三江源地区鼠疫耶尔森菌CRISPR基因分型及流行特征研究

目的了解三江源地区鼠疫菌株分布情况,进行规律间隔成簇短回文重复序列(Clustered regularly in-terspaced short palindromic repeats)基因分型研究,为该地区鼠疫疫源地菌株鉴定溯源、科学防控提供理论依据。方法选取三江源地区310株鼠疫菌提取DNA,分别PCR扩增、测序3个CRISPR的位点YPa、YPb和YPc,所测得CRISPR序列与CRISPR Dictionary数据库最新数据进行比对,鉴定CRISPR spacer阵列并对三江源地区鼠疫菌进行基因分型。对310株鼠疫菌结合CRISPR基因型和分离宿主信息进行统计分析。结果310株鼠疫菌共发现26种spacer,分别为YPa15种、YPb8种、YPc3种;310株鼠疫菌被分成16个不同CRISPR基因型,G22型和G22-a1′型分布于整个三江源地区包括称多县、治多县、玉树市、曲麻莱县、囊谦县、杂多县、玛多县、玛沁县、同仁县、泽库县、共和县、同德县、贵德县;G24型分布于泽库县、玛多县、囊谦县、称多县;G26-a1′型主要分布于共和县、兴海县、贵德县、玛多县、称多县、杂多县,16个基因型归类为7个CRISPR类群:Cb4、Cb4′、Ca7、Ca7′、Ca8、Ca35′、Cc3′。结论三江源地区鼠疫菌CRISPR基因型具有多样性,不同疫源地基因型分布特征显著,且不同菌株基因型存在差异。

血清学检测和基因分型在ABO疑难血型鉴定中的性能评价

目的分析血清学检测和基因分型在ABO疑难血型鉴定中的应用。方法对106例ABO疑难血型实施血清学检测(吸收放散试验)等,同时对其实施基因分型检测(荧光定量PCR试验),以基因测序结果为金标准,评估血清学检测和基因分型所得结果与基因测序一致性,比较两种检查方式灵敏度、特异度。结果以基因测序为金标准,血清学检测所得结果一致性为中度,基因分型检测所得结果一致性很好。通过比较血清学检测和基因分型灵敏度、特异度可知,两种检查方式所得特异度、灵敏度差异有统计学意义,基因分型灵敏度、特异度更高(P<0.05)。结论基因分型检测和血清学检测有各自的优缺点,但总体上来说,基因分型检测具有更高的准确性和可靠性,更快速、高效。

宫颈病变患者HPV基因分型检测及其临床意义分析

目的:分析宫颈病变患者人乳头瘤病毒(HPV)基因分型检测及临床意义。方法:回顾性分析2021年5月—2023年5月泰兴市人民医院收治的125例宫颈病变患者的临床资料,均进行HPV基因分型检测。统计125例宫颈病变患者HPV感染阳性率、HPV基因分型情况(多重感染重复计算)。比较不同程度宫颈病变患者中HPV感染阳性率、高危型HPV感染阳性率。以病理检查为“金标准”,分析并比较液基薄层细胞学检查(TCT)单独诊断、TCT联合HPV基因分型诊断子宫颈癌的准确度、敏感度、特异度。结果:125例宫颈病变患者中,HPV感染阳性率为51.20%(64/125),HPV感染阳性患者中HPV基因型总数为92株,其中高危型HPV为63.04%(58/92),低危型HPV为36.96%(34/92)。高危型HPV感染阳性率最高的前5位基因型分别为HPV16(16.30%)、HPV18(11.96%)、HPV58(8.70%)、HPV53(6.52%)、HPV51(4.35%);低危型HPV感染阳性率最高的前3位基因型分别为HPV6(8.70%)、HPV11(7.61%)、HPV40(4.35%)。不同级别宫颈病变患者HPV感染阳性率、高危型HPV感染阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。TCT单独诊断子宫颈癌的准确度为78.40%(98/125),敏感度为66.67%(18/27),特异度为81.63%(80/98),阳性预测值为50.00%(18/36),阴性预测值为89.89%(80/89),Kappa值为0.431;TCT联合HPV基因分型诊断子宫颈癌的准确度为88.00%(110/125),敏感度为59.26%(16/27),特异度为95.92%(94/98),阳性预测值为80.00%(16/20),阴性预测值为89.52%(94/105),Kappa值为0.609;TCT联合HPV基因分型诊断子宫颈癌的准确度、特异度均显著高于TCT单独诊断,差异有统计学意义(P<0.05);TCT联合HPV基因分型诊断子宫颈癌的敏感度低于TCT单独诊断,但差异无统计学意义(P>0.05)。结论:宫颈病变类型与HPV基因分型密切相关,且不同宫颈病变恶性程度患者HPV感染阳性率、高危型HPV感染阳性率存在显著差异,因此HPV基因分型用于辅助子子宫颈癌筛查具有重要意义。

血培养大肠埃希菌的耐药特点、毒力基因分布及种系分型

目的检测并分析血培养大肠埃希菌的耐药特点、种系分型和毒力基因分布。方法收集我院2019年1月1日至2020年12月13日连续且非重复血培养大肠埃希菌。采用微量肉汤法测定大肠埃希菌对17种抗菌药物的敏感性;水煮法提取细菌基因组DNA,采用PCR法检测arpA、chuA、yjaA、TspE4C2、ArpAgpE和trpAgpC基因以确定细菌的种系分型;采用多重PCR法检测毒力基因iutA、fimH、fyuA、kpsMTⅡ、cnf1、cvac、hlyA、traT、kpsMTⅢ和PAI;使用卡方检验分析种系分型之间的耐药率及毒力基因分布差异。结果270株血培养大肠埃希菌对头孢曲松、复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林和环丙沙星的耐药率较高,均大于50.0%;对亚胺培南、厄他培南、阿米卡星和哌拉西林/他唑巴坦的敏感性较高,耐药率均低于5.0%。在种系分型方面,最常见的型别是B2型和D型,分别占总数的38.0%和16.2%,而E型和隐分支Ⅰ型占比<1.0%,较为少见。毒力基因分析发现,fimH和fyuA基因的分布率最高,均在99.0%以上,而kpsMTⅢ、hlyA和cvaC 3种基因的分布率较低,均低于20.0%。卡方检验显示,毒力基因iutA、fimH、fyuA、kpsMTⅡ、cnf1、PAI在B2型的分布显著高于非B2型(P<0.05),且B2型携带的iutA、fyuA、kpsMTⅡ、cnf1、PAI基因显著高于D型(P<0.05)。结论在治疗引起血流感染的大肠埃希菌时,应慎用头孢曲松、复方新诺明、氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢唑林和环丙沙星等药物。血流感染的大肠埃希菌为B2型时,应同时进行中段尿培养以确认感染源并监测治疗的成功率。

西藏4个绵羊品种SNP基因分型及群体结构分析

藏系绵羊分布范围广泛,品种资源丰富,目前主要分为三大类群,但藏系绵羊群体结构不清。为分析藏系绵羊SNP位点及群体结构,实验利用Illumina Ovine SNP 600K商业化芯片对西藏阿旺绵羊、岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊等150只藏系绵羊进行了SNP基因分型,并通过PCA和NJ-tree等方法分析了藏系绵羊群体结构。SNP质控结果表明,共有147个个体符合质控条件,共获得456 418个SNP位点。群体结构分析表明,西藏地区的岗巴绵羊、多玛绵羊和霍尔巴绵羊分别聚为一类,而其他地区的藏系绵羊混乱聚集在一起。本实验研究结果为今后西藏当地绵羊遗传资源的鉴定和保护开发利用提供了理论基础和参考依据。

血小板HPA-3,HPA-15基因分型微滴式数字PCR检测体系的构建

目的建立血小板HPA-3,HPA-15基因分型的微滴式数字PCR(ddPCR)高灵敏检测方法,并初步探索应用于孕妇外周血胎儿游离DNA HPA抗原相容性检测的可行性。方法针对HPA-3,HPA-15的SNP突变位点,设计特异性引物及MGB探针,优化ddPCR退火温度及引物浓度等扩增条件,建立最佳反应体系,明确检验程序。对该检测方法进行方法学性能评估包括特异性、灵敏度、重复性和稳定性。利用ddPCR技术对2022年6月至2023年6月67例临床血液标本进行检测,将等位基因分型结果与基因测序结果比较,并对52例母体外周血胎儿游离DNA HPA抗原进行检测。结果检测血小板HPA-3,HPA-15的ddPCR方法,引物及探针特异性良好,HPA-3,HPA-15的最佳退火温度分别为:61.6℃,60.2℃;体系最佳引物浓度分别为:900 nM,700 nM;探针终浓度均为250 nM。拷贝数定量检测范围为:2~20000 copies,检测下限为0.1 copies/μL且线性良好。在低拷贝数标本中,HPA-3及HPA-15实际检测值的批内及批间变异系数(CV)均<5%。对67份人血液标本DNA的HPA-3,HPA-15基因型检测,结果与基因测序结果完全一致。应用于胎母血小板HPA-3,HPA-15基因型检测结果符合预期。结论本研究构建的HPA-3,HPA-15 ddPCR检测体系准确性高,重复性及稳定性较好,灵敏度高,可应用于临床血小板HPA-3,HPA-15基因型供者库的建立、基因配型及胎母血小板相容性检测等。

胰腺癌免疫基因组学分型、特征及其临床意义研究

目的 通过基因组学建立胰腺癌免疫分型,并进一步探讨其免疫特征和临床意义。方法 癌症基因组图谱数据库下载178例胰腺癌患者的基因表达谱及临床特征数据,通过单样本基因集富集分析(ssGSEA)评分对患者进行分组;采用ESTIMATE及CIBERSORT分别评估各胰腺癌免疫分型样本中免疫微环境及免疫细胞的组成;采用Kaplan-Meier绘制生存曲线并对组间差异进行log-rank检验;GSEA鉴定不同免疫分型GO富集通路。结果 根据基质评分、免疫评分和肿瘤纯度将患者分为高、中、低免疫组,三组间预后具有统计学差异。高免疫组所包含的免疫细胞和基质细胞数量最多,肿瘤纯度最低;HLA、PD-L1(CD274)和CTLA4表达明显增高;浆细胞、活化的CD4^(+)记忆性T细胞、CD8^(+)T细胞以及γδT细胞含量最高,而M0巨噬细胞和M2巨噬细胞最少;总生存率明显低于低免疫组患者;抗免疫活性明显升高。结论 胰腺癌免疫分型有助于判断患者的预后,高免疫组患者具有较高的抗免疫活性和较低的生存率。

联合应用基因分型和DH3检测406例女性子宫颈HPV感染分析与临床意义

HPV属于球形无包膜的双链DNA病毒,能特异性引起人体皮肤黏膜的鳞状上皮增殖,可导致多种良恶性病变。HPV高危型持续感染是导致子宫颈癌发生的主要原因,其检测方法多种、多样,各有优缺点。本科室联合应用基因分型和第三代杂交捕获技术定量分型(daltonbio hybrid capture 3,DH3),可以准确检测子宫颈中HPV型别和病毒载量的高低,对子宫颈癌的筛查进行精准分流,现作简要介绍。1材料与方法1.1材料收集2021~2022年我院妇产科门诊和健康管理中心406例女性子宫颈标本,患者年龄18~76岁,中位年龄34岁。

南昌地区血小板供者HLA-A、B和HPA基因多态性分析及分型库的建立

目的通过对血小板捐献者HLA-A、B和HPA 1-6,10,15,21基因位点的检测,分析基因位点分布特点,加强南昌地区血小板供者资料库的建设,保障临床血小板输注的有效性、及时性,提高临床输血疗效。方法对南昌地区800位血小板捐献者血样,采用荧光定量PCR的方法,对HLA-A、B位点、HPA 1-6,10,15,21位点进行基因分型,计算基因频率和基因型频率。结果HLA-A、B位点共检出HLA-A、HLA-B等位基因45个,其中HLA-A等位基因16个,频率较高的有A2、A11、A24;检出HLA-B等位基因29个,频率较高的有B13、15、B40、B46。HPA 1-6,10,15,21位点不配合率较高的是HPA3和HPA15,除此之外不配合率均低于10%。结论南昌地区人群与其它汉族地区HPA-HLA基因多态性类似。考虑其它汉族地区基因资料库计算结果和南昌ABO血型分布频率,资料库总人数需要达到7000人才能比较好的满足患者需求。

广州地区259例丙型肝炎病毒患者HCV基因分型研究

目的 了解广州地区丙型肝炎病毒患者的HCV基因型分布情况,为该地区丙型肝炎病毒的预防和诊疗提供依据。方法 选择自2019年9月至2023年4月共259例丙型肝炎病毒患者的HCV基因分型的结果,分析比较不同年龄、性别和年度各基因型感染率的差异。结果 共纳入259例患者,最常见的基因型为6a型和1b型,占42.47%和42.08%,与其他亚型差异有统计学意义(P<0.05)。其余依次为3a型占6.18%,2a型占4.63%,3b型占4.25%,2b型占0.39%,未发现亚型混合感染。1b型,青年人群(41.86%)、中年人群(31.447%)分别低于老年人群的71.93%;6a型,青年人群(44.186%)、中年人群(51.572%)分别高于老年人群的15.789%,差异有统计学意义(P<0.05)。女性1b型63.077%、2a型10.769%分别高于男性的35.052%和2.577%,女性6a型18.462%低于男性的50.516%,差异有统计学意义(P<0.05)。不同年度各基因型感染率差异无统计学意义。结论 广州地区丙型肝炎病毒患者HCV基因分型以6a型、1b型为主。1b型多见于60岁以上的老年人群和女性,6a型多见于中青年人群及男性。

基于直接TaqMan-PCR的无创检测脂质代谢相关SNP基因分型技术

目的建立一种基于直接TaqMan-PCR的无创多重单核苷酸多态性分型技术用于高通量检测与脂质代谢相关的rs688和rs964184位点,以满足风险人群快速筛查的需求。方法采用提取的DNA对设计的TaqMan探针进行PCR退火延伸温度和扩增程序的优化;将口腔拭子放入样品处理液后进行短暂震荡和离心,取少量上清进行直接qPCR扩增分析;探索探针冻融稳定性和样品保存时间对分型结果的影响。结果本方法仅需对口腔拭子样本简单处理后即可进行qPCR分析,并且可在室温情况下保存4 d。优化后的方法能够较好地区分rs688和rs964184位点的野生纯合子、突变纯合子及杂合子。结论建立了一种快速便捷、高通量、低成本的SNP分型新技术,为大规模筛查携带易感基因的风险人群提供了高效且准确的新方法。

朱鹮源大肠埃希氏菌的耐药性及毒力基因与种系分型检测分析

为了解陕西圈养朱鹮源大肠埃希氏菌耐药性、系统进化分群、毒力基因及耐药基因携带情况,对采集自陕西省周至县32份朱鹮源肛拭子进行肠道细菌分离鉴定,采用微量肉汤稀释法测定9种抗菌药物对分离株的最小抑菌浓度(MIC),PCR检测毒力基因、耐药基因携带情况,采用三重PCR鉴定分离菌株的系统进化分群,并进行小鼠致病性试验。结果显示,在32份朱鹮源肛拭子中分离到大肠埃希氏菌15株,分离率为46.87%;分离菌株对氨苄西林100%耐药,对多西环素、恩诺沙星、头孢噻夫耐药率较高,对美罗培南、替加环素、黏菌素表现较高敏感,耐2种以上抗菌药物的菌株达100%;从分离菌株中检测到blaTEM、blaSHV、blaCTX-M等耐药基因的检出率分别为100%、93.3%、33.3%,phop、tetx3占比较高(66.67%、53.33%),未检测到cfr、tetx4耐药基因;分离菌株携带10种不同的毒力基因,未检测到hlyA、saf、cnf1、iutB、stx1、stx2、papC、FasA等8种毒力基因,其中etrA、aer、hlyE、ompA的检出率最高,均达到93.33%,其他依次为iutA(80%)、fimC(73.33%)、rfc(60%)、ompT(53.33%)、hlyF(46.67%)、Tsh(20%),且检测到9株分离菌株携带的rfc毒力基因。该批朱鹮源大肠埃希氏菌以B2型为主(占53.33%),其次为D型(占33.34%),A型仅占比13.33%,未检测到B1型;小鼠致病性试验表明,小鼠表现较轻的临床症状。结果表明,该批朱鹮源大肠埃希氏菌耐药现象较为严重,毒力基因与耐药基因在该批朱鹮中较流行,与其他动物相比,其种系分型较特殊。研究结果可为朱鹮源大肠杆菌病的防控、治疗及圈养朱鹮的放飞提供参考依据。

赣州市2株人感染猪链球菌2型的毒力基因及多位点序列分型分析

目的 探解赣州市人源猪链球菌的毒力基因携带情况及其多位点序列分型(MLST)型别,从分子水平上为制定相应的防控对策提供科学依据。方法 对近年当地分离自病人的2株临床分离株进行菌株鉴定、菌种特异性基因(16S rRNA)及主要毒力基因(cps2J、mrp、sly、ef、gapdh)的PCR检测、MLST检测和药敏试验。结果 2株临床分离株菌株鉴定和猪链球菌种特异性基因鉴定均为2型猪链球菌,主要毒力基因检测和MLST结果分别为:cps2J+mrp+sly+gapdh+ef+、ST7型和cps2J+mrp-sly+gapdh+ef+、ST1型。结论 赣州市人源2型猪链球菌具有较强致病性。MLST分别归属ST7和ST1型,均为我国人源猪链球菌流行的主要型别,其中ST1基因型为赣州市首次发现。

新疆维吾尔自治区阿克苏地区某屠宰场羊源大肠杆菌MLST分型、耐药性分析和毒力基因检测

[目的]了解新疆维吾尔自治区阿克苏地区屠宰场羊源大肠杆菌的流行情况以及耐药性和毒力基因分布特征。[方法]从阿克苏地区某屠宰场采集健康羊的淋巴结、胴体拭子、粪便样本共30份,使用选择性培养基分离大肠杆菌,然后采用大肠杆菌特异性phoA基因对其进行分子生物学鉴定;利用PCR扩增及测序技术对大肠杆菌分离株进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST);采用K-B纸片扩散法开展分离菌株对抗菌药物的敏感性试验;应用PCR技术检测分离菌株的耐药基因和毒力基因携带情况;使用96孔板微量肉汤法测定分离菌株的生物被膜形成能力。[结果]从30份样本中分离得到14株大肠杆菌,分离率为46.67%;14株分离株分属于10个MLST型别;对复方新诺明(100%)、青霉素(85.71%)和四环素(50.00%)耐药率较高,9株菌具有多重耐药表型(64.29%);在14株大肠杆菌中检测到blaTEM(85.71%)、aph(3′)(71.43%)、tetA(64.29%)、sul1(57.14%)和sul2(57.14%)等12种耐药基因,并且8株菌携带Ⅰ型整合子int-Ⅰ基因(57.14%);在14株大肠杆菌中检测到fimH(100%)、yijP(92.86%)、mat(92.86%)、sheA(92.86%)、stx1(35.71%)和ibeB(28.57%)等10种毒力基因;10株大肠杆菌具有生物被膜形成能力(71.43%)。[结论]该屠宰场羊源大肠杆菌种内分型丰富,具有较强的耐药性,还可形成生物被膜,并且携带多种耐药基因和毒力基因,对动物性食品安全可能存在潜在威胁。

HPV拓展基因分型检测在宫颈癌预防中的临床价值

人乳头瘤病毒(HPV)感染是导致宫颈病变的主要原因,以HPV检测为初筛是宫颈癌筛查的进步。HPV检测特异性低,基于HPV的筛查可能面临很多挑战。HPV拓展基因分型检测通过检测HPV基因型可更早预测持续性宫颈病变的风险,有助于提前采取预防和治疗干预措施,以减少相关疾病的发生,还可有效地区分低风险与高风险患者,以最大限度地优化医疗资源分配。早期进行HPV拓展基因分型检测是宫颈病变未来风险预测和分层的关键,其在宫颈癌预防中具有重要价值。

基于COVID-19相关基因的肝细胞癌分子分型及预后模型构建与验证

目的:基于新型冠状病毒肺炎(COVID-19)相关基因对肝细胞癌进行分子分型,并建立预后模型。方法:收集GeneCard数据库中COVID-19相关基因,分析其在肝细胞癌患者癌与癌旁组织的基因表达量差异,通过一致聚类分析进行分子分型。使用limma包计算不同分子亚型之间差异表达基因并进行功能富集分析。使用R软件包“ESTIMATE”评估不同分子亚型的免疫评分。使用Cox比例风险回归模型和lasso回归构建多基因预后模型,并在其他数据库进行外部验证。结果:基于28个COVID-19相关基因将TCGA的365个肝细胞癌(LIHC)样本分成3个亚型,预后较差的C2亚型具有更高的免疫评分。多因素Cox回归分析结果说明5基因模型是肝细胞癌患者的独立预后危险因素。细胞周期、同源重组等肿瘤相关通路随着风险评分的升高而增加,提示高风险组具有更强的侵袭性。结论:构建了基于COVID-19相关基因的肝细胞癌分子亚型,并开发了预后相关的5基因模型(VEGFA、CD14、CD209、REN、PSMD1)。

影像组学及影像基因组学预测乳腺癌分子分型的研究进展

影像组学可从医学图像中高通量地提取大量影像特征,影像基因组学则侧重于挖掘影像数据与基因组之间的相关性。基于动态对比增强MRI(DCE-MRI)、乳腺X线摄影、乳腺超声等成像技术,影像组学及影像基因组学能够评估乳腺癌的肿瘤异质性及生物学行为,为乳腺癌诊断、疗效评估及预后预测等方面的研究提供了新途径和新思路,尤其在术前无创性地预测乳腺癌分子分型方面显示出极大的潜能。就影像组学及影像基因组学预测乳腺癌分子亚型方面的研究进展予以综述。

新疆驼乳源金黄色葡萄球菌MLST分型与毒力基因检测

为了解驼乳源金黄色葡萄球菌多位点序列分型(multilocus sequence typing, MLST)与毒力基因携带情况,本试验对新疆驼乳源分离得到的金黄色葡萄球菌进行MLST、药物敏感性检测、生物被膜形成能力和溶血性检测以及毒力基因检测。结果表明,金黄色葡萄球菌在健康生驼乳中的分离率为5%(4/80);4株金黄色葡萄球菌分别属于ST8114、ST8119、ST2073和ST130(其中ST8114和ST8119为新的序列型),对12种抗菌药物全部敏感;在4株驼乳源金黄色葡萄球菌中可检测到sei、hla、hlb、clfA和clfB等毒力基因,并且均具有生物被膜形成能力和溶血活性。说明新疆驼乳源金黄色葡萄球菌分型丰富,在宿主致病和食品生产安全等方面存在隐患。本研究可为新疆驼乳源金黄色葡萄球菌的相关研究提供基础试验数据。

基于DNA提取方法优化转基因小鼠基因分型研究

目的:探讨DNA提取方法优化后对转基因小鼠基因分型结果的影响,并比较分析与业内常用试剂盒基因型鉴定结果的差异。方法:在团队前期专利基础上,改进了DNA裂解液的配方和实验流程,并以新型转录因子Musculin和增强型绿色荧光蛋白(enhanced green fluorescent protein,EGFP)转基因小鼠为例,对基因分型结果进行了比较研究和验证。结果:DNA提取时现配裂解液配方为100μL 0.025 N NaOH工作液、160μL 0.5 M EDTA工作液和40 mL超纯水;每个样本加入180μL裂解液,100℃30 min。与相关领域常用的基因分型试剂盒相比,该DNA提取优化方案能够在确保鉴定准确的前提下有效缩短基因分型时间,而且裂解液配置方法简单,反应次数多,步骤更简便,可大幅降低试剂成本和工作量。结论:本研究提供1种适用于转基因小鼠基因分型的经济、简单、可靠的DNA提取技术,具有较好的应用和推广价值。

基因分型方法在结核分枝杆菌分型中的应用进展

结核分枝杆菌(Mtb)基因分型在结核病流行病学研究中应用广泛,对结核病疫情的监测、溯源和防控具有重要意义。Mtb基因分型方法中,IS6110限制性片段长度多态性分型曾经是国际公认的Mtb分型的“金标准”,但其缺陷明显,包括分型能力不足、对样本质量要求高和实验操作繁琐等;间隔区寡核苷酸分型技术操作简便且成本较低,稳定性较高,但其分型能力同样不足,结果可能趋向同型化;长序列多态性分型可以简便、快速鉴别牛型、人型和北京基因型菌株,并且在遗传进化研究中发挥重要作用;可变数目串联重复序列分型的分辨率高、可重复性好,可以根据不同情况优化位点组合,已经成为结核分子流行病学研究的重要方法;单核苷酸多态性分型具有高通量、高分辨率和结果准确性高等优点,在结核分子流行病学上的应用非常广泛,有望成为Mtb分型的下一个金标准。