家畜复杂性状稀有变异遗传研究

本研究通过模拟和基因组数据,使用群体遗传模型来预测稀有变异选择的预期特征,并比较不同SNP年龄估计方法的结果之间的异同。Wright-Fisher模型框架下,随着初始基因频率的增加,基因被固定的概率上升;与有效群体缩减Wright-Fisher模型相比,一般Wright-Fisher模型和有效群体扩增Wright-Fisher模型的基因被固定概率更高,但初始基因频率较高时,3种模型无明显差异。稀有变异基因的遗传方式为共显性、完全显性时,稀有变异基因可以在群体中达到很高的频率或固定,其中完全显性时基因频率在群体中达到0.5以上的概率更高;稀有变异基因的遗传方式为共显性时,不同有效群体含量随选择系数变化的规律与理论预测基本相同。SNP年龄估计依据不同假设条件,往往有不同估计结果。