽梅 +2 位作者 杨峰霞 徐翼 李旭芳 《广州医药》 2021年第6期1-5,共5页
目的对3例儿童Rotor综合征的临床特点及SLCO1B1和SLCO1B3基因突变分析,提高儿科医生对Rotor综合征的认识。方法收集广州市妇女儿童医疗中心2018年—2019年确诊的3例Rotor综合征患儿的临床资料,对患儿及其家系成员肝脏常见遗传代谢性疾... 目的对3例儿童Rotor综合征的临床特点及SLCO1B1和SLCO1B3基因突变分析,提高儿科医生对Rotor综合征的认识。方法收集广州市妇女儿童医疗中心2018年—2019年确诊的3例Rotor综合征患儿的临床资料,对患儿及其家系成员肝脏常见遗传代谢性疾病二代测序筛查并家系验证结果进行分析。结果患儿主要临床表现为反复或持续巩膜和(或)皮肤轻度黄染,实验室检查提示高直接胆红素血症。二代测序发现3例患儿均为SLCO1B1基因c.1738C>T纯合突变和SLCO1B3基因5号内含子区域大片段插入纯合突变。SLCO1B1基因和SLCO1B3基因2处纯合突变均进行了家系验证。文献报道的SLCO1B1基因c.1738C>T突变是无义突变,可以造成蛋白功能缺失;SLCO1B3基因的大片段插入突变虽暂未有文献收录或报道,但大片段的插入突变可引起移码突变而造成编码蛋白功能丧失。结论由于基因检测技术的不断进步,Rotor综合征不断被儿科医生所认识。SLCO1B1和SLCO1B3双基因纯合或复合杂合突变是3例Rotor综合征患儿的分子遗传基础。 展开更多
关键词 ROTOR综合征 SLCO1B1基因 slco1b3基因
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鸡OATP1B3互作蛋白筛选及其相关基因的转录表达分析
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作者 陈友波 叶涛 +5 位作者 余欢 石钰仕 赵德鹏 龙霞 谭启松 李辉 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期3683-3696,共14页
【目的】筛选鉴定鸡有机阴离子转运多肽1B3(OATP1B3)的互作蛋白,并探究其对鸡蛋绿壳颜色形成的影响,为提高绿壳蛋鸡群体选育准确性提供参考依据。【方法】以真核表达载体p EGFP-SLCO1B3和空载体pEGFP-C1分别转染绿壳型赤水乌骨母鸡蛋壳... 【目的】筛选鉴定鸡有机阴离子转运多肽1B3(OATP1B3)的互作蛋白,并探究其对鸡蛋绿壳颜色形成的影响,为提高绿壳蛋鸡群体选育准确性提供参考依据。【方法】以真核表达载体p EGFP-SLCO1B3和空载体pEGFP-C1分别转染绿壳型赤水乌骨母鸡蛋壳腺上皮细胞,通过免疫共沉淀(Co-IP)结合液相色谱与串联质谱联用技术(LC-MS/MS)筛选鸡OATP1B3互作蛋白,经GO功能注释分析、KEGG信号通路富集分析及蛋白相互作用网络分析鉴定出与鸡蛋绿壳性状形成相关的OATP1B3互作蛋白。同时,通过构建SLCO1B3基因沉默及过表达载体分别转染蛋壳腺上皮细胞,检测SLCO1B3基因过表达或沉默时部分OATP1B3互作蛋白基因(FXR1、CTTN、RPL12和RPS17)在蛋壳腺上皮细胞中的表达情况,并根据鸡蛋壳颜色分为白壳、浅绿和深绿3种类型,分析蛋壳颜色△a*值与FXR1、CTTN、RPL12和RPS17基因表达的相关性。【结果】共筛选鉴定出37个与鸡OATP1B3相互作用的蛋白,其中FXR1、CTTN、RPL12和RPS17与鸡蛋的绿壳性状有密切关系。SLCO1B3基因过表达能极显著下调蛋壳腺上皮细胞内FXR1基因的表达(P<0.01,下同),显著上调RPL12基因表达(P<0.05,下同),极显著上调RPS17基因表达;当SLCO1B3基因沉默后,蛋壳腺上皮细胞内FXR1和CTTN基因的表达极显著上调,而RPL12基因的表达显著下调。白壳类型赤水乌骨母鸡下丘脑中的FXR1基因相对表达量极显著高于绿壳类型赤水乌骨母鸡,肝脏中的RPL12和RPS17基因相对表达量极显著或显著高于绿壳类型赤水乌骨母鸡;此外,FXR1基因在下丘脑中的相对表达量与蛋壳颜色△a*值极显著正相关,RPL12基因在蛋壳腺和肝脏中的相对表达量与蛋壳颜色△a*值极显著正相关。【结论】筛选鉴定出的37个鸡OATP1B3互作蛋白主要定位于细胞质和细胞核,具有蛋白结合能力及结构分子活性,主要参与细胞过程、生物调节和能量代谢。在鸡壳腺上皮细胞内SLCO1B3基因与FXR1、CTTN、RPL12和RPS17基因间存在调控关系,其中,FXR1和RPL12基因在鸡蛋绿壳性状的形成过程中发挥着重要作用。 展开更多
关键词 赤水乌骨鸡 有机阴离子转运多肽1B3(OATP1B3) slco1b3基因 互作蛋白 表达调控
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SLCO1B3基因多态性对狼疮性肾炎患者吗替麦考酚酯疗效的影响
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作者 谢晓纯 顾庆玲 +5 位作者 许百洁 莫守崎 蔡旭镇 黄丽娜 黄民 李嘉丽 《中国现代应用药学》 CSCD 北大核心 2024年第1期133-137,共5页
目的 探讨有机阴离子转运体1B3(solute carrier organic anion transporter family,member 1B3,SLCO1B3)基因多态性对狼疮性肾炎患者吗替麦考酚酯(mycophenolate mofetil,MMF)药效学的影响。方法 以2019年9月—2021年4月于揭阳市人民医... 目的 探讨有机阴离子转运体1B3(solute carrier organic anion transporter family,member 1B3,SLCO1B3)基因多态性对狼疮性肾炎患者吗替麦考酚酯(mycophenolate mofetil,MMF)药效学的影响。方法 以2019年9月—2021年4月于揭阳市人民医院就诊的新确诊的或既往确诊的狼疮性肾炎患者为研究对象。受试者均使用MMF治疗,且总疗程≥12个月,综合评估MMF的疗效。采用Agena MassARRAY■方法检测受试者SLCO1B3 334T>G/699G>A (rs4149117/rs7311358)基因型,应用SPSS 25.0软件分析基因多态性与MMF药效学的相关性。结果 SLCO1B3 334T>G/699G>A基因型频率符合Hardy-Weinberg平衡。334GG/699AA携带者MMF疗效差的几率显著高于334TT/699AA和334TG/699GA携带者(P<0.001);Logistics回归显示334GG/699AA和尿蛋白>2.5 g·(24 h)^(-1)是MMF疗效差的危险因素[OR=4.038(1.731,9.420),P<0.001;OR=4.157(1.705,10.137),P=0.002]。经过联合分析表明,携带334GG/699AA型且尿蛋白>2.5 g·(24 h)^(-1)的患者疗效差的风险是非334GG/699AA携带者的8.563倍[(3.301,22.216),P<0.001]。结论 SLCO1B3 334T>G/699G>A与狼疮性肾炎患者MMF疗效有关,334GG/699AA携带者MMF疗效差的可能性更高。 展开更多
关键词 吗替麦考酚酯 狼疮性肾炎 药效学 slco1b3 药物基因组学
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林甸鸡绿壳蛋、隐性白、快慢羽性状的遗传基础分析 被引量:10
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作者 张元良 王志鹏 +4 位作者 邱家维 冷丽 李玉茂 曹志平 李辉 《中国家禽》 北大核心 2015年第17期5-11,共7页
试验旨在研究影响绿壳蛋、隐性白和快慢羽性状的SLCO1B3、TYR和K基因型在林甸鸡群中的分布情况。通过PCR和电泳技术分别对影响林甸鸡绿壳蛋、隐性白和快慢羽性状的SLCO1B3、TYR和K基因突变位点进行分型工作,发现产绿壳蛋的林甸鸡携带SLC... 试验旨在研究影响绿壳蛋、隐性白和快慢羽性状的SLCO1B3、TYR和K基因型在林甸鸡群中的分布情况。通过PCR和电泳技术分别对影响林甸鸡绿壳蛋、隐性白和快慢羽性状的SLCO1B3、TYR和K基因突变位点进行分型工作,发现产绿壳蛋的林甸鸡携带SLCO1B3-O等位基因,SLCO1B3-OO型占12.5%,SLCO1B3-Oo型占87.5%;林甸鸡中白羽个体基因型为TYR-cc,非白羽个体中有19.3%的鸡携带TYR-c等位基因,基因型为TYR-Cc;在林甸鸡中检测到慢羽型鸡占7.8%,快羽型鸡占92.2%。通过追溯试验群体的系谱结构,发现影响林甸鸡绿壳蛋性状SLCO1B3基因、隐性白性状的TYR基因和快慢羽性状的K基因的突变位点在上下代传递过程中符合孟德尔遗传规律。 展开更多
关键词 林甸鸡 slco1b3基因 TYR基因 K基因
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鸡蛋绿壳性状与候选基因研究进展
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作者 王欢欢 陈美玲 楼立峰 《杭州农业与科技》 2016年第6期20-21,24,共3页
绿壳蛋是蛋鸡壳色的一个重要表型,也是最直观的品种特征。绿壳蛋颜色是由一个主效基因和多个微效基因控制的综合性状。目前国内外针对鸡绿壳蛋品质与遗传开展了大量的研究工作。本文简要介绍鸡绿壳蛋形成机理、蛋品质分析与绿壳分子遗... 绿壳蛋是蛋鸡壳色的一个重要表型,也是最直观的品种特征。绿壳蛋颜色是由一个主效基因和多个微效基因控制的综合性状。目前国内外针对鸡绿壳蛋品质与遗传开展了大量的研究工作。本文简要介绍鸡绿壳蛋形成机理、蛋品质分析与绿壳分子遗传研究进展,以期促进鸡蛋绿壳性状的研究与应用。 展开更多
关键词 鸡蛋绿壳 蛋品质 HO-1基因 slco1b3基因
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受体SLCO1B1 rs2291075位点多态性对肝移植术后早期他克莫司剂量校正谷浓度的影响 被引量:1
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作者 吴懿 王让让 +1 位作者 王兆文 樊军卫 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2020年第11期1268-1275,共8页
目的:探索肝移植术后早期SLCO1B1 rs2291075基因型对他克莫司(FK506)剂量校正谷浓度(dose-corrected trough concentration,C/D,ng·mL-1·mg-1·kg-1)的影响作用。方法:利用PCR扩增和DNA测序技术对210例肝移植受体及其供... 目的:探索肝移植术后早期SLCO1B1 rs2291075基因型对他克莫司(FK506)剂量校正谷浓度(dose-corrected trough concentration,C/D,ng·mL-1·mg-1·kg-1)的影响作用。方法:利用PCR扩增和DNA测序技术对210例肝移植受体及其供体进行SLCO1B1 rs2291075位点以及FK506代谢经典生物标志物CYP3A5 rs776746位点基因分型,分析多态性与FK506代谢表型C/D值的相关性。根据肝功能恢复和C/D值变化情况,肝移植术后早期分为恢复期(1~14 d)和平稳期(15~28 d),分别进行统计分析。结果:供体和受体CYP3A5 rs776746联合分析可将FK506代谢表型区分为快(EM)、中(IM)、慢(PM)代谢3组,形成E-I-P分型体系。受体SLCO1B1 rs2291075 CC、CT+TT基因型患者C/D值在术后恢复期(P=0.0195)和平稳期(P=0.0152)差异均有统计学意义;供体SLCO1B1 rs2291075基因型与FK506 C/D值无关联。多因素分析显示FK506日剂量、总胆红素、E-I-P分型和受体SLCO1B1 rs2291075进入恢复期FK506剂量C/D值预测模型;而在平稳期,受体SLCO1B1 rs2291075未能进入C/D值多因素预测模型。PM亚组分析,排除供体和受体CYP3A5 rs776746影响后,受体SLCO1B1 rs2291075基因型在术后恢复期和稳定期均是FK506 C/D值的独立影响因素(P分别为0.030,0.040)。结论:受体SLCO1B1 rs2291075位点可能是影响肝移植早期FK506 C/D值的新遗传位点,其与供体和受体CYP3A5 rs776746基因型相结合,有助于形成精准用药指导体系。 展开更多
关键词 肝移植 他克莫司 CYP3A5 SLCO1B1 基因多态性
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CYP3A4和SLCO1B1在云南白族人群中的基因多态性 被引量:2
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作者 郝芳芳 赖泳 +2 位作者 董榆 杜一民 莽朝永 《医药导报》 CAS 2016年第12期1360-1364,共5页
目的探讨CYP3A4和SLCO1B1基因的主要突变位点CYP3A4-392A>G、SLCO1B1 388A>G和521T>C在云南白族人群中的分布情况。方法采用聚合酶链反应(PCR)-直接测序法检测94名健康白族人的CYP3A4-392A>G、SLCO1B1 388A>G和521T>... 目的探讨CYP3A4和SLCO1B1基因的主要突变位点CYP3A4-392A>G、SLCO1B1 388A>G和521T>C在云南白族人群中的分布情况。方法采用聚合酶链反应(PCR)-直接测序法检测94名健康白族人的CYP3A4-392A>G、SLCO1B1 388A>G和521T>C基因型,用PHASE2.1软件构建SLCO1B1基因单倍型。结果在检测的94名健康白族人中,未发现CYP3A4-392A>G突变个体,所有研究对象均为AA基因型携带者;在检测的90名健康白族人中,SLCO1B1 388A>G的野生型AA、突变杂合子AG、突变纯合子GG基因型频率分别为3.3%,32.2%,64.5%,突变等位基因频率为80.6%;在检测的94名健康白族人中,SLCO1B1 521T>C的野生型TT、突变杂合子TC、突变纯合子CC基因型频率分别为91.5%,7.4%,1.1%,突变等位基因频率为4.8%;在研究的健康白族人群中,主要有SLCO1B1*1a、*1b、*15这3种单倍型,单倍型的频率分别为19.4%,75.6%,5.0%。结论 CYP3A4-392A>G在云南白族人群中未发生突变;云南白族人群SLCO1B1基因多态性分布具有自己的特点,388A>G等位基因突变频率较高,而521T>C等位基因突变频率较低,其存在*1a、*1b、*15这3种单倍型。 展开更多
关键词 CYP3A4 SLCO1B1 白族人群 基因多态性
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肾移植患者SLCO1B3基因多态性与他克莫司血药浓度相关性研究
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作者 张函舒 宋沧桑 +4 位作者 李兴德 杨金伟 毛盼盼 王国徽 马雪娇 《中国现代应用药学》 CAS CSCD 北大核心 2023年第23期3297-3300,共4页
目的探究肾移植患者SLCO1B3基因多态性与术后早期他克莫司血药浓度的相关性。方法选取昆明市第一人民医院68例肾移植患者为研究对象,运用化学免疫发光法监测他克莫司血药浓度,同时采用聚合酶链反应法检测CYP3A5^(*)3、SLCO1B3 T334G和G6... 目的探究肾移植患者SLCO1B3基因多态性与术后早期他克莫司血药浓度的相关性。方法选取昆明市第一人民医院68例肾移植患者为研究对象,运用化学免疫发光法监测他克莫司血药浓度,同时采用聚合酶链反应法检测CYP3A5^(*)3、SLCO1B3 T334G和G699A基因多态性,并进行基因分型,分析各基因型与他克莫司血药浓度的相关性。结果CYP3A5^(*)3不同基因型对术后他克莫司血药浓度和标准化血药浓度有影响,差异具有统计学意义(P<0.05),SLCO1B3 T334G和G699A基因位点不同基因型对术后他克莫司血药浓度和标准化血药浓度无影响,差异均无统计学意义。结论与CYP3A5^(*)3/^(*)3基因型相比,CYP3A5^(*)1等位基因携带者达到相同的他克莫司浓度需要增加他克莫司给药剂量。SLCO1B3 T334G和G699A基因多态性对肾移植术后早期他克莫司血药浓度无影响。 展开更多
关键词 肾移植 他克莫司 血药浓度 slco1b3 基因多态性
原文传递
SLCO1B1单倍型对利福平诱导CYP3A活性的影响
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作者 张伟 贺毅憬 +5 位作者 谢海棠 邓晟 范岚 刘亚利 谭志荣 周宏灏 《中国临床药理学与治疗学》 CAS CSCD 2007年第10期1195-1196,共2页
Rifampin, a member of the rifamycin class of antibiotics, is well known for its ability to activate the pregnant X receptor and induce drug-metabolizing enzymes and transporters. Available data suggest rifampin entry ... Rifampin, a member of the rifamycin class of antibiotics, is well known for its ability to activate the pregnant X receptor and induce drug-metabolizing enzymes and transporters. Available data suggest rifampin entry into hepatocytes is mediated by OATP1B1. Accordingly, it is therefore plausible that modulation of the intracellular concentration of rifampin by OATP1B1 genetic polymorphisms would influence the degree of CYP3A induction. AIM: To study the association between haplotypes of the SLCO1B1 and the rifampicin-mediated inducible CYP3A4 activity. A single-point determination of midazolam plasma concentration method was developed to assess the constitutive and inducible CYP3A4 activity. A pharmacokinetic study of a single dose of 450 mg rifampicin was conducted to evaluate the mechanism of rifampicin-midazolam interaction in different SLCO1B1 genotypic subjects. METHODS: Twenty-three healthy volunteers with different SLCO1B1 haplotypes (7 for SLCO1B1*1a/*1a, 7 for SLCO1B1*1b/*1b, 7 for SLCO1B1*1b/*15 and 2 for SLCO1B1*15/*15) were enrolled in this study. Each was given a single oral dose of 7.5 mg midazolam on day 0 and day 6. Rifampicin of 450 mg was given from day 1 to day 5. Plasma concentrations of midazolam were measured for up to 8 hours by LC-MS, and its pharmacokinetic parameters were analyzed. Plasma concentrations of a single oral dose of 450 mg rifampicin were measured for up to 12 hours. RESULTS: A significant correlation (r2=0.763, P<0.001, n=23) was found between AUC(0-∞) and the single plasma concentration of midazolam at 2.5 hour (C2.5 h). The 2.5 h midazolam measurement was an optimal predictor of CYP3A phenotype. However, the percentage reduction of AUC(0-∞) or C2.5 h in different SLCO1B1 haplotypes was not significantly different. The pharmacokinetics parameters of rifampin were not significantly different between the 521T>C mutant group and the control group. CONCLUSION: A single blood concentration at 2.5 h after 7.5 mg oral midazolam intake can be used to predict CYP3A activity. The SLCO1B1 haplotypes do not influence the extent of inducible CYP3A activity by rifampin. SLCO1B1 genotypes has no significant impact on the disposition of rifampin in vivo. 展开更多
关键词 SLCO1B1单倍型 利福平 CYP3A 活性
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长顺绿壳蛋鸡的SLCO1B3基因分型及分子选育 被引量:3
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作者 陈林 伍革民 +1 位作者 韩雪 孙勇 《黑龙江畜牧兽医(下半月)》 北大核心 2017年第4期69-70,共2页
为了固定SLCO1B3基因,提高长顺绿壳蛋鸡绿壳蛋率,笔者采用双重PCR法对长顺绿壳蛋鸡群体进行SLCO1B3基因分型检测,并与绿壳表型进行关联分析。结果表明:186只长顺绿壳蛋鸡中,SLCO1B3基因的绿壳纯合基因型鸡约占33.33%,绿壳杂合基因型约... 为了固定SLCO1B3基因,提高长顺绿壳蛋鸡绿壳蛋率,笔者采用双重PCR法对长顺绿壳蛋鸡群体进行SLCO1B3基因分型检测,并与绿壳表型进行关联分析。结果表明:186只长顺绿壳蛋鸡中,SLCO1B3基因的绿壳纯合基因型鸡约占33.33%,绿壳杂合基因型约占50%,非绿壳纯合基因型约占16.67%。说明长顺绿壳蛋鸡绿壳基因还未固定,从绿壳基因角度看绿壳蛋率为83.33%,需要分子辅助选育快速提高绿壳蛋率。 展开更多
关键词 长顺绿壳蛋鸡 slco1b3基因 分子选育 双重PCR 绿壳蛋率
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长顺绿壳蛋鸡绿壳基因SLCO1B3多态性分析 被引量:2
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作者 喻昌燕 谢健 +3 位作者 王洋 林家栋 陈眷华 张福平 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第7期2816-2820,共5页
为了筛选出产绿壳蛋的纯合子基因型鸡群。本试验采用双重PCR方法检测长顺绿壳蛋鸡群体中EAV-HP在SLCO1B3基因中的插入频率,结果显示,该群体中包含3种基因型:N/N、LC/N和LC/LC,其基因型频率分别为5.23%、52.33%和42.44%;LC基因频率为68.6... 为了筛选出产绿壳蛋的纯合子基因型鸡群。本试验采用双重PCR方法检测长顺绿壳蛋鸡群体中EAV-HP在SLCO1B3基因中的插入频率,结果显示,该群体中包含3种基因型:N/N、LC/N和LC/LC,其基因型频率分别为5.23%、52.33%和42.44%;LC基因频率为68.60%,绿壳蛋频率达到94.77%。该插入位点在长顺绿壳蛋鸡群体中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(p<0.01)。表明长顺绿壳蛋鸡群体拥有大量EAV-HP插入整合的个体,其基因纯合度较高,是优良的地方品种资源。 展开更多
关键词 长顺绿壳蛋鸡 EVA-HP slco1b3
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一例Rotor综合征患儿的基因变异分析 被引量:1
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作者 王大燕 李小兵 +1 位作者 赖盼建 郑兰缙 《中华医学遗传学杂志》 CAS CSCD 2021年第4期359-362,共4页
目的探讨1例Rotor综合征患儿的遗传学病因。方法收集患儿的临床资料,应用高通量测序技术对患者行全外显子组测序并进行Sanger测序验证。用单管三引物PCR分析法检测SLCO1B3基因第5内含子长散布元件-1(long-interspersed element-1,LINE-1... 目的探讨1例Rotor综合征患儿的遗传学病因。方法收集患儿的临床资料,应用高通量测序技术对患者行全外显子组测序并进行Sanger测序验证。用单管三引物PCR分析法检测SLCO1B3基因第5内含子长散布元件-1(long-interspersed element-1,LINE-1)的插入情况。结果高通量全外显子组测序发现患儿携带SLCO1B1基因c.1738C>T纯合无义变异。SLCO1B3基因第5内含子中LINE-1的纯合插入,导致第5外显子或第5~7外显子跳跃,并在SLCO1B3转录本中引入了终止密码子。结论SLCO1B1基因c.1738C>T纯合变异以及SLCO1B3基因第5内含子LINE-1的纯合插入可能是该Rotor综合征患儿的致病原因。 展开更多
关键词 ROTOR综合征 SLCO1B1基因 slco1b3基因 长散布元件-1
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