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类别不平衡的分类方法及在生物信息学中的应用
被引量:
26
1
作者
邹权
郭茂祖
+1 位作者
刘扬
王峻
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2010年第8期1407-1414,共8页
提出一种处理正反例不平衡的分类方法,以解决生物信息学中的snoRNA识别、microRNA前体判别、SNP位点的真伪识别等问题.利用集成学习的思想,将反例集均匀分割并依次与正例集组合,得到一组类别平衡的训练集.然后对每个训练集采用不同原理...
提出一种处理正反例不平衡的分类方法,以解决生物信息学中的snoRNA识别、microRNA前体判别、SNP位点的真伪识别等问题.利用集成学习的思想,将反例集均匀分割并依次与正例集组合,得到一组类别平衡的训练集.然后对每个训练集采用不同原理的分类器进行训练,最后投票表决待测样本.为了避免弱分类器影响投票效果,结合AdaBoost思想,将每个分类器训练中产生的错误样本加入到下2个分类器的训练集中,既避免了AdaBoost的反复训练,又有效地利用投票机制遏制了弱分类器的影响.5组UCI测试数据和3组生物信息学实验证明了它在处理类别不平衡分类问题时的优越性.
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关键词
生物信息学
类别不平衡
非编码RNA识别
snp位点鉴别
分类
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职称材料
题名
类别不平衡的分类方法及在生物信息学中的应用
被引量:
26
1
作者
邹权
郭茂祖
刘扬
王峻
机构
哈尔滨工业大学计算机科学与技术学院
出处
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2010年第8期1407-1414,共8页
基金
国家自然科学基金项目(60741001
60871092
+2 种基金
60932008)
黑龙江省杰出青年科学基金项目(JC200611)
黑龙江省自然科学基金重点项目(ZJG0705)~~
文摘
提出一种处理正反例不平衡的分类方法,以解决生物信息学中的snoRNA识别、microRNA前体判别、SNP位点的真伪识别等问题.利用集成学习的思想,将反例集均匀分割并依次与正例集组合,得到一组类别平衡的训练集.然后对每个训练集采用不同原理的分类器进行训练,最后投票表决待测样本.为了避免弱分类器影响投票效果,结合AdaBoost思想,将每个分类器训练中产生的错误样本加入到下2个分类器的训练集中,既避免了AdaBoost的反复训练,又有效地利用投票机制遏制了弱分类器的影响.5组UCI测试数据和3组生物信息学实验证明了它在处理类别不平衡分类问题时的优越性.
关键词
生物信息学
类别不平衡
非编码RNA识别
snp位点鉴别
分类
Keywords
bioinformatics
class imbalance
ncRNA identification
mining
snp
from EST
classification
分类号
TP18 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
类别不平衡的分类方法及在生物信息学中的应用
邹权
郭茂祖
刘扬
王峻
《计算机研究与发展》
EI
CSCD
北大核心
2010
26
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