东北狍SNRPB基因cDNA克隆及其生物信息学分析

为了初步探索东北狍(Capreolus pygargus)小核糖核蛋白B(small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1,SNRPB)基因的结构与功能,试验以东北狍狍茸顶端组织cDNA为模板,采用RT-PCR和分子克隆技术成功获得包含东北狍SNRPB基因全部编码区的cDNA序列,对该基因的编码序列进行同源性分析和构建系统进化树,并初步预测和分析其编码氨基酸序列的结构特征。结果表明:东北狍SNRPB基因与白尾鹿德克萨斯亚种(Odocoileus virginianus texanus)的亲缘关系最近,与小鼠(Mus musculus)的亲缘关系最远,基因编码序列全长723 bp,编码240个氨基酸,蛋白质相对分子质量为24.62。SNRPB蛋白是一种能在细胞核内发挥生物学作用的不稳定碱性亲水蛋白,具备一个由内向外的跨膜螺旋结构,没有信号肽,含有11个磷酸化位点和1个乙酰化位点。蛋白质的二级结构由无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-转角构成,所占比例分别为64.17%、18.75%、12.08%、5.00%。SNRPB蛋白氨基酸序列的N端含有LSM蛋白家族的Sm_B结构域,上有RNA结合位点,可参与前体mRNA剪接、端粒复制和mRNA降解等生物途径。

基于Oncomine数据库分析SNRPB基因在乳腺癌中的表达及临床意义

目的:研究小核糖体核蛋白B(small nuclear ribonucleoprotein polypeptides B and B1,SNRPB)在乳腺癌中的表达及临床意义。方法:运用Oncomine数据库搜索乳腺癌与SNRPB基因相关的数据,通过Kaplan-Meier Plotter数据库分析SNRPB基因与乳腺癌患者预后的关系。结果:Oncomine数据库中SNRPB基因癌组织/正常组织表达量分析结果共有414个,在癌组织中显著高表达109个,低表达3个。其中13个分析结果显示SNRPB在乳腺癌组织(包括6个侵袭性乳腺癌分析结果)中显著高表达,低表达的分析结果为1个。运用Kaplan-Meier Plotter数据库分析结果显示,高表达SNRPB的乳腺癌患者其总体生存率(OS)、无复发生存率(PFS)、无远处转移生存率(DMFS)显著低于低表达SNRPB的乳腺癌患者(P<0.05)。结论:SNRPB基因在乳腺癌中高表达,可以作为有效的生物标志物预测乳腺癌患者转移的发生及判断预后,可为乳腺癌的靶向治疗提供依据。

环状RNA FBXO11靶向miR-376a-3p/SNRPB轴调控胃癌SNU-1细胞的增殖与凋亡

目的:探讨环状RNA FBXO11(circFBXO11)调控miR-376a-3p/小核糖核蛋白多肽B基因(SNRPB)轴对胃癌细胞增殖与凋亡的影响。方法:选取2018年1月至2019年1月华北理工大学附属医院肿瘤外科30例手术切除的胃癌患者的癌和癌旁组织标本,免疫组化染色法检测胃癌组织中SNRPB蛋白阳性表达率,qPCR法检测胃癌组织、胃癌细胞系SNU-1、AGS及HS-746T和胃黏膜细胞GES1中circFBXO11、miR-376a-3p和SNRPB mRNA的表达水平。用双荧光素酶报告基因实验验证circFBXO11与miR-376a-3p、miR-376a-3p与SNRPB之间的靶向关系。将si-NC、si-circFBXO11、miR-NC、miR-376a-3p、si-SNRPB、si-circFBXO11+anti-miR-NC、si-circFBXO11+anti-miR-376a-3p、si-circFBXO11+pcDNA-NC、si-circFBXO11+pcDNA-SNRPB等分别转染进SNU-1细胞,用CCK-8法、流式细胞术以及WB法分别检测细胞的增殖活力、凋亡率以及SNRPB、cyclin D1和C-caspase-3蛋白的表达水平。结果:与癌旁组织比较,胃癌组织中circFBXO11表达水平显著升高、SNRPB蛋白阳性率升高、miR-376a-3p表达显著降低(均P<0.01);与GES1细胞比较,胃癌细胞中circFBXO11和SNRPB表达水平显著升高、miR-376a-3p表达水平显著降低(均P<0.01)。circFBXO11靶向负调控miR-376a-3p表达,miR-376a-3p靶向负调控SNRPB表达。抑制circFBXO11表达或过表达miR-376a-3p或抑制SNRPB表达后,SNU-1细胞的增殖活力降低、凋亡率升高(均P<0.01)。抑制miR-376a-3p表达可部分逆转抑制circFBXO11对SNU-1细胞增殖和凋亡的作用(均P<0.01)。过表达SNRPB可部分逆转抑制circFBXO11对SNU-1细胞增殖和凋亡的影响(均P<0.01)。结论:胃癌组织中circFBXO11呈高表达,抑制circFBXO11表达可抑制胃癌细胞增殖并诱导细胞凋亡,其机制与调控miR-376a-3p/SNRPB通路相关。

基于蛋白互作网络分析SNRPB在肝癌发生中的作用

本研究旨在探讨SNRPB影响肝细胞癌发生的分子机制及其与患者预后的关系。利用Oncomine数据库分析SNRPB基因在肝细胞癌中的表达水平,从GEO数据库GSE14520中筛选出与SNRPB共表达的基因,STRING构建蛋白互作网络,Cytoscape识别网络模块进行聚类分析,Kaplan-Meier法分析SNRPB基因表达与肝细胞癌预后的关系。Oncomine数据库中3个数据集均显示SNRPB在肝细胞癌组织中高表达,SNRPB共表达基因构建的蛋白互作网络中识别出3个网络模块,GO分析发现网络模块中涉及基因主要参与有丝分裂细胞周期和G1/S有丝分裂细胞周期的转变等生物过程,KEGG分析发现网络模块中涉及基因主要参与细胞周期和DNA复制等信号通路,此外肝细胞癌中SNRPB基因表达水平与患者预后相关。上述结果表明,SNRPB可能通过调控细胞周期信号通路影响肝细胞癌的发生,可以作为一个候选的肝细胞癌临床预后标志物和潜在的治疗靶点。

枪口火光探测系统研究

针对枪口火光探测系统中存在的探测灵敏度低及系统信噪比低的主要问题,论文基于PBS探测器主要研究火光探测系统中的前端探测系统。建立了探测器遇到火光时的数学模型,通过分析探测器前端的电压变化量,求得有最大电压变化时的最佳匹配电阻,以便提高探测灵敏度与系统的信噪比。论文根据选择的PBS探测器,经过对12.7mm步枪枪口火光的探测证明了最佳匹配电阻数学模型的正确性。