受条斑病菌侵染的水稻cDNA文库构建

提取经条斑病菌（Xanthomonas oryzae pv．oryzicola）侵染诱导后的水稻mRNA，利用SMART^TM技术于载体pGADT7-SfiAB上构建了水稻cDNA文库。检测发现，文库中含有水稻病程相关蛋白基因OsPR—1a、OsPR—1b和PAL。随机提取cDNA文库克隆的质粒，酶切分析发现，该cDNA文库的插入片段分布在500～2000bp之间，平均大小约为1kb，重组率达95％。上述结果表明，水稻受条斑病菌侵染的cDNA文库质量较好，这为研究条斑病菌致病性因子与水稻互作机制奠定了工作基础。

云南疣粒野生稻部分cDNA片段的分离和注释

从疣粒野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择120个菌样进行测序,获得的95条序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等软件进行序列分析,结果为:与栽培稻日本晴序列比较匹配碱基数>400 bp的占27.37%;确定可阅读框(>100 bp,具有起始和终止密码子)的占90%;与拟南芥的功能基因比较,相似性大于60%的有46个;确定功能、代谢过程和编码蛋白部位的cDNA片段分别有34个、31个和31个.

云南元江普通野生稻cDNA文库注释

从元江普通野生稻cDNA扩增文库中随机挑取500个噬菌斑,通过载体环化,选择115个菌样进行测序,获得的序列,分别采用Blast、ORFfinder、UniGene和EntrezGene系统等生物信息分析软件对这些序列进行分析,结果为:与栽培稻(Oryza sativa(japonica cultivar-group))序列比较匹配碱基数>400bp的占48.45%;确定可阅读框(>100bp,具有起始和终止密码子)的占70%;与拟南芥的功能基因比较,相似性大于60%的有38个;确定功能、代谢过程和编码蛋白部位的cDNA片段分别有17个、16个和24个。