【目的】探明当归(Angelica sinensis)春化作用相关SOSEKI(SOK)基因的生物学功能,分析其对春化作用和冷冻温度的表达响应。【方法】基于当归种苗春化作用(0℃)和冷冻贮藏(-3℃)后的全长转录组测序,挖掘春化作用基因FLOWERING LOCUS C(FL...【目的】探明当归(Angelica sinensis)春化作用相关SOSEKI(SOK)基因的生物学功能,分析其对春化作用和冷冻温度的表达响应。【方法】基于当归种苗春化作用(0℃)和冷冻贮藏(-3℃)后的全长转录组测序,挖掘春化作用基因FLOWERING LOCUS C(FLC),利用在线生物信息学工具分析其生物学功能,并对表达模式进行qRT-PCR验证。【结果】从当归全长转录组中挖掘到一个含1005个碱基的AsSOK基因,包括FLC及其侧翼基因UPSTREAM OF FLC(UFC)和DOWNSTREAM OF FLC(DFC),亚细胞定位于细胞核;保守基序和系统进化树分析显示,该基因编码的蛋白质含有4个保守基序(motif-2、-4、-5和-6),与黄胡萝卜(Daucus carota subsp.Sativus)中的LOC Dc108213152关系最近,具有相似的结构和位置。基因表达检测发现,AsSOK基因在种苗春化作用过程中表达量显著下降,而在冷冻贮藏过程中显著增加。【结论】第一次挖掘到并全面分析了当归春化作用相关基因AsSOK的生物学功能,为利用基因编辑AsSOK调控当归抽薹开花等研究提了供理论基础。展开更多
文摘【目的】探明当归(Angelica sinensis)春化作用相关SOSEKI(SOK)基因的生物学功能,分析其对春化作用和冷冻温度的表达响应。【方法】基于当归种苗春化作用(0℃)和冷冻贮藏(-3℃)后的全长转录组测序,挖掘春化作用基因FLOWERING LOCUS C(FLC),利用在线生物信息学工具分析其生物学功能,并对表达模式进行qRT-PCR验证。【结果】从当归全长转录组中挖掘到一个含1005个碱基的AsSOK基因,包括FLC及其侧翼基因UPSTREAM OF FLC(UFC)和DOWNSTREAM OF FLC(DFC),亚细胞定位于细胞核;保守基序和系统进化树分析显示,该基因编码的蛋白质含有4个保守基序(motif-2、-4、-5和-6),与黄胡萝卜(Daucus carota subsp.Sativus)中的LOC Dc108213152关系最近,具有相似的结构和位置。基因表达检测发现,AsSOK基因在种苗春化作用过程中表达量显著下降,而在冷冻贮藏过程中显著增加。【结论】第一次挖掘到并全面分析了当归春化作用相关基因AsSOK的生物学功能,为利用基因编辑AsSOK调控当归抽薹开花等研究提了供理论基础。