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受条斑病菌侵染的水稻cDNA文库构建 被引量:1
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作者 赵梅勤 李玉蓉 +1 位作者 邹丽芳 陈功友 《南京农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期51-55,共5页
提取经条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)侵染诱导后的水稻mRNA,利用SMART^TM技术于载体pGADT7-SfiAB上构建了水稻cDNA文库。检测发现,文库中含有水稻病程相关蛋白基因OsPR—1a、OsPR—1b和PAL。随机提取cDNA文库克隆的... 提取经条斑病菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola)侵染诱导后的水稻mRNA,利用SMART^TM技术于载体pGADT7-SfiAB上构建了水稻cDNA文库。检测发现,文库中含有水稻病程相关蛋白基因OsPR—1a、OsPR—1b和PAL。随机提取cDNA文库克隆的质粒,酶切分析发现,该cDNA文库的插入片段分布在500~2000bp之间,平均大小约为1kb,重组率达95%。上述结果表明,水稻受条斑病菌侵染的cDNA文库质量较好,这为研究条斑病菌致病性因子与水稻互作机制奠定了工作基础。 展开更多
关键词 水稻 水稻条斑病菌 CDNA文库 smarttm技术 病程相关蛋白
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云南疣粒野生稻部分cDNA片段的分离和注释 被引量:1
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作者 史冬燕 程在全 《安徽大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2008年第3期86-89,共4页
从疣粒野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择120个菌样进行测序,获得的95条序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等软件进行序列分析,结果为:与栽培稻日本晴序列比较匹配碱基数>400 bp的占... 从疣粒野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择120个菌样进行测序,获得的95条序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等软件进行序列分析,结果为:与栽培稻日本晴序列比较匹配碱基数>400 bp的占27.37%;确定可阅读框(>100 bp,具有起始和终止密码子)的占90%;与拟南芥的功能基因比较,相似性大于60%的有46个;确定功能、代谢过程和编码蛋白部位的cDNA片段分别有34个、31个和31个. 展开更多
关键词 云南疣粒野生稻 CDNA文库 smarttm技术 序列同源性
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云南元江普通野生稻cDNA文库注释 被引量:2
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作者 史冬燕 程在全 《贵州大学学报(自然科学版)》 2008年第2期217-220,共4页
从元江普通野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择115个菌样进行测序,获得的序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等生物信息分析软件对这些序列进行分析,结果为:与栽培稻(Oryza sativa(japoni... 从元江普通野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择115个菌样进行测序,获得的序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等生物信息分析软件对这些序列进行分析,结果为:与栽培稻(Oryza sativa(japonica cultivar-group))序列比较匹配碱基数>400bp的占48.45%;确定可阅读框(>100bp,具有起始和终止密码子)的占70%;与拟南芥的功能基因比较,相似性大于60%的有38个;确定功能、代谢过程和编码蛋白部位的cDNA片段分别有17个、16个和24个。 展开更多
关键词 元江普通野生稻 CDNA文库 smarttm技术 序列同源性
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Construction of a Normalized Full-Length cDNA Library of Sesame Developing Seed by DSN and SMART^(TM) 被引量:8
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作者 KE Tao DONG Cai-hua +3 位作者 MAO Han ZHAO Ying-zhong LIU Hong-yan LIU Sheng-yi 《Agricultural Sciences in China》 CAS CSCD 2011年第7期1004-1009,共6页
Sesame (Sesamue indicum L.) is one of the most important oilseed crops with high oil yield. Here, we described a simple and efficient method for constructing a normalized cDNA library from a high oil content cultiva... Sesame (Sesamue indicum L.) is one of the most important oilseed crops with high oil yield. Here, we described a simple and efficient method for constructing a normalized cDNA library from a high oil content cultivar of sesame Zhongzhi 14, during its oil accumulation stages. It combined switching mechanism at 5?end of RNA transcript (SMART) technique and duplex-specific nuclease (DSN) normalization methods. Double-stranded cDNAs were synthesized from mRNAs, processed by normalization and Sfi I restriction endonuclease, and finally the cDNAs were ligated to pDNR-LIB vector. The ligation mixture was transformed into Escherichia coli DH10B by electroporation. The capacity of the library was 1.0?06 clones in this library. Gel electrophoresis results indicated the fragments ranged from 700 to 2 000 bp, with the average size of 1 800 bp. Random picking clones showed that the recombination rate was 100%. The results showed that the cDNA library constructed successfully was a full-length library with high quality, and could be used to screen the genes related to development of oil synthesis. 展开更多
关键词 DSN full-length library NORMALIZATION oil accumulation Sesamue indicum Zhongzhi 14 cDNA library switching mechanism smarttm
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