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东方蜜蜂微孢子虫染色体结构维持(SMC)蛋白的分子特性与系统进化分析
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作者 钱加珺 张文德 +7 位作者 张佳欣 赵萧 赵浩东 高旭泽 朱乐冉 陈大福 付中民 郭睿 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期556-562,共7页
【目的】解析东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae染色体结构维持(Structural maintenance of chromosome,SMC)蛋白的分子特性,鉴定东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的SMC的保守基序和结构域,并进行系统进化分析,旨在丰富东方蜜蜂微孢子虫SMC的... 【目的】解析东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae染色体结构维持(Structural maintenance of chromosome,SMC)蛋白的分子特性,鉴定东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的SMC的保守基序和结构域,并进行系统进化分析,旨在丰富东方蜜蜂微孢子虫SMC的基本信息,为功能研究的深入开展提供依据。【方法】使用Expasy网站的相关软件预测和分析SMC的理化性质、信号肽、磷酸化位点、二级结构和三级结构,利用MEME软件鉴定东方蜜蜂微孢子虫和其他物种SMC的保守基序,采用TBtools软件鉴定东方蜜蜂微孢子虫和其他物种SMC的结构域,通过Mega 11.0软件采用邻接法构建东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的SMC系统进化树。【结果】东方蜜蜂微孢子虫SMC包含1102个氨基酸,分子式为C_(5787)H_(9418)N_(1526)O_(1771)S_(41),相对分子质量约130020,脂溶系数为93.49,等电点为8.28,平均亲水系数为−0.740,亲水氨基酸多于疏水氨基酸,不含典型信号肽;包含50个丝氨酸磷酸化位点、26个酪氨酸磷酸化位点及28个苏氨酸磷酸化位点;包含787个α−螺旋、106条β−折叠、49个β−转角及160个无规则卷曲;可同时定位于细胞核、细胞质和线粒体。在东方蜜蜂微孢子虫、海伦脑炎微孢子虫Encephalitozoon hellem、麦格水蚤汉氏孢虫Hamiltosporidium magnivora、颗粒病微孢子虫Nosema granulosis、康氏泰罗汉孢虫Thelohania contejeani、菲尼斯毕罗酵母Piromyces finnis、指间毛廯菌Trichophyton interdigitale、紫色毛廯菌Trichophyton violaceum、发廯菌Trichophyton tonsurans和黑曲霉Aspergillus melleus的SMC中预测到相同的9个保守基序;东方蜜蜂微孢子虫和上述其他9个物种的SMC中均含有1个SMC_N结构域和1个SMC_hinge结构域。进一步分析发现,东方蜜蜂微孢子虫与菲尼斯毕罗酵母的SMC序列相似性最高(61.96%),与康氏泰罗汉孢虫的SMC序列相似性最低(34.73%);东方蜜蜂微孢子虫与颗粒病微孢子虫的SMC聚为一支,置信度达到99%,进化距离最近。【结论】本研究明确了东方蜜蜂微孢子虫SMC的分子特性,丰富了SMC的基本信息,并揭示SMC在东方蜜蜂微孢子虫和其他微孢子虫中具有较高的保守性,为功能研究的深入开展提供了依据。 展开更多
关键词 微孢子虫 东方蜜蜂微孢子虫 染色体结构维持(smc)蛋白 生物信息学 分子特性 系统进化
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XCAP-C-like Protein Existing in Nuclei and Chromosomes of Allium sativa
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作者 王岩 邢苗 阎石 《Acta Botanica Sinica》 CSCD 2002年第1期29-33,共5页
In studying the XCAP-C-like protein in the root meristematic cells of Allium sativa L., the nuclei were isolated from the cells and the nuclear matrices prepared. A 165 kD polypeptide, which is equivalent to XCAP-C in... In studying the XCAP-C-like protein in the root meristematic cells of Allium sativa L., the nuclei were isolated from the cells and the nuclear matrices prepared. A 165 kD polypeptide, which is equivalent to XCAP-C in molecular weight, was demonstrated in the nuclei by SDS-PAGE, and was then proved to be an XCAP-C-like protein by Western blot using an anti-XCAP-C antiserum, but neither the polypeptide nor the XCAP-C-like protein was detected in die nuclear matrix. The nuclei, Chromosomes and chromosome scaffolds were observed to emanate strong, specific fluorescence after labeled with the anti-XCAP-C antiserum and an FITC-conjugated secondary antibody, indicating their containment of the XCAP-C-like protein. It was confirmed by viewing with immunoelectron microscopy that the gold particles representing the localization of the XCAP-C-like protein were found to be mainly distributed in the condensed chromatin regions of the nuclei and chromosomes. 展开更多
关键词 Allium saliva smc protein XCAP-C-like protein nucleus chromosome
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真核生物集缩素SMC2/SMC4异二聚体的结构解析研究进展 被引量:2
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作者 王洪振 杨斯涵 李桂英 《中国细胞生物学学报》 CAS CSCD 2018年第3期439-447,共9页
真核生物集缩素(condensin)的主要作用是在细胞周期过程中调控染色体的动态变化。它是一种含5个亚基的蛋白质,由1个起核心催化作用的SMC2(structure maintenance of chromosomes 2)/SMC4异二聚体和3个起调节作用的非SMC亚基组成。目前,... 真核生物集缩素(condensin)的主要作用是在细胞周期过程中调控染色体的动态变化。它是一种含5个亚基的蛋白质,由1个起核心催化作用的SMC2(structure maintenance of chromosomes 2)/SMC4异二聚体和3个起调节作用的非SMC亚基组成。目前,关于集缩素中SMC2/SMC4异二聚体的体内构象和分子作用机制仍不清楚。最近,对SMC2/SMC4异二聚体的结构解析取得许多新进展。该文在简要介绍SMC蛋白的基本结构、真核生物集缩素的发现、真核生物集缩素的结构组成的基础上,对近年来SMC2/SMC4异二聚体的结构解析的研究进展作一综述,以期为相关研究提供参考。 展开更多
关键词 smc蛋白 smc2/smc4异二聚体 集缩素 结构解析
原文传递
SMC蛋白在有丝分裂染色体集缩中的作用研究进展 被引量:2
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作者 王洪振 程军 刘春明 《吉林师范大学学报(自然科学版)》 2007年第1期71-73,共3页
SMC蛋白是新近发现的一种重要的染色体非组蛋白,研究发现SMC蛋白在大多数生物中普遍存在,而且SMC蛋白在有丝分裂染色体集缩中起着非常重要的作用。本文介绍了SMC蛋白的结构特点。并简要综述了SMC蛋白在有丝分裂染色体集缩中的作用的研... SMC蛋白是新近发现的一种重要的染色体非组蛋白,研究发现SMC蛋白在大多数生物中普遍存在,而且SMC蛋白在有丝分裂染色体集缩中起着非常重要的作用。本文介绍了SMC蛋白的结构特点。并简要综述了SMC蛋白在有丝分裂染色体集缩中的作用的研究进展. 展开更多
关键词 smc蛋白 集缩素 有丝分裂染色体集缩
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