SNF2家族新成员Ercc6l的cDNA克隆与表达分析(英文)

SNF2家族蛋白在基因组复制、修复与表达中具有重要作用 .报道了SNF2家族新成员Ercc6l (excisionrepaircross complementingrodentrepairdeficiency,complementationgroup 6 like)的cDNA克隆、特性与表达分析 .通过表达序列标签 (EST)搜索和组装 ,获得了cDNA全长 4 0 0 2bp的新基因Ercc6l (GenBankAcc .NoAY172 6 88) ,然后通过RT PCR在小鼠胚胎心脏成功克隆了该基因 .Ercc6l在小鼠基因组中由两个外显子和一个内含子组成 ,定位于X染色体 ,最大开放阅读框 (ORF)编码一个含 12 4 0个氨基酸的假定蛋白质 .该假定蛋白质含有SNF2蛋白的 8个保守基序 (SNF2结构域 ) .通过与SNF2家族各亚家族的成员进行多重比对 ,初步确认Ercc6l属于ERCC6亚家族成员 .将Ercc6l编码区克隆到pEGFP C3然后转染HeLa ,3T3和B16细胞 ,融合蛋白主要定位于胞浆 .BLAST搜索检索出 6 9条小鼠EST与Ercc6l同源 ,这些EST主要来自胚胎和肿瘤组织 .对小鼠不同发育时期的多种组织进行RT PCR ,发现Ercc6l在胚胎期强表达 ,出生产后表达显著下调 .

SRCAP和CEACAM5蛋白水平对结肠癌根治术后复发转移的预测价值

目的探讨Snf2相关CREBBP激活蛋白(SRCAP)和癌胚抗原相关细胞黏附分子5(CEACAM5)蛋白水平对结肠癌根治术后复发转移的预测价值。方法选择2016年12月至2019年12月在同济大学附属杨浦医院接受腹腔镜结肠癌根治术治疗的100例结肠癌患者纳入研究。所有受试者在腹腔镜下采集结肠癌组织及癌旁正常结肠黏膜组织。采用免疫组织化学染色法测定SRCAP和CEACAM5的表达水平。采用电话和门诊复查的方式对患者进行随访,记录复发转移情况并计算无病进展生存率(PFS)。结果结肠癌组织中SRCAP和CEACAM5蛋白阳性表达率分别高于癌旁正常结肠黏膜组织,差异均有统计学意义(P均<0.05)。肿瘤直径≥3 cm、TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期、浸润侵及浆膜层、高分化、有淋巴结转移、有神经侵犯的结肠癌患者组织中SRCAP蛋白的阳性表达率较高,肿瘤直径≥3 cm、TNM分期为Ⅲ~Ⅳ期、浸润侵及浆膜层、有淋巴结转移、有神经侵犯的结肠癌患者组织中CEACAM5蛋白的阳性表达率较高,差异均有统计学意义(P均<0.05)。SRCAP和CEACAM5蛋白阳性表达者的PFS均低于阴性表达者(P均<0.05)。Cox回归模型分析结果显示,TNM分期、分化程度、淋巴结转移、SRCAP蛋白水平、CEACAM5蛋白水平是结肠癌根治术后复发转移的危险因素(P均<0.05)。ROC曲线分析结果显示,SRCAP蛋白水平预测结肠癌根治术后复发转移的敏感度、特异度、曲线下面积(AUC)分别为76.34%、73.98%和0.723(95%CI:0.702~0.853),CEACAM5蛋白水平预测结肠癌根治术后复发转移的敏感度、特异度、AUC分别为73.08%、71.28%和0.696(95%CI:0.678~0.706),两者联合检测预测结肠癌根治术后复发转移的敏感度、特异度、AUC分别为79.74%、77.72%和0.789(95%CI:0.741~0.832),均高于单项检测(P均<0.05)。结论结肠癌组织中SRCAP和CEACAM5蛋白阳性表达率较高,且SRCAP和CEACAM5蛋白阳性表达者的术后复发转移率较高,其可作为结肠癌根治术后复发转移的预测指标。

发育相关基因Ercc6l的分子克隆与表达分析及其在酒精致畸中的作用

背景与目的 :在GeneBank中筛选新的小鼠发育相关基因 ,研究其在酒精致畸中的作用。材料与方法 :利用EST介导的基因克隆和表达谱分析进行新基因克隆、表达和同源性分析 ;利用RT-PCR、绿色荧光蛋白标记基因转染、全胚胎原位杂交、石蜡切片原位杂交和Northern杂交进行新基因的验证、亚细胞和组织定位及其在酒精致畸中的表达变化研究。结果 :成功克隆小鼠基因Ercc6l,其在胚胎期正常组织中强表达 ,在新生鼠表达明显减弱 ,在成年鼠几乎不表达。酒精染毒体内、外实验均显示畸变胚胎Ercc6l的表达显著降低。结论 :Ercc6l是小鼠胚胎发育相关基因 ,同时是酒精致畸作用的分子靶点。