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《科学》发表第一份不同人群的SNP图谱
1
作者
史季忠
《科技中国》
2005年第4期55-55,共1页
人与人之间的基因组序列99.9%都是一样的,只有大约千分之一的序列有所不同,但正是这些比例微小的差别造就了每个人的遗传特征,导致了人与人之间对环境、疾病和药物等的不同反应。
关键词
《科学》
杂志
人群
遗传差异
snp图谱
“单核苷酸多态性”
下载PDF
职称材料
利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位
被引量:
3
2
作者
周小静
董洋
+9 位作者
张芳
任小平
陈玉宁
黄莉
陈伟刚
廖伯寿
雷永
晏立英
罗怀勇
姜慧芳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期750-756,共7页
为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对...
为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对3个单环境及联合环境下出仁率进行QTL定位,共检测到28个QTL。各QTL解释的表型变异为3.98%-13.77%,LOD值介于2.59-7.36之间,其中6个为贡献率大于10.0%的主效QTL。Meta-QTL分析鉴定出7个在不同环境下都能稳定表达的一致性QTL。其中一致性QTL cqSPA4b在3个单环境和联合环境中都能检测到,一致性QTL cq SPB6a在3个单环境中能检测到,且平均贡献率为11.86%。与前人的研究结果比较发现,cq SPA5b与另外两个不同群体鉴定出的A5染色体上出仁率QTL区间相似。本研究结果为出仁率QTL的精细定位及分子标记辅助育种奠定了良好基础。
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关键词
花生
出仁率
QTL定位
snp
标记
图谱
meta-QTL分析
下载PDF
职称材料
基因组单核苷酸多态性图谱构建方法研究进展
被引量:
4
3
作者
季华员
张学良
+3 位作者
刘林秀
谢明贵
武艳平
杨群
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2010年第8期59-63,共5页
自人类基因组计划(HGP)开展以来,现代生物学上相继实施了一系列重大的工程项目,第三代遗传图谱的构建和相关的研究工作仍在继续,而单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)在其中发挥着重要作用。面对征服人类疾病和生物学...
自人类基因组计划(HGP)开展以来,现代生物学上相继实施了一系列重大的工程项目,第三代遗传图谱的构建和相关的研究工作仍在继续,而单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)在其中发挥着重要作用。面对征服人类疾病和生物学本身研究的迫切需要,基因组SNP图谱的构建方法不断得到完善和提高,作者从池DNA技术、物理学方法和生物信息学方法3个方面对其作出阐述。
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关键词
基因组
snp图谱
单核苷酸多态性
构建方法
下载PDF
职称材料
传递/不平衡检验TDT(Transmission/Disequilibrium Test)
被引量:
2
4
作者
倪鹏生
崔静
沈福民
《国外医学(遗传学分册)》
2000年第2期82-86,共5页
本文系统的综述了传递 /不平衡检验 (TDT)的理论依据 ,使用的方法 ,应用范围和最新进展 ,为在国内进一步开展这方面的研究提供一些线索。
关键词
传递
不平衡检验
snp图谱
TDT
遗传病
基因诊断
下载PDF
职称材料
题名
《科学》发表第一份不同人群的SNP图谱
1
作者
史季忠
出处
《科技中国》
2005年第4期55-55,共1页
文摘
人与人之间的基因组序列99.9%都是一样的,只有大约千分之一的序列有所不同,但正是这些比例微小的差别造就了每个人的遗传特征,导致了人与人之间对环境、疾病和药物等的不同反应。
关键词
《科学》
杂志
人群
遗传差异
snp图谱
“单核苷酸多态性”
分类号
Q987 [生物学—遗传学]
下载PDF
职称材料
题名
利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位
被引量:
3
2
作者
周小静
董洋
张芳
任小平
陈玉宁
黄莉
陈伟刚
廖伯寿
雷永
晏立英
罗怀勇
姜慧芳
机构
中国农业科学院油料作物研究所
全国农业技术推广服务中心
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第6期750-756,共7页
基金
国家自然科学基金(31301362
31471534
+1 种基金
31271764)
农作物种质资源保护项目(NB2010-2130135-28B)
文摘
为进一步明确出仁率遗传基础,本研究以出仁率性状有显著差异的两亲本中花5号和ICGV 86699衍生的RIL群体为材料,以其表型数据结合栽培花生第一张基于SNP标记的高密度遗传图谱,采用Windows QTL Cartographer V.2.5软件的复合区间作图法,对3个单环境及联合环境下出仁率进行QTL定位,共检测到28个QTL。各QTL解释的表型变异为3.98%-13.77%,LOD值介于2.59-7.36之间,其中6个为贡献率大于10.0%的主效QTL。Meta-QTL分析鉴定出7个在不同环境下都能稳定表达的一致性QTL。其中一致性QTL cqSPA4b在3个单环境和联合环境中都能检测到,一致性QTL cq SPB6a在3个单环境中能检测到,且平均贡献率为11.86%。与前人的研究结果比较发现,cq SPA5b与另外两个不同群体鉴定出的A5染色体上出仁率QTL区间相似。本研究结果为出仁率QTL的精细定位及分子标记辅助育种奠定了良好基础。
关键词
花生
出仁率
QTL定位
snp
标记
图谱
meta-QTL分析
Keywords
Cultivated peanut
Shelling percentage
QTL mapping
snp
- based map
Meta- QTL analysis
分类号
S565.203 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
基因组单核苷酸多态性图谱构建方法研究进展
被引量:
4
3
作者
季华员
张学良
刘林秀
谢明贵
武艳平
杨群
机构
江西省农业科学院畜牧兽医研究所
江西省南昌市动物疫病预防控制中心
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2010年第8期59-63,共5页
基金
江西省农业科学院青年基金资助
文摘
自人类基因组计划(HGP)开展以来,现代生物学上相继实施了一系列重大的工程项目,第三代遗传图谱的构建和相关的研究工作仍在继续,而单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)在其中发挥着重要作用。面对征服人类疾病和生物学本身研究的迫切需要,基因组SNP图谱的构建方法不断得到完善和提高,作者从池DNA技术、物理学方法和生物信息学方法3个方面对其作出阐述。
关键词
基因组
snp图谱
单核苷酸多态性
构建方法
Keywords
genome
snp
map
single nucleotide polymorphisms (
snp
)
construction method
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
传递/不平衡检验TDT(Transmission/Disequilibrium Test)
被引量:
2
4
作者
倪鹏生
崔静
沈福民
机构
上海医科大学妇幼卫生教研室
上海医科大学流行病学教研室
出处
《国外医学(遗传学分册)》
2000年第2期82-86,共5页
文摘
本文系统的综述了传递 /不平衡检验 (TDT)的理论依据 ,使用的方法 ,应用范围和最新进展 ,为在国内进一步开展这方面的研究提供一些线索。
关键词
传递
不平衡检验
snp图谱
TDT
遗传病
基因诊断
分类号
R596 [医药卫生—内科学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
《科学》发表第一份不同人群的SNP图谱
史季忠
《科技中国》
2005
0
下载PDF
职称材料
2
利用SNP标记高密度遗传图谱进行花生出仁率QTL定位
周小静
董洋
张芳
任小平
陈玉宁
黄莉
陈伟刚
廖伯寿
雷永
晏立英
罗怀勇
姜慧芳
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
3
下载PDF
职称材料
3
基因组单核苷酸多态性图谱构建方法研究进展
季华员
张学良
刘林秀
谢明贵
武艳平
杨群
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2010
4
下载PDF
职称材料
4
传递/不平衡检验TDT(Transmission/Disequilibrium Test)
倪鹏生
崔静
沈福民
《国外医学(遗传学分册)》
2000
2
下载PDF
职称材料
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