吉马烯A合酶的同源模建及分子对接

在吉马烯A合酶的催化作用下,法尼基焦磷酸(farnesyl pyrophosphate,FPP)可生成抗癌药物β-榄香烯.为了提高β-榄香烯的产量,采用分子模拟和对接的方法,分析吉马烯A合酶活性位点的关键氨基酸,以期获得酶活高、产物单一的吉马烯A合酶.以加拿大一枝黄花(Solidago canadensis)中吉马烯A合酶(GenBank:AJ304452.1,Sc-GAS)为优化对象,首先,使用MODELLER 9.2、InsightⅡ的Lib Dock、Calculate Mutation Energy、Build Mutants等程序对其进行同源模建、分子对接及虚拟突变体的构建,然后基于SNAP2饱和诱变及氨基酸的ConSurf分析氨基酸的改变对吉马烯A合酶功能的影响.研究结果表明,有23个氨基酸对吉马烯A合酶的活性有重要作用,有4组单突变能增强吉马烯A合酶的热稳定性及与FPP结合的亲和力.