SPC25在肝细胞癌中的表达和意义——基于数据库分析

目的:检测纺锤体极体组件25同族体(SPC25)在肝细胞癌(HCC)中的表达及预后价值。方法:下载癌症基因组图谱(TCGA)中肝细胞癌组织和正常肝组织样本的基因表达谱数据和临床数据,比较SPC25在肝细胞癌组织和正常肝组织中的表达,并检测SPC25表达水平与患者生存预后的关系。结果:肝细胞癌组织(n=371)的SPC25表达高于正常肝组织(n=50),P<0.000 1。与配对的肝细胞癌组织(n=50)相比,肝细胞癌组织(n=50)的SPC25表达水平明显升高,P<0.000 1。将肝细胞癌患者(n=365)分为SPC25高表达组和低表达组,高表达组与低表达组相比具有更高比例较差的组织病理学分级(G3/G4:69/138,50%vs 61/222,27.5%,P<0.001)、晚期肿瘤(StageⅢ/Ⅳ:44/131,33.6%vs 43/210,20.5%,P=0.003)和死亡(67/140,47.9%vs 63/225,28%,P=<0.001)。Kaplan-Meier法显示,肝细胞癌患者中SPC25高表达组总体生存率显著低于低表达组,P<0.05。亚组分析证实SPC25表达与病理分级和临床分期的相关性。单因素、多因素回归分析显示,SPC25高表达和晚期肿瘤是影响肝细胞癌患者总体生存率的独立预后因素,P<0.05。结论:SPC25在肝细胞癌组织中较正常肝组织高表达,SPC25可能是肝细胞癌患者预后的独立影响因素。

基于机器学习分析的浸润性乳腺癌蛋白质编码基因的标志物鉴定

目的应用随机森林(RF)、极限梯度提升算法(XGBoost)、轻量的梯度提升机(LightGBM)、类别型特征提升(CatBoost)4种机器学习算法分析浸润性乳腺癌转录组表达数据,筛选与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物。方法通过癌症基因组图谱公共数据库下载浸润性乳腺癌的表达数据,采用DESeq2程序包、t检验及Cox单因素分析,对人类浸润性乳腺癌样本中与生存预后相关的差异蛋白质编码基因进行筛选。基于RF、XGBoost、LightGBM、CatBoost等机器学习模型的构建与比较,挖掘浸润性乳腺癌预后相关的蛋白质编码基因标志物,并使用基因表达综合数据库的乳腺癌表达数据作为外部测试进行验证。结果共获得151个与生存预后相关的差异蛋白质编码基因,其中由C3orf80、UGP2和SPC253个基因构建的机器学习模型效果较好。结论筛选出3个(UGP2、C3orf80、SPC25)与浸润性乳腺癌预后相关的生物标志物,为诊断和治疗浸润性乳腺癌提供了新的方向。

肝癌患者血浆Spc25蛋白表达水平及临床意义

目的探讨血浆Spc25蛋白表达在肝癌诊断中价值。方法 34例肝癌(小肝癌15例,非小肝癌19例)患者为肝癌组,28例肝硬化患者为肝硬化组,25例体检健康者为对照组。采用ELISA法检测3组血浆Spc25蛋白和甲胎蛋白(alpha fetoprotein,AFP)水平,分析血浆Spc25蛋白表达水平与肝癌患者临床特征的关系;Pearson法分析肝癌患者血浆Spc25与AFP的相关性,绘制ROC曲线,分析Spc25蛋白诊断肝癌的效能。结果肝癌组血浆Spc25蛋白表达水平[(106.66±64.38)μg/L]高于肝硬化组[(36.97±34.21)μg/L]和对照组[(26.40±25.60)μg/L](P<0.05),肝硬化组与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05);AFP阴性(AFP<20μg/L)肝癌患者血浆Spc25蛋白表达水平[(106.58±59.03)μg/L)]与AFP阳性(AFP≥20μg/L)肝癌患者[(106.86±81.50)μg/L]比较差异无统计学意义(P>0.05);血浆Spc25蛋白表达水平在肝癌有远处转移[(143.80±66.37)μg/L]及TNM分期Ⅲ期[(103.97±62.10)μg/L]、Ⅳ期者[(143.80±66.37)μg/L]高于无远处转移[(86.40±54.66)μg/L]、TNM分期Ⅰ+Ⅱ期者[(74.23±47.59)μg/L](P<0.05);不同年龄、性别、肿瘤直径、肝炎病毒感染状况及有无门静脉血管侵犯肝癌患者血浆Spc25蛋白表达水平比较差异均无统计学意义(P>0.05);Spc25蛋白诊断肝癌和小肝癌的AUC分别为0.830、0.818,与AFP诊断肝癌和小肝癌的AUC(0.836、0.732)比较差异均无统计学意义(P>0.05);Spc25蛋白诊断肝癌的灵敏度(82.4%)、特异度(75.7%)与AFP(73.5%、73.5%)比较差异均无统计学意义(P>0.05);Spc25蛋白诊断小肝癌的灵敏度(80.0%)、特异度(57.1%)与AFP(66.7%、50%)比较差异均无统计学意义(P>0.05);Spc25蛋白诊断AFP阴性肝癌的AUC为0.816,灵敏度为77.8%,特异度43.8%;Spc25蛋白联合AFP诊断肝癌的AUC(0.947)与AFP单独诊断比较差异无统计学意义(P>0.05),诊断小肝癌的AUC(0.962)大于AFP单独诊断(P<0.05)。结论肝癌患者血浆Spc25蛋白表达增高,且其表达与肝癌远处转移、TNM分期有关;Spc25蛋白在AFP阴性肝癌诊断中有一定价值,与AFP联合可提高小肝癌诊断效能。

SPC25在恶性肿瘤中的研究

纺锤体成分25(SPC25)作为Ndc80复合体成员之一,是有丝分裂的重要调节因子,在染色体的分离过程中起着重要作用,同时也是纺锤体组装检查点所必须的,可维持遗传物质精确分配。SPC25异常表达会造成有丝分裂紊乱,导致细胞异常增殖,最终增加恶性肿瘤形成的几率。目前在多种恶性肿瘤中均发现SPC25过表达,研究SPC25在恶性肿瘤中的表达情况与患者预后及各项临床病理参数的相关性,探索SPC25在恶性肿瘤中的发生发展机制,寻求SPC25靶向治疗药物,充分发掘SPC25的应用价值,是为肿瘤患者寻得生机的重要途径。本文就SPC25在细胞分裂中的作用、SPC25在肝癌、肺癌、乳腺癌、前列腺癌和其他肿瘤中的研究及其在非肿瘤性病变中的研究作一综述。