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水稻干尖线虫SPRYSEC基因的克隆及表达定位分析
1
作者
王步勇
王峰
+3 位作者
李丹蕾
马玲
陈俏丽
王博文
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期305-311,共7页
根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用c DNA末端快速扩增技术(RACE法)从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab–SPRYSEC(NCBI登录号为KT188820)。该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框(ORF)。...
根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用c DNA末端快速扩增技术(RACE法)从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab–SPRYSEC(NCBI登录号为KT188820)。该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框(ORF)。预测蛋白编码653个氨基酸,相对分子质量为72 009,理论等电点为4.82,不稳定指数为41.5,属于不稳定性蛋白。保守区预测分析结果表明,该蛋白含有B302_SPRY和CTLH 2个保守结构域,属于SPRY超家族。多序列比对分析结果表明,该基因编码蛋白与马来丝虫的SPRY(XP_001891979.1)蛋白的相似度为43%。蛋白结构分析结果表明,β–折叠与无规则卷曲是Ab–SPRYSEC蛋白的主要结构元件。表达定位分析结果表明,Ab–SPRYSEC基因的表达位置在水稻干尖线虫食道腺附近。Ab–SPRYSEC基因作为水稻干尖线虫效应因子,在水稻干尖线虫侵染宿主中发挥了重要作用。
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关键词
水稻干尖线虫
sprysec基因
原位杂交
c
DNA末端快速扩增技术(RACE法)
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职称材料
题名
水稻干尖线虫SPRYSEC基因的克隆及表达定位分析
1
作者
王步勇
王峰
李丹蕾
马玲
陈俏丽
王博文
出处
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第3期305-311,共7页
基金
黑龙江省自然科学基金(ZD201404)
中央高校基本科研业务专项基金(2572015AA09)
文摘
根据水稻干尖线虫转录组测序结果,采用c DNA末端快速扩增技术(RACE法)从水稻干尖线虫中克隆到效应因子SPRY同源基因,并将其命名为Ab–SPRYSEC(NCBI登录号为KT188820)。该基因全长为2 089 bp,包含1个1 962 bp的开放阅读框(ORF)。预测蛋白编码653个氨基酸,相对分子质量为72 009,理论等电点为4.82,不稳定指数为41.5,属于不稳定性蛋白。保守区预测分析结果表明,该蛋白含有B302_SPRY和CTLH 2个保守结构域,属于SPRY超家族。多序列比对分析结果表明,该基因编码蛋白与马来丝虫的SPRY(XP_001891979.1)蛋白的相似度为43%。蛋白结构分析结果表明,β–折叠与无规则卷曲是Ab–SPRYSEC蛋白的主要结构元件。表达定位分析结果表明,Ab–SPRYSEC基因的表达位置在水稻干尖线虫食道腺附近。Ab–SPRYSEC基因作为水稻干尖线虫效应因子,在水稻干尖线虫侵染宿主中发挥了重要作用。
关键词
水稻干尖线虫
sprysec基因
原位杂交
c
DNA末端快速扩增技术(RACE法)
Keywords
Aphelenchoides besseyi
sprysec
gene
in situ hybridization
rapid amplification of cDNA(RACE method)
分类号
S435.111.48 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
水稻干尖线虫SPRYSEC基因的克隆及表达定位分析
王步勇
王峰
李丹蕾
马玲
陈俏丽
王博文
《湖南农业大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2016
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